研究揭示抗生素抗性基因可经反式剪接参与蛋白产生
7月9日，国际知名学术期刊Cell Research在线发表了中科院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所李伯良研究组题为Production of ACAT1 56-kDa isoform in human cells via trans-splicing involving the ampicillin resistance gene的研究论文，报道了来自氨苄青霉素抗性基因的外源转录本通过与内源人ACAT1 mRNA反式剪接并翻译产生人ACAT1 56-kD异构体的新机制。 抗生素抗性基因在自然环境和人体肠道广泛分布，正在成为影响公众安全的一个潜在威胁。某些抗生素抗性基因，如氨苄青霉素抗性基因，已作为最为常见的选择标记用于重组质粒中，并随之在近40年间广泛应用于科研、农业及医药等领域。RNA反式剪接能够将不同来源的转录本拼接起来，扩展并丰富了真核生物的转录组和蛋白质组。在此之前，来自重组质粒的外源性转录本......阅读全文
花生转录组denovo测序揭示果针发育相关的功能基因
近日，由广东省农业科学院作物研究所梁炫强研究员、陈小平博士，山东省农业科学院花生研究所所长禹山林研究员及国际半干旱热带作物研究所(ICRISAT)基因组中心负责人Rajeev Kumar Varshney等完成的花生转录组de novo测序的结果发表于Plant Biotechnology
多阶段单细胞转录数据的基因识别统计方法问世
近日，西安交通大学公共卫生学院孙世权教授团队开发了一种高效灵活的非参数方法，用于检测多个时间点上的基因表达模式。该方法称为TDEseq，即时间序列scRNA-seq数据的时间差异表达基因，近日该成果发表于《基因组生物学》上。TDEseq采用线性可加混合模型（LAMM）来拟合单个基因表达值和时间点的关
多阶段单细胞转录数据的基因识别统计方法问世
近日，西安交通大学公共卫生学院孙世权教授团队开发了一种高效灵活的非参数方法，用于检测多个时间点上的基因表达模式。该方法称为TDEseq，即时间序列scRNA-seq数据的时间差异表达基因，近日该成果发表于《基因组生物学》上。TDEseq采用线性可加混合模型（LAMM）来拟合单个基因表达值和时间点的关
基因组所发布全转录组关联研究知识库
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（NGDC）开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在
千年基因总部助力韩国人胃癌基因组及转录组研究
千年基因总部Macrogen助力研究者完成了韩国人胃癌基因组及转录组微卫星突变的研究，该研究的基因组和转录组测序于Macrogen通过ISO9001 & ISO13485 & CLIA认证的国际最高质量标准的大型基因组学实验室完成，研究成果于6月4日发表于Genome Research。
CCAAT转录因子
中文名称CCAAT转录因子英文名称CCAAT transcription factor定 义可与启动子中的CCAAT元件发生特异性相互作用的转录因子。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
核转录分析
实验材料 cDNA0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA试剂、试剂盒 PBS NP-40 裂解缓： 20XSSC LNaOH 甘油储存缓冲液 10X 转录缓冲液 核苷酸:ATPGTPCTP 200uCi「α32P]-UTP 10XSET 蛋占酶 K 无 RNase 的 DNase
转录的特点
转录时,细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA,通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比,转录有很多相同或相似之处,亦有其自己的特点。转录中,一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说,以特定的DNA片段作为模板,以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂,合成前体
转录因子组成
真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分：亚基RNA聚合酶的亚基，它们是转录必须的，但并不对某一启动子有特异性。复合物某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复
核转录分析
实验材料 cDNA 0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA 试剂、试剂盒 PBS
体外转录
· In Vitro RNA Transcription (Promega)For in vitro preparation single-stranded RNA probes or microgram quantities of defined RNA transcripts f
辅助转录因子
中文名称辅助转录因子英文名称ancillary transcription factor定 义协助RNA聚合酶同启动子结合，并促进已结合的RNA聚合酶启动转录速率的转录因子。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
RNA－反转录
实验材料 poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin实验步骤 一材料与设备1)p
RNA－反转录
实验材料 poly(A)+RNA 反转录酶 鼠源反转酶 或禽源反转录酶 试剂、试剂盒 oligo
转录组测序与转录表达谱测序的异同
转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息，从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile)：指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特
转录组测序和全转录组测序的区别
全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术，可以全面获取样本中转录产物信息，结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制， 进行联合分析，深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有
RNA的转录与逆转录相关介绍
转录是以DNA为模板合成RNA的过程，经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中，再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的，以RNA分子中的一条链为模板，在逆转录酶的作用下，以四种脱氧核苷酸为原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
蛋白质组学不能被基因组和转录组取代
基因和蛋白并不存在严格的线性关系ORF并不预示一定存在相应的功能性基因mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应翻译后修饰及同工蛋白质（isforms)等现象在基因水平无从表现
上海生科院在玉米胚乳储存蛋白基因转录调控中取得进展
7月29日，《遗传学》（Genetics）杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所巫永睿研究组题为Divergent Transactivation of Maize Zein Storage Genes by the Transcription Factors Opaque
增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示
广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作，首次报道了植物中的增强子转录，初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》（Genome Biology）。 增强子是一种40
同济大学康九红：lncRNAs如何精确调控干细胞基因转录
来自同济大学生命科学与技术学院的研究人员发表了题为 “LincRNA-1614 coordinates Sox2/PRC2 mediated repression of developmental genes in pluripotency maintenance”的研究成果。着重揭示了多能干细
多名学者推荐全基因组分析转录因子功能新技术
来自北卡罗来纳大学教堂山分校，NIH等处的研究人员利用一种新型方法，分析了酵母转录因子Rap1在整个基因组中的结合动态，从而可以更好研究这一转录因子的功能，这一方法将有助于科学家们实时分析转录情况，相关成果公布在Nature杂志上。 对于这一成果，来自法国国家科学研究中心的François
利用人工组合转录因子对人类基因组扫描
Scanning the human genome with combinatorial transcription factor librariesPublished online: 18 February 2003, doi:10.1038/nbt794March 2003 Volume 21
Cell－reports:转录激活因子抑制基因表达——一切皆有可能
近日，来自韩国的科学家在国际学术期刊cell reports在线发表了他们的最新研究进展，他们发现Hippo肿瘤抑制途径下游一直作为转录共激活因子的YAP和YAZ，也能够通过与具有TEA结构域的转录因子相互作用发挥转录共抑制因子活性，促进肿瘤进展。 YAP和TAZ是位于Hippo肿瘤抑制途径下
研究发现植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器，对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队，历时五年，通过对三种高等植物（水稻、玉米和拟南芥
增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示
广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作，首次报道了植物中的增强子转录，初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》（Genome Biology）。 增强子是一种40
信使RNA的反转录酶与反转录过程
定义：以反义RNA为模版，通过反转录酶，进行的RNA转录 1．概念反转录是以RNA为模板合成DNA的过程，也称逆转录。这是DNA生物合成的一种特殊方式。 2．反转录酶与反转录过程 反转录过程由反转录酶催化，该酶也称依赖RNA的DNA聚合酶（RDDP），即以RNA为模板催化DNA链的合成。合
RNA复制的转录与逆转录的过程介绍
转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成
上海生科院发现转录中介体基因能够控制肥胖及糖尿病
9月16日，国际学术期刊Cell Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王纲研究组的最新研究成果，该工作发现在小鼠肝脏中删除中介体MED23基因能够减缓肥胖和糖尿病的发生发展, 揭示了中介体MED23在肝脏糖脂代谢调控和糖尿病发生发展过程中的作用及机制
最新进展：胰岛素基因转录调控通路进化取得进展
5月25日，Nature Communications以Evidence from oyster suggests an ancient role for pdx in regulating insulin gene expression in animals为题，在线报道了中国科学院海洋研究所