青年和老年人结肠上皮的比较蛋白质组学研究
摘要 衰老的大肠上皮不仅多种生理功能下降,而且对大肠癌在内的多种衰老相关的肠道疾病易感性显著增加,但结肠上皮衰老及衰老的结肠上皮对癌症易感的分子机制仍然不清楚. 为此,应用双向凝胶电泳(2-DE)技术分离青年人及老年人的正常结肠上皮的总蛋白质,图像分析识别差异表达的蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对差异表达的蛋白质点进行鉴定, 免疫组化和实时定量(real-time quantitative) PCR 检测部分差异蛋白,在青年人和老年人结肠上皮中的表达水平.得到了分辨率较高、重复性较好的青年人和老年人结肠上皮的2-DE 图谱,质谱分析鉴定了17 个结肠上皮衰老相关的蛋白质,免疫组化和real-time quantitative RT-PCR 证实了部分差异蛋白质的表达水平. 研究结果提示,线粒体功能受伤、抗氧化能力下降是结肠上皮衰老的重要原因,4 个差异蛋白质即guanine nucleot......阅读全文
质谱和蛋白质组学:击中目标
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008) 作者:Nathan Blow 分析测试百科 译 近年来,质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度,使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面,更从容地面对挑战。 在2008年6月的美国质谱大会(ASMS)
蛋白质免疫印迹实验
实验步骤 操作流程(1)制备与凝胶大小一致的硝酸纤维素膜一张,吸水滤纸 2 张 (Whatman 3 MM)。(2) 将凝胶在转印缓冲液中浸泡 30m in,将转移膜、滤纸和海绵垫也在同样的缓冲液浸湿。(3) 安装转印「夹心三明治」。将凝胶放置在玻璃平板上,然后将一张浸湿的滤纸放在凝胶上,如
蛋白质免疫印迹实验
蛋白质免疫印迹实验 实验步骤 操作流程 (1)制备与凝胶大小一致的硝酸纤维素膜一张,吸水滤纸 2 张
蛋白质免疫印迹技术
实验概要免疫印迹是利用聚丙烯酰胺凝胶电泳来检测样品或提取物中某种特定蛋白的方法。聚丙烯酰胺凝胶紧贴着膜放置,在电流的作用下蛋白质从凝胶迁移到膜上并且被固定,常用的膜是硝酸纤维素或 PVDF(聚偏乙烯氟化物)。膜是凝胶蛋白质的复制品,然后可以与抗体结合后进行染色。实验步骤1. 样品准备1) 抽
蛋白质免疫印迹实验
这是一个建立在 B urnette 实验方案基础上的实验流程,小于 80k D a 的蛋白质的转移效果很好并且结果稳定, 重复性好。应用这种膜转移方法,我们利用多克隆抗体在下面的样本中检测目的蛋白:哺乳动物细胞和细菌溶解产物、细胞培养上清、组织提取物以及组织液。虽然下列实验条件是根据我们自己的实验需
手足口病易感性免疫机理研究获突破
中科院上海巴斯德研究所科研人员在手足口病易感性免疫机理研究中获得重要突破,相关研究成果近日在线发表于《公共科学图书馆—病原体》。 手足口病是由EV71等多种肠道病毒感染而导致的传染病,感染人群主要为5岁以下的儿童。自2008年手足口病在我国暴发以来,已经成为我国每年感染人数最多的第一大传染病
2025蛋白质组学大会之非质谱蛋白质组学专场
2025年10月14日上午10点10分,第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会暨π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“非质谱蛋白质组学” (Proteomics Beyond Mass Spectrometry) 分会场于广州白云国际会议中心岭南B厅拉开序幕。
华盈视角:蛋白质组学——质谱技术
蛋白质作为功能的直接执行者,在生物医学领域中有着重要意义,检测蛋白质表达、修饰、互作等有助于我们理解生命机体的各类机制和活动规律,为疾病的治疗、诊断,药物的开发、优化等提供有力的支持。质谱技术作为检测蛋白质组学的主流技术,有必要了解其核心原理,才能更好的服务于科学问题的解决。1.质谱的原理: 质谱是
Orbitrap质谱蛋白质组沙龙在京举行
【导语】使用质谱仪器进行蛋白质组研究中有三个关键环节,第一个是样品的处理阶段,这是最简单,也是最重要的一个步骤。第二个阶段是仪器的操作部分,使用液相、质谱等仪器把蛋白质进行分离、分析。主要涉及仪器参数的优化调整。第三步是生物信息学分析部分,这也是最难的部分。本期沙龙中中科院生物物理所的
蛋白质免疫印迹(Western-Blot,WB-)——Western印迹法
实验材料蛋白质样品试剂、试剂盒裂解液PBSG 250考马斯亮蓝溶液NaClSDS上样缓冲液电泳缓冲液转移缓冲液丽春红染液封闭液TBSTTBS洗脱抗体缓冲液显影液定影液抗体化学发光试剂仪器、耗材高压锅玻璃匀浆器高速离心机分光光度仪-20℃低温冰箱垂直板电泳转移装置恒温水浴摇床多用脱色摇床实验步骤一、操
定量蛋白质组学质谱采集技术进展(一)
摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋
定量蛋白质组学质谱采集技术进展(四)
无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决
蛋白质组质谱新方法一览
2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动
定量蛋白质组学质谱采集技术进展(三)
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有
定量蛋白质组学质谱采集技术进展(二)
同步母离子选择(Synchronous precursor selection, SPS)技术的出现彻底解决了MS3 响应弱的问题。SPS 技术利用多频切迹的选择波形电压(MultiNotch) [27] ,在线性离子阱中实现一次选择同时获得多个离子,最多可同时选择15 个(图2A)。利用这一原理,
关于诺瓦克病毒的免疫保护与宿主易感性的介绍
一项志愿者人体试验研究表明,诺如病毒的免疫保护力可持续6-24个月,即使先前感染过诺如病毒,同一个体仍可重复感染同一毒株或不同毒株的诺如病毒 [11] 。 部分人群即使暴露于大剂量诺如病毒仍不会感染,这可能与先天宿主因素和后天获得性免疫有关。组织血型抗原(HBGAs)包括H型、ABO血型和Le
蛋白质免疫印迹(Western-Blot-)(二)
二、蛋白样品制备 1. 单层贴壁细胞总蛋白的提取 (1) 倒掉培养液,并将瓶倒扣在吸水纸上使吸水纸吸干培养液(或将瓶直立放置一会儿使残余培养液流到瓶底然后再用移液器将其吸走)。 (2) 每瓶细胞加3 ml 4℃预冷的PBS(0.01M pH7.2~7.3)。平放轻轻摇动1 min洗涤细胞,然后弃
蛋白质免疫印迹(Western-Blot,WB-)
实验方法原理 Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测的方法。对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。与Southern或Northern杂交方法类似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺
蛋白质免疫印迹(Western-Blot-)(一)
蛋白质免疫印迹(Western Blot )可以:(1)从蛋白质混合物中检出目标蛋白质;(2)定量或定性确定细胞或组织中蛋白质的表达情况;(3)用于蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA、蛋白质-RNA相互作用后续分析。实验方法底物化学发光ECL法Western印迹法图解实验方法原理Western免疫印迹(
蛋白质免疫印迹(Western-Blot,WB-)
蛋白质免疫印迹(Western Blot ) 可以:(1)从蛋白质混合物中检出目标蛋白质;(2)定量或定性确定细胞或组织中蛋白质的表达情况;(3)用于蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA、蛋白质-RNA相互作用后续分析。实验方法原理: Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋白
蛋白质免疫印迹(Western-Blot-)(三)
四、SDS-PAGE电泳 1. 清洗玻璃板 一只手扣紧玻璃板,另一只手蘸点洗衣粉轻轻擦洗。两面都擦洗过后用自来水冲,再用蒸馏水冲洗干净后立在筐里晾干。 2. 灌胶与上样 (1)玻璃板对齐后放入夹中卡紧。然后垂直卡在架子上准备灌胶。(操作时要使两玻璃对齐,以免漏胶。) (2)按前面方法配10%分离
蛋白质免疫印迹(Western-Blot,WB-)
实验方法原理 Western免疫印迹,是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测的方法。对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。 与Southern或Northern杂交方法类似,但We
《自然》子刊专题:蛋白质组学中的质谱
涉及到蛋白质组学分析的研究人员都知道蛋白质组学研究的技术路线有两条,一条是以双向电泳加生物质谱的方法鉴定生物体系中各种蛋白的表达谱以及各蛋白表达程度的相对变化,另一条路线就是多维色谱与生物质谱相结合的称之为鸟枪法的技术路线。其中质谱分析技术(Mass spectrometry,MS)是蛋白质组学常用
质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法
2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动
浅析肺癌治疗的潜在靶点水通道蛋白4(AQP4)
肺癌是一种危害性较大的恶性肿瘤之一,探讨肺癌的发病机制、寻找抗肿瘤治疗新靶点是当前肺癌治疗研究的热点和难点。研究发现水通道蛋白4(AQP4)在肺癌细胞中呈高表达,而且敲降AQP4可明显降低肺癌细胞迁移能力。作为一种广泛用于蛋白检测和分析的技术,Western印迹分析可以检测细胞或者提取物中的蛋白
表观遗传学和人类疾病
上个世纪50年代初,Watson和Crick建立了DNA分子结构模型,极大程度地促进了生命科学的发展。自此遗传学便成为现代医学研究领域中一个重要的分支。人类已经认识到基因突变可以导致疾病的发生,如慢性进行性舞蹈病(Huntington's chorea, Hc)和囊性纤维化等。近年来
昆明动物所揭示线粒体DNA种系突变对肿瘤易感性的影响
线粒体DNA(mtDNA)在肿瘤发生发展中的作用多年来备受关注。前期研究揭示,大部分肿瘤细胞mtDNA体细胞突变很可能都是由于其线粒体氧化磷酸化功能限制降低而产生的副产品。而mtDNA种系突变不仅存在于肿瘤组织,同样也存在于正常组织中。但是目前仍不清楚肿瘤细胞mtDNA种系突变是否和体细胞突变的
蛋白质质谱测序
蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目,不一定要用到质谱技术简单说,蛋白质测序的方法有很多,一般是在构建完成后,通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。而质谱检测一般是用在蛋白质表达纯化完成后,用来鉴定是否是最初设计的那个蛋白。
上海巴斯德所手足口病易感性免疫机理研究取得突破
1月23日,传染病领域国际学术期刊PLoS Pathogens 在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所冷启彬课题组的研究论文:TLR3 Signaling in Macrophages Is Indispensable for the Protective Immunity of Invarian