Science：破纪录的超大病毒
2003年法国科学家发现了当时已知世界上最大的病毒，并将其命名为Mimivirus，时隔十年，来自法国国家科研中心(CNRS)的研究人员报道称，他们发现了两种比Mimivirus更大的病毒，这些病毒被命名为Pandoraviruses(潘多拉病毒)，这一研究成果公布在Science杂志上。 普通病毒的大小在10到100纳米之间，较大的天花病毒也只有300纳米。2003年发现的Mimivirus病毒则有400纳米，是当时已知世界上最大的病毒。目前针对Mimivirus病毒，已经完成基因组测序工作，发现这种病毒的DNA包含了大约1260个基因，并且有50个基因编码一些以前在病毒中没有发现的功能，例如DNA修复和将mRNA翻译成蛋白质的能力。当时研究人员推测Mimivirus可能曾经有靠自己进行自我复制的能力，但是后来则丢失了这个能力。 而最新发现的这两种巨型病毒：智利发现的Pandoravirus salinus，以......阅读全文
首个白蚁基因组破译完成－促进社会性昆虫进化研究
白蚁的蚁王具有长久的生殖能力，与蚁后拥有同等的特殊地位，其他社会性昆虫却没有王。因此，白蚁是研究社会性进化重要的昆虫。近日，《自然·通讯》在线发表的文章中，中、美、德等国科学家宣布完成了首个白蚁(内华达古白蚁)基因组测序和分析，在揭示白蚁复杂社会性的分子基础方面获新发现。 白蚁与蚂蚁和蜜蜂一样
中国热科院揭示香蕉亚基因组进化及功能分化规律
近日，中国热科院生物所联合华大基因、法国农业研究国际合作中心、国际生物多样性中心、美国罗格斯大学、中国热科院海口实验站等11家单位，绘制了双单倍体香蕉野生种Pisang Klutuk Wulung（BB基因组）的精细基因组图谱，揭示了香蕉A、B基因组的分化，二倍化进程中A、B基因组的特点、多倍体
绿潮藻叶绿体基因组进化机理研究取得新进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503670.shtm石莼属海藻是一类具有重要生态功能和开发潜力的经济海藻，同时也是一类可以暴发性生长导致绿潮灾害的大型绿藻，在全球范围内广泛分布。近日，中国科学院海洋研究所海洋生态环境基因组学团队围绕石莼
单纯疱疹病毒的进化可追溯至青铜时代
剑桥大学领导的一个研究团队分析了单纯疱疹病毒1（HSV-1）的古老基因组，并首次进行了测序。这种病毒会终生潜藏在宿主体内，引起唇部溃疡，目前全球约有37亿人感染了该病毒。最新的研究表明，HSV-1病毒谱系大约在5000年前出现。伴随着青铜时代从欧亚草原到欧洲的大规模迁徙以及相关的人口激增，病毒加快了
研究揭示丙肝治疗失败过程中病毒变异进化特征
近日，《感染、遗传和进化》（Infection, Genetics and Evolution）杂志在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所研究组与上海瑞金医院感染科教授研究组合作研究的最新成果。他们通过对两例不同类别的干扰素治疗失败的慢性丙肝患者进行长期随访，从病毒学角度深入研究了各随访
关于病毒基因组的基本介绍
病毒是最简单的生物，完整的病毒颗粒包括外壳蛋白和内部的基因组DNA或RNA（有些病毒的外壳蛋白外面有一层由宿主细胞构成的被膜（envelope），被膜内含有病毒基因编码的糖蛋白。病毒不能独立地复制，必需进入宿主细胞中借助细胞内的一些酶类和细胞器才能使病毒得以复制。外壳蛋白（或被膜）的功能是识别和
病毒基因组的结构特点介绍
1.病毒基因组大小相差较大,与细菌或真核细胞相比，病毒的基因组很小，但是不同的病毒之间其基因组相差亦甚大。如乙肝病毒DNA只有3kb大小，所含信息量也较小，只能编码4种蛋白质，而痘病毒的基因组有300kb之大，可以编码几百种蛋白质，不但为病毒复制所涉及的酶类编码，甚至为核苷酸代谢的酶类编码，因此
研究揭示植物基因组倍性变化和适应性进化机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518047.shtm
基因组所合作研究揭开两种家养水稻起源进化“篇章”
6月9日，在最新一期的PLOS Genetics上，来自中国科学院北京基因组研究所的吴仲义研究员和中山大学施苏华教授发表了合作研究文章《水稻基因组两种进化历史：驯化基因的角色》(Two Evolutionary Histories in the Genome of Rice: the R
解析斑鳖的全基因组序列及其适应性进化基础
斑鳖（Rafetus swinhoei）是目前地球上现存体型最大的鳖类物种，其背甲长度可达1.5米、体重可达115公斤。此外，斑鳖也是全球目前最濒危的龟鳖类物种。在2019年初，全球已经明确记录的斑鳖个体仅仅只有4只。然而，2019年4月13日，我国的雌性个体意外死亡（这也是当时全球唯一确定性别
版纳植物园揭示壳斗科植物的基因组大小进化
物种的基因组大小是物种形成和多样化中最近处的性状。通过测定物种的基因组大小，有助于了解物种的染色体倍性和基因组进化，为全基因组测序提供基础数据，提高基因组多样性的生物信息学研究的效率。前人对植物基因组大小进化的研究多集中于温带草本类群，并且未与系统发育和地理分布相关联，对热带木本植物的基因组大小
昆明动物所研究团队在蝴蝶基因组大小进化方面获进展
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。 中国科学院昆明动物研究所科研团队在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其
真骨鱼类全基因组加倍后重复基因进化研究引起关注
基因和基因组加倍在进化过程中起了重要作用。1970年，Ohno提出脊椎动物进化早期的两次基因组加倍导致了脊椎动物基因组大小和复杂性的增加，同时也为脊椎动物的进化多样性提供了基础。大量的比较基因组学研究显示，真骨鱼类还经历了第三次基因组加倍，这一加倍被称为鱼类特有的基因组加倍。然而，在物种形成过程
研究揭示植物基因组倍性变化和适应性进化机制
日，中山大学生命科学学院教授施苏华、副教授何子文团队以红树植物杯萼海桑所在支系为对象，全面分析基因组进化轨迹，探索倍性变化（多倍化-重二倍化过程）在基因组进化中的作用，研究全球气候变化背景下的植物适应性进化机制。相关成果发表于《自然-通讯》。 该研究基于高质量的基因组数据，使用共线性分析、非同
基因组所小内含子进化机制研究获得新进展
插入删除数目和比值 近日，在中国科学院北京基因组研究所副所长、中国科学院基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员的指导下，该重点实验室博士生王大鹏通过对人类千人基因组计划数据的比较分析，进一步证实了两种DNA组分特殊效应在人类基因组中的存在，使该研究组延续十几年的小内含子基本功能和
北京基因组所等揭示人类胚胎发育和进化机制
人类的生命从受精卵开始。一个受精卵如何发育成一个含有200多种细胞类型、36个重要器官的复杂有机体，是生命科学最大的难题之一。已知发育的进行需要体内基因能够按照设定程序、在特定时间和特定地点有序地表达，这个过程称为基因表达的编程。就像计算机程序的运行需要使用计算机语言来编程一样，人体设定基因表达
基因组研究显示七鳃鳗独立于其他脊椎动物进化
一个国际研究团队在新一期《自然·遗传学》杂志上说，他们成功破译了原始鱼类七鳃鳗的基因组，发现这种动物拥有诸多不同于其他脊椎动物和更原始的无脊椎动物的基因特征，这表明七鳃鳗是独立进化而来的。 七鳃鳗又称八目鳗，属于无腭纲，它们的嘴呈圆筒形，没有上下腭。从进化角度看，七鳃鳗处于接近脊椎动物祖先
未知基因组的神秘“巨型病毒”揭示病毒世界变异性
据国外媒体报道，目前，科学家最新发现一种具有未知基因组的神秘巨型病毒。 该病毒被称为“Yaravirus”，是在巴西贝洛哈里桑塔城帕普哈人工湖中发现的，它是以巴西神话传说中“水仙（Yara）”的名字命名的。尽管该病毒可能不是什么超自然警报，但它可能像神话中的“水仙（Yara）”一样神秘。 因
Nature－Biotechnology定义病毒基因组标准：何谓高质量基因组
据说，地球上的微生物总量超过了银河系中的恒星数量，而且病毒总量也要比之前预计的多得多。 在最新的Nature Biotechnology杂志上，美国能源部（DOE）联合基因组研究所（JGI）构建了重要的病毒序列数据库，同时提出了病毒基因组标准，指出了三类基因组质量的分级。 目前虽然许多病毒未
科学家揭示埃博拉病毒在宿主内的进化模式
9月5日，《自然-微生物学》杂志在线发表了中国科学院微生物研究所、中国人民解放军军事医学科学院、首都医科大学附属北京地坛医院等单位合作研究成果：Intra-host dynamics of Ebola virus during 2014，第一次系统揭示了埃博拉病毒在宿主内的进化模式，并指出了病毒
中国新型冠状病毒的基因组序列
《自然》杂志2月3日发表了新型冠状病毒的基因组序列（论文：A new coronavirus associated with human respiratory disease in China），病毒样本系从一名曾在最先爆发疫情的海鲜市场工作过的患者体内分离得到。基因组分析显示，该病毒与此前在
武汉植物园发现蕨类植物叶绿体基因组进化的过渡形态
目前已知的蕨类植物叶绿体基因组在组织结构上表现为两种基本类型：一是核心型，高等核心薄囊蕨类水龙骨目和树蕨目具此类型;另一是基部型，见于其他蕨类基部类群。与基部型相比，核心型叶绿体基因组的反向重复区和大单拷贝区的rpoB-psbZ区(BZ区)发生过复杂的基因组重排，同时它们还丢失了5个相同的tRN
基因组内简单重复序列在对虾适应性进化中的作用
近日，由中国科学院海洋研究所李富花课题组主导完成的科研论文Simple sequence repeats drive genome plasticity and promote adaptive evolution in penaeid shrimp，在Communications Biolog
大白鲨如何获得抗癌能力的？全基因组破译发现进化机制
一个国际科研团队破解了大白鲨的全基因组，发现这种处于海洋食物链顶端的大型脊椎动物在进化过程中产生的基因序列变化使它获得了一种抗癌能力，其寿命可长达70岁。 领衔该研究的美国诺瓦东南大学和康奈尔大学研究人员18日在美国《国家科学院学报》上发表论文说，大白鲨体型庞大，身长5到6米，体重可超3吨，寿
酸浆属果实进化发育基因组变异机制取得的研究进展
茄科酸浆属（Physalis）宿存花萼在受精后随浆果发育迅速膨大，形成“中国灯笼”或膨大花萼综合征（ICS）这一创新形态，包裹浆果。然而，酸浆属果实形态、生化特性及其起源背后的遗传基础有待探究。 中国科学院植物研究所研究员贺超英研究组等合作完成了毛酸浆（Physalis pubescens s
我国科学家对桃进行全基因组重测序－绘制进化路线
我们平时吃的桃是如何进化而来的？近日，一项针对桃的全基因组重测序研究揭开了这一谜底。该研究对84份桃种质进行重测序，在全基因组水平上绘制了从光核桃到普通桃的进化路线，并鉴定了与人工选择相关的候选基因，揭示了桃的进化历史及人类活动对果树的影响。 这项研究由中国农业科学院郑州果树研究所王力荣研究团
中国学者解析甜瓜全基因组变异图谱及进化机制
近日，Nature Genetics线发表了中国农科院与其它机构合作完成的两篇重量级文章，文章分别构建了甜瓜全基因组变异图谱和解析了西瓜果实品质性状进化分子机制。 鉴于该两项研究的重要性，Nature Genetics杂志还同期发表了题为“Sweet genes in melon and w
科学家开发比较基因组学进化分析新方法
比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据，解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一，如PAML等方法，都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展，众多物种的基因组
昆明动物所在果蝇基因组进化合作研究中取得新进展
银额果蝇基因组进化研究 性染色体和B染色体（相对于正常染色体而言不遵循孟德尔遗传分裂规律的染色体）的演化一直是经典遗传学长期未曾研究透彻的重要问题。有意思的是，在一种叫做银额果蝇（Drosophila albomicans）的果蝇物种（如图），新近演化出了非常年轻的性染色
科学家开发比较基因组学进化分析新方法
比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据，解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一，如PAML等方法，都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展，众多物种的基因组