PNAS：RNA剪接调控研究方面新的进展
近日，PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展。该研究揭示了RNA二级结构在剪接调控中的新机制，并首次证明了MYC调控蛋白FUBP1同样具有剪接调控活性。 RNA剪接是连接转录与翻译的重要桥梁，也是生物体蛋白质多样性的重要保证。在真核生物中，mRNA前体被剪接成为成熟的mRNA一般需要在多种蛋白质及snRNA的帮助下，经历两步转酯剪接反应来完成。目前对于第二步剪接反应的调控知之甚少。 冯英研究组在前期工作中发现了一种特殊的mRNA前体，该前体在剪接反应已经开启的情况下，仅将转酯反应进行到第一步即停止，第二步反应则被完全抑制。冯英研究员指导的博士生李璜等研究人员对造成这一特殊现象的机制进行了深入研究。利用多种体外、体内的剪接模型以及定点突变，研究组发现剪接位点附近形成的RNA二级结构会显著抑制第二步剪接反应的发生;同时还发现单链DNA结合蛋白FUBP1通过与剪接沉默子(ESS)元件结......阅读全文
中科大院士PNAS解析“垃圾”RNA
来自中国科技大学，英国邓迪大学的研究人员围绕一种关键小蛋白：Stc 1的结构和功能展开了研究，从中揭示出了裂殖酵母中RNAi与染色质修饰之间的分子作用机制，指出了非编码RNA的又一重要作用。相关成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。 文章的通讯作者是中国科技大学生命科学学
PNAS：用RNA干扰来治疗恶性肿瘤
套细胞淋巴瘤（MCL）被认为是最具侵袭性的血癌，中位生存时间仅为七年，目前可用的治疗方法很少。每年有三千美国人被诊断为MCL，尽管用于身体其他部位转移瘤的个性化疗法已经取得了一定进展，但是，系统性的将治疗药物传递到癌细胞，对世界癌症研究来说仍然是个挑战。 最近，以色列特拉维夫大学（TAU）的一
异常剪接
中文名异常剪接定 义指对序列库中异常剪接mRNA的鉴定和分析隶属领域生物领域主要功能处理多顺反子性转录单元，调控转录效率和mRNA的稳定性，同时可以增加产物蛋白的多样性
自剪接
自剪接(self-splicing)出现在稀少的内含子组成核酸酶，核酸酶在只有RNA的情况下代替了剪接体的功能。自剪接的内含子有两种，称为I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型内含子以与剪接体类似的方式进行剪接，但不需要任何蛋白质。这种相似性使人相信这些内含子与剪接体在演化过程上有着关连。自剪接亦可能是非常古老，且
科学家首次展示RNA剪接分子时钟精确原子模型
西湖大学生命科学学院施一公教授研究组题为《ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化剪接体激活过程中结构重塑的分子机理》的论文，11月27日在《科学》杂志以长文形式发表。此文报道了酿酒酵母处于激活状态的剪接体2.5埃的高分辨率电镜结构，该结构是目前报道的最高分辨率的剪接体结构，首次展
PNAS：利用RNA控制CRISPR/Cas9基因编辑
在过去的几年里，研究人员找到了一种方法利用天然存在的细菌免疫系统CRISPR/Cas9来失活或纠正任何生物体内的特定基因。然而，CRISPR/Cas9持续地发挥基因编辑活性，带来了额外编辑不必要位点的风险。 现在，来自加州大学圣地亚哥医学院、Ludwig癌症研究所和艾希司制药公司（Isis P
上海生科院揭示新RNA剪接因子调控植物脱落酸信号途径
9月25日，国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为An Arabidopsis PWI and RRM motif-containing protein is critical for pre-mR
北京基因组所揭示RNA甲基化调控基因剪接机制
中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂课题组在研究m6A甲基化修饰调节mRNA选择性剪接规律过程中，发现了读码器YTHDC1通过招募前体mRNA剪接因子SRSF3同时抑制剪接因子SRSF10与RNA的结合，促进外显子被保留的分子机制。该研究结果于2016
剪接位点
中文名称剪接位点英文名称splicing site;splice site定 义剪接体可识别的RNA前体中内含子和外显子连接边界的序列和接头位点。根据位置不同可以分为供体和接纳体剪接位点。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
剪接体
剪接体（英文：spliceosome）定义：由核小RNA(snRNA，U1、U2、U4、U5、U6等)和蛋白质因子(约100多种)动态组成、识别RNA前体的剪接位点并催化剪接反应的核糖核蛋白复合体。只与SMT蛋白理解与糖性一致。
PNAS惊人发现：沉默基因的RNA可直接遗传
近年来人们发现，父母的生活经历会对后代产生显著的影响。营养不良、接触毒素或罹患疾病会改变父母的基因表达模式，这种改变在某些情况下能传递给下一代。然而，这种非基因遗传机制一直是一个谜。 十月十七日马里兰大学的研究人员在美国国家科学院院刊PNAS杂志上发表文章指出，非基因遗传机制其实可能非常简单。
研究人员揭示RNA剪接在阿尔茨海默症中的作用
2019年10月8日，美国贝勒医学院Joshua Shulman教授课题组在Cell Reports发表题为Tau-mediated Disruption of the Spliceosome Triggers Cryptic RNA-splicing and Neurodegeneration
上海生科院揭示RNA可变剪接在细胞周期时序性的调控机制
3月25日，国际学术期刊Elife 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所王泽峰研究组的最新论文“An extensive program of periodic alternative splicing linked to cell cycle progression”。该工作
研究人员开发环形RNA定量和剪接体转换识别新方法
2020年1月3日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-通讯》（Nature Communications）杂志上发表题为Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform sw
中科院最新PNAS文章
近日，PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展：“Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing re
简述第Ⅳ类内含子的剪接tRNA的剪接
酵母基因组共有约400个tRNA基因,含有内含子的基因仅占十分之一。内含子的长度从14到46个碱基对不等,它们之间并无保守序列,切除内含子的酶识别仅是共同的二级结构,而不是共同的序列。通常内含子插入到靠近反密码子处,与反密码子碱基配对,未成熟tRNA的反密码子环不存在,而是以插入的内含子所构成的
Nature子刊:深度学习预测传统RNASeq无法检测的选择性剪接
项目负责人Yi Xing博士是CHOP计算和基因组医学中心主任，本周他与博士生Zijun Zhang和Zhicheng Pan在《Nature Methods》报道了这款DARTS的框架。DARTS，又称为深度学习加强的RNA-seq转录剪接分析（Deep-learning Augmented
精氨酸甲基化在RNA剪接和翻译全局调控中的关键作用
7月15日，中国科学院上海营养与健康研究所研究员王泽峰课题组在Science Bulletin上发表了题为A systematic survey of PRMT interactomes reveals the key roles of arginine methylation in the g
选择性剪接
中文名选择性剪接外文名alternative splicing别 名可变剪接作 用mRNA前体加工特 点表达水平的不同而导致不同的表型定义选择性剪接（也叫可变剪接）是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式（选择不同的剪接位点组合）产生不同的mRNA剪接异构体的过程，使得最终的蛋白
Cell子刊：RNA剪接或成治疗阿尔兹海默症的潜在分子靶标
众所周知，RNA剪接失调与某些神经退行性疾病的发展有关，例如脊髓性肌萎缩和肌萎缩性侧索硬化症。而阿尔兹海默症作为世界上最常见的神经退行性疾病，在这一领域仍未得到详细的研究。 于是，在2013年，美国Emory大学的Seyfried教授课题组在这一领域开启了最前沿的研究。该研究首次发现RNA剪接
PNAS：U2AF的不同构象在mRNA前体剪接中起着关键性作用
2016年11月6日/生物谷BIOON/--在基因的RNA转录本能够表达蛋白之前，它们的非编码区被一种称作剪接体的复合体移除。在一项新的研究中，德国科学家们报道这种分子复合体的一种成员的不同构象在这种移除过程中发挥着至关重要的作用。 RNA充当着将储存在DNA中的遗传信息有序地转化为合成特异性
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体（RNP)，它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成，在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方法原理剪接体是由 RNA 和蛋白质
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
实验方法原理 剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体（RNP)，它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成，在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。
关于第Ⅲ类内含子的剪接hnRNA的剪接的介绍
核基因hnRNA内含子的剪接点序列为…外显子…↓GU…内含子…AG↓…外显子…,这就是普遍适用的所谓Breathnach-Chambon规则（GU-AG规则）(GU-AG rule),此规律不适合于线粒体和叶绿体的内含子,也不适合于tRNA和某些编码rRNA的核结构基因,酵母的分支位点序列是高度
第1类内含子自我剪接rRNA的自我剪接介绍
第1类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列绝大部分为…外显子…U↓…内含子…G↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,第1类内含子还具有比较保守的4种10一12核苷酸的序列,分别以5’-P-Q-R-S-3’表示,P、Q、R、S的一致序列。序列能与Q序列互补,R序列能与S序列互补,形成一个所谓中部
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
实验方法原理 剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体（RNP)，它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成，在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。实验材料 PIP 10 载体核苷酸焦磷酸酶RNasinT7 RNA 聚合酶
PNAS：芹菜素杀伤癌细胞
近日，一项新研究表明，地中海饮食中丰富的化合物可以剥夺癌细胞逃避死亡的 “超级动能”。这项由美国Ohio State大学的研究人员发现，一种化合物芹菜素能诱导乳腺癌细胞死亡。 但是，这些健康食品在体内工作的实际分子机制在许多情况下仍是一个谜。香菜，芹菜和甘菊茶是芹菜素最常见的来源，它被
PNAS:－融合基因组学揭示横纹肌肉瘤细胞起源
基因融合一直被认为是肿瘤独有的特征。基因融合是指染色体上两个异位的基因嵌合在一起，由于染色体发生易位、缺失或者倒置造成的，通常在癌症的发生发展扮演着重要的角色，并且可以作为诊断和治疗癌症的靶标。基因融合现象最早在慢性粒细胞白血病中发现 BCR-ABL基因融合（费城染色体）。除血液系统肿瘤外，在实
计算机技术还能帮助揭示癌症恶化的分子机制！
近日，费城儿童医院（CHOP）领导的一项研究揭示了蛋白质可变剪切与促癌基因之间的联系。相关结果发表在《PNAS》杂志上。 文章作者，计算与基因组学中心主任Xing博士说：“我们的研究为癌症驱动基因与选择性剪接之间的关系提供了见解，这些发现可用于指导靶向可变剪接的癌症疗法的发展”。 选择性剪接
关于基因剪接的简介
基因组中或基因组间发生遗传信息的重新组合，被称为DNA重组（DNA recombination），其中发生在基因组中的DNA重组又称DNA重排。包括同源重组、特异位点重组和转座重组等类型，广泛存在于各类生物。体外通过人工DNA重组可获得重组体DNA，是基因工程中的关键步骤。