家猪基因组提供大规模数据,有助解析人类健康

近日,研究人员完成了几个品系家猪的全基因组测序和分析,其中包括可作为人类医学研究模型以及治疗性药物测试模型的迷你猪(mini-pig)。 一个物种的基因组在深入研究其生物学本质及演化进程时具有十分重要的作用。近日,由华大基因参与完成的两篇关于家猪全基因组测序和分析的文章分别在《自然》(Nature)和《GigaScience》(由华大基因和BioMed Central联合创办)上发表。对于发表在《自然》上的文章,国际家猪基因组测序协作组(SGSC)主要选取作为重要肉类来源的家猪品系――杜洛克猪(Duroc breed)进行了全基因组测序,另外还对亚洲野猪、亚洲家猪和欧洲品系等进行了重测序研究;而发表在《GigaScience》上的文章,主要针对医学研究用的迷你猪进行了研究,这个项目主要由华大基因与中国农科院北京畜牧兽医研究所主导完成。此外,还有一系列有关猪基因组的文章同时在BioMed Central系列期......阅读全文

美研究者完成“生命暗物质”基因组测序

  正当物理学家苦苦寻找宇宙暗物质之际,美国研究人员10日报告说,他们完成了对“生命暗物质”的基因组测序。   1996年,科学家首次发现了一种名为“候选门TM6”的细菌。这种细菌广泛存在于水环境中,却无法在实验室中培养,除了其标志性的16S基因外,科学界对它的生命活动特点几乎一无所知。

454测序参与棉花基因组进化研究工作

  棉花是全球重要的经济作物之一。它的纤维,俗称皮棉,是纺织工业主要的天然原料。全世界棉花种植面积约5亿亩,我国常年种植面积近8千万亩。棉花不但是重要的纤维和油料植物,而且是重要的植物蛋白来源。在食用油中,棉籽油的亚油酸含量最高,达到55.6%。除此以外,棉花种子中还含有极为丰富的蛋白质和脂肪等物质

英国将测序万人基因组用于疾病研究

  近日,在英国伦敦的科学博物馆,维康基金会(Wellcome Trust)宣布了英国10K(UK10K)项目,即英国将在接下来的三年内测定10000个人的基因组序列。英国10K项目的负责人Richard Durbin表示,这项宏伟的计划将得到生物医学慈善会约1000万英镑的支持,10K项目旨在找出

遗传发育所研究团队领衔完成小麦A基因组测序

  3月24日,国际著名学术刊物《自然》在线发表了题为Draft genome of the wheat A-genome progenitor Triticum urartu的研究论文。该项研究首次完成了小麦A基因组的测序和草图绘制,比较全面地揭示了A基因组的结构和表达特征,对未来

国际团队完成蜈蚣基因组测序-具有重要研究价值

  一个国际研究小组日前宣布完成了对第一种蜈蚣基因组的测序工作。研究发现蜈蚣基因组大小只有人类基因组的十分之一,其中含有的基因数量共有15000个,只有人类的约三分之二。来自12个国家的106名研究人员参与了该项目。相关论文在线发表在美国《科学公共图书馆·生物卷》上。  节肢动物是科学研究中一个非常

世界首个梅花全基因组重测序研究完成

  日前,北京林业大学张启翔教授领衔的国家花卉工程技术研究中心,与青岛华大基因研究院、深圳华大生命科学研究院以及宾夕法尼亚州立大学等单位通力合作完成了首个梅花全基因组重测序研究,构建完成了世界首张梅花全基因组变异图谱,“梅花花部性状的遗传结构”(The genetic architecture of

近期全基因组测序研究进展一览

【1】Cell:全基因组测序揭示出自闭症新的基因变异doi:10.1016/j.cell.2017.08.047自闭症有遗传的根源,但是大多数病例并不能够通过当前的遗传测试加以解释。如今,在自闭症儿童中发现的基因组模式---细胞内完整的一套遗传指令---揭示这种出这种疾病的一种新的遗传特征。这种特征

-NIH出资$3.13亿用于疾病基因组测序研究

  美国国立卫生研究院(NIH)将资助一些基因组测序分析中心,致力于破解人类常见病和罕见病的基因信息。NIH下属的国家人类基因组研究所(NHGRI)14日宣布成立“常见疾病基因组学中心(CCDG)”,该中心将利用基因组测序技术,从基因水平研究心脏病、糖尿病、中风以及自闭症等常见疾病产生的原因。NHG

what?“定制人类”!资本围猎基因测序百亿美金市场

  在不久的将来,我们也许能亲眼目睹定制而成的“完美婴儿”。克劳斯·施瓦布在其所著《第四次工业革命》中,认为生物基因工程领域变革的引爆点将是首个“编辑基因组”婴儿的诞生。而被“设计”过的婴儿,将拥有某些特质或对某些疾病有免疫。  定制人类  自21世纪初至今,人类全基因组测序的成本几乎下降了6个数量

Nature子刊:华大基因参与破解白蚁基因组

  湿木白蚁是一种真社会性昆虫。研究人员获得了湿木白蚁的遗传学蓝图,并在此基础上向人们展现了这种白蚁与其他社会性昆虫(蚂蚁、黄蜂和蜜蜂等)的关键异同,为理解社会性昆虫的演化提供了重要的线索。此外,这项研究也可以帮助人们寻找有助于控制白蚁的基因功能。  湿木白蚁主要生活在木头中,不怎么出去。研究人员测

1亿美元仪器几近瘫痪-华大基因收购CG始末

  后来成为深圳式创新样板的华大基因,诞生于20世纪末的北京,出身于红旗下,有着国字号基因。  而各级政府对其的政策和资金支持,在华大基因的发展历程中,也一直扮演着不可或缺的角色。这个旁人说不清是科研机构、国有公司还是民营公司的“机构”,得以独树一帜地发展壮大至今。  离开中科院  为完成中国承担的

基因测序:数据深度挖掘和解读难题待解

  作为一种新型基因检测技术,基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。正因如此,今年华大基因的上市,就引发了资本市场的热烈追捧。  在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上,与会的众多专

基因测序:数据深度挖掘和解读难题待解

   作为一种新型基因检测技术,基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。正因如此,今年华大基因的上市,就引发了资本市场的热烈追捧。  在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上,与会的众多

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

认识泛基因组测序

什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年

基因测序全球大热,谁会抢到市场先机

  日前,美国总统奥巴马在2015年国情咨文演讲中提出“精确医学计划”,提议在2016财年向该计划投入2.15亿美元,推动个性化医疗发展。   在这笔2.15亿美元预算中,1.3亿美金将分配给NIH(美国国立卫生研究院),用于首批志愿者的招募和测序;7000万美金给NIH的癌症研究所,用于解码肿瘤

Nature、Cell相继发布重磅成果-精准医学进入基因大数据时代

大规模人群基因组学成果密集发布图片来源:http://www.pharmaceuticaldaily.com日前,最新一期《Nature》发表两项重磅研究,集中介绍了英国生物样本库(UK Biobank)的遗传数据。该数据集涵盖了约50万个体的全基因组遗传数据、临床测量以及健康记录,向我们揭示了生物

关于全基因组测序的测序指标介绍

  一、全基因组测序的测序指标— 深度  测序深度(Sequencing depth)是指测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小的比值,它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。测序的个体,如果采用的是双末端或Ma

多项重磅科研成果-精准医学进入基因大数据时代

  日前,最新一期《Nature》发表两项重磅研究,集中介绍了英国生物样本库(UK Biobank)的遗传数据。该数据集涵盖了约50万个体的全基因组遗传数据、临床测量以及健康记录,向我们揭示了生物大数据对于精准医学的极高价值。  10月4日,《Cell》发布了迄今为止最大规模的中国人基因组学大数据研

无创产前技术概述(一)

什么是无创产前基因检测无创产前基因检测技术全球统称为NIPT(Noninvasive prenatal test),主要是通过采集5毫升的孕妇外周血,从血浆中把游离的DNA提取出来,经过高通量的测序和生物信息学的分析,得出胎儿患染色体异常的疾病风险率的一项技术。这项检测技术可以检测胎儿全部的

我国完成首个鱼类基因组测序项目

  记者8月5日从深圳华大基因研究院获悉,中国水产科学研究院黄海水产研究所和深圳华大基因研究院已联合完成半滑舌鳎全基因组测序和组装,绘制了半滑舌鳎全基因组序列图谱。这是我国完成的第一个鱼类基因组测序项目和全基因组序列图谱,使半滑舌鳎成为世界上第一个测定了全基因组序列的鲽形目鱼类。  据了解

德爆发急性肠出血性流行病-华大基因启动基因组检测

  近日德国爆发急性肠出血性流行病,被感染人数持续上升,据德国卫生部5月24日提供的数据,截至当日已至少发现300个确诊病例。患者以成年女性为主,感染该病菌的人会产生腹痛腹泻、腹积水或者肾衰竭等症状,而抗生素对其几乎无效,严重者将会有生命危险。  德国汉堡大学医学院计划通过对该致病性大肠杆

华大基因Nature、GigaScience杂志发表新成果

  获得一个物种的参考基因组对于深入了解它的生物学和进化具有极其重要的意义。今天的《自然》(Natrure)和《GigaScience》杂志发布了华大基因研究人员参与的两项研究的最新成果,全基因组测序、分析和生成了猪的高质量参考基因组。   在Nature研究中,猪基因组测序联盟呈递了作为重要的经

基因测序市场发展前景分析-市场规模将保持快速增长

从1988年人类基因组计划启动开始,基因组学应用的壮阔前景开始展现在人类面前。1998年毛细管测序技术问世,测序提速10倍,原计划15年完成的人类基因组计划加快进度。2006年第二代测序仪诞生,成本下降百倍,形成“超摩尔定律”之势。随着测序成本的显著降低和生物信息分析能力的显著上升,美国等西方发达国

美国科学家鉴定出自闭症基因遗传突变

  自闭症基因组学研究获新突破,或让“星星的孩子”远离孤独。美国杜克大学医学院、多伦多儿童医院以及深圳华大基因研究院等单位通过全基因组测序的方法,成功鉴定出一系列与自闭症相关的遗传突变和风险基因。今天,该研究成果在《美国人类遗传学》上发表,为自闭症研究提供了宝贵的遗传资源,同时或将成为探索自闭症病理

人类基因遗传变异整合图谱完成华大基因承担1/4工作

  11月1日,由中、美、英等多个国家共同发起的大型国际合作项目“千人基因组计划”的最新研究成果在国际著名科技期刊《自然》杂志上在线发表。该协作组公布了高分辨率的人类基因组遗传变异整合图谱,将为基因组学在人类疾病与健康领域中的应用以及个体化医疗时代的到来奠定坚实的科学基础。华大基因作为该计划的发起者

测序技术如何助推精准医学?

主要应用领域基因测序的一个重要应用是测出生缺陷,包括单基因病、遗传病、无创产前、基因检测,这是目前应用的最多、最成熟的产业。整个肿瘤基因组结构非常复杂,一个肿瘤基因组数据量大约有几十个G,要完整地测一个肿瘤单细胞,则需要更多工具,数据量也更大。移植配型白血病、骨髓配型,包括基因身份证和整个的器官移植

《自然》封面:大熊猫基因组测序

  由深圳华大基因研究院发起,中国科学院昆明动物研究所、中国科学院动物研究所、成都大熊猫繁育研究基地和中国保护大熊猫研究中心参与的合作研究成果《大熊猫基因组测序和组装》,1月21日以封面故事形式在国际权威杂志《自然》上发表。   在国家林业局、深圳市政府、深圳市盐田区政府及相关企业的支持下,“

首届深圳国际生物科技创新论坛暨展览会在深隆重开幕

  2012年12月13日,由深圳市人民政府、中国医药生物技术协会以及华大基因共同主办的“深圳国际生物科技创新论坛暨展览会”在深圳会展中心成功开幕。本次展会以“生物产业链上的高成长机会”为主题,旨在深入探讨以生物基因资源为源头、以生物科技创新为牵引,贯穿从科学研究到技术创新到产业发展的生物领域全新思