开发出精氨酸二甲基化蛋白质组分析新方法
近日,中科院大连化学物理研究所研究员叶明亮团队和上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员刘聪团队合作,将硼酸化学引入到甲基化蛋白质组分析方法中,并巧妙利用了精氨酸残基上不同修饰基团的位阻差异,实现了高效的精氨酸二甲基化肽段富集,显著提高了蛋白质甲基化的分析能力。利用此新方法,团队系统分析了蛋白质分相过程中精氨酸二甲基化的变化,揭示了此类修饰的发生会降低蛋白质的分相能力。相关研究成果发表在《美国科学院院报》上。 蛋白质精氨酸甲基化是一种调控蛋白质功能的重要翻译后修饰,其与众多疾病的发生发展密切相关。研究表明,精氨酸二甲基化会影响一些神经退行性疾病相关蛋白的液—液相分离,以及相分离所驱动的无膜细胞器的产生。然而,受限于目前精氨酸二甲基化蛋白质组分析技术覆盖率不足,这类研究只聚焦于少数几个蛋白,尚未有系统性研究过精氨酸甲基化对蛋白质相分离的影响。 本研究发现,不同甲基化修饰的精氨酸残基在与邻二酮类化合物反应时,由于位阻不......阅读全文
PNAS发布人类胎盘甲基化组
甲基化是控制基因表达的关键表观遗传学修饰。加州大学Davis分校和加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员对胎盘进行研究,揭示了人类胎盘的甲基化组,文章发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。他们发现,37%的胎盘基因组具有低甲基化区域(部分甲基化区域PMD),这与大多数人体组织不同,在大多数人体
PNAS发布人类胎盘甲基化组
甲基化是控制基因表达的关键表观遗传学修饰。加州大学Davis分校和加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员对胎盘进行研究,揭示了人类胎盘的甲基化组,文章发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。他们发现,37%的胎盘基因组具有低甲基化区域(部分甲基化区域PMD),这与大多数人体组织不同,在大多数人体
基因组DNA甲基化分析方法
早期的基因组DNA甲基化分析技术,如SssI甲基转移酶分析法、氯乙醛反应法、免疫学抗体技术等,已经不能满足现代表观遗传学研究的需求。今年来常用的基因组甲基化的方法有以下两种。1. 甲基化敏感扩增多态性实验甲基化敏感扩增多态性实验技术被用于检测双向型真菌的DNA甲基化,它是在扩增片段长度多态性技术的基
iTRAQ蛋白质组学研究原理、优势及实验流程(二)
“那iTRAQ的原理是什么,有哪些优势?”“iTRAQ(Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)技术由美国AB SCIEX公司研发,最早于2004年美国质谱年会上被提出,是一种基于体外等重同位素标记的相对定量技术。该技术利用同
蛋白质组学发文章的四重境界(二)
译文:细胞+基因芯片+iTRAQ+WB+功能验证。遥想当初,很多老师意气风发砸钱做芯片,数据堆积如山,一脸懵逼。然而如今世风日下,基因芯片灌水发文章很难上5分,怎么将课题继续下去?其实芯片数据结合蛋白质组学可以玩出新花样,比如下面这篇:Cheng DD, Yu T, et al. MiR-542-5
植物蛋白质组学和糖基化实验(二)
刀豆球蛋白 A (ConA)- 过氧化物酶方法(根据参考文献 20 修改的方法)。( 1 ) 通过 1D 或 2D 电泳分离,并转移到硝酸纤维素膜上。( 2 ) 用 TTBS 缓冲液浸泡印迹膜 1 h。( 3 ) 将印迹膜在含有 ConA ( 25 μg/ml)的 TTBS 缓冲液中,室温下温育 2
精氨酸甲基转移酶prmt5在斑马鱼性腺发育中的功能和机制
蛋白质精氨酸甲基化是一类重要的蛋白质翻译后修饰型式,它受精氨酸甲基化转移酶基因家族的介导,在RNA加工、DNA修复、蛋白与蛋白相互作用及基因调控等方面起非常重要的作用。精氨酸甲基转移酶prmt5为该基因家族成员之一,属II型精氨酸甲基化转移酶,介导对称性精氨酸双甲基化。由于Prmt5基因在小鼠中
科学家开发出蛋白质甲基化分析新技术
近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员叶明亮团队与中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员程红团队、中国科学院上海营养与健康研究所研究员王泽峰团队、研究员李国辉团队合作,开发了一种基于代谢标记的蛋白质甲基化分析新技术,实现了蛋白质甲基化组的全景式分析。该方法不需要预先设置甲基化修饰类型,可以对多种
科学家开发出蛋白质甲基化分析新技术
近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员叶明亮团队与中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员程红团队、中国科学院上海营养与健康研究所研究员王泽峰团队、研究员李国辉团队合作,开发了一种基于代谢标记的蛋白质甲基化分析新技术,实现了蛋白质甲基化组的全景式分析。该方法不需要预先设置甲基化修饰类型,可以对
水生所精氨酸甲基转移酶prmt5在斑马鱼性腺发育中机制
蛋白质精氨酸甲基化是一类重要的蛋白质翻译后修饰型式,它受精氨酸甲基化转移酶基因家族的介导,在RNA加工、DNA修复、蛋白与蛋白相互作用及基因调控等方面起非常重要的作用。精氨酸甲基转移酶prmt5为该基因家族成员之一,属II型精氨酸甲基化转移酶,介导对称性精氨酸双甲基化。由于Prmt5基因在小鼠中
生物物理所解析线虫精氨酸对称双甲基化酶的晶体结构
线虫PRMT5晶体结构示意图,其活性单位为同源二聚体 12月5日,美国《国家科学院院刊》(PNAS) 在线发表了中科院生物物理研究所许瑞明、龚为民、刘迎芳研究组以及遗传发育所鲍时来课题组合作的最新研究成果Structural Insights into Prote
2025蛋白质组学大会之模式生物蛋白质组
2025年10月13日14:00-16:00,模式生物蛋白质组分论坛成功举办。论坛云集圣保罗大学、中国科学院昆明动物研究所、国家蛋白质科学中心(北京)、中国科学院大连化学物理研究所、湖南师范大学、东北林业大学、南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)、湖北工业大学等10余家国内外高校及科研机构的顶尖专
关于组蛋白修饰的形式介绍
在哺乳动物基因组中,组蛋白则可以有很多修饰形式.。一个核小体由两个H2A,两个H2B,两个H3,两个H4组成的八聚体和147bp缠绕在外面的DNA组成. 组成核小体的组蛋白的核心部分状态大致是均一的,游离在外的N-端则可以受到各种各样的修饰,包括组蛋白末端的乙酰化,甲基化,磷酸化,泛素化,ADP
蛋白质组学研讨会(第二轮通知)
蛋白质组学技术已广泛应用于科学研究的各个领域,尤其在生命科学研究方面正在发挥着越来越重要的作用。为了给关心蛋白质组学进展的科研人员提供一个交流的平台,展现不同领域优秀科学家的最新科研成果和质谱技术的最新进展,促进不同学科和各科研单位间的深入交流,中国医学科学院基础医学研究所发起并举办蛋
甲基化的基因组直接测序法
基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解
在基因组范围定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定,但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来,科学家们开发出多种新方法,试图在基因组范围定位DNA甲基化。 尽管从理论上来说,全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组,但它还是面临技
表观遗传之DNA甲基化(二)
二 DNA甲基化 DNA甲基化:DNA甲基化是通过DNA甲基转移酶在胞嘧啶环的第5个碳原子上共价加成甲基而产生的,从而产生5-甲基胞嘧啶(5-mC),在体细胞中,几乎仅在二核苷酸CpG的对称甲基化配对中发现了5-mC,而在胚胎干(ES)细胞中,在非CpG中也观察到了大量的5-mC。5-mC作为表型和
2025蛋白质组学大会之蛋白质组学新技术
2025年10月13日上午,蛋白质组学新技术(Emerging proteomics technologies)专题分论坛顺利召开。本场会议由本领域学者陆豪杰教授、王初教授、谭敏佳教授、秦伟捷教授和Yasushi Ishihama教授共同召集和组织。来自海内外的多位知名学者围绕该领域的前沿进展,分享
单细胞测序新技术:同时分析转录组和甲基化组
单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而,在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。这是因为细胞之间存在较大的差异,又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组。加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授领导团队解决了这个问题。他们在Genome Biology杂志上发
蛋白质组服务介绍
基因是生物体的基本遗传单位。然而,基因本身并不能直接行使功能,其功能的发挥最终需要通过表达出的蛋白质体现出来。蛋白质是细胞所有功能的主要执行者,其功能的发挥决定了人体健康与疾病的各种状态。蛋白质组是在宏观的角度全面、系统地解析蛋白质状态与功能的科学,是“后基因组”时代的核心研究内容。蛋白质组是比基因
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE,那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里,我们不考虑传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效,而是因为它们通常耗时
蛋白质组是什么
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(genOME),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变. 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE,那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里,我们不考虑传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效,而是因为它们通常耗时、耗力,不
蛋白质组研究系统
4700 TOF/TOF蛋白质组分析系统4700TOF/TOF蛋白质组分析系统是全球第一台TOF/TOF 串联飞行质谱仪,它作为目前的最新质谱技术,它一问世即被世界各大蛋白组研究中心和著名蛋白质实验室所争相采用。它由两级TOF和高能碰撞池组成,其工作原理是离子在MALDI源中产生并被加速和聚焦;对于
蛋白质组的概念
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(Genome),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(protein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个
蛋白质组的概念
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(Genome),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(protein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个
蛋白质组是什么
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(genOME),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变. 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE,那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里,我们不考虑传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效,而是因为它们通常耗时、耗
精氨酸
性状本品为白色结晶或结晶性粉末,几乎无臭,有特殊味本品在水中易溶,在乙醇中几乎不溶;在稀盐酸中易溶。比旋度取本品,精密称定,加6mol/L盐酸溶液溶解并定量稀释制成每1ml中约含80mg的溶液,依法测定(通则0621),比旋度为+26.9°至+27.9°。鉴别(1)取本品与精氨酸对照品各适量,分别加
2025蛋白质组学大会之单细胞蛋白质组学研究
2025年10月13日上午10:10,第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会、π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Single Cell Proteomics”分论坛在广州白云国际会议中心汕头厅(Shantou Hall)成功举行。 本场论坛由浙江大学方群