新成药性预测模型可提供更综合且具解释性的评估

华东理工大学药学院教授唐赟团队,通过整合ADMET性质、理化性质以及可合成性,构建了一个全新的成药性预测模型,可为候选药物分子提供更综合、更具解释性的成药性评估。相关研究近日发表于美国化学会的《药物化学杂志》。据统计,平均每10000个化合物中只有1个化合物最终可能成为药物。临床前的类药性研究是关键环节,可帮助研究人员快速、精确地判断化合物作为潜在药物的可行性。传统的类药性评估多以经验法则为基础,虽便于快速筛选,却难以精细区分候选物的优劣。加权函数方法则对毒性等关键安全性维度考虑不足,易导致评价不全面。为此,亟需一种统一、可推广且可解释的类药性评价范式。研究团队建立了一种基于三元组对比学习的变分自编码框架(CLVAE)方法CLaSP。该方法以分子的ADMET性质为核心,融合经典理化性质与可合成性,并通过半监督的三元组对比损失训练构建了结构良好的“类药”潜空间,进而由潜空间坐标导出可解释的成药性评估。测试结果显示,该评分方法在多个......阅读全文

科学家为年轻人开发心血管疾病终生风险预测模型

近日,《科学通报》(英文版)杂志以封面文章在线发表中国科学院院士、中国医学科学院阜外医院副院长顾东风教授团队的研究成果。该团队在针对国人的China-PAR 10年风险预测模型基础上,进一步开发了适合于我国年轻个体(60岁以下)或者10年动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)风险为中低危个体的

科学家为年轻人开发心血管疾病终生风险预测模型

  近日,《科学通报》(英文版)杂志以封面文章在线发表中国科学院院士、中国医学科学院阜外医院副院长顾东风教授团队的研究成果。该团队在针对国人的China-PAR 10年风险预测模型基础上,进一步开发了适合于我国年轻个体(60岁以下)或者10年动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)风险为中低危个体的终

新的机器学习模型预测CRISPRCas9编辑人原代T细胞的结果

  近日,一项发表于Nature Biotechnology的题为"Large dataset enables prediction of repair after CRISPR-Cas9 editing in primary T cells"研究中,来自Chan-Zuckerberg Biohub

甲基化标记物可预测早期肝癌病人术后复发模型建立方法

  研究背景   在全世界分范围内,每年因肝癌死亡的病例超过50万人,是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中,随着影像学的进步以及健康体检的普及,越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺,外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确预测体系或标志物

近三成美国人预测中国将成为全球科技领导者

民调显示过半选民担心美国科技领导力下滑。图片来源:研究!美国  超过半数的美国人在最近一次全国民意测验中怀疑美国到2020年是否还会被认为是医疗保健的全球领导者,并且近60%的人相信,到那时,将有一个美国之外的国家在科学与技术上引领全世界。负责实施这项民调的健康研究组织“研究!美国”

拉曼光谱技术首发现,无创预测D3胚胎成囊率

  来自中信湘雅医院团队的一项最新研究表明,使用拉曼光谱和深度学习分类模型,能够检测D3胚胎培养基,并预测D3卵裂期胚胎到囊胚期的发育潜力,总体准确率达到73.53%,整体精度接近到74%,敏感性为77.78%,特异性为 72%;预测交付的总体准确性为 80.5%,敏感性为 85.7%,特异性为80

基因突变致青蒿素失效:消灭耐药性疟原虫成防疟重点?

  围绕湄公河三角洲的地区因为疟疾虫泛滥而声名狼藉。上世纪五六十年代,疟原虫已两次对关键药物产生耐药性,其潜在的基因突变无情地席卷全球,迫使公共卫生官员不得不寻找抵抗疟疾的新方法。  现在,耐药性突变再次卷土重来。过去十年,治疗疟疾最有效的药物青蒿素已在柬埔寨、缅甸、越南、老挝以及泰国边境地区越来越

5月5日新冠疫情:新模型预测美国死亡病例将超13万

国内疫情  5月4日0—24时,31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例1例,为境外输入病例(在上海);无新增死亡病例;无新增疑似病例。  当日新增治愈出院病例87例,解除医学观察的密切接触者710人,重症病例减少4例。  境外输入现有确诊病例325例(含重症病例5例),现有疑似

百度研究院2023科技趋势预测:大模型生态初现、虚实共生

  1月5日,百度研究院2023年科技趋势预测如约而至。这是自2020年以来,百度研究院第四次发布十大科技趋势预测。  连续四年发布十大科技趋势预测,百度研究院看到了什么?  “我们欣喜地看到,‘技术向实’正在发生。”百度首席技术官、百度研究院院长王海峰在序言中写道,驱动科技和产业变革的核心技术往往

光合13C分馏模型在叶肉导度影响水分利用效率定量预测...

光合13C分馏模型在叶肉导度影响水分利用效率定量预测的应用     近日,福建师范大学巩晓颖教授、杨玉盛教授团队在”叶肉导度(gm)影响植物水分利用效率(iWUE)预测”方面取得重要进展,相关成果以“Accounting for mesophyll conductance substantially

氮污染正悄然改变全球森林的呼吸方式:这项研究将改变碳循环预测模型

森林正在以一种我们看不见的方式发生改变。一项史无前例的全球分析揭示,氮污染正以两种截然相反的方式重塑森林土壤的“呼吸”节律,而这一变化将对全球碳循环产生深远影响。 由奥胡斯大学领导的国际研究团队汇集了有史以来规模最大的土壤呼吸数据集,涵盖全球168项氮添加实验和3,689项自然观测数据。研究结果发

深度学习复活古老的肽以对抗抗生素耐药性

在最近发表在《自然生物医学工程》杂志上的一项研究中,一组研究人员展示了使用深度学习从灭绝的生物体中复活抗生素肽,为抗生素耐药性和其他生物医学挑战提供了新的解决方案。使用深度学习从古代蛋白质组中去除抗生素的分子灭绝。 所有可用的灭绝生物的蛋白质组都是通过我们的深度学习算法APEX挖掘的。将已灭绝生物体

新药DT109成功治疗动物模型的脂肪肝疾病

  一种新发现的氨基酸化合物被发现成功地治疗了非人类灵长类动物的非酒精性脂肪肝,代表着向开发这种迅速蔓延的健康状况的首个人类治疗方法迈出了重要一步。密歇根医学院的科学家们已经开发了DT-109,一种基于甘氨酸的三肽,作为一种治疗被称为非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的严重形式的脂肪肝的方法。NASH会

科学家利用AI预测小样本数据下抗耐药菌聚合物结构

华东理工大学教授唐漾与刘润辉合作,依赖小样本(1060)中精准预测聚合物抗菌活性,并通过逆向设计发现大量具有突出广谱抗耐药菌活性和高选择性的优选聚合物结构,为抗耐药菌多肽模拟聚合物研究提供了新思路。相关研究发表于《自然—通讯》。全球抗生素耐药性风险不断升级,亟需探索高效抗耐药菌广谱抗菌剂的新策略。宿

黄芩的药性如何?

  黄芩味苦、性寒,归肺、胆、脾、大肠、小肠经。黄芩的苦味具有清热燥湿、泻火解毒的作用,寒性则有助于清除体内的热邪。因此,黄芩常用于治疗热性疾病和症状,如发热、口渴、咳嗽、咽喉肿痛等。  需要注意的是,黄芩性寒,脾胃虚寒者慎用。此外,黄芩不宜与藜芦同用。在使用黄芩时,请遵循医嘱,确保安全有效地治疗疾

黄芩的药性如何?

  性味归经:黄芩味苦,性寒。归肺、胆、大肠、胃经。  主要功效:黄芩具有清热燥湿、泻火解毒、凉血止血、安胎等功效。  清热燥湿:黄芩苦寒,能清热燥湿,主要用于湿热蕴结所致的黄疸、泄泻、痢疾等病症。  泻火解毒:黄芩具有很好的清热解毒作用,可用于治疗高热烦躁、口渴引饮、咽喉肿痛、痈肿疔疮等病症。  

靶标预测

靶标预测A:有什么简单的方法可以通过化合物的结构式预测该化合物可能的药理毒理作用么,比如抗肿瘤,抗炎,抗神经等等。B:反向找靶。A:那就复杂咯,想简单点,然后去做细胞实验验证。想着是不是可以通过计算机来预测哈子。C:反向对接。D:直接做激酶谱不就行了。E:多糖类药物可以做这个激酶谱吗?F:激酶谱 一

新AI模型可大幅提高化合物蛋白质相互作用预测可靠性

中国科学院上海药物研究所研究员郑明月,副研究员张素林、李叙潼,提出了基于知识图谱的人工智能计算模型PertKGE,并以数据驱动的形式从微扰转录组数据中解耦出化合物-蛋白质相互作用(CPI)。9月19日,相关研究发表于《细胞基因组学》。对化合物和蛋白质之间的相互作用进行建模,是药物发现的基础。目前,研

如何提高生态模型构建技术预测苔藓物种分布和多样性变化的准确性?

以下是一些提高生态模型构建技术预测苔藓物种分布和多样性变化准确性的方法:数据质量和数量提升收集更多、更全面和更精确的苔藓物种分布数据,包括增加调查地点的覆盖范围和密度。确保环境变量数据的准确性、高分辨率和长时间序列,以捕捉更细微的环境变化。精细的环境变量选择不仅仅局限于常见的气候和地形变量,还应考虑

新AI模型可大幅提高化合物蛋白质相互作用预测可靠性

中国科学院上海药物研究所研究员郑明月,副研究员张素林、李叙潼,提出了基于知识图谱的人工智能计算模型PertKGE,并以数据驱动的形式从微扰转录组数据中解耦出化合物-蛋白质相互作用(CPI)。9月19日,相关研究发表于《细胞基因组学》。对化合物和蛋白质之间的相互作用进行建模,是药物发现的基础。目前,研

帕金森体外模型帕金森体外模型

体外培养的中脑多巴胺能神经元MPTP损伤模型l实验操作:实验采用胚胎龄14一16天的大鼠,剖子宫取胎,取胎鼠中脑腹侧区。可将多个胚胎来源的组织收集在一起,置Fl2培养基(Gibco)至35mm的培养皿中,以细剪刀剪碎。将2ml含0.125%的胰酶的F12加入到组织中,该混合物于37oC孵育10分钟后

石头拉丝做衣服?玄武岩矿石熔体粘度预测与成纤领域新突破

棉、混纺、化纤、真丝……市面上的服装材质五花八门,但你见过石头拉丝做的衣服吗?这种特殊的石头就是玄武岩,天然玄武岩矿石经高温熔融拉制后,就会变成强度高、密度低的玄武岩纤维。近日,中国科学院新疆理化技术研究所科研团队与香港理工大学合作,在玄武岩矿石熔体粘度预测方面取得进展,相关成果发表于《非结晶固体杂

体外筛选-轻松评估耐药性!

  耐药性威胁着全球对疟疾的控制和消除工作,因此有必要发现和开发新的抗疟疾药物。此外,在临床使用中,疟原虫对每种抗疟药都产生了耐药性,这促使人们需要鉴定出介导耐药性的途径。  在一项新的研究中,美国研究人员报道了一种用于评估恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)对新型抗疟疾药物产生

新型药物组合可以克服耐药癌细胞

  癌细胞能够适应并产生对化疗药物的耐药性,这使得根除肿瘤变得困难。由布莱根妇女医院的研究人员领导的一项新研究表明,三种药物的组合,包括一种新的葡萄糖-6-磷酸脱氢酶抑制剂,可以克服交叉治疗耐药性。这项研究的结果于近日发表在《Science Signaling》杂志上。  "我们只是在最近才开始解开

清华大学药学院学者开发基于蛋白质语言模型的结构与功能预测方法

  研究背景  随着计算生物学的快速发展,我们正处于一个由数据驱动的生物信息学新时代。蛋白质,作为生命活动的执行者,其结构和功能预测一直是科学研究的核心问题。近年来,深度学习技术的突破性进展,尤其是蛋白质语言模型的兴起,为研究者们提供了一个全新的视角来了解蛋白质在生命体内所扮演的角色。  蛋白质语言

基于循环肿瘤DNA甲基化特征的结外NK/T细胞淋巴瘤诊断预测模型

  结外NK/T细胞淋巴瘤(ENKTL)是非霍奇金淋巴瘤的一种少见亚型,多数病例发生在鼻腔和咽喉部以上部位,又称鼻型NK/T细胞淋巴瘤。ENKTL的诊断依赖于病理学检查,然而坏死组织的存在以及发病部位的解剖学复杂性为病理采样带来了挑战。目前临床使用Ann Arbor分期标准和NK/T细胞淋巴瘤预后指

有哪些数学模型可以用于预测指示生物在不同环境条件下的反应?

以下几种数学模型可用于预测指示生物在不同环境条件下的反应:逻辑斯蒂增长模型(Logistic growth model):用于描述生物种群在有限资源环境中的增长规律,可预测种群数量随环境条件的变化。多元线性回归模型(Multiple linear regression model):可以将指示生物的

百度螺旋桨团队成果登NMI:对化合物3D建模

日前,国际知名机器学习学术期刊Nature Machine Intelligence(NMI,近2年影响因子≈16.649)在线发表了百度生物计算团队(“螺旋桨”团队)的最新研究成果,论文提出基于空间结构的化合物表征学习方法,即“几何构象增强AI算法”(GEM模型),将化合物的几何结构信息引入自监督

赤白芍的药性介绍

  赤芍药气味苦平,无毒。主治邪气腹痛,除血痹,破坚积,寒热,病疲,止痛,利小便,益气。   芍药始出中岳山谷,今白山、蒋山、茅山、淮南、杨州、江浙、吴松处  处有之,而园圃中多旖植炙。春生红芽,花开于三月四月之问,有赤白二色,又有干叶、单叶、楼子之不同,入药宜用单叶之根,盖花薄则气藏于根也。开赤花

法半夏的药性如何?

  法半夏是一种中药材,其药性为辛、温。归肺、脾、胃经。具有燥湿化痰、降逆止呕的功效。常用于治疗咳嗽、痰多、胸闷、呕吐等症状。