790万元成交！这家公司中标北京神外所质谱仪采购项目
北京市神经外科研究所神外所4D高通量高深度蛋白质组学平台建设项目-3质谱仪采购项目公开招标，预算金额790万元，现北京融京科技发展有限公司中标，详细内容如下：公告信息：采购项目名称神外所4D高通量高深度蛋白质组学平台建设项目-3质谱仪采购项目品目货物/专用设备/医疗设备/其他医疗设备采购单位北京市神经外科研究所行政区域北京市公告时间2023年09月22日 11:20预算金额￥790.000000万元（人民币）联系人及联系方式：项目联系人臧妍、梁潇项目联系电话010-85343428采购单位北京市神经外科研究所采购单位地址北京市丰台区南四环西路119号采购单位联系方式李老师 010-59976728代理机构名称北京国际贸易有限公司代理机构地址北京市朝阳区建国门外大街甲3号代理机构联系方式臧妍、梁潇 010-85343428 一、项目信息 采购人：北京市神经外科研究所 项目名称：神外所4D高通量高深度蛋白质组学平台建设项目-3......阅读全文
蛋白质组学之逆袭，深度注释基因组
申请课题缺创新点？撰写论文没思路？急着毕业时间紧？别怕，对于吉凯，一切都是套路！更有甚者，对于宇宙终极难题：“屌丝如何逆袭白富美？”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。 从前，在生物学研究领域，有一个白富美叫基因组学（Genomics），她有一项强大的技能：DNA测序，凭借这项技能，她完
张玉奎院士：蛋白质组学深度覆盖
分析测试百科网讯 2016年9月23日-26日，由中国仪器仪表学会原子光谱专业委员会主办，武汉大学化学与分子科学学院承办的第四届全国原子光谱及相关技术学术会议在武汉大学召开。中科院大连化物所的张玉奎院士在闭幕当天的大会报告上作题为《蛋白质组学深度覆盖》的精彩报告。中科院大连化物所 张玉奎院士
790万！神外所4D高通量高深度蛋白质组学平台采购公告
项目概况 神外所4D高通量高深度蛋白质组学平台建设项目-3质谱仪采购项目 招标项目的潜在投标人应在北京市政府采购电子交易平台 网址：http://zbcg-bjzc.zhongcy.com/bjczj-portal-site/index.html#/home获取招标文件，并于2023-08-11
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（三）
人类尚未充分认识复杂的癌症基因组是如何转化为导致复发和死亡的驱动生物学的，将蛋白质组学与基因组学结合在一起能够让我们获得对癌症的新认识，同时提供一种有价值的资源以便科学界能够用来提出关于这些疾病的新假设，以及治疗它的手段。蛋白质基因组学终有一天会被证明是一种强大的临床工具，使得人类能够横跨癌症基因组
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（一）
申请课题缺创新点？撰写论文没思路？急着毕业时间紧？别怕，对于吉凯，一切都是套路！更有甚者，对于宇宙终极难题：“屌丝如何逆袭白富美？”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。从前，在生物学研究领域，有一个白富美叫基因组学（Genomics），她有一项强大的技能：DNA测序，凭借这项技能，她完成了对多种物
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（二）
针对一些乳腺癌亚型和携带常见突变如PIK3CA和TP53突变的肿瘤，分析结果揭示出了一些新的蛋白质标记物和信号通路。另外将一些基因中的拷贝数改变与蛋白质水平联系一起，从而鉴别出了10个新的候选调控因子。其中两个候选基因SKP1和 CETN3可能与癌基因EGFR有关联。EGFR是一种特别具有侵
布鲁克：利用CCS检测和深度学习研究4D蛋白质组学
近日，Matthias Mann教授团队和Fabian Theis教授组*共同在《Nature Communication》上发表开创性成果，标题为“Deep learning the collisional cross sections of the peptide universe from
高友鹤：尿液蛋白质组学－实现更早期的诊断
“早发现、早诊断、早治疗”是干预疾病向危重症发展的关键，是医生和患者的共同心愿。许多慢性疾病的及早治疗可以显著提高患者的生命质量，极大减轻国家、社会和个人的医疗负担，因此，探索疾病早期生物标志物具有十分重要的意义。 生物标志物是与机体生理及病理状态相关的可监测到变化的生化指标。蛋白质组学是精准
蛋白质组与蛋白质组学简介2
3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合，然后将DNA从被修饰的碱基处切割，电泳分离，结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰，不能切断，可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白
蛋白质组与蛋白质组学简介1
一、蛋白质组概念：一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表
Nature子刊实验室洞察：高通量蛋白质组学方法学综述
在后基因组时代，蛋白质组学在生物医学研究中发挥着重要作用。2022年8月，Nature子刊《Laboratory Investigation》发表了一篇高通量蛋白组的mini-review，概述了高通量蛋白质组学技术、统计和算法的进展。 蛋白质组学作为蛋白质组实验和数据分析的结合，从整
新型双压线性离子阱质谱仪给蛋白质组学带来革...（六）
图 9 四级杆 - 飞行时间质谱在两个不同二级质谱扫描速率下，对同一个二价前体离子 LVGDLDDAQVDVER 二级质谱图的比较。而 LTQ Velos 离子阱对同一前体离子检测只用了 80% 的样品量。结论：在一个复杂的蛋白质组样品中，高灵敏的检测和鉴定化合物对于了解和认知动态蛋白质学具有极其重
新型双压线性离子阱质谱仪给蛋白质组学带来革...（三）
表 3 四级杆 - 飞行时间质谱仪采集参数软件平台Proteome Discoverer搜索引擎MASCOT v 2.1数据库NCBI, April 2008最大漏切数目1前体离子容忍度离子阱数据 : 1.4 Da四级杆飞行时间质谱数据 : 40 ppm碎片容忍度离子阱数据四级杆飞行时间质谱数据 :
新型双压线性离子阱质谱仪给蛋白质组学带来革...（四）
如图 4 所示，在不同仪器之间，有很多蛋白会重复出现，即被不同仪器同时鉴定到。在 60 分钟的分离过程中， LTQ Velos 双压离子阱鉴定到了 LTQ XL 得到到蛋白数目的 88% ， LTQ Velos 双压离子阱鉴定到了 Q-TOF 得到蛋白数目的 90% ，此外，还有 570 个
新型双压线性离子阱质谱仪给蛋白质组学带来革...（五）
图 6 1ug C.elegans 蛋白胰酶酶解物在反相色谱分离的基峰图，四级杆飞行时间质谱和 LTQ Velos 线性离子阱全扫描动态范围的比较Q-TOF 扫描速率对灵敏度的影响 如图 7 所示，将 Q-TOF 扫描速率从 3Hz 升至 6Hz ，导致鉴定到肽段数目减少，这主要是因为随着 Q-TO
新型双压线性离子阱质谱仪给蛋白质组学带来革...（一）
Tonya Pekar Second, Justin Blethrow, Jae C. Schwartz, Vlad Zabrouskov, Thermo Fisher Scientific, San Jose, CA关键词：LTQ Velos 线性离子阱，蛋白质学，蛋白鉴定，肽测序、灵敏度、蛋白质
新型双压线性离子阱质谱仪给蛋白质组学带来革...（二）
实验 样品制备 C.elgans 匀浆液的可溶性部分用 pH7.8 的碳酸氢铵稀释，加入 0.1% 的 RapiGest 表面活性剂，解释用二硫苏糖醇在 100 ℃ 还原二硫键，并用碘乙酰胺对半胱氨酸烷基化。样品解释用对 K/R 特异性酶酶切 4 个小时。酶解物质酸化后存放至 -80 ℃ 。
蛋白质组，蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
蛋白质组，蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
组学发展的机遇与挑战，－－高通量成为组学研究关键因素
近年来随着新技术的不断涌现，加快了组学研究飞速发展。特别是生命科学领域，随着基因组学、转录组学、蛋白组学、代谢组学以及脂质组学技术的不断完善与进化，组学向分子水平的各个分支领域不断进化和完善，研究者更是利用组学研究思路和手段，不断推进衍生出了食品组学，金属组学等新型组学研究方向，从而引领大组学研究不
葛瑛：光解表面活性剂助力高通量蛋白质组学
2020年2月25日，继2019年在Nature Method [1]上发表文章后，威斯康星大学麦迪逊分校的细胞和再生生物学和化学系教授葛瑛(Ying Ge,相关链接：葛瑛教授研究团队)团队在 Angewandte Chemie Int Ed（2018 影响因子 12.257）上再次发表文章 [
蛋白质组学研究技术
可以说，蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否，很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基（20/ 4）， 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰，如磷酸化和糖基化等，给分离和分析蛋白质带来很多困难。此外，
蛋白质组学+AI技术
人们在吞咽的时候，颈部有个器官会随着吞咽动作上下活动，它就是甲状腺。西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目，就是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。甲状腺很小，但它影响到五脏六腑。数据显示，每5个成年人中就可能有1人患有甲状腺结节。其中，约60%的甲状腺结节都是良性的。但有10%的结节是恶性的，
什么是蛋白质组学
这个概念最早是在1995年提出的，它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前，在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的
什么是蛋白质组学
(Marc Wilkins（1994))A study of proteome using the technologies of large-scale protein separation, identification and quantitation.The study of protein
什么是蛋白质组学
这个概念最早是在1995年提出的，它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前，在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的
什么是蛋白质组学
这个概念最早是在1995年提出的，它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前，在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的
Bruker新型IMPACT－HD质谱仪引起轰动的蛋白质组学研究新成果
布鲁克IMPACT HD树立了蛋白质组鉴别的新基准，实现超过8000个全蛋白分析，具备破纪录的复杂生物样品中痕量物质鉴定的分析能力 2013年6月10日——在Minneapolis会议中心召开的第61届ASMS会议上，布鲁克推出蛋白质组学和生物标志物研究中令人振奋的全新高精度质谱仪。ZL低噪声
Aebersold研究组发布用于全蛋白质组的高通量定量方法
瑞士苏黎世联邦理工学院的研究人员领导的一个研究小组，已制定了一个质谱工作流，用于对整个蛋白质组进行高通量的绝对定量。 据ETH的研究者、该研究的领头人Ruedi Aebersold说，对于多种形态，该技术实现了目标蛋白质组的重现性定量，提供用于
PlantScreen高通量表型组学平台研究叶片衰老
韩国大邱基础科学研究所Jeongsik Kim、Pyung Ok Lim等，利用PlantScreen大型高通量表型组学研究平台，对植物叶片衰老进行了系列研究（参见论文：Jae IL Lyu etc. 2017. High-throughput and computational study