微生物所发现真菌跨界SmallRNA作用新机制
自然界中,不同物种间进行着广泛的生物大分子交流,包括蛋白、DNA和RNA等(Zhao and Guo, 2019)。近年来,由跨界传递的small RNA(sRNA)介导的RNA沉默(RNA silencing or RNA interference,RNAi)受到了广泛关注。 RNAi是真核生物基因表达调控的保守机制。研究表明,sRNA在植物-病原菌间进行双向传递,并在受体细胞中发挥作用 (Hua et al., 2018)。一方面,植物将自身保守的sRNA传递到病原菌细胞抑制致病基因表达,影响致病性;另一方面,病原菌释放sRNA效应子,利用宿主RNAi系统影响抗性途径,抑制宿主免疫 (Zhao and Guo, 2022; Zhu et al, 2022)。 中国科学院微生物研究所郭惠珊团队以棉花黄萎病为研究对象,在国际上首次报道了植物-真菌跨界抗病RNAi。团队发现,棉花传递自身保守的microRNA(miRNA)......阅读全文
微生物所发现真菌跨界Small-RNA作用新机制
自然界中,不同物种间进行着广泛的生物大分子交流,包括蛋白、DNA和RNA等(Zhao and Guo, 2019)。近年来,由跨界传递的small RNA(sRNA)介导的RNA沉默(RNA silencing or RNA interference,RNAi)受到了广泛关注。 RNAi是真核
RNA干扰相关知识Small-interfering-RNA(siRNA)
Small interfering RNA(siRNA):是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。
Small-interfering-RNA(siRNA)的概念
Small interfering RNA(siRNA):是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。
Small-interfering-RNA(siRNA)是什么意思?
Small interfering RNA(siRNA):是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。
真菌RNA提取实验
实验方法原理 液氮研磨可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离开。 实验材料 菌丝体试剂、试剂盒 NaCl蒸馏水SDSTr
真菌RNA提取实验
液氮研磨法 实验方法原理 液氮研磨可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚
真菌RNA提取实验
真菌RNA的提取可以:(1)用于真菌RNA干扰机制研究;(2)用于cDNA文库构建等研究;(3)用于真菌分子生物学相应研究。实验方法原理液氮研磨可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成
非编码small-RNA参与缺氧下的血管生成(一)
非编码RNA是近年来转录组学研究的热点,其中,long non-coding RNA(lncRNA),microRNA,circularRNA是大家研究的非常多的非编码。其实,在small non-coding RNAs世界,除了我们熟知的microRNA之外,还包括piwi-interac
非编码small-RNA参与缺氧下的血管生成(二)
接下来,Northern blot实验也验证了其中上调的tRNAVal(CAC)和tRNAGly(GCC)来源片段。此外,qPCR分析也表明,这些small RNAs在缺血后24hr,48hr和72hr时都显著提高。为了进一步探究胁迫诱导的tRNAs剪切过程,研究人员在缺血条件下对不同时间
真菌总-RNA-的制备
真菌总 RNA 的制备 试剂、试剂盒 酚 氯仿 异戊醇 12mol L 氯化锂
真菌总-RNA-的制备
试剂、试剂盒 酚氯仿异戊醇 12mol L 氯化锂 3mol L 乙酸钠 乙醇 DEPC 处理的水仪器、耗材 水浴 低温高速离心机实验步骤 一 材料与设备1) 酚:氯仿:异戊醇 (25:24:1)。2) 氯仿:异戊醇 (2:1)3)12mol/L 氯化锂。4)3mol/L 乙酸钠。5)70% 乙醇。
Omega真菌RNA提取流程
实验概要Omega真菌RNA提取试剂盒中文说明书(E.Z.N.A. Fungal RNA Kit)。主要试剂1. 取适量RB裂解液,按1ml裂解液加入20ul 2-疏基乙醇。该混合液可于室温放置一周。2. 用DEPC水配置一小瓶70%乙醇。3. 按下表用无水乙醇稀释RNA Wash Buffer I
真菌DNA和RNA提取方法
真菌DNA和RNA提取方法一、真菌DNA的提取(方法一)实验试剂(1)DNA提取液:0.2M Tris-HCl(pH 7.5),0.5M NaCl,0.01M EDTA,1%SDS(2)3M NaAc(3)TE:10 mmol/L Tris-HCl pH8.0,1 mmol/L EDTA(4)酚(p
2.6-真菌总-RNA-的制备
试剂、试剂盒酚氯仿异戊醇 12mol L 氯化锂3mol L 乙酸钠乙醇DEPC 处理的水仪器、耗材水浴低温高速离心机实验步骤一 材料与设备1) 酚:氯仿:异戊醇 (25:24:1)。2) 氯仿:异戊醇 (2:1)3)12mol/L 氯化锂。4)3mol/L 乙酸钠。5)70% 乙醇。6)DEPC
RNAi制备小分子干扰RNA(small-interfering-RNAs,siRNAs)的方法2
越来越多的研究人员开始采用小分子干扰RNA(small interfering RNAs,siRNAs)来抑制特定的哺乳动物基因表达。siRNA是一种短片断双链RNA分子,能够以同源互补序列的mRNA为靶目标降解特定的 mRNA,这个过程就是RNA干扰途径(RNA interference
RNAi制备小分子干扰RNA(small-interfering-RNAs,siRNAs)的方法1
最适用于:快速而经济地研究某个基因功能缺失的表型不适用于:长时间的研究项目,或者是需要一个特定的siRNA进行研究,特别是基因治疗体内表达前面的3种方法主要都是体外制备siRNAs,并且需要专门的RNA转染试剂将siRNAs转到细胞内。而采用siRNA表达载体和基于PCR的表达框架则属于:从转染到细
真菌的DNA和RNA提取方法
一、真菌DNA的提取(方法一)1.实验试剂(1)DNA提取液:0.2M Tris-HCl(pH 7.5),0.5M NaCl,0.01M EDTA,1%SDS(2)3M NaAc(3)TE:10 mmol/L Tris-HCl pH8.0,1 mmol/L EDTA(4)酚(pH8.0):氯仿:异戊
真菌的DNA和RNA提取方法
搞真菌基因功能研究的不可避免的总要涉及到DNA和RNA提取,由于真菌中有较多的多糖成分影响到所提DNA和RNA的质量和后续的分析。因此一个高质量的、实惠的提取方法是我们的优先选择,在此分享一下我一直在用的提取方法,供大家参考。真菌DNA的提取(方法一)1.取真菌菌丝0.5g, 在液氮中迅速研磨成粉2
真菌菌丝的总RNA的提取
试剂:RNA提取缓冲液(CTAB):2% CTAB(W/V),2% 聚乙烯吡咯烷酮PVP(W/V),100 mM Tris-HCl(pH8.0,DEPC处理的水配置),25mM EDTA, 0.5g/L 亚精胺Spermidine,2.0M NaCl,2%巯基乙醇(V/V,使用前加入)。由于在高温灭
真菌的DNA和RNA提取方法
搞真菌基因功能研究的不可避免的总要涉及到DNA和RNA提取,由于真菌中有较多的多糖成分影响到所提DNA和RNA的质量和后续的分析。因此一个高质量的、实惠的提取方法是我们的优先选择,在此分享一下我一直在用的提取方法,供大家参考。真菌DNA的提取(方法一)1.取真菌菌丝0.5g, 在液氮中迅速研磨成粉2
真菌的DNA和RNA提取方法
一、真菌DNA的提取(方法一)1.实验试剂(1)DNA提取液:0.2M Tris-HCl(pH 7.5),0.5M NaCl,0.01M EDTA,1%SDS(2)3M NaAc(3)TE:10 mmol/L Tris-HCl pH8.0,1 mmol/L EDTA(4)酚(pH8.0):氯仿:异戊
真菌菌丝的总RNA的提取方法
1.实验试剂 (1)RNA提取缓冲液(CTAB):2% CTAB(W/V),2% 聚乙烯吡咯烷酮PVP(W/V),100mM Tris-HCl(pH8.0,DEPC处理的水配置),25mM EDTA,0.5g/L 亚精胺Spermidine,2.0M NaCl,2%巯基乙醇(V/V,使用前加入
非同一般的非编码small-RNA,参与缺氧下的血管生成
非编码RNA是近年来转录组学研究的热点,其中,long non-coding RNA(lncRNA),microRNA,circularRNA是大家研究的非常多的非编码。其实,在small non-coding RNAs世界,除了我们熟知的microRNA之外,还包括piwi-interacti
真菌菌丝的总RNA的提取的操作方法
试剂:RNA提取缓冲液(CTAB):2% CTAB(W/V),2% 聚乙烯吡咯烷酮PVP(W/V),100 mM Tris-HCl(pH8.0,DEPC处理的水配置),25mM EDTA, 0.5g/L 亚精胺Spermidine,2.0M NaCl,2%巯基乙醇(V/V,使用前加入)。由于
Small-scale-DNA-preps-for-Neurospora-crassa.
Molecular biology experiments often require preparation of small amounts of DNA from many samples. This abbreviated DNA isolation method yields an ave
Small-Scale-Yeast-Whole-Cell-Extract-for-IP
Grow 100 ml yeast cells in desired media overnight to an A600 of ~1.0 (0.6 to 1.2 works well). For growth in minimal media, 1 ml of a saturated overni
Small-Leucinerich-Proteoglycan-(SLRP)-molecules
The small leucine-rich proteoglycans (SLRPs) are a family of proteins that are present in extracellular matrix and that share in common multiple repea
Small:新荧光纳米探针助力肿瘤治疗
近日,刊登在国际杂志Small上的一篇研究论文中,来自新加坡A*STAR研究所的研究人员开发了一种混合金属聚合物纳米颗粒,其在肿瘤细胞周围特殊的酸性环境下就会发光用以指示肿瘤所在,因此可以鉴别任何肿瘤的非特异性探针或许就可以用于监测癌症的发病部位、扩散及其疗法的有效性。 癌性肿瘤pH通常比正常
少孢节丛孢小RNA研究揭示真菌“变身”重要助力
在生物界中,真菌作为真核生物,自成一门。真菌能够引起植物多种病害,给农林业生产造成巨大的经济损失。真菌还可引起动物和人类的多种疾病。真菌引起的病害难以防治,其中一个重要原因在于真菌感染的机制尚不明确;同时,真菌和感染的宿主同为真核生物,为防治增加了难度。真菌通常营多种生活方式,以此适应各种各样的
新型跨界侵染植物与真菌负单链RNA病毒被发现
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519441.shtm西北农林科技大学植物保护学院教授孙丽英课题组发现了一种新型跨界侵染植物与真菌的负单链RNA病毒(VmNSRV1),相关研究成果近日发表在PNAS上。 ?该研究发现的新型真菌