本周要闻：Centogene、ARUP实验室、OxfordNanopore、GenTegra等新动向
Centogene本周表示，已完成与Lifera（沙特阿拉伯公共投资基金（PIF）全资拥有的生物制药公司）组建合资企业的计划。这项交易最初于六月宣布。这家位于利雅得的合资企业将命名为Lifera Omics，旨在增加沙特阿拉伯和海湾合作委员会国家患者获取基因组和多组学检测的机会。根据协议的条款，Lifera将拥有合资企业80％的股权，Centogene将拥有20％。根据向美国证券交易委员会提交的文件，Centogene还向合资企业授予了在沙特阿拉伯王国范围内的特定专有技术、专利和数据的独家许可。Centogene有资格获得与绩效相关的里程碑支付，包括1,000万美元的合资企业前期里程碑支付，以及自JV成立六周年起至2033年合资企业净收入的低个位数的版税。两家公司将在Lifera Omics董事会上各有代表，两名Lifera代表将加入Centogene的监事会。正如之前报道的那样，Lifera还以可转换贷款的形式向Centoge......阅读全文
Nature发布单细胞基因组学新技术
胚胎是如何形成我们肺脏、肌肉、神经和其他组织中的细胞的?一种新的方法可以解码使得胚胎万能细胞能够增殖并转变为机体许多特化细胞类型的遗传指令。 一开始是一团相同的细胞，随着增殖不断地改变形状和功能，最终变为我们肺脏、肌肉、神经和机体所有其他特化组织中的细胞。胚胎拥有这种创造奇迹的能力。
基因组学推动生命科学大步向前
2010年下旬，河南安阳曹操墓真伪之辩正酣。而一则来自上海的重磅消息更是引发了多方关注。复旦大学现代人类学教育部重点实验室宣布，向全国征集曹姓男性DNA样本，拟用基因组科学的手段验证出土的头骨是否为曹操本人。 一下子，基因组科学成为热门，这一话题“落入寻常百姓家”。 事实上，伴随着2
Neogen农业基因组学解决方案（三）
猪的基因组学解决方案GeneSeek 的猪基因组学解决方案为窥探猪的遗传结构打开了一个重要的窗口，包括是否易感染治疗昂贵的疾病以及繁殖中对想要性状的锁定。GeneSeek猪全基因组低密度微珠芯片该微珠芯片提供约 10,000个 SNP，包括经常使用的 USDA血统和身份 SNP、用于识别品种的 SN
Nature发布比较基因组学研究重要发现
来自杜克大学医学院、Brigham妇女医院和哈佛医学院的研究人员，发现了一个机制可以解释：一些遗传突变在一种基因组中会致病，而在另一种基因组中则为良性的原因。 在发表于6月29日《自然》（Nature）杂志上的研究论文中，研究人员比较了成千上万的人类致病突变与大约100个动物物种的相似序列。
－【Cell综述】从癌症基因组到精准肿瘤学
迅速发展的基因组技术让有限的肿瘤活检材料获得更广泛的分子分析,从而促进更广泛地实施个性化癌症治疗。以基因组为基础通过不同肿瘤的患者分类化目前还不太可能取代在解决临床需要时对组织来源的考虑，包括开发和实施新的合理目标的肿瘤疗法。 1是否要再分类 在本综述的讨论中考虑以基因组为基础的病人分类,要
基因组学将如何进入日常医学？
随着大规模的DNA结果越来越多的可供病人和保健提供者使用，医学界在酝酿着一次平静的转换。在一连串的数据当中，医生、顾问和家庭正在梳理如何更好地理解这些信息，并将其用于医疗决策的制定。 最近，在两大儿科医院举行的临床遗传学会议上，来自多家机构的专家提出了他们对于“基因组整合到临床实践”的第一份建
家犬基因组学研究获新进展
科学界对于家犬的起源和驯化一直争议不断。近日，中科院院士张亚平带领团队发现，家犬中亚起源的假说与基于全基因组重测序数据分析的家犬东亚南部起源模式相冲突。相关成果日前在线发表于美国《国家科学院院刊》。 2015年，美国学者Shannon等人通过分析大量的家犬群体全基因组DNA芯片数据，提出了家犬
Illumina传奇（二）：基因组学领域的巨无霸
Illumina的圣地亚哥总部与硅谷的科技园有些相似。走廊上非常明亮，即使是雾天也不例外，空间宽敞可以供员工们工作、喝咖啡和自助用餐，不过食物并不是免费的，这在一定程度上证明了资源被有效利用。高层管理人员与其他人一起在隔间工作，没有专门的办公室。在deSouza担任CEO的第一周，他将行政楼层的隔间
协同创新驱动农业基因组学发展
“作为生物技术领域最基础的学科，农业基因组学研究不仅需要国内外科学家同行的协同创新，更需要与生物技术产业发展需求无缝衔接，才能发挥出农业基因组学的最大潜能。基于这种认识，在国家农业科技创新联盟的框架下，建立农业基因组学的协同创新联盟就显得十分迫切。”中国农科院科技局局长梅旭荣表示。 7月24
研究指出基因组学引领生物育种变革
记者从近日举行的第五届国际农业基因组会议暨深圳国际食品谷研讨会上获悉，现代农业研究已迈入生物组学大数据时代，特别是基因组学及其衍生技术在生物育种中发挥着重要的引领作用。 基因组学是对生物体所有基因进行集体表征、定量研究及不同基因组比较研究的一门交叉生物学学科。基因组学主要研究基因组的结构、功能
安捷伦科技发布基因组学站式网站
2010年4月19日，北京 – 安捷伦科技公司(NYSE：A)日前发布了一个全新的的动态基因组学网站，genomics.agilent.com。 此网站将是所有基因组学资源的一站式供应点。用户可在其中找到众多组织有序、易于查找的信息，从最新的科学进展到最热门的产品一应俱全。此网站以一体化网
遗传学大牛Science发现基因组新奥秘
来自斯坦福大学，霍德华休斯医学院的一组研究人员发现，当基因组中相似的基因不断“弹出来”的时候，通常这些基因会丢失，但如果能被留下来（也就成为了多余基因），就会由于一个基因发生一次表达消减这一理论，而在哺乳动物中受到保护。 这一研究成果公布在5月20日的Science杂志上。文章的通讯作者是斯坦
美国推动基因组学转向临床医学
美国政府将用数亿美元积极推动基因组学向临床医学的转化，探索基因组学的新前沿。12月6日，国立卫生研究院（NIH）所属国家人类基因组研究所宣布一项为期4年、资助经费4.16亿美元的新计划经费实施方案，促进该所旗舰项目“大规模基因组测序计划”。该项目致力于探索罕见遗传疾病的起因、加速基因组
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染
肠道宏基因组学及代谢组学标志物或可诊断早期结直肠癌
在大多数散发性结直肠癌病例中，肿瘤的发生是一个多阶段的过程，包括基因组的改变和形态学的改变。近年来，越来越多的证据显示，人类肠道微生物组与结直肠癌的发生具有一定的关联，更多的科学研究试图从粪便中分析肠道菌群的特点，以期找到有关肠道微生物与结直肠癌的线索。今年4月，两个科学团队在Nature Me
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
蛋白组学应用前沿：肝脏疾病研究进入后基因组时代
蛋白组学应用前沿：肝脏疾病研究进入后基因组时代
基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展
2014年1月，中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组，与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究，发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
国内首个乙肝病毒前基因组RNA检测试剂盒上市
专项启动会合影。（北医供图） 近日，国内首个血清乙型肝炎病毒前基因组RNA荧光定量检测试剂盒获国家药品监督管理局批准上市。意味着这一可作为慢性乙肝患者安全停药指导依据的新靶标将正式进入临床应用，可在各级医院开展检测。 该试剂盒由北京大学基础医学院鲁凤民教授团队和北京热景生物技术股份有限
基因组学：将数字信息转化为生物学功能
优势 · 同时检测克隆和定量荧光标记---使用表现型筛选克隆 · 从加样、涂布到挑取完全自动化工作流程 · 从样品涂布到挑取、复制和重排记录并追踪样品数据 · 每天准确挑取超过30000个筛选到的克隆，效率>98% 美国能源部联合基因组研究所（
Illumina副总裁：基因组学如何影响肿瘤学未来的发展？
专访Illumina肿瘤业务营销副总裁John Leite 基因组学正在改变肿瘤研究，其最终目标是推进癌症的诊断、治疗、监控及最终的筛查方式。Illumina的肿瘤业务营销副总裁John Leite介绍了这一领域的最新进展，以及随着今天的研究转化为临床，他对未来的期望。 基因组学如何影响肿瘤
转基因检测的“黄金期”不能少了转基因检测试纸
我们知道，未经允许的转基因农作物是严禁销售种植的，目前，农作物生长已进入苗期，是转基因检测的黄金时期。为了维护市场持续，杜绝一些非法转基因农产品流入市场，相关部门也在积极开展检测工作。 检测方法主要是通过到田间及相关企业随机抽取农作物叶片进行转基因检测试纸测试。近日来，就有多地进行玉米
PNAS打开基因组生物学的黑盒子
最近，美国佛罗里达州立大学、贝勒医学院和哈佛大学-麻省理工学院Broad研究所的科学家们，开辟了人类遗传学中一个鲜为人知的领域。相关研究结果发表在7月18日的《PNAS》杂志。 在这项研究中，研究人员表明，一条不活跃的X染色体上的一段不寻常的DNA重复序列，实际上对于这种女性特有的遗传现象的整
英国成立功能基因组学实验室
近日，英国科研与创新署（UKRI）宣布，医学研究理事会（MRC）、剑桥大学米尔纳治疗研究所（MTI）等联合成立功能基因组学实验室，作为英国卓越研究中心和国家资源中心，汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识，加速新药物和诊断方法的研究发现，巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。 该实验
谢晓亮：当单分子遇上基因组学
当单分子遇上基因组学，它们会擦出什么样的火花？著名华人学者谢晓亮（Sunney Xie）博士围绕这个话题，在《美国医学会杂志》（JAMA）上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授，也任北京大学生物动态成像中心主任。 谢博士写道，单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于
基因组学结合传统育种获得优质主食作物
“我喜欢这个。”Ismail Rabbi边说边将手掌放在木薯上，就像父母在夸赞自己心爱的孩子，他羞涩地笑了。“它们看上去没什么了不起的——并不高。”Rabbi说，“但它克服了我们设置的所有障碍。” Rabbi是尼日利亚伊巴丹国际热带农业研究所（IITA）的遗传学家。他和同事正在开展一项改良木
《PLoS生物学》：乳齿象线粒体基因组测定完成
这的确有些不可思议。德国科学家利用一颗远古牙齿化石，成功确定了乳齿象完整的线粒体基因组，这也是迄今为止科学家得到的最古老的线粒体基因组。该研究成果有望加深科学家对于象类分化的理解。相关论文发表在的7月24日的《PLoS生物学》上。 2800万年前出现的乳齿象是现代大象的近亲，它们大约有3米高，有和猛