抗乳腺癌研究数据将走向公开化
近期，美国最高法院裁定Myriad基因公司关于癌症基因的ZL无效，要求其披露相关数据后，非盈利组织Free the Data!在大数据软件公司Syapse的帮助下开始一项共享癌症研究资料的计划。这项计划旨在通过不同来源收集整理与乳腺癌相关的基因信息供研究者使用。近期Free the Data! 将首先向所有研究者公开BRCA1和BRCA1突变体的相关数据。 由斯坦福大学于2008年组织成立的Syapse公司建立了一个收集分析与癌症相关的分子数据库用以帮助研究人员分析疾病机理。 ......阅读全文
－导致更侵袭性癌症的基因开关
科学家们最近发现，如果打开一个基因——FOXC1，可在五分之一的急性髓系白血病（AML）患者中导致更具侵袭性的癌症，相关研究结果发表在九月十四日的《Cancer Cell》杂志。 FOXC1基因在胚胎发育过程中通常是打开的，并且是将细胞转变为特定组织（如眼睛、肾脏、脑和骨）所必需的。 但是这
《科学》重点文章：癌症与基因突变
生物通报道：来自霍德华休斯医学院，Ludwig癌症遗传与治疗中心（the Ludwig Center for Cancer Genetics and Therapeutics）以及约翰霍普金斯凯门综合癌症中心（Johns Hopkins Kimmel Comprehensive Cancer Cen
Nature子刊揭示新型癌症驱动基因
研究人员发现了一种基因驱动了1%癌症患者的肿瘤形成。这是首次证实CUX1基因与癌症形成存在广泛的联系。 研究小组发现，当CUX1失活时激活了一种促进肿瘤生长的生物信号通路。当前有一些抑制这一信号通路的药物正在临床使用或进入研发阶段，因此为携带这种致癌突变的患者提供了一种潜在的靶向新疗法。
Cell年度综述：癌症基因组入选
Cell杂志创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。近期Cell杂志盘点了2013年度最佳综述及最佳论文，其中热门技术CRISPR也登上了榜单，相关论文描述了利用基因调控系统 CRISPR/Cas，一步
鉴定出癌症免疫疗法的必需基因
在一项新的研究中，来自美国国家卫生研究院（NIH）、乔治城大学医学院、纽约大学、纽约基因组中心、宾夕法尼亚大学、布罗德研究所和麻省理工学院的研究人员鉴定出癌症免疫疗法发挥作用所必需的基因，这解决了为何一些肿瘤不对免疫疗法作出反应，或者初始时作出反应但随着肿瘤细胞对免疫疗法产生抵抗力后不再作出反应的问
基因突变检测指导癌症靶向治疗
肺癌和结直肠癌近年来已成为大多数国家癌症死亡的主要原因。由于个体遗传基因存在差异性，不同类型的癌症患者选择适合的靶向治疗药物或能取得预期的疗效，基因突变检测为医生提供了重要参考信息。中国国家食品药品监督管理局日前批准由瑞士罗氏诊断研发的cobas EGFR/KRAS基因突变检测技术用于临床基因突
发现新基因与3/4癌症有关
据国外媒体报道，意大利科学家最近发现了一种基因，近四分之三的癌症与它有关。这一重大发现增加了找到治愈癌症新方法的希望。 研究人员在西班牙巴塞罗纳召开的欧洲癌症大会上公开了这一发现。他们说，一种叫Trop-2的基因在很多常见的肿瘤上扮演着重要角色，其中包括乳腺癌、结肠癌、胃癌、肺癌、前列腺癌、子房
基因研究揭示：癌症和衰老存在“制衡”
本报讯 《自然-通讯》发表的一项研究显示，衰老相关的基因表达变化与退行性慢性病相关基因表达变化轨迹一致，但与癌症的相反。这一发现有助于解释研究人员观察到的一种现象：在人类衰老后期，人类的主要死因从癌症变成了退行性慢性病。 在该研究中，德国基尔大学研究者生成了一个大型衰老相关基因表达谱数据集，
基因检测能否延长癌症患者的生命？
在决定治疗方案时，先进行基因检测，这在肺癌治疗领域已成为共识。不过，肿瘤基因检测的产品获批、商业化，还需国内公司通过长期随访、病例积累，自证临床价值。 （在决定治疗方案时，先进行基因检测，这在肺癌治疗领域已成为共识，美国、欧洲、中国等的医生组织均制定了相应的共识文件。图/视觉中国）
国外癌症基因液体检测技术进展
通过技术手段从病人体液中检测出相关的癌症信号，让病人提前获知癌症信号、及时治疗；Freenome公司获得555万美元种子轮投资。 前不久，美国Freenome公司获得种子轮融资555万美元。本轮融资由Andreessen Horowitz领投，跟投方Founders Fund、Data Col
基因检测可提高癌症治愈率？
据报道，三年前，弗雷德-巴克（Fred Barker）被诊断出患有一种罕见的肾上腺恶性癌症，多数患上此病的人寿命将少于半年。而高度复杂的基因测试改变了癌症的治疗方式，也使得弗雷德的生命延续了将近三年。 这项测试的目的是寻找特定的肿瘤基因，之后便可以对病人进行针对性的药物治疗。这个月初，美国临床
北京迈基诺：检测你的癌症基因
最常见的两个用药检测是罗氏的赫赛汀和阿斯利康的易瑞沙。前者对HER2阳性的乳腺癌患者有效;后者对EGFR突变的非小细胞肺癌患者有效。赫赛汀 1998年就已上市，相应的检测在医院已经很成熟。易瑞沙2008年在国内上市，相应的检测还没能在医院全部推行。今年6月，又一款新药获批在中国上市，用药之前
《Nature》：癌基因“地震扩增”，驱动多种癌症！
染色体外DNA（ecDNA）是一类特殊的从正常基因组上脱落下来的游离于染色体外的环状DNA。早在1964年，人们就在神经母细胞瘤细胞中观察到了ecDNA的存在 ，但由于技术受限，人们对于ecDNA在肿瘤发生发展中发挥的具体作用未能有更进一步认识。 2017年Paul Mischel团队在《自然
Nature对儿童癌症基因组分析，有望实现儿童癌症精准治疗
在一项新的研究中，来自美国圣犹大儿童研究医院等研究机构的研究人员证实患有癌症的儿童和成年人通常具有不同的发生突变的基因来促进疾病产生，这提示着这些患者可能受益于不同的疗法。这一发现强调了对儿童癌症进行精准医疗的必要性。相关研究结果于2018年2月28日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“P
罗氏NimbleGen综合性癌症基因捕获进行全面癌症突变检测
个人化癌症治疗是癌症治疗的发展方向与研究热点，相关的各种分子检测方案的发展迅猛。美国一个癌症中心开发了一个两步法方案用于指导药物选择、选择合适的患者参加药物临床实验。 这两步检测法包括：第一步，对少量癌症基因的突变热点进行测序，这些基因通常有较为明确的针对性治疗方案或者靶向药物，此作为快速的初步筛
基因编辑专家亓磊：人类可以通过编辑基因根治癌症
11月6日，2016年腾讯WE大会在北京北展剧场举行，腾讯公司首席探索官David Wallerstein、奇点大学联合创始人Peter Diamandis等人参加大会，并就航空、引力波、科技艺术、AR等前沿话题发表演讲。 基因编辑领域专家、斯坦福大学生物工程系和化学与系统生物学系助理教授亓磊
Nucleic－Acid－Res：大数据库助力癌症药物的开发
近日，来自英国癌症研究所的研究人员通过研究表示，通过加入错误蛋白的3D结构，以及绘制癌症交流的图谱，就会为世界上最大的癌症药物数据库带来革命性的突破；最近更新的canSAR数据库或将为英国及全球的科学家们提供机会来设计出更加高效的癌症疗法，相关研究刊登于国际杂志Nucleic Acid Rese
GEN：专家解析－大数据研究对于癌症治疗的焦点问题
在今年一月，美国副总统拜登在瑞士达沃斯世界经济论坛的科学家小组讨论中提出了一系列攻克癌症的具体要求。其中，怎样通过大数据的收集、分析与应用来研究、预防与治疗癌症成为了一个格外引人注目的话题。 专家： Keith Perry：圣裘德儿童研究医院高级副总裁和首席信息官 Narayan Desa
最新研究数据证明甘精胰岛素不增加癌症风险
美国糖尿病协会 （ADA）、欧洲糖尿病协会（EASD）、国际糖尿病联盟（IDF） 和中华医学会糖尿病学分会（CDS）均建议，Ⅱ型糖尿病患者口服降糖药物控制不佳时应尽早使用等基础胰岛素治疗，以降低糖尿病患者空腹血糖水平。 使用胰岛素与癌症之间是否存在相关性一直是国际医学界研究的重要科学问题
GEN：大数据挖掘对癌症治疗的四大影响
2016年1月在瑞士达沃斯召开的世界经济论坛上的一个panel讨论中，美国副总统Joe Biden当场要求临床医生和研究者举例表示人类在抗击癌症中突破的障碍。当几个重要话题浮现时，最重要的议题是“大数据”，具体而言，即“大数据”的收集、分析和应用。 研究者表示：“大数据”是有效的，这是因为有重
我国最新癌症数据出炉！肺癌发病和死亡率居首
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517216.shtm今天（2月4日）是世界癌症日。2月2日，获国家卫生健康委批准，国家癌症中心基于肿瘤登记及随访监测最新数据，在JNCC上发布了2022年中国恶性肿瘤疾病负担情况，并形成《2022年中国癌
癌症单细胞测序数据分析中常用的方法
癌症单细胞测序数据分析中常用的一些方法：数据预处理质量控制：去除低质量的细胞和测序数据，如检测到的基因数量过少、线粒体基因比例过高的细胞。数据标准化：对基因表达数据进行标准化处理，以消除技术偏差和细胞测序深度的差异。细胞聚类使用无监督学习算法，如基于主成分分析（PCA）、t-分布随机邻域嵌入（t-S
透过大规模基因组分析推出－泛癌症图谱－开启癌症治疗
【Technews科技新报】美国国立卫生研究院（NIH）资助的研究团队已经完成了一份详细的基因组分析，这个被称为泛癌症图谱（PanCancer Atlas）的研究结果收录了 27 篇论文，并包含了 33 种癌症、1 万多个种不同肿瘤分子和临床讯息的数据资料。 泛癌症图谱主要是针对癌症基因组
超过8％的儿童癌症患者携带癌症易感基因突变研究概要
《 New England Journal of Medicine》期刊公布的一项研究显示，超过8%的儿童癌症患者携带癌症易感基因突变。 研究者对1120例儿童癌症患者的肿瘤样本和正常组织进行了DNA测序，发现8.5%的患者的正常组织携带生殖细胞系致病或可能致病突变，这些突变会导致癌症风
这种基因突变导致1/4的人罹患癌症，并且还助力癌症生长
癌症的发生与原癌基因的突变有关。研究表明，原癌基因例如Ras基因发生突变，会导致25%的人类癌症的发生。 近日弗兰西斯克里克研究所的Matthew Coelho博士做了相关实验后发现，Ras基因发生突变还可以抑制免疫系统的抗癌反应。相关研究成果以题为《Oncogenic RAS Signali
EBioMedicine：全基因组测序高效识别癌症相关基因突变
UT西南医学中心癌症研究人员已经证明，全基因组测序可用于识别癌症的遗传性风险，其可以潜在地改善癌症的预防，诊断和治疗。 这是首次研究使用了全基因组测序以评估一系列258癌症患者的基因组，诊断其癌症倾向性突变情况。这项研究发表在杂志EBioMedicine上。全基因组测序是新的基因工具，能够确定
基因数据分析的主流软件
基因组测序在过去的几年中，许多生物的基因组完成了测序工作，如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用，正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具，已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取，那些基于
冰岛基因公司数据挖掘计划泡汤
图片来源：基因解码公司 因采集冰岛人DNA用于发现基因和疾病之间关系而著名的基因解码公司遇到了一个棘手问题。近日，《科学》杂志报道称，冰岛负责监督数据保密性的国家机构驳回了基因解码公司的请求——该公司希望可以使用计算机方法分析该国的宗系记录，以估算28万名并未同意参与该公司的研究，
基因数据噪音或可保护患者隐私
大型基因组数据库对于科学家寻找同疾病相关的遗传变异来说是必不可少的。不过，对于贡献了DNA的人来说，这会带来隐私风险。一项2013年的研究显示，黑客能利用网络上公开可用的信息，从被匿名的基因组数据中辨别出人们的身份。 为解决这些担忧，一个由美国麻省理工学院计算机科学家Bonnie Berger
谷歌将提供基因数据在线服务
近日，谷歌公司宣布将开始提供由生物医学研究机构 Broad 研究所开发的DNA 分析软件的云服务版本。 Broad 研究所是由来自哈佛大学、麻省理工学院和哈佛大学附属医院的科学家组成的。该机构的基因组分析工具包GATK，可用于分析基因组测序数据，并已被研究人员和企业下载20000 次。谷歌表示