什么是sgRNA

shRNA是short hairpin RNA 的缩写。翻译为“短发夹RNA”。shRNA包括两个短反向重复序列,中间由一茎环(loop)序列分隔的,组成发夹结构,几个基因有一段核苷酸序列重叠在一起。重叠基因中不仅有编码序列也有调控序列,大基因内包含小基因。重叠基因有多种重叠方式,更重要的可能是参与对基因的调控如。向导RNA 可以与非编辑的mRNA序列互补,并加入尿嘧啶U,产生编辑的mRNA。所以说向导RNA是作用于pre-mRNA 也就是mRNA的前体,同样是DNA转录的直接产物。基因,dna或rna分子上含特定遗传信息的一段核苷酸序列,是遗传物质的最小功能单位。基因在染色 体上星线性排列,每个基因都有一定的位置,即座位。在同源染色体。CRISPR (clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats)是一种来自细. 通过基因工程手段对crRNA和tracrR......阅读全文

研究揭示Cas9切割DNA及其被AcrIIC3抑制的分子机理

  CRISPR/Cas系统是广泛存在于细菌和古菌中抵抗病毒、质粒等外源核酸的获得性免疫系统。II型的Cas9在RNA的介导下可以特异性识别、切割dsDNA,具有可编辑性,因此被广泛用作基因编辑工具。由于其重要性,Cas9被系统地研究,大量的文献报道了Cas9的原子分辨率结构、单分子测量结果、分子动

西北农林科大等成功获得多基因编辑克隆猪

多基因编辑猪的培育。   多基因编辑猪的鉴定。图片由论文作者提供10月9日,西北农林科技大学动物医学院华进联团队和云南农业大学魏红江团队合作,采用高效培育多基因编辑猪的sgRNA表达方案,利用三头代孕母猪产下两头双基因编辑仔猪。这是西北地区首次成功获得多基因编辑克隆猪,标志着该地区生猪产业基因编辑生

应用优化CRISPR技术建立基因完全敲除的小鼠及猴

  6月6日,《细胞研究》在线发表了一项成果,应用改进的“C-CRISPR”技术可以获得单基因或多基因功能完全敲除的小鼠及猴。这项研究由中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心的杨辉研究组、熊志奇研究组以及神经所苏州非人灵长类研究平台孙强团队合作完成。该研究通过将多个

哈工大最新发表Nature文章-再次解析CRISPR作用机制

  来自哈尔滨工业大学生命科学与技术学院的研究人员发表了题为“Structural basis of CRISPR–SpyCas9 inhibition by an anti-CRISPR protein”的文章,揭示了Anti-CRISPR 蛋白AcrIIA4抑制SpyCas9活性的分子机制。  

-Jennifer-Doudna:除了基因编辑,CRISPR还能做什么?

  Jennifer A. Doudna(左)  很少有发现能够像CRISPR那样在一夜之间改变整个领域。CRISPR-Cas原本是原核生物的适应性免疫系统,自从人们发现了Cas9的应用潜力,这一系统迅速成为了炙手可热的基因组编辑工具。加州大学伯克利分校的Jennifer A. Doudna在本期M

基因筛查进入单细胞时代

  遗传筛选是生物学中最有力的工具,它可以阐明复杂的生物过程。最近四项研究已经开发了一个新的遗传分析方法,通过使用单个细胞作为微观实验室,测定扰动。这些研究开发了CROP-seq、PERTURB-seq和CRISP-seq技术,克服了现有基因筛查方法的局限性,并且可以分析一些原本无法分析的样本。  

深圳大学Nature子刊CRISPR研究成果

  最近,有研究报道CRISPR-Cas9系统能够靶定病毒RNA,因此这种现象提出了一个有趣的问题:Cas9是否也可能影响细胞mRNAs的翻译。7月13日,来自深圳大学第一附属医院的研究人员,在Nature子刊《Scientific Reports》上发表题为“Targeting cellular

PNAS:在小鼠细胞中利用CRISPRCas9技术高效进行基因组编辑

  为了利用CRISPR-Cas9基因编辑系统切割基因,人们必需设计一种与靶基因的DNA相匹配的RNA序列。大多数基因具有上百个这样的在基因组中的活性和独特性上存在差异的序列。因此,寻找最佳的序列很难通过手工实现。一种新的“CrispRGold”程序有助科学家们鉴定出最为高效的和最为特异性的RNA序

CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激活细胞

  题目:CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus Enables   Reprogramming to Pluripotency   期刊:Cell stem cell   影响因子:23.3

CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激活细胞

  题目:CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus Enables   Reprogramming to Pluripotency   期刊:Cell stem cell   影响因子:23.3

CRISPR基因编辑技术的利与弊

说到基因编辑,大家都会想起CRISPR技术。这个当年名声大噪的技术,现今依旧热度不减,尤其是我们的CRISPR大神张锋,近期发表的文章频频亮相于知名杂志,又引起一片热议。时过境迁,CRISPR技术并没有销声匿迹,一直在线。但任何事物包括技术有利就有弊,CRISPR技术当然也毫不例外。CRISPR技术

详解CRISPR基因编辑技术的利与弊

  说到基因编辑,大家都会想起CRISPR技术。这个当年名声大噪的技术,现今依旧热度不减,尤其是我们的CRISPR大神张锋,近期发表的文章频频亮相于知名杂志,又引起一片热议。时过境迁,CRISPR技术并没有销声匿迹,一直在线。但任何事物包括技术有利就有弊,CRISPR技术当然也毫不例外。   CR

哈工大Nature:揭示AntiCRISPR蛋白抑制SpyCas9活性的分子机制

  4月28日,哈尔滨工业大学生命学院黄志伟教授课题组在《自然》(《Nature》)在线发表了题目为《Anti-CRISPR蛋白抑制CRISPR-SpyCas9活性的分子机制》(Structural basis of CRISPR-SpyCas9 inhibition by an anti-CRIS

中科院学者连发两篇Cell-Res文章获CRISPR技术重要突破

  基因编辑工具的快速发展令整个生物学研究领域疯狂,目前第三代DNA剪刀的主角是CRISPR,这是一种比其前身更快更便宜的工具。近期来自中科院神经科学研究所的杨辉研究组与多个研究组合作,在Cell Research杂志上发表了多篇文章,获得了CRISPR-Cas9技术的重要突破。  研究组成员通过与

南京大学黄行许:连发CRISPR/Cas9重要研究成果

  南京大学模式动物研究所的黄行许(Xingxu Huang)教授,是近年来基因组编辑领域的风云人物之一。其实验室不仅首次在世界上利用CRISPR/Cas9进行了大鼠的条件性基因敲除,还通过原核注射实现了世界上首次猴基因敲除。这些成果在国际上受到广泛的瞩目。  近期黄行许教授课题组接连在CRISPR

CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激...(二)

3. CRISPR-dCas9-SunTag-VP64系统单独对Sox2基因进行内源激活,也能有效获得iPS研究者单独选取了能对Sox2进行激活的SgRNA进行iPS诱导,发现在有效激活内源Sox2基因表达的情况下,能成功得到诱导性多能干细胞,并能稳定增殖传代。得到iPS通过体内体外实验,如干细胞基

深圳先进院在CRISPR基因编辑应用领域取得新突破

  近日,中国科学院深圳先进技术研究院研究员喻学锋课题组在CRISPR基因编辑应用领域取得新突破。相关工作Enhanced Cytosolic Delivery and Releases of CRISPR/Cas9 by Black Phosphorus Nanosheets for Genome

华人学者推出CRISPR新设计工具

  细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争,为此它们演化出了多种防御机制,CRISPR/Cas适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,可以在引导RNA的指引下,靶标并切割入侵者的遗传物质。  2012年研究者们利用这一特点,将CRISPR系统发展成了强大的

Nature:CRISPRCAS9推动后基因组时代

  近日,来自美国的科学家在国际期刊Nature发表了他们的最新研究成果,他们利用结构导向的方法改造了CRISPR-CAS9复合物来系统性研究基因功能,并通过构建sgRNA文库大规模筛选抵抗BRAF抑制剂的激活基因。该文章利用CRISPR-CAS9技术研究基因功能,对后基因组时代的基因功能研究具有推

Genome-Biology:为CRISPR选择最佳向导

  细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争,为此它们演化出了多种防御机制,CRISPR-Cas9 适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,可以在引导RNA的指引下,靶标并切割入侵者的遗传物质。 2012年研究者们利用这一特点,将CRISPR系统发展成了强大

关于肝损伤修复及其分子调控机制

  利用 CRISPR/Cas9 技术,针对靶基因序列设计 sgRNA, 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂,在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中,靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中,最终导致靶基因无法正常转录翻译,达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRISPR

斑马鱼的基因敲除定制(Cas9KO)法介绍

  利用 CRISPR/Cas9 技术,针对靶基因序列设计 sgRNA, 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂,在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中,靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中,最终导致靶基因无法正常转录翻译,达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRISPR

斑马鱼的基因敲除定制(Cas9KO)法介绍

利用 CRISPR/Cas9 技术,针对靶基因序列设计 sgRNA, 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂,在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中,靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中,最终导致靶基因无法正常转录翻译,达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRIS

CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激...(一)

CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激活细胞重编程题目:CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus EnablesReprogramming to Pluripotency期刊:C

著名华裔院士:CRISPR/Cas9介导的荧光原位杂交

  加州大学伯克利分校生物化学与分子生物学系钱泽南(Robert Tjian)教授是美国著名华裔生物化学家,其以研究真核生物细胞遗传信息转录闻名,担任国际顶级生物学期刊《Cell》杂志的编委,1991年当选美国国家科学院院士,2009年担任美国霍华德•休斯医学研究所(HIMI)主席。科学界将其与著名

新研究实现转基因小鼠脑内多基因的同时激活

  1月15日,《自然-神经科学》(Nature Neuroscience)发表了题为《利用CRISPR/dCas9转基因小鼠在脑内进行多基因的同时激活》的研究论文,该研究由中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心、神经科学国家重点实验室杨辉研究组与上海科技大学黄鹏羽

刘小乐教授连发多项研究成果

  华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐(X Shirley Liu)教授,也是教育部“长江学者”讲座教授、中组部“千人计划”入选者,是国际生物信息学界的领军人物。其带领的课题组长期致力于生物大数据的收集和信息挖掘、筛选治疗癌症药物的有效靶点,以及开发个性化癌症诊

华人先锋《Nature-Methods》利用CRISPRi绘制遗传互作图谱

  斯坦福大学亓磊(Lei Stanley Qi)教授早年毕业于清华大学,现任斯坦福大学生物工程学、化学和系统生物学系的助理教授,近年来他在CRISPR研究领域取得了一系列突破性进展,比如第一次采用CRISPR-Cas9系统的变种技术,改变了读取诱导多能干细胞(iPSCs)基因组的方式(由此入选了生

基因编辑技术是什么

基因编辑技术不断发展,到现在已发展到第三代基因编辑技术。第三代基因技术CRISPR/Cas克服了传统基因操作的周期长、效率低、应用窄等缺点。作为一种最新涌现的基因组编辑工具,CRISPR/Cas能够完成RNA导向的DNA识别以及编辑。通过一段序列特异性向导RNA分子(sequence- specif

中科院李劲松团队等筛选小鼠骨发育中的关键基因

  大规模隐性遗传筛查是一种用于鉴定生物过程基因的有效方法。这种策略在低等生物中已经成功,如酵母(酿酒酵母)和线虫(秀丽隐杆线虫)。在哺乳动物生物中,由于它们的二倍体基因组,这种功能筛选具有挑战性。RNA干扰(RNAi)目前用于通过靶向mRNA在哺乳动物细胞中进行基因组规模的功能丧失筛选;然而,这种