巴西开发计算机模拟平台设计新药
巴西国家科学计算实验室近日发布了巴西也是南半球首个帮助新药物设计的受体-配基分子对接模拟平台。这一免费的开放平台将有助于研发治疗艾滋病与南美锥虫病等疾病的药物。 治疗艾滋病、癌症等疾病的药物，要与细胞的特定蛋白质结合才能发挥疗效。与药物结合的细胞蛋白质被称为受体，受体与药物结合的分子基团则被称为配基。筛选合适的受体和配基已成为新药物研发的重要环节。 据介绍，通常研发一种新型药物需要耗费10到15年和巨额资金，很大部分是花费在筛选受体和配基的实验上。但巴西开发的这一新型平台，以计算机模拟分子结构，并可根据各参数自动模拟受体与配基结合过程，有望大大加快新药的研发进程。......阅读全文
药物动力学模拟新算法，将减少新冠药物开发时间
英国《自然》杂志近日在线发表一篇重磅研究。在美国华盛顿大学蛋白质设计研究所所长、2021年生命科学突破奖获得者戴维·贝克的带领下，研究人员创造了一种生产蛋白质药物的强大新方法。利用计算机，他们设计了可以针对体内重要蛋白质（如胰岛素受体，以及病毒的表面蛋白）的小分子结合蛋白。这一进展或有助于开发应对诸
巴西开发计算机模拟平台设计新药
巴西国家科学计算实验室近日发布了巴西也是南半球首个帮助新药物设计的受体-配基分子对接模拟平台。这一免费的开放平台将有助于研发治疗艾滋病与南美锥虫病等疾病的药物。 治疗艾滋病、癌症等疾病的药物，要与细胞的特定蛋白质结合才能发挥疗效。与药物结合的细胞蛋白质被称为受体，受体与药物结合的分子基团则
什么是糖苷配基？
糖苷配基是糖苷分子中的非糖体部分，是配糖类化合物通过氢原子移除糖基后的剩余物质。
分子模拟的概念
一些微生物和正常宿主细胞或细胞或细胞外成分有相似的抗原表位，感染人体后激发的免疫应答也能攻击人体的细胞或细胞外成分，引起自身免疫性疾病。
我国农业生物药物分子设计平台建设取得可喜进展
国家“863计划”现代农业技术领域通过攻关发现并鉴定了一系列基因和蛋白新靶标，在农业生物药物分子设计平台建设方面取得可喜进展。 从受体蛋白、基因等水平发现和鉴定了新的生物药物靶标，为生物药物分子设计和创制奠定了基础。首次通过量化计算的方法构建了新烟碱受体可能的作用模型；通过3H标记吡虫啉和IPP化
染料配基层析法纯化蛋白质实验——染料配基法
染料配基层析不是真正意义的亲和层析，因为它们并不是与它们结合的蛋白质的天然配基。然而染料柱能很好地结合蛋白质，并能导致满意地纯化蛋白质。事实上，有时这种结合甚至比正常的配基更紧。染料配基柱通常是廉价和稳定的，并且具有较高的蛋白质结合容量。所以染料配基层析能作为蛋白质纯化中有价值的步骤之一。来源：《蛋
分子模拟的原理优势
利用适当的简化条件，将原子间的作用等效为质点系的运动，从而避免了求解繁琐的量子力学方程。原子的运动遵从牛顿第二定律，质点系整体遵从哈密顿原理。与之对应，完全从量子力学出发进行的原子计算称为”第一性原理(ab into)计算“。第一性原理计算虽然精度高，但是计算复杂，难以实现大规模的模拟。而分子模拟则
分子模拟的主要方法
分子模拟的主要方法有两种：分子蒙特卡洛法和分子动力学法。
分子模拟的工作类型
分子模拟的工作可分为两类：预测型和解释型。预测型工作是对材料进行性能预测、对过程进行优化筛选，进而为实验提供可行性方案设计。解释型工作即通过模拟解释现象、建立理论、探讨机理，从而为实验奠定理论基础。
分子模拟的应用特点
分子模拟是指利用理论方法与计算技术，模拟或仿真分子运动的微观行为，广泛的应用于计算化学，计算生物学，材料科学领域，小至单个化学分子，大至复杂生物体系或材料体系都可以是它用来研究的对象。
亲和色谱配基的选择
纯化生物大分子的配基(ligand)可以选小的有机分子,也可以选天然的生物高分子作理想的配基,它首先必须对欲纯化的大分子具有很高的亲和力。另外这些配基必须具备可修饰的基团,而且通过这些基团与载体形成共价键。这些共价键的形成不致于严重地影响配基与欲纯化蛋白质的亲和力。用于亲和层析的配基有酶的底物、酶的
糖苷配基的名词含义
糖苷配基是糖苷分子中的非糖体部分，是配糖类化合物通过氢原子移除糖基后的剩余物质。按照糖苷配基的种类，可以分为烷基糖苷、芳香糖苷、双萜糖苷及三萜糖苷等。
德国建世界最大钻探技术模拟平台
德国克劳斯塔尔工业大学下萨克森能源研究中心将建设一座深钻技术模拟平台，它将是该领域世界同类装置中最现代化、功能最强大的研发装置。该项目总投资约 1000万欧元，其中通过欧洲区域发展基金(EFRE)获得500万欧元，下萨克森州投入资金约400万，克劳斯塔尔工业大学及参加能源研究中心的协作企业和
Nature－Methods发布首个DNA精确模拟平台
模拟可以将实验手段无法直接观察到的活动呈现在人们眼前。科学家们日前开发了首个能够精确模拟DNA的平台，有助于研究DNA的结构改变，以及DNA与蛋白和药物的互作。 分子动力学可以解析发生在不同时间尺度上的过程（从皮秒到分钟），适用于不同规模的分析体系（从纳米到米）。这一技术能用来模拟DNA的各种
药物研发新途径受全球欢迎，共享分子平台发出解锁邀约
药物分子的研究是一个庞大的体系性工作。在药物研发的早期过程中，可能会有许多临床前分子由于各种原因迟迟未能达到药物状态，其研究只好搁置，不知何时何地才会再次重启。这不能不说是一种极大的资源浪费。更糟糕的是，这样的搁置可能会带来无尽的遗憾：如果能持续研究，这些分子或许早已变成了药物，挽救了千百万人的
德研究人员找到可模拟合成生命起源关键分子新“配方”
生命如何在地球上起源是至今未解的问题，科学界认为ＲＮＡ（核糖核酸）在其中发挥着关键作用，但一直没找到模拟远古地球环境而合成ＲＮＡ的方法。科研人员近日找到一种新“配方”，可以用远古地球上存在的简单物质模拟合成ＲＮＡ的基本“模块”。 ＲＮＡ是重要的遗传物质，它被认为在原始生命的遗传信息传递和蛋白质
分子模拟的定义和原理
分子模拟（Molecular Simulation） 利用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子结构与行为，进而模拟分子体系的各种物理、化学性质的方法。它是在实验基础上，通过基本原理，构筑起一套模型和算法，从而计算出合理的分子结构与分子行为。分子模拟不仅可以模拟分子的静态结构，也可以模拟分子体系的动态
Discovery－Studio——全方位抗体模拟计算平台
与小分子药物相比，生物疗法提供了一系列独特的益处。这使得以抗体和其他生物治疗方式（如双特异性抗体）为中心的研发项目大幅增加。然而，这些项目还必须克服小分子药物在安全性和药代动力学方面所面临的类似挑战。高免疫原性和低溶解度是影响抗体药物开发和疗效的重要因素。Discovery Studio从抗体序列出
关于强心苷的配基介绍
配基是强心苷的药理活性部分，配基本身对心肌的作用微弱而短促，但与糖结合后其作用的强度和持久性均增加。糖的部分影响强心苷的药物动力学性质（吸收、半衰期、代谢等）。在中国，已从30余种植物中提出可供临床应用的强心苷类。3000年前，古埃及人已知多种含强心苷的药用植物。18世纪末，英格兰医师、植物学家
地高辛配基随机标记DNA探针
1．标记DNA探针 每次标准的反应可标记10ng至3μg线性的DNA，也可标记更大量的DNA，但所有的成分和体积要相应增加。 （1）DNA探针热变性，煮沸10min，迅速冷却于冰/乙醇中5min以上，待用。 （2）取Eppendorf管（1.5ml）置于冰上，加下列及试剂：
英伟达推出生成式AI药物发现平台开启新布局
人工智能计算领导者英伟达（NVIDIA）在过去的一年里接连投资几家AI药物开发公司，其在药物开发领域的雄心壮志正在成为全世界的焦点。 日前，英伟达宣布了三项新举措，其中包括与安进（Amgen）子公司deCode进行新的合作。英伟达表示，deCode将利用英伟达的超级计算机和BioNeMo生成式人工智
量子系统模拟分子再创纪录
最新一期《自然》杂志刊登了量子计算机领域一项重大突破：IBM公司科学家利用其研发的全新算法，成功在7量子位系统中模拟出氢化铍（BeH2）分子，是迄今量子系统模拟的最大、最复杂分子，打破了以往纪录。新研究意味着用小型量子系统研发新药和各种新材料指日可待。 当今超级计算机能模拟氢化铍和其他简单分子
超导器件可以模拟分子振动光谱啦！
量子化学模拟已成为量子计算机的「杀手级」应用之一。近年来，Google，IBM和其他IT公司为了模拟分子结构，一直在设计越来越好的超导比特。最开始，为了计算分子的基态能量,人们提出了量子相位估计算法。然而，这种量子算法的可扩展性对于目前的量子技术来说要求太高。一种替代方法被称为“变分本征值求解法
分子模拟技术发展和应用
近年来分子模拟技术发展迅速并在多个学科领域得到了广泛的应用。在药物设计领域，可用于研究病毒、药物的作用机理等；在生物科学领域，可用于表征蛋白质的多级结构与性质；在材料学领域，可用于研究结构与力学性能、材料的优化设计等；在化学领域，可用于研究表面催化及机理等；在石油化工领域，可用于分子筛催化剂结构表征
国内颠覆性突破－新型高通量药物筛选NanoSPR分子互作平台
2022年9月1日，Advanced Functional Materials杂志以“An Nanoplasmonic Portable Molecular Interaction Platform for High-Throughput Drug Screening”为题在线发表了华中科技大学
新突破！冷冻电镜技术和多尺度分子模拟相结合成效颇丰
近日，中国科学院大连化学物理研究所分子模拟与设计研究组研究员李国辉团队受邀在Current Opinion in Structural Biology上发表综述文章Multiscale Simulations of Large Complexes in Conjunction with Cryo
新研究使用人工智能确定药物分子结构
瑞士研究人员新开发出一种利用人工智能技术确定药物分子结构的方法，比现有方法效率大大提高，有助于制药行业开发新药物。 为充分了解药物在人体内的功效，研究人员需要确定其分子结构。科研人员常利用核磁共振技术来探测分子结构，但此前的相关计算非常复杂和耗时。 瑞士洛桑联邦理工学院研究人员在新一期英国《
FDA批准通道提速，Lucira－Health分子新冠药物获批
美国食品和药物管理局周二批准了 Lucira Health 的分子 COVID-19/流感测试的紧急使用授权。Lucira COVID-19 & Flu 检测获准在护理点使用。 据该机构称，这是与美国国立卫生研究院独立测试评估计划 (ITAP) 合作后获得授权的第一个分子 COVID-19 测试，该
8月FDA批准的7个新分子实体药物
2018年8月，美国FDA一共批准了7个新分子实体（指在美国从未作为药品批准或销售的活性成分）药物，其中有多个属于罕见病新药。汉鼎好医友结合FDA官网信息，整理如下： NO.1 药品名称：Galafold 活性成分：Migalastat hydrochloride 获批时间：201808
新冠药物，引发药物研发新变革
在新冠药物研发中，我国新药研发力量得到加强，实力渐显。五十余个新冠药物获批进入临床试验阶段，抗疫“三方”中药新药获批上市，我国首款抗新冠病毒药物获批上市……经过两年多的攻坚研发，中国原创新冠药物正在或即将参与到终结新冠大流行的战斗中。 国家药品监督管理局的最新统计数据显示：截至2022年2月底，