武汉植物园等在金豆的叶绿体全基因组解析研究中获进展
金豆【Fortunella venosa(Champ. ex Benth.) C.C.Huang】是芸香科中一种多年生常绿灌木。此物种为我国特有,分布区域与金柑【《中国植物志》 Fortunella hindsii (Champ. ex Hook.) Swingle】略有重叠,且范围狭窄,主要分布在福建南平和江西永丰等地,在湖南宁远、茶陵和桂东等地也有发现。由于气候变化和人类活动影响等原因,该种在野外存在数量已大幅减少,作为濒危物种被列入《中国物种红色名录(红色名录第1卷)》。该种在分类学和系统学上的地位素有争议。在《中国植物志》(英文版)(Flora of China)中,金橘属(《中国植物志》 Fortunella Swingle)被并入柑橘属(Citrus L.),原金橘属中包括金豆在内的几个物种都被处理为金柑(Flora of China:Citrus japonica Thunb.)的同物异名。 湖南师范大学生命......阅读全文
科学家揭示德保苏铁叶绿体基因组特征
广西大学植物生理生态与进化课题组在苏铁植物的基因组学研究方面取得新进展,首次用苏铁的叶绿体全基因组重建了苏铁植物的系统进化树,揭示托叶铁科为非单系起源,该研究成果近日发表在《科学报告》上。 据介绍,研究人员通过对德保苏铁展开二代测序,获得了德保苏铁基因组几百万条的短片段,用先进的算法进行组装,
珀金埃尔默超推出快速全基因组测序,5天内出结果
珀金埃尔默推出了超快速的全基因组测序服务,该服务可在五天内为医生提供结果,以帮助他们管理和改善新生儿和儿科重症监护病房患者的预后。 这家总部位于马萨诸塞州沃尔瑟姆的公司表示,这项服务通过 PerkinElmer Genomics 提供,使用干血样本进行表型驱动分析,平均覆盖患者基因组的 40 倍
叶绿体基因组遗传信息获取技术体系建立
记者日前从中科院昆明植物所获悉,该所种质资源库多年来致力于叶绿体基因组学研究,并建立了较为完善的叶绿体基因组遗传信息获取技术体系。该技术体系解决了叶绿体基因组获取方法需要大量新鲜材料以及一些物种因个体微小须通过二代测序方法获取叶绿体基因组的难题。 2012年以来,科研人员利用二代测序技术研究了
植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器,对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队,历时五年,通过对三种高等植物(水稻、玉米和拟南芥
关于蓝藻和叶绿体基因组的比较研究介绍
原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。 蓝藻基因组的
细胞化学基础蓝藻和叶绿体基因组的比较研究
原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。蓝藻基因组的作图和测
虎尾海马全基因组破译
中科院南海海洋研究所、德国康斯坦茨大学、华大基因和新加坡A*STAR研究院联合破译了虎尾海马的全基因组。有关研究成果日前以封面文章的形式发表在《自然》杂志上。 海马隶属于海龙科。与其他硬骨鱼不同,海马呈现高度特殊的形态,例如头部前方具有管状长嘴,无腹鳍和尾鳍,尾端卷曲,全身覆盖硬骨骼,没有鳞片
全基因组扩增技术介绍
研究人员通常会在下游分析中遭遇DNA样本量有限或不足的问题。QIAGEN的全基因组扩增技术通过以包括单细胞在内的小量样本或珍贵样本扩增获得基因组DNA,解决此类难题。REPLI-g Kit能够准确地复制原始DNA样本,不会造成偏差,扩增后的DNA可以直接应用于广泛的遗传学分析。什么是全基因组扩增(w
人类全基因组测序计划
全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部(DOE)与美国国家卫生研究院(NIH),分别在1986年与1987年加入人类基
水肥药一体集成新技术让土豆变“金豆”
“在黑龙江省农科院牡丹江分院专家指导下,我把窄垄变宽垄,水肥药一起用,用这种新技术种出的土豆,不仅省水省肥省人力,而且产量比靠天种地增加20%。”8月5日,来自全国各地的百余位马铃薯领域专家,来到位于黑龙江省宁安市卧龙乡卧龙村“马铃薯大垄双行膜下滴罐水肥药一体化栽培技术”示范基地进行现场观摩,这片地
水肥药一体集成新技术让土豆变“金豆”
科技日报牡丹江8月5日电 “在黑龙江省农科院牡丹江分院专家指导下,我把窄垄变宽垄,水肥药一起用,用这种新技术种出的土豆,不仅省水省肥省人力,而且产量比靠天种地增加20%。”8月5日,来自全国各地的百余位马铃薯领域专家,来到位于黑龙江省宁安市卧龙乡卧龙村“马铃薯大垄双行膜下滴罐水肥药一体化栽培技术
昆明植物所等在蔷薇类系统发育基因组学研究中取得进展
蔷薇类(rosids)和菊类(asterids)是真双子叶植物的两个主干分支,其中蔷薇类包括17个目,140个科,约70,000个物种,呈现了丰富的形态多样性,并具有重要的经济价值。近十几年以来,对叶绿体基因序列的分析支持蔷薇类分为豆类分支和锦葵类分支。其中,豆类分支包括固氮支系(由葫芦目Cuc
全基因组的比较基因组杂交技术介绍
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
武汉植物园新研究支持将金橘属并入柑橘属
金橘属植物是我国独具特色的水果资源,几乎所有物种在野外个体非常稀少,均为珍稀濒危植物,其资源的保护及分类问题一直受到关注。近期,中科院武汉植物园联合相关单位在金橘属分类学研究获进展,支持将金橘属并入柑橘属。相关成果在Frontiers in Plant Science发表。金橘属隶属芸香科,为常绿灌
关于植物叶绿体基因组基因表达调控的研究的介绍
叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式
叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日,记者从中国科学院华南植物园获悉,该园分子生态学团队及其合作者,基于中国森林监测网络(CForBio)平台,揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉,系统发育群落生
我国学者揭示花叶组重楼植物叶绿体基因组特征
重楼属植物主要生物活性物质为甾体皂苷,具有消炎、止血、抗肿瘤等功效,是云南白药、宫血宁等86种著名中成药的重要原料。重楼属花叶组包括花叶重楼与禄劝花叶重楼两种,与属内其它植物相比,叶具斑块,植株矮小,果实很小且产量低。花叶组重楼植物含有中国药典规定的四种重楼皂苷。然而,花叶组重楼生长十分缓慢,对
细胞化学基础植物叶绿体基因组基因表达调控的研究
叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转
叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日,记者从中国科学院华南植物园获悉,该园分子生态学团队及其合作者,基于中国森林监测网络(CForBio)平台,揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉,系统发育群落生
花叶芋叶片关联分析和叶绿体基因组研究获进展
广东省农业科学院环境园艺研究所特色花卉研究室在花叶芋叶片重要观赏性状关联分析和叶绿体基因组研究方面取得新进展。相关研究分别发表于Physiologia Plantarum和Genes。 花叶芋(Caladium)是天南星科花叶芋属多年生草本植物,被誉为“观叶皇后”。花叶芋资源丰富,表型性状变异丰
我国学者阐述重楼叶绿体基因组结构特征与进化
重楼属植物主要生物活性物质为甾体皂苷,具有消炎、止血、抗肿瘤等功效,是云南白药、宫血宁等86种著名中成药的重要原料。重楼属花叶组包括花叶重楼与禄劝花叶重楼两种,与属内其它植物相比,叶具斑块,植株矮小,果实很小且产量低。花叶组重楼植物含有中国药典规定的四种重楼皂苷。然而,花叶组重楼生长十分缓慢,对
全基因组研究解码口吃根源
口吃跨越不同语言和血统,影响着全球约7000万人。过去,许多人认为口吃能够通过自主控制来改善。但数十年来的研究表明,口吃实际上是一种高度遗传的不可控疾病,其原因复杂且模糊。而一项7月28日发表于《自然-遗传学》上的研究让口吃的部分原因变得清晰。 研究人员利用基因检测服务公司23andMe的庞大
昆虫全基因组DNA的提取
实验概要利用改进的CTAB 法提取昆虫全基因组DNA。主要试剂1. 蛋白酶K[美国Merck公司]2. 三羟甲基氨基甲烷(Tris)[美国Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 琼脂糖及溴化乙锭(EB)[美国Amresco公司生产]5. 乙二胺四乙酸钠(Na2ED
全基因组测序的诊断价值
根据《Nature Genetics》上发表的一项新成果,全基因组测序有望用于临床上的遗传病诊断。这项研究评估了影响全基因组测序在临床诊断中取得成功的因素。 这个国际研究小组由英国的研究人员领导,对156个病例或家庭开展了临床基因组测序。这些病例有着遗传疾病的特征,但无法通过之前的筛查检测来解
全基因组测序各步骤工具
全基因组测序(WGS)是下一代测序技术,用于快速,低成本地确定生物体的完整基因组序列。基因组的深度测序对于临床研究的意义重大,解读WGS数据并了解基因组突变在健康和疾病中的重要性是精准医疗的基石。WGS分析流程能分为三大块,数据处理、检测变异和综合分析,具体如下图所示:由于WGS现在已经非常成熟了,
全血基因组提取操作步骤
操作步骤((200ul全血))* 第一次使用前请先在15ml漂洗液WB中加入60ml无水乙醇! 1. 取200ul新鲜、冷冻或加入各种抗凝剂的血液,放入1.5ml离心管。对如果全血起始量小于200μl,则用缓冲液BB补足到200μl。如果起始量介于200μl-300μl之间,则后续操作需要按照比例增
多国实施全基因组分析计划
由于基因测序可以探查与特定疾病相关的基因,该疗法正在成为日益受欢迎的诊断方法。 英国计划到2017年对10万人进行基因组测序。 美国加州一对龙凤胎出生后,他们的父母非常忧虑:两个婴儿不仅发育缓慢,而且肌肉松软无力。大脑扫描结果显示,男婴或存在大脑性麻痹;然而医生对造成女婴震颤和癫痫的原因却不
叶绿体亚分级实验——叶绿体亚分级
实验材料叶绿体试剂、试剂盒裂解缓冲液仪器、耗材微量离心管小型离心机实验步骤1. 将含 1 mg 叶绿素的叶绿体悬液吸至一微量离心管中。2. 在小型离心机中 14000 r/min 离心 30 秒钟,弃去上清。3. 加 1 ml 裂解缓冲液,振荡,冰浴 5 分钟。裂解缓冲液:10 mmol/L HEP
研究发现植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器,对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队,历时五年,通过对三种高等植物(水稻、玉米和拟南芥
版纳植物园叶绿体比较基因组学研究取得进展
樟科油丹属树种木材质优,国际市场上的商品名为“medang”,和楠木树种的亲缘关系较近。以往的分子系统学研究表明油丹属为复系类群,但与润楠属、鳄梨属和楠属等的系统关系尚不明晰。 近日,中国科学院西双版纳热带植物园生物多样性研究组以分布于印度南部的油丹模式种Alseodaphne semecar