Science:一幅脑内的甲基化图谱

我们基因的表达可能会受到我们DNA上的特定标记的影响,例如那些通过对特定核苷酸碱基对的甲基化而被赋予的标记——这一过程被称为表观遗传学过程。科学家们现在提出了一个详细的图谱用以阐释在发育中的哺乳动物大脑中的甲基化如何随着时间的推移而变化。在我们很小的时候及在我们的神经环路正在成形时,DNA甲基化会发生在我们大脑的神经元中;事实上,甲基化被认为与脑发育、学习及记忆等方面有关联。与此同时,尽管人们对发育时的表观遗传修饰一直有很大的兴趣,但很少有研究对其特点进行描述。 现在,Ryan Lister及其同事用一种新的方法分析了在小鼠及人类脑发育中的全基因组范围内的DNA甲基化改变,而不是像许多过去做过的研究那样仅仅关注甲基化的热点。通过考察在多个发育阶段(胎儿、出生后早期及成年时)的神经元,研究人员绘制出了由DNA甲基化的特殊类型所致的基因组范围......阅读全文

研究发现表观遗传精准编辑帮助修复遗传性大脑紊乱症状

  近日,来自约翰霍普金斯大学医学院的研究人员在发育中的小鼠大脑中使用了针对性的基因表观基因组编辑方法,逆转了一个导致遗传性疾病WAGR综合征,从而导致人的智力残疾和肥胖的基因突变。这种特殊的编辑方式并没有改变被调控基因的实际遗传密码,而是改变了表观基因组,即基因的调控方式。  研究人员发现,该基因

遗传发育所曹晓风团队开辟水稻表观遗传研究新方向

  DNA测序技术发明之后,科学家们认为自己可以通过DNA全基因组测序解析生命的全部密码。渐渐的,他们发现有些重要信息并不编码于DNA序列里面,即便基因序列没有发生变化,生物体的表型也可以改变。这种研究被称为“表观遗传学”,继传统遗传学之后,表观遗传学如火如荼地发展起来了。曹晓风供图  中科院院士、

儿童双侧威尔姆斯肿瘤的遗传与表观遗传机制解密

揭示儿童肾癌易感性的遗传机制威尔姆斯肿瘤,又称为肾母细胞瘤,是一种主要影响儿童的罕见肾癌。儿童被诊断出患有威尔姆斯肿瘤的平均年龄取决于一个或两个肾脏是否受累。如果一侧肾脏受累,通常在42-47个月时被诊断出患有单侧威尔姆斯肿瘤。如果两侧肾脏受累,通常在30-33个月时被诊断出患有双侧威尔姆斯肿瘤。威

看表观新修饰6mA甲基化如何助力IF飙升!

  DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-6m

关于基因表观修饰的方式—甲基化检测的程序介绍

  1.甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)  用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能

中科院Nature子刊表观遗传新成果

  来自中国科学院动物研究所、北京大学的研究人员在新研究中,解析了小鼠精子发生过程中5-羟甲基胞嘧(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)的动态机制,相关论文“Dynamics of 5-hydroxymethylcytosine during mouse spermatog

饮食改变衰老过程的表观遗传学修饰

  表观遗传学修饰可以不改变基因编码,而影响基因的开启或关闭。研究人员对185位志愿者(84位男性和101位女性)的直肠组织切片进行了研究,发现人体内基因的表观遗传学修饰主要受衰老的驱动,不过日常饮食也会对表观遗传学修饰产生重要影响。该研究发表在十二月六日的Aging Cell杂志上。   研

中科院PNAS表观遗传研究新进展

  近日来自中国科学院遗传与发育生物学研究所的研究人员在组蛋白H3K4去甲基化酶研究中取得重要进展,证实水稻中的H3K4特异性去甲基酶JMJ703参与控制了转座子活性,相关研究论文于1月14日在线发表在《美国科学院院刊》(PNAS)杂志上。   领导这一研究的是中国科学院遗传发育所基因组生物学研究

植物利用表观遗传记忆适应气候变化

人们已经知道,动物能迅速适应不利的环境条件,以保证生存。现在,越来越多的证据表明,植物也可以。现在,科学家详细介绍了植物是如何迅速适应气候变化不利影响的,以及它们是如何将这些适应能力遗传给后代的。相关研究11月18日发表于《植物科学趋势》期刊。 “有一天,我在想,一个人的生活方式和经历会如何影响

Nature发布迄今为止表观遗传最全面图谱

  30,000个人类疾病为什么出现的原因  二十年前的这个月,第一张人类基因组草图公布。这一项目带来的主要惊喜是,人们发现只有1.5%的人类基因组由蛋白质编码基因组成。  在过去的二十年间,那些最初被认为是“垃圾DNA”的非编码DNA片段被证明在发育和基因调控中起着至关重要的作用。而在一项最新研究

Cell:朊蛋白,表观遗传学的新层面

  朊蛋白prion总是与疯牛病和克-雅氏病等联系在一起,不过人们正逐渐意识到,朊蛋白在生物中也能够发挥正常的有益功能。   日前科学家们发现,朊蛋白能够使酵母从常规单细胞形态转变为多细胞协作形式,并由此在不利环境条件下增大酵母的生存几率。这种可遗传的改变不会影响酵母基因组,是一种表观遗传学现象。

神经精神疾病的表观遗传学关联

  根据加州大学欧文分校的科学家报道,多巴胺信号的功能障碍,可深刻地改变大脑前额叶皮层中大约2000个基因的活性水平,可能是某些复杂神经精神疾病(如精神分裂症)的一个根本原因。  接收这种神经递质的脑细胞中基因活性的这种表观遗传学改变,首次表明多巴胺不足会影响前额叶皮层中调控的各种行为和生理功能。 

Cell新发现颠覆表观遗传传统认知

  来自美国托马斯杰斐逊大学的一个研究团队获得了关于组蛋白修饰作用相反的证据。在一项果蝇胚胎研究中,他们发现亲代的甲基化组蛋白并没有转移给子代DNA。相反,在DNA复制后,由新合成的未修饰组蛋白组装成了新的核小体。相关论文发布在8月23日的《细胞》(Cell)杂志上。   托马斯杰斐逊大学生物化学

长江学者Cell揭示癌症表观遗传新机制

  来自肯塔基大学、武汉大学和清华大学等机构的研究人员,在新研究中揭示了表观遗传修饰调控人类DNA修复的一种独特的新机制。这一研究发现或可解释某些形式的大肠癌从前未知的根源。研究论文发表在4月25日的《细胞》(Cell)杂志上。   肯塔基大学Markey癌症中心的李国民(Guo-Min Li)教

大脑中非常规的表观遗传现象

  胞嘧啶甲基化(mC)是对DNA的修饰,进而调节多种生物功能,如生长发育、肿瘤、以及基因印迹。在绝大多数哺乳动物躯体组织中,当胞嘧啶在一个二核苷酸序列中,并且其后跟着鸟嘌呤(G)时出现mC。同时这些位点绝大多数出现了甲基化(mCG)。然而,在成年哺乳动物大脑,在非CG序列中非常规的胞嘧啶甲基化出现

新方法可无损破译基因表观遗传密码

  美国宾夕法尼亚大学研究人员开发出一种破译DNA表观遗传密码的新方法,利用DNA脱氨酶进行基因测序。他们8日在《自然·生物技术》杂志上发表论文称,新测序方法克服了沿用数十年的亚硫酸氢盐测序法的局限,将有助于更深入理解肿瘤生成等复杂生物过程。  表观遗传指的是在基因核苷酸序列不发生改变的情况下,基因

-Nat-Met:新型单细胞技术助力表观遗传研究

  跨学科组织的专家们首次为临床医生实现“无艾滋病时代”的目标设计了最新的改进方案,方案融合了尖端的生物医学技术以及基础的行为干预方法。该研究发表在《美国医学协会杂志》上。  这项方案是由国际抗病毒组织IAS-USA召集的专家志愿者小组提出的,为临床医生实施新型HIV预防方法提供了指导方针。专家们对

厦门大学PNAS表观遗传学新文章

  来自厦门大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员证实,热休克蛋白HSP70精氨酸甲基化调控了维甲酸介导的RARβ2基因激活。这项研究发布在6月16日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。  厦门大学药学院的刘文(Wen Liu)教授和加州大学圣地亚哥分校的Michael G. Rosenfeld教

Science新闻:表观遗传学印记让基因“窒息”

  吸烟留下的可不仅仅是衣服和手指上的烟味,现在一项新研究提出了强有力的证据指出,吸烟能够通过表观遗传学修饰影响增加癌症发病风险的基因活性。这一发现,为研究者们提供了一个评估吸烟人群癌症风险的新工具。   我们DNA上的化学修饰可以影响基因的功能,决定基因的开启和关闭,这些化学修饰被称为表观遗传学

上海交大癌症表观遗传研究登国际刊物

  来自上海交通大学基础医学院,上海中医药大学等处的研究人员针对前列腺癌展开了研究,发现前列腺癌中抑癌基因HIC1的启动子如果出现高度甲基化,就可能导致其表达沉默而失去抑癌功能,这从表观遗传学修饰的新角度,阐明抑癌基因在调控前列腺癌发生发展中的作用机制,相关成果公布在肿瘤领域国际期刊Cli

用表观遗传药物来终止疱疹病毒活性

  表观遗传药物是一类通过改变基因表达而起作用的新型药物;它们能阻断动物中的疱疹病毒感染。这些结果提示,用表观遗传药物来阻断人体内的疱疹病毒基因表达可能是让该病毒受到控制的一种新方法。不同类型的疱疹病毒会引起口周的唇疱疹及眼部(眼疱疹)和生殖器疱疹。就像是细胞中的DNA,疱疹病毒DNA被包在被称为染

何川教授eLife最新表观遗传学成果

  7月2日,国际著名学术期刊《eLife》在线刊登了芝加哥大学何川教授(Chuan He)和俄亥俄州立大学Li Wu带领的一项研究成果,题为“N6-methyladenosine of HIV-1 RNA regulates viral infection and HIV-1 Gag protei

表观遗传学开关控制基因节律性转录

  当夜晚降临,我们就会慢慢入睡,这是受昼夜节律circadian cycle影响的结果,我们的每个器官甚至基因中都存在这样的节律。   Salk研究所的科学家发现,表观遗传学修饰是使肝脏活性与昼夜节律同步的遗传学开关。这一发现能够帮助人们进一步了解高血糖、高胆固醇等健康威胁背后的机制,文章于近期

Nature子刊:表观遗传预示精神疾病风险

  来自德克萨斯大学健康科学中心、杜克大学、哥伦比亚大学等机构的科学家们,在对青少年抑郁症的研究中发现一种基因的细微改变可以预测大脑对压力的反应。压力可引起诸如抑郁症、创伤后应激障碍和肥胖等健康问题。这项研究发表在8月2日的《自然神经科学》(Nature Neuroscience)杂志上。  科学家

Science医学:癌肿瘤的表观遗传“保护伞”

  由匹兹堡大学癌症研究所(UPCI)领导的一个国际研究小组发现,一种通过阻断雌激素合成来激活癌症杀伤基因的乳腺癌治疗方法有时候会失效,其原因在于:癌症借助了一些表观遗传机制,包括造成患者肿瘤中一些永久的DNA改变,使得肿瘤能够再度生长。   这一研究发现表明,添加一些有可能阻止癌症劫持患者抑制基

表观遗传学变异或可解释慢性肾病

  由宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院肾电解质和高血压部门的医学副教授、临床科学家Katalin Susztak博士带领的一项研究,试图阐明慢性肾病的分子根源和遗传素质,其研究成果发表在最近的Genome Biology杂志上。   在这项研究中,Susztak和她的共同通讯作者、来自阿尔伯特爱因

Science:表观遗传学实现行为重编程

  在佛罗里达木蚁中,大工蚁(majors)和小工蚁(minors)属于两个完全不同的阶级,它们的社会性行为存在很大差异。宾夕法尼亚大学领导的研究团队发现, 这些阶级特异性的社会行为并非一成不变,可以人为地进行表观遗传学重编程。这一重要成果发表在本期的Science杂志上。  表观遗传学修饰可以在不

厦门大学PNAS表观遗传学新文章

  来自厦门大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员证实,热休克蛋白HSP70精氨酸甲基化调控了维甲酸介导的RARβ2基因激活。这项研究发布在6月16日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。  厦门大学药学院的刘文(Wen Liu)教授和加州大学圣地亚哥分校的Michael G. Rosenfeld教

金鹏教授Nature子刊解析iPSC与表观遗传

  来自埃默里大学的研究人员在新研究中绘制出了体细胞重编程过程中,5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5-hmC)在细胞中的动态变化,揭示出在iPS细胞的亚端粒区域存在大量5-hmC介导的异常表观遗传修饰热点。这一研究成果发表在5月19日的《自然细胞生物学》(Natur

施晓冰博士Cell发布表观遗传重要发现

  谈到配送,就连联邦快递(Federal Express®)和UPS快递(UPS®)也无法与人体相比。在癌症生物学中存在着一个令人惊叹的包装和传送系统,其影响了人体是否将会形成癌症。  组蛋白,这一染色质的主要组成元件是一个让人感兴趣的领域。人们认为染色质畸变可导致与癌症相关的DNA损伤。来自德克