RTqPCR需要注意的那些事

rt-qpcr需要注意的那些事,你都了解吗?在rt-qpcr实验中不论是实验小白还是老司机,都会遇到各种不同的实验问题。解决问题不仅要浪费额外的样品和试剂,还要占用大量的时间一遍遍的重复和分析,真是被实验折磨得焦头烂额。那实验过程中应该注意哪些细节呢?小翊精心为大家总结了rt-qpcr实验的注意事项,希望助小伙伴们一臂之力。rt-qpcr实验包括rna提取与质量评估,逆转录和qpcr三大步骤,每个步骤都有很多注意事项,才能做出可靠的数据。下面由小翊给您详细介绍。rna质量评估在rt-qpcr实验中,rna提取完成后,需要对rna的质量进行评估,合格后才可进行后续实验。评估方法有分光光度计,琼脂糖凝胶电泳,agilent 2100分析等,其中最常用的有分光光度计和琼脂糖凝胶电泳法检测。我们需要注意的是这两种方法需要搭配使用,才能完成对rna浓度、纯度和完整度的检测分析,以保证rna的质量。分光光度计检测法分光光度计主要用于测定rn......阅读全文

Nano500微量分光光度计的样本检测情报

  对于每天都沉浸在分子实验的科研人员来说,如果可以在早期就了解到样品精确的数量(浓度)和质量(纯度),将非常有助于实验的进展和有效的防止下游实验的失败。   虽然无论是用微量检测还是荧光计检测,您都可以在几秒钟内获得到DNA,RNA或蛋白质样品的浓度和纯度,但由于下游实验目的的不同,选择准确的测

烟台海岸带所在硝基芳香污染物微生物降解机制取得进展

 硝基芳香化合物是一类重要的化工原料,广泛应用于医药、农药、染料、杀虫剂等化工产品的生产。该类化合物大多具有较高的毒性,在食物链中具有富积和放大效应,对人体具有致畸、致癌、致突变等性质,严重威胁人类健康。2,6-二溴-4-硝基酚(2,6-dibromo-4-nitrophenol,2,6-DBNP)

徕卡LMD在研究冠状病毒对细胞NFκB信号通路和染色质...2

他们分离了表达冠状病毒N蛋白的细胞,并提取了整个RNA。图4 借助免疫荧光和激光显微切割分离细胞株Laser microdissection实验过程:细胞接种在加入2μm 青霉素(PEN)的30mm的圆形培养皿中。免疫染色和LMD按照预定方案*进行,并进行如下修改。处理结束时,细胞用Hank'

生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功...(一)

生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功能学检测RealTime ready 应用生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功能学检测RealTime ready应用 Sabine Lohmann*, Andrea Herold*, Tobias Bergauer#, Anton Belouso

抗根肿病芜菁高质量参考基因组发布

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/4/478019.shtm 芸苔属植株在长期对抗根肿病菌的过程中CR基因的进化模型   课题组供图 近日,华中农业大学教授张椿雨、教授杨庆勇团队与沈阳农业大学教授朴钟云团队合作,发布了抗根肿病的欧

3分钟读懂环介导等温扩增(LAMP)那些事儿

  什么是LAMP?  环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是Notomi等人于2000年提出来的一种新的核酸扩增技术。针对靶基因的6个区域设计4种特异引物,在链置换DNA聚合酶(Bst DNA polymerase)作用下,可以在

刘芝华团队发表食管鳞癌lncRNA转录图谱及其在临床的潜力

  为建立一个临床通用的基于lncRNA的恶性肿瘤概率模型以评估ESCC发生的风险概率,研究团队整合了上述6个lncRNA生物标志物,构建了一个多lncRNA诊断特征(MLMRPscore)。经内部SCH队列验证,MLMRPscore在区分ESCC和非癌组织方面表现出优异的性能,AUC为1.0。  

新冠病毒核酸检测PCR技术知识点梳理(二)

定量PCR,也就是qPCR,由于其英文全称是real-time quantitative polymerase chain reaction,有些也称为RT-qPCR,国外通常简称为qPCR,是由美国Applied Bisystems公司于1996年研制出的一种新型核酸定量技术,并随着荧光P

定量PCR

定量PCR可以用于:(1)以外参或内参为标准,通过对PCR终产物的分析或PCR过程的监测,进行PCR起始模板量的定量;(2)用外标法(荧光杂交探针保证特异性)通过监测PCR过程(监测扩增效率)达到精确定量起始模板数的目的,同时以内对照有效排除假阴性结果(扩增效率为零)。实验方法原理定量PCR(即时聚

雄穗和果穗发育提前的转录调控变化获揭示

  近日,华南农业大学生命科学学院、岭南现代农业科学与技术广东省实验室王海洋课题组与中国农业科学院生物技术研究所合作,解析了玉米响应模拟密植条件下雄穗和果穗发育提前的转录调控变化,鉴定到一个以UB2/UB3/TSH4为核心的转录调控网络调控玉米花序发育响应密植遮荫信号。相关研究发表于The Plan

circRNA_104075在促进肝癌发生和进展的机制研究(二)

5. circ_104075可以结合miR-582-3p作者首先想到circRNA通过海绵作用吸附miRNA,直接调控靶蛋白的表达,作者利用miRanda数据库预测了circ_104075最有可能结合的5个miRNA,接着通过RNA pull down技术(云序生物提供此项实验)捕获复合物后RT-q

IGF1如何通过ERK/MAPK信号通路来保护肾管状上皮细胞?

肾脏管状上皮细胞受损能诱发急性肾衰竭与梗阻性肾病。服用类胰岛素生长因子(insulin-like growth factor-1, IGF-1)能改善小鼠单侧输尿管结扎(UOO)引起的肾脏损伤,但其潜在机理不完全了解。今年6月,上海交大医学院的研究团队在Nature子刊Scientific

雄穗和果穗发育提前的转录调控变化获揭示

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/12/491056.shtm 近日,华南农业大学生命科学学院、岭南现代农业科学与技术广东省实验室王海洋课题组与中国农业科学院生物技术研究所合作,解析了玉米响应模拟密植条件下雄穗和果穗发育提前的转录调控变化,

无需ROX校准的Azure-Cielo™-RealTime-PCR光学系统的应用

ROX是一种广泛使用的惰性荧光染料,通常添加到qPCR反应液中以校正荧光信号。然而,随着荧光技术在仪器中的发展,比如在Azure Cielo™实时荧光定量PCR系统,为了标准化而单独使用染料的步骤已不再需要。当实时荧光定量PCR系统首次引入市场时,许多产品使用固定光源和检测系统对96孔整板进行同

基因编辑技术在治疗复杂遗传病领域获重要进展

  暨南大学粤港澳中枢神经再生研究院研究员闫森/教授李晓江团队首次将CRISPR/CasRx系统应用于亨廷顿舞蹈症大动物模型的治疗,并成功在多种疾病模型中验证了其有效性。CRISPR/CasRx系统的成功应用,标志着基因编辑技术在治疗复杂遗传病领域取得重要进展。近日,相关成果发表于《分子神经退行性疾

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析(一)

近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 throu

Nano500的样本检测情报站

  对于每天都沉浸在分子实验的科研人员来说,如果可以在早期就了解到样品精确的数量(浓度)和质量(纯度),将非常有助于实验的进展和有效的防止下游实验的失败。   虽然无论是用微量检测还是荧光计检测,您都可以在几秒钟内获得到DNA,RNA或蛋白质样品的浓度和纯度,但由于下游实验目的的不同,选择准确的测

传统中药材艾叶在植物源除草剂方面的新应用

在影响农作物产量的有害生物中,杂草位居第一。近日,湖北中医药大学的一项研究发现,艾叶提取物及活性成分可作为绿色除草剂,为绿色环保的除草剂开发提供思考和启示。相关成果发表于农林科学领域期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry。据统计,杂草在全球范围内造成

IGF1如何通过ERK/MAPK信号通路来保护肾管状上皮细胞?

  锐博生物--Nature子刊:IGF-1如何帮助患者免受肾病之苦?   肾脏管状上皮细胞受损能诱发急性肾衰竭与梗阻性肾病。服用类胰岛素生长因子(insulin-like growth factor-1, IGF-1)能改善小鼠单侧输尿管结扎(UOO)引起的肾脏损伤,但其潜在机理不完全了解。今年

上海交大/浙大团队共同揭示“点燃”胰腺癌免疫微环境的表观遗传治疗靶点

  近日,上海交通大学医学院附属仁济医院薛婧、王宇团队与上海交大基础医学院唐玉杰,浙江大学王超尘等国内外研究者合作在Gut期刊发表的最新研究成果,就揭示了经由内源性逆转录病毒元件(Endogenous Retroelements,ERs)和表观遗传机制,对胰腺癌免疫抑制性微环境有重要调控作用的靶点M

痰液中的miRNAs或成为肺癌的生物标记物

  非小细胞肺癌(NSCLC)在美国依然是造成癌症死亡最多的种类,而去年大约有16万美国人死于其。由于早期的治疗可以显著的改善患者的预后,重度吸烟者和患有其他风险的人群会使用低剂量的计算机断层扫描来进行疾病的筛选。虽然其是有效的,但是CT筛查是昂贵的,耗时的,而且,最重要的是,其会造成过度诊断,因为

长链非编码-RNA(lncRNA)研究策略

长链非编码 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子,它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构。研究显示,lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能,它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作

利用光控分子马达实现对于细胞通讯的高精度调控

  Nat Cell Biol封面文章 | 利用光控分子马达实现对于细胞通讯的高精度调控  人体由数十万亿的细胞组成,其正常生理活动的维持需要细胞间物质和信号传递的精准协调,而如此高精度的信号传递很难以单纯的信号因子顺浓度梯度扩散进行阐释。近些年有越来越多的证据表明,细胞会形成类似于神经元的细胞膜突

天津医大教授癌症研究连发3权威期刊

  天津医科大学肿瘤医院肿瘤研究所的博士生导师冯玉梅(Yu-Mei Feng)教授,研究方向为肿瘤分子生物学,多年来致力于乳腺癌转移基因筛选、转移预后预测及转移机制研究。在2015年上半年,她带领的研究小组先后在国际知名期刊《Breast Cancer Research》(影响因子5.88)、《Ca

微生物所发现真菌跨界Small-RNA作用新机制

  自然界中,不同物种间进行着广泛的生物大分子交流,包括蛋白、DNA和RNA等(Zhao and Guo, 2019)。近年来,由跨界传递的small RNA(sRNA)介导的RNA沉默(RNA silencing or RNA interference,RNAi)受到了广泛关注。  RNAi是真核

m5C-RNA修饰表达谱文章教您如何另辟蹊径快速发文

文章导读随着RNA修饰在生物领域的持续火热,关于m6A修饰的研究已经广 泛开展并发表,至今已觉不新鲜;5-甲基胞嘧啶RNA甲基化(m5C)是一类新的修饰方式,参与调控细胞应激、发育和基因表达等方面,目前m5C研究正处 方兴未艾之际,大量的科学研究工作也亟待开展,非常适合有探索性和新颖性需求的老师。这

抗疫现场闪现“国科”身影-中科院企业科技支撑疫情防控

  “需要大量计算资源!”  1月24日除夕之夜,中山大学药学院教授罗海彬提出了紧急需求,中科曙光的工程师火速响应,组建了应急工作组,不眠不休协调计算资源,帮助该团队开展药物筛选作业。  这是中国科学院控股有限公司(以下简称国科控股)旗下科技企业以科技力量支撑新冠病毒疫情防控的一个缩影。事实上,在这

云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用(二)

4.对年龄相关性白内障circRNA的分析显示,circZNF292可以通过海绵机制调节miR-23b-3p功能发表期刊:Aging-us影响因子:4.831发表时间:2020.9.10研究方法:全转录组测序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、双荧光素酶实验等云序提供文章链接:Pr

唾液样本处理系列三:唾液RNA提取试剂盒

     2020年4月中旬,美国罗格斯大学宣布,美国食品和药物管理局(FDA)在其紧急使用授权(emergency use authorization,EUA)下批准了首个采用唾液作为SARS-CoV-2(新冠病毒)检测生物材料的新检测方法。        2020年8月中旬,美国FDA宣布,授予

外泌体miRNA或将更适合结肠癌早期诊断

  结肠直肠癌(CRC)是全球诊断率排名第三的消化道恶性肿瘤。2018年,约有881,000人死于CRC。据统计,超过70%的CRC位于结肠,也就是结肠癌(CC)。CC在北美、欧洲和澳大利亚等地区的发病率和死亡率非常高。近年来,亚洲国家CC的发病率也逐年递增,CC的诊断和治疗已成为全球关注的热点问题