郭天南:全景式组学研究为新冠重症早诊断提供决策依据

分析测试百科网讯 在新冠肺炎COVID-19疫情肆虐全球之际,PCR技术在快速筛查中已大显神威,但进入临床后如何更早地区分轻症和重症患者,从而更准确地治疗和用药?5月27日中国研究人员在《Cell》发表文章,利用蛋白质组学和代谢组学的全景式分析,发现了重症患者体内应对病毒进攻特征性的分子改变,并结合机器学习筛选出COVID-19重症患者特征性的22个蛋白质和7个代谢物,有望为临床医生提供有指导意义的诊断和治疗线索。这项研究的一位主要参与者是西湖大学生命科学学院的特聘研究员郭天南博士。分析测试百科网小编近日采访到郭天南博士,他将分享一个蛋白质组学研究者对于COVID-19及各类挑战性难题的探索,追溯蛋白质组学发展的历程,展望蛋白质组学的未来,期望为组学研究者、为正在攻克新冠病毒、肿瘤等人类科学和临床难题的读者们带来启示。西湖大学 郭天南特聘研究员《Cell》:COVID-19重症患者血清特征性分子改变 目前,临床上评估COV......阅读全文

郭天南:全景式组学研究为新冠重症早诊断提供决策依据

  分析测试百科网讯 在新冠肺炎COVID-19疫情肆虐全球之际,PCR技术在快速筛查中已大显神威,但进入临床后如何更早地区分轻症和重症患者,从而更准确地治疗和用药?5月27日中国研究人员在《Cell》发表文章,利用蛋白质组学和代谢组学的全景式分析,发现了重症患者体内应对病毒进攻特征性的分子改变,并

郭天南:藏在尿液中的新冠肺炎病情“密码”

  团队从尿液中筛选出20个蛋白质标志物并建立模型,成功实现了对轻、重型新冠肺炎患者进行分类预测。该研究表明,从新冠肺炎患者尿液中获取的蛋白分子可以灵敏地反映机体的病理状态。  近日,西湖大学生命科学学院郭天南实验室与合作团队在《细胞》子刊《细胞报告》发表最新研究成果:联合团队从尿液中筛选出20个蛋

一文读懂|西湖大学郭天南:多组学对新冠的研究与挑战

  编译 | 陆恬,钱丽琴  作者 | 陆恬,王瑛睿 ,郭天南  COVID-19 仍在全球肆虐,且似乎不会从地球消失。近日,西湖大学郭天南团队在 Cell Reports Medicine 发表评述,在这篇评述中,郭天南等人讨论了多组学技术在揭示 COVID-19 发病、进展和传播背后的分子机制中

西湖大学郭天南团队发现新冠患者生物标志物

  北京时间5月28日12时左右,Cell杂志在线发表了西湖大学生命科学学院蛋白质组大数据实验室同合作团队的新冠肺炎研究论文,揭示了重症患者的血清中存在多种独特的分子变化,并找出了重症患者一系列特征性的重要生物标志物,将有望为预测轻症患者向重症发展提供导向。  这是继周强实验室之后,西湖大学在新冠病

西湖大学郭天南团队发现新冠重症生物标志物

   继周强实验室之后,西湖大学生命科学学院PI郭天南带领的蛋白质组大数据实验室,近日在新冠病毒研究方面又有重要发现。   他们和合作团队一起对新冠肺炎患者血液中的蛋白质和代谢物分子进行系统检测,发现重症患者的血清中存在多种独特的分子变化,并找到了一系列生物标志物,有望为预测轻症患者向重症发展提供导

西湖大学郭天南:蛋白质组大数据和人工智能的临床应用

  高通量蛋白质组技术的进步驱动了大队列级别的临床蛋白质组研究的深度不断拓展。2020年1月10日上午,SCIEX特邀西湖大学特聘研究员郭天南进行网络讲座,为大家介绍《蛋白质组大数据和人工智能的临床应用》,将具体探讨蛋白质组大数据的方法学进展,以及其结合人工智能在医学中的应用。敬请期待!  →点击此

Cell提出一个新“组学”:蛋白质代谢小分子互动组学

  科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学(protein-metabolite interactomics)。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学,现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。  基因组学针对的是生物体基因的系统分析,而蛋

西湖实验室郭天南团队利用膨胀水凝胶助力组学分析

  蛋白质作为疾病生物标志物和药物靶点在现代生物医学中具有举足轻重的作用,蛋白质组学是分析生物体内所有蛋白质的组成与定量的有效手段。传统的蛋白质组检测的是整块组织或分离后的细胞中的蛋白表达水平,失去了空间位置信息。然而,由于组织异质性,组织中不同细胞表达的蛋白种类和数量可能存在显著性差异,获得组织空

新冠肺炎患者器官损伤背后分子层面的“面纱”逐步揭开

  科学家针对新冠病毒及致病机理的研究在持续深入,关于新冠肺炎患者器官损伤背后分子层面的“面纱”也在逐渐揭开。 北京时间1月9日,顶级学术期刊《细胞》(Cell)在线发表了由西湖大学生命科学学院和华中科技大学同济医学院附属协和医院的研究人员共同完成的一项研究,题为“Multi-organ Pro

Nature:蛋白质组学揭示新冠治疗靶标-抑制病毒复制!

  新冠肺炎已迅速在全球蔓延,对全球公共卫生造成严重威胁并对全球经济造成严重影响。目前针对新冠主要是一些支持性和对症治疗,因此迫切需要开发抑制SARS-CoV-2感染或复制的疗法。尽管SARS-CoV-2与其他冠状病毒有相似之处。但目前仍然缺乏对SARS-CoV-2感染机制的理解以及针对新冠的潜在治

尿液蛋白质组学为新冠肺炎快速诊断提供新思路

  2020年由SARS-CoV-2引起的非典型肺炎(COVID-19)对全球公共卫生造成严重威胁。在短短四个月内,在全球范围内已报告的确诊病例共379万例,死亡人数累计超27万人,并且目前仍在持续发展中,并对全球经济造成严重影响。由于目前尚无可用于高度传染性SARS-CoV-2的特效药物或疫苗,因

总裁专访-|-蛋白质组学新里程

  2020年是蛋白质组学发展关键的一年,全球新冠疫情突显了蛋白质组学在应对公共卫生危机中的临床应用。人类可以从这次新冠疫情中汲取许多经验,毫无疑问地,这些将在未来几年内影响蛋白质组学发展。近日,Technology Networks与布鲁克·道尔顿生命科学质谱执行副总裁Rohan Thakur博士

AI赋能甲状腺结节良恶性诊断-大幅提升准确率

术后检测?穿刺活检?在手术前,甲状腺结节的良性恶性难分辨。西湖大学教授郭天南团队将高通量蛋白质组学与Al技术结合,诊断准确率提高到85%以上。 9月6日,西湖大学郭天南研究员团队、李子青教授团队及临床合作者在学术期刊《细胞发现》(Cell Discovery)杂志上发表论文“Artificial

蛋白质组学牛人Cell发表病毒研究新工具

  科学家们在质谱分析的基础上,开发了一种全新的蛋白质组学技术——QTV(quantitative temporal viromics)。这一技术能够在病毒感染的过程中,对宿主和病毒蛋白的实时动态进行系统性定量分析,展现病毒与宿主的具体互作过程。这一技术发表在六月五日的Cell杂志上。  在QTV技

第二届西湖临床质谱研讨会-探讨临床蛋白质组学

  Progresses and Perspectives of Mass Spectrometry-based Clinical Proteomics  基于质谱的临床蛋白质组学的研究进展与展望联合主席:Steve Pennington 贺福初 郭天南主办单位:西湖大学 CNHUPO HUPO会议

西湖大学等绘制世界首张“新冠患者分子全景图”

  1月9日,西湖大学生命科学学院郭天南课题组与合作团队(华中科技大学同济医学院附属协和医院胡豫、夏家红、聂秀团队)在《细胞》在线发表了题为《新冠肺炎死亡患者多器官蛋白质组全景图》的论文,报道了2020年初因新冠肺炎去世的患者体内多器官组织样本中蛋白质分子病理全景图。相当于他们将医生在显微镜下看到的

新冠治疗新希望?2天新冠病毒减少5000倍!

  随着近期印度疫情再次加剧,当地大面积应用伊维菌素的消息引发关注,还有研究显示,伊维菌素能在 48 小时内将新冠病毒 RNA 减少 5000 倍。  一个不少人关心的问题:伊维菌素要成为新冠治疗的新希望吗?  伊维菌素能治新冠吗?  伊维菌素(Ivermectin)是上世纪七十年代发现的一种抗生素

直接RNA测序、串联质谱法揭示新冠转录组和蛋白质组特征

此前,南开大学高山、阮吉寿等在中国预印本ChinaXiv网站发表论文,称新冠病毒S蛋白可能存在Furin蛋白酶切位点。近日,发表在预印本网站bioRxiv上的一篇论文使用直接RNA测序和串联质谱法表明了SARS-CoV-2的转录组和蛋白质组的特征,揭示了细胞通道在去除了疑似Furin 蛋白酶切位点的

新蛋白质组学方法引领蛋白功能研究革命

人类细胞是通过成千上万个蛋白质的协同作用来控制它们生长和分化的。但是,到目前为止,大多数人类蛋白质的特定功能还不清楚。 疾病的发生常常是由于冠军细胞蛋白质功能的失常。目前,世界各地已经启动了大量大规模的研究计划以了解所有人类蛋白质的功能。 现在,来自IRCM(Instiut de recherc

天美任命原华测检测郭冰为新执行董事

  分析测试百科网讯 2015年7月2日,天美控股已经任命新的执行董事,而已达到退休年龄的徐国平先生将辞职。  郭冰,今年1月加入天美,目前是天美(大中国区)的行政总裁,他是华测检测的联合创始人及前首席执行董事,2003年起担任执行董事直到去年七月。在此之前,他与人合作创办了GREEM咨询

蛋白质组与蛋白质组学简介2

3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合,然后将DNA从被修饰的碱基处切割,电泳分离,结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰,不能切断,可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白

蛋白质组与蛋白质组学简介1

一、蛋白质组概念:一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表

华测郭冰、郭勇低调入股天美-天美或被并购

  一度闹得沸沸扬扬的华测检测(300012)董事会内部分歧,如今又有了新的剧情。两大创始股东郭冰和郭勇在淡出华测检测之后,最近低调入股了一家同处于第三方检测行业的香港上市公司天美控股(01298.HK)。  据天美控股此前发布的公告,郭冰及郭勇以每股2.4港元的价格认购了天美控股3487

利用转录组学方法揭示南荻群体遗传

  南荻是中国特有的亩产生物量最大的芒属能源植物。南荻原产于河滨地带,但其遗传变异丰富,生态适应强,移栽到黄土高原等半干旱地区后,生长良好;由于其根系较浅,种植后不会过度利用深层土壤水分,可以有效减少地表径流,有助于水土保持,发挥重要的生态修复功能。  近日,中国科学院武汉植物园闫娟博士在李建强和桑

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

蛋白质新冠疫苗-有望开启新冠免疫新时代

与mRNA和病毒载体新冠疫苗属于新兴事物不同,蛋白质疫苗可谓人类的老朋友了。数十年来,蛋白质疫苗一直被用于保护人们免受肝炎、带状疱疹和其他病毒感染。图片来源:视觉中国  对于渴望接种新冠疫苗的部分人员来说,由于容易出现急性免疫反应和血液循环问题,他们对一些基于信使RNA(mRNA)和病毒载体技术的疫

当蛋白质组遇上AI,加速的是什么

临床质谱局部图  西湖欧米供图使用压力循环技术处理微量组织样品。  西湖欧米供图西湖欧米愿景图  西湖欧米供图一个普通人做一次血液全蛋白质组的质谱检测,能获得哪些有意义或有趣的信息?谁会成为蛋白组领域的23andMe(DNA鉴定公司)?去年7月人类蛋白质组98.5%的蛋白质结构被AlphaFold破

蛋白质组学研究技术

可以说,蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基(20/ 4), 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰,如磷酸化和糖基化等,给分离和分析蛋白质带来很多困难。此外,

蛋白质组学+AI技术

人们在吞咽的时候,颈部有个器官会随着吞咽动作上下活动,它就是甲状腺。西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目,就是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。甲状腺很小,但它影响到五脏六腑。数据显示,每5个成年人中就可能有1人患有甲状腺结节。其中,约60%的甲状腺结节都是良性的。但有10%的结节是恶性的,