研究揭示异常剪切体蛋白结构

上海交通大学医学院附属第九人民医院沈键锋团队与上海交通大学网络信息中心交我算团队合作于Nature子刊Scientific Data上发表了题为“Structure prediction of novel isoforms from uveal melanoma by AlphaFold”的研究论文,首次全面系统地预测了葡萄膜黑色素瘤中高频异常剪切异构体的蛋白结构,为后续识别癌症新抗原及潜在治疗新靶点等多种类型的研究奠定了基础。葡萄膜黑色素瘤(Uveal Melanoma,UM)是成人最常见的眼内恶性原发性肿瘤,其恶性程度高,严重威胁患者生命。特定的可变剪切异构体与包括葡萄膜黑色素瘤在内的多种肿瘤发生有关。混合测序策略是以三代测序数据作为基础和重点,将三代测序长读段与高质量二代测序短读段数据结合在一起,充分利用两个技术平台的优势,是目前全局精准检测可变剪切事件的高效办法之一。尽管在研究不同异构体的选择性剪切机制和功能方面付出了巨......阅读全文

扩展蛋白的结构

  其氨基末端为约 2 2个氨基酸编码的信号肽,进入分泌途径后被剪切, 使扩张蛋白成为成熟肽 。该蛋白碳末端假定的结合 区域 ( 约10kDa ) 含有一系列保守的色氨酸残基 ( w) , 这些色氨酸残基有一定的间隔,很像纤维酶 的纤维素结合区域。中间区域 ( 1 5 k Da ) 被认为是重要的催

糖蛋白的结构

  糖蛋白中的糖链变化较大,含有丰富的结构信息。寡糖链往往是受体、酶类的识别位点。  1、 N-糖苷键型(N-连接)  N-糖苷键型主要有三类寡糖链:  ① 高甘露糖型,由GlcNAc和甘露糖组成;  ② 复合型:除了GlcNAc和甘露糖外、还有果糖、半乳糖、唾液酸;  ③ 杂合型,包含①和②的特征

α角蛋白的结构

  α-角蛋白主要是由α-螺旋构象的多肽链构成的,并与角蛋白的长向平行,即其氨基酸序列分为富含α螺旋的中央棒状区和两侧的非螺旋区域。其立体构造是α-螺旋的典型实例,几何表示为:两股右手α-螺旋向左缠绕,拧成一根称为原纤维的结构,直径为2nm,这就是aa组合的超二级结构。原纤维再排列成“9+2”的电缆

简述黏蛋白的蛋白质结构

  成熟黏蛋白是由两个不同的区域:  氨基和羧基末端区域被轻度糖基化,且富含半胱氨酸。半胱氨酸残基参与建立二硫内和黏蛋白单体之间的联系。  的10〜80残基序列的多个串联重复序列,其中多达一半的形成的大的中央区域的氨基酸是丝氨酸或苏氨酸。这个区域被与数百饱和O-连接的寡糖。N-连接寡糖中也发现对粘蛋

关于骨桥蛋白的蛋白结构的介绍

  OPN作为带负电的非胶原性骨基质糖蛋白,广泛的分布于多种组织和细胞中,其相对分子质量约为44 kDa,约含300 个氨基酸残基,其中天冬氨酸、丝氨酸和谷氨酸残基占有很高的比例,约占总氨基酸量的一半。骨桥蛋白多肽链的二级结构中包括8个α螺旋和6个β折叠结构,高度保守的RGD基元两端各有一个β折叠结

瘦蛋白的结构特点

瘦蛋白(leptin; OB protein)又称OB蛋白。系肥胖基因(obese gene)在脂肪细胞内的表达产物。分子量16 000,含167个氨基酸残基的单链蛋白质分子、具有高度亲水性,在N端含有分泌信号肽。

Cell:蛋白固有结构失序

  许多蛋白(固有无序蛋白,IDPs)或蛋白区域(固有无序蛋白区域:IDRs)缺乏明确的生理条件三维结构,这些蛋白虽然未折叠,且高度动态化,但是其本身并没有变性,相反蛋白的固有结构失序就是其天然功能状态。   作为一类缺乏稳定结构的特殊蛋白质,固有无序蛋白在生命活动中行使重要的生物学功能,与人类重大

波形蛋白的结构

波形蛋白单体,与所有其他中间丝一样,具有一个中心α-螺旋结构域,其末端由非螺旋氨基(头部)和羧基(尾部)结构域覆盖。两种单体可能以促进它们形成卷曲螺旋二聚体的方式共翻译表达,这是波形蛋白组装的基本亚基。α-螺旋序列包含有助于在螺旋表面形成“疏水密封”的疏水氨基酸模式。此外,酸性和碱性氨基酸呈周期性分

微管蛋白的结构特点

是一种球蛋白,是细胞内微管的基本结构单位。它是由两个蛋白质分子,即α-、β-微管蛋白分子聚合而成的异二聚体;每个这样的二聚体又与两个核苷酸分子相结合,一个属紧密结合,另一个为疏松结合,而且可以快速交换。分子量12万,沉降系数6s。微管蛋白有两个尺寸相等而结构不同的亚基(α和β)。其亚基分子量为5.5

Ras蛋白的结构特点

Ras蛋白为膜结合型的GTP/GDP结合蛋白,相对分子质量为2.1万,定位于细胞膜内侧.它由188或189个氨基酸组成,它的第一个结构域为含有85个氨基酸残基的高度保守序列,接下来含有80个氨基酸残基的结构域中,Ras蛋白结构轻微不同,除了K2Ras末端25个氨基酸由于不同的外显子而分为A型和B型外

简述脂蛋白的结构

  脂蛋白中的蛋白部分称为载脂蛋白(Apo)。载脂蛋白在脂蛋白代谢中具有重要的生理功能。Apo是用ABC命名法,当前已经发现很多种类,一般分为5~7类,主要测定其ApoAI,ApoB两种。   ApoAI主要由肝脏合成,小肠也可合成,它是高密度脂蛋白胆固醇(HDL-CHOL)的主要结构蛋白,占HD

骨桥蛋白的基因结构

  OPN人的OPN基因定位在染色体4q13,是单一编码基因,8kb大小,具有7个外显子和6个内含子组成。小鼠位于5号染色体上,基因长约7Kb,包括7个外显子,其5’端有启动子序列,该启动子中IKb长度也被测序并用GCG程序分析了转录因子的可能识别部位,这些转录因子包括API-5、PEA-3、PEA

微管蛋白的结构特点

tubulin组成微管的蛋白质称为微管蛋白。微管蛋白是球形分子,有两种类型:α微管蛋白(α-tubulin)和β微管蛋白(β-tubulin),这两种微管蛋白约占微管蛋白总量的80%~95%,具有相似的三维结构,能够紧密地结合成二聚体,作为微管组装的亚基。α亚基由450个氨基酸组成,β亚基是由455

Ras蛋白的结构特点

Ras是大鼠肉瘤(rat sarcoma,Ras)的英文缩写。Ras蛋白是原癌基因 c—ras的表达产物,相对分子质量为21kDa。

胶原蛋白的基本结构

其基本结构为三股胶原蛋白多肽链相互缠绕形成的三螺旋结构,直径为1.5nm。部分类型的胶原蛋白三螺旋可组合成相互平行的有序多聚体,称为胶原蛋白纤丝(collagen fibril),其直径在10-300nm,长度可达几μm。胶原蛋白纤丝可以进一步组装成直径为0.5-3μm、长度为上百μm的胶原蛋白纤维

载脂蛋白基因结构

  载脂蛋白基因的分离是通过用相应的cDNA作为探针筛选基因文库而完成的。比较基因的核苷酸序列与cDNA的核苷酸序列得以鉴定基因的内含子与外显子数目以及它们的分界线。大部分真核细胞的基因含有内含子,内含子不编码氨基酸,但有些内含子参与基因表达的调控。外显子通常占据基因内的三个区域:第一个区域不编码氨

肌动蛋白的结构

肌动蛋白的氨基酸序列是最高度保守的蛋白质之一,因为它在进化过程中几乎没有变化,在藻类和人类等不同物种中的差异不超过20%。因此,它被认为具有优化的结构。它有两个显着特征:它是一种缓慢水解ATP的酶,ATP是生物过程的“通用能量货币”。然而,需要ATP以保持其结构完整性。其高效的结构是由几乎xxx的折

酶蛋白的结构特点

酶蛋白具有一般蛋白质的物理化学性质,由20种天然氨基酸构成的生物大分子化合物,是由氨基酸以肽健(酰胺健)聚合成的肽链,一个蛋白质分子可能由一条肽链构成,也可能由几条肽链构成。在蛋白质肽链上的氨基酸残基按严格确定的顺序排列,它的侧链可以是各种天然氨基酸,不是单一氨基酸残基的重复。   酶蛋白是球蛋白,

肌球蛋白的结构

肌球蛋白是长形不对称分子,形状如“Y”字,长约160nm。电子显微镜下观察到它含有两条完全相同的长肽链和两对短肽链,组成两个球状头部和一个长杆状尾部。肌球蛋白分子量约460kD,长肽链的分子量约240kD,称重链;短链称轻链。将肌肉肌球蛋白用5,5′-二硫双(α-硝基苯甲酸,DTNB)处理后放出的一

胶原蛋白的结构功能

胶原蛋白是生物高分子,动物结缔组织中的主要成分,也是哺乳动物体内含量最多、分布最广的功能性蛋白,占蛋白质总量的25%~30%,某些生物体甚至高达80%以上。

关于蛋白质结构的结构种类概述

  蛋白质分子是由氨基酸首尾相连缩合而成的共价多肽链,但是天然蛋白质分子并不是走向随机的松散多肽链。每一种天然蛋白质都有自己特有的空间结构或称三维结构,这种三维结构通常被称为蛋白质的构象,即蛋白质的结构。  蛋白质的分子结构可划分为四级,以描述其不同的方面:  一级结构:组成蛋白质多肽链的线性氨基酸

关于蛋白质结构的结构测定介绍

  专门存储蛋白质和核酸分子结构的蛋白质数据库中,接近90%的蛋白质结构是用X射线晶体学的方法测定的。X射线晶体学可以通过测定蛋白质分子在晶体中电子密度的空间分布,在一定分辨率下解析蛋白质中所有原子的三维坐标。大约9%的已知蛋白结构是通过核磁共振技术来测定的。该技术还可用于测定蛋白质的二级结构。除了

关于蛋白质结构的结构预测介绍

  测定蛋白质序列比测定蛋白质结构容易得多,而蛋白质结构可以给出比序列多得多的关于其功能机制的信息。因此,许多方法被用于从序列预测结构。  一、二级结构预测  二、三级结构预测  同源建模:需要有同源的蛋白三级结构为基础进行预测。  Threading法。“从头开始”(Ab initio):只需要蛋

蛋白质二维结构的结构特点

二维结构是指原子或离子集团中的原子或离子具有在空间沿二维方向的正、反向延伸作有规律排布的结构。

蛋白质三级结构的结构特点

三级结构是由一个已经具有了某些a-螺旋和/或b折叠区的多肽链折叠成一个紧密包裹的、几乎成球形的空间结构,或称为天然构象。三级结构的一个重要特点是在一级结构上离得远的氨基酸残基在三级结构中可以靠的很近,它们的侧链可以发生相互作用。二级结构是靠骨架中的酰胺和羰基之间形成的氢键维持稳定的,三级结构主要是靠

血管生成蛋白的结构特点

中文名称血管生成蛋白英文名称angiogenin定  义最初从人腺癌培养细胞中分离的一种小分子蛋白质。能使新血管在活组织中生长。健康的非癌组织也产生这种小分子蛋白质,有35%的序列与胰核糖核酸酶同源。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),激素与维生素(二级学科)

样本蛋白的结构性质

了解样本蛋白的结构性质有助于选择最合适的抗体,至少两方面因素需要考虑。待测样本蛋白的结构域:抗体是由各种不同免疫原免疫宿主而制备得来,其中的免疫原包括:全长蛋白、蛋白片断、多肽、全有机体(如:细菌)或细胞,抗体说明书一般都有免疫原的描述,如果打算检测的是蛋白片断或一种特殊的同型物或蛋白全长的某一区

弹性蛋白酶的结构

弹性硬蛋白是一种由丙氨酸、亮氨酸、异亮氨酸等非极性氨基酸残基交联而成的网状结构,它可以耐受酸碱处理,并能抵抗一般蛋白酶的消化。

蛋白质整体的结构

 蛋白质是以氨基酸为基本单位构成的生物大分子。蛋白质分子上氨基酸的序列和由此形成的立体结构构成了蛋白质结构的多样性。蛋白质具有一级、二级、三级、四级结构,蛋白质分子的结构决定了它的功能。     一级结构:蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序,以及二硫键的位置。     二级结构:蛋白质分子局区域内,多肽

波形蛋白的结构简介

  一个波形蛋白单体,与其他中间丝相似,有着一个中央α螺旋结构域,在前端盖著一个非螺旋的胺基,及于末端盖著一个羧基。两个单体会互相扭曲,形成一个卷曲螺管形状的二聚物。两个二聚物会进一步形成一个四聚物,再与其他四聚物相连成为一片。  α螺旋序列包含一组疏水的氨基酸,这组氨基酸在螺旋表面形成一层“疏水性