关于Ⅱ型内含子的基本信息介绍

同I型内含子类似,是一类具有酶催化功能的内含子,转录成RNA后,可以自我剪接。Ⅱ型内含子以与剪接体类似的方式进行剪接,但不需要任何蛋白质(自剪接)。 Ⅱ型内含子是主要存在于线粒体中的一类内含子,它的剪接位点类似于核编码结构基因的内含子,并同样遵从GU-AG规律。剪接机理同核内含子的剪接相似,也要形成一个套索的中间体,通过形成5'-2'磷酸二酯键将要剪接的位点靠近到一起。但是,Ⅱ型内含子的剪接又不完全与核内含子的剪接相同,它具有自我剪接的功能,不需要剪接体和snRNA的参与,也不需要ATP供能。从结构上看,Ⅱ型内含子的6个结构域可形成发夹环,结构域5与6之间只间隔3个碱基,结构域6参与转酯作用。 [1] 虽然剪接可以在没有蛋白质的情况下进行,但依然会额外的使用5个RNA分子及超过50多个蛋白质,并水解多个三磷酸腺苷(ATP)分子。使用 ATP 是要提高剪接mRNA的准确性,避免出现错误。 以下是Ⅱ型内含子......阅读全文

关于RNA剪接第Ⅱ类内含子的自我剪接介绍

  第Ⅱ类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列多为…外显子…↓GUGCG…内含子…嘧啶碱AU↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,在离3’剪接点上游6-12bp有一段比较保守的序列,一致序列为CUCAC,在这一保守序列A的两侧各有一段3~5核苷酸的短序列能与上游方向的核苷酸互补,而A总是不包含在这

关于第一类内含子的可能机制介绍

  第一类内含了DNA的内部ORF表达,产生一个双链内切核酸酶,该酶识别无内含子的同一基因上的顺序并结合上去,酶切产生具有4bp伸出析3'-OH末端的双链断裂,然后以I+基因的未切割的同源顺序作为模板来修复双链断裂,该修复机制延伸到侧翼区域,导致共转变,而内含子一旦插入后,它本身既可产生内切

非编码序列内含子子长度多度性((ILPs)

实验概要本实验中运用Perl脚本用于比较Nipponbare和93-11基因组序列,从而开发潜在的ILP标记,通过EPIC-PCR开发候选ILP标记,最后用实验验证及评价了ILP标记。实验步骤1. 水稻釉粳亚种基因组比较搜索ILP我们运用Perl脚本用于比较Nipponbare和93-11基因组序列

内含子的开放续框中编码产生的蛋白介绍

(1)核酸内切酶:在DNA的靶位点剪切,使内含子得以插入;(2)反转录酶:涉及将内含子RNA变成DNA拷贝;(3)成熟酶:从前体的RNA中切掉内含子的部分。

关于第一类内含子的基本作用介绍

  内含子DNA顺序插入到一个新位置,应带来它的转录和剪接问题,内含子回归不存在这个问题,因为I+基因本身可正常转录和剪接。但是,就内含子转坐而言,由于内含子本身无启动子,其转坐有赖于宿主基因,所以,内含子转座常导致产生一个无活性的内含子,它将因无法时行有效转录而通过随机突变在进化中消失,故内含子转

关于第Ⅲ类内含子的剪接hnRNA的剪接的介绍

  核基因hnRNA内含子的剪接点序列为…外显子…↓GU…内含子…AG↓…外显子…,这就是普遍适用的所谓Breathnach-Chambon规则(GU-AG规则)(GU-AG rule),此规律不适合于线粒体和叶绿体的内含子,也不适合于tRNA和某些编码rRNA的核结构基因,酵母的分支位点序列是高度

第1类内含子自我剪接rRNA的自我剪接介绍

  第1类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列绝大部分为…外显子…U↓…内含子…G↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,第1类内含子还具有比较保守的4种10一12核苷酸的序列,分别以5’-P-Q-R-S-3’表示,P、Q、R、S的一致序列。序列能与Q序列互补,R序列能与S序列互补,形成一个所谓中部

科学家发现内含子对细胞适应饥饿的调节机制

  1月16日,加拿大舍布鲁克大学科研人员在Nature上发表了题为“Introns are mediators of cell response to starvation”的文章,发现内含子对细胞的饥饿反应具有调节作用。  内含子是所有真核细胞普遍存在的特征,通过对最初转录产物剪接除去内含子以产

关于第一类内含子的基本信息介绍

  第一类内含子(groupIintron)广泛在于各种生物的线粒体、叶绿体及基因组内,内含子移动分内含子回归(intron loss)和内含子转座(imtron transposition),前者已为实验证实,后者则尚未被证实。  一类新的可动因子即第一类内含子(groupIintron)已被发现

内含子的重要功能:帮助酵母应对压力下的生存

  内含子(intron)的存在,是真核细胞蛋白质编码基因与原核细胞最大的区别。在真核细胞基因表达的过程中,需要经过RNA剪接反应将其去除。一般来说,内含子的长度远比编码蛋白的外显子序列长,并且执行剪接反应的酶——剪接体高度复杂,由170多个相关蛋白组成。剪接反应需要高度精准,移码错位一个碱基都会导

关于第一类内含子的发现和初步研究介绍

  1975年,人们以啤酒酵母菌mt-DNA某些突变为标记进W+XW-杂交,发现W+传递到了代的比例为95%而W-几乎为零,现象上好似发生了单方赂基因转变(unidirectionalgeneconversion)。从W-到W+,由于W+中有内含子ScLDU.1,而W-则无,故人们认为上述现象与该内

基因组所小内含子进化机制研究获得新进展

插入删除数目和比值  近日,在中国科学院北京基因组研究所副所长、中国科学院基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员的指导下,该重点实验室博士生王大鹏通过对人类千人基因组计划数据的比较分析,进一步证实了两种DNA组分特殊效应在人类基因组中的存在,使该研究组延续十几年的小内含子基本功能和

Science-|-西湖大学万蕊雪施一公团队再取重要进展

  次要剪接体负责U12型内含子的剪接,由5个小核RNAs (snRNAs)组成,其中只有一个与主剪接体共享。  2024年3月14日,西湖大学施一公及万蕊雪共同通讯在Science 在线发表题为“Structural basis of U12-type intron engagement by t

微生物所开发出梭菌基因删除新策略

  梭菌(Clostridium)是一类与人类关系非常密切的细菌。其中既有许多致病菌,如产生外毒素的破伤风梭菌和肉毒梭菌等;也有一些具有重要工业应用价值或潜力的梭菌,如丙酮丁醇梭菌和热纤梭菌等。   基因失活或基因删除是细菌功能基因组学研究的基本手段。近年来,基于乳酸乳球菌II型内含子剪切机制开发

两篇Nature发现内含子的新作用:帮助细胞应对压力

  一直以来,科学家们对许多真核蛋白编码基因中散布的没有明显生物学功能的非编码DNA片段到底起什么作用感到困惑。这些被称为内含子的序列通常在转录和翻译的时候,从它们的原始序列剪接出来并在蛋白质产生之前迅速被破坏。  1月16日Nature杂志上发表的两项最新研究意外发现了内含子的新作用(至少在酵母中

自剪接

自剪接(self-splicing)出现在稀少的内含子组成核酸酶,核酸酶在只有RNA的情况下代替了剪接体的功能。自剪接的内含子有两种,称为I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型内含子以与剪接体类似的方式进行剪接,但不需要任何蛋白质。这种相似性使人相信这些内含子与剪接体在演化过程上有着关连。自剪接亦可能是非常古老,且

科学家揭示内含子来源环形RNA新分子及转录调控功能机制

  9月27日,国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)发表了中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲组与计算生物学所杨力组的最新合作研究论文,发现来源于基因内含子区域的环形RNA新分子,揭示其成环机制及在基因转录调控中的重要功能。   众所周知,人类基因组中存

PLoS-Genet:科学家深度解析基因组的“黑暗面”:内含子

  近日,一项刊登在国际杂志PLoS Genetics上的一篇研究报告中,来自纽卡斯尔大学等机构的科学家们通过研究揭示了内含子突变与人类种群变异之间的直接关联;科学家们在基因组学研究中所面临的最大挑战之一就是揭示人类基因组的“黑暗面”所扮演的关键角色,这些区域即科学家们尚未找到携带特殊功能的基因组区

O型+A型竟生出B型!

 如果当你得知,你和你的另一半生出的小孩不可能是这个血型?你会怎么想?难道是隔壁老王家的?其实,血型是不能作为判断亲子关系的依据的。   电视剧常演因为血型不同,才发现老婆「外遇」的事实,但其实还有许多罕见的血型是容易被误判的。有网友抱怨,一个O型、一个A型的爸妈,怎么样也生不出B型,「我是科技业,

Cell重要成果:RNA剪切视图

  来自耶鲁大学的科学家以最详细的细节描述了RNA执行基因表达化学过程的特征。在发表于10月26日《细胞》(Cell)杂志上的论文中,研究人员报告了 II型内含子(group II introns)的14个晶体结构。II型内含子是一种具有酶催化功能的内含子,参与RNA剪切这一遗传复制的关键阶

核酶的主要类别

天然核酶主要有:(1)异体催化剪切型,如RNaseP;(2)自体催化的剪切型,如植物类病毒、拟病毒和卫星RNA;(3)Group I 内含子自我剪接型,如四膜虫大核26S rRNA;(4)Group II 内含子自我剪接型;(5)核糖体中的rRNA人工筛选的核酶:可以对tRNA进行氨酰化的Flexi

基因组所重复序列与哺乳动物内含子扩张关系研究获进展

  近日,在中国科学院北京基因组研究所副所长、基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员和“百人计划”雷红星研究员的指导下,基因组所王大鹏博士、博士研究生苏尧等科研人员在哺乳动物基因组内含子扩张与基因功能关系研究,以及突变和自然选择在基因组进化中的作用研究中取得新进展。相关学术论文在Ev

肌动蛋白的遗传性能

结构蛋白的主要相互作用是基于钙粘蛋白的粘附连接。肌动蛋白丝通过纽 蛋白与α- 肌动蛋白和膜连接。 纽蛋白的头部结构域通过α-连环蛋白 , β-连环蛋白和γ-连环蛋白与E-钙粘蛋白结合 。 纽蛋白的尾部结构域与膜脂质和肌动蛋白丝结合。肌动蛋白是整个进化过程中最高度保守的蛋白质之一,因为它与大量其他蛋白

细胞肌动蛋白的遗传性能

结构蛋白的主要相互作用是基于钙粘蛋白的粘附连接。肌动蛋白丝通过纽 蛋白与α- 肌动蛋白和膜连接。 纽蛋白的头部结构域通过α-连环蛋白 , β-连环蛋白和γ-连环蛋白与E-钙粘蛋白结合 。 纽蛋白的尾部结构域与膜脂质和肌动蛋白丝结合。肌动蛋白是整个进化过程中最高度保守的蛋白质之一,因为它与大量其他蛋白

肌动蛋白的遗传性能介绍

  结构蛋白的主要相互作用是基于钙粘蛋白的粘附连接。肌动蛋白丝通过纽 蛋白与α -肌动蛋白和膜连接。 纽蛋白的头部结构域通过α-连环蛋白 , β-连环蛋白和γ-连环蛋白与E-钙粘蛋白结合 。 纽蛋白的尾部结构域与膜脂质和肌动蛋白丝结合。  肌动蛋白是整个进化过程中最高度保守的蛋白质之一,因为它与大量

脂蛋白脂酶的组成

  LPL基因位于第8染色体短臂8p22,长约35kb,由10个外显子和9个内含子组成,编码475个氨基酸残基的蛋白质,LPL基因位点存在多态性,主要分布在LPL基因内含子和侧翼序列中,其中内含子6中PVUⅡ多态位点和内含子8中HindⅢ多态位点与高脂血症有关,并为高脂血症的家系连锁分析提供了遗传标

施一公团队再取进展

  剪接体通常在外显子上组装,并经历重新排列以跨越相邻的内含子。大多数由内含子定义的剪接体状态已经在结构上得到了表征。然而,一个完全组装的外显子定义的剪接体的结构仍然未知。  2024年4月24日,清华大学/西湖大学施一公及清华大学闫创业共同通讯在Cell Research(IF=44)在线发表题为

天然核酶可分为那几个种类?

天然核酶可分为四类:(1)异体催化剪切型,如RNaseP;(2)自体催化的剪切型,如植物类病毒、拟病毒和卫星RNA;(3)第一组内含子自我剪接型,如四膜虫大核26SrRNA;(4)第二组内含子自我剪接型。利用反义技术研制的药物称反义药物。反义药物作用于产生蛋白的基因,因此可广泛应用于多种疾病的治疗,

天然核酶可分几大类?

天然核酶可分为四类:(1)异体催化剪切型,如RNaseP;(2)自体催化的剪切型,如植物类病毒、拟病毒和卫星RNA;(3)第一组内含子自我剪接型,如四膜虫大核26SrRNA;(4)第二组内含子自我剪接型。利用反义技术研制的药物称反义药物。反义药物作用于产生蛋白的基因,因此可广泛应用于多种疾病的治疗,

嗜热细菌或可解开高等生物早期进化谜团

  据物理学家组织网报道,生存在日本温泉中的一种嗜热细菌或许可解开高等复杂生物体早期进化的谜团,并可能成为21世纪生物燃料生产的关键。相关研究报告发表在《公共科学图书馆·生物学》(Public Library of Science Biology)杂志上。   分子生物学教授艾伦·兰博维兹介绍说,