我国科研机构发布细胞组学技术Stereocell

j近日,华大生命科学研究院牵头建设的基因组多维解析技术全国重点实验室联合多家机构,发布全球领先的细胞组学技术Stereo-cell。相关研究成果发表在学术期刊《科学》上。该技术的发布标志着中国在细胞组学技术领域取得原创性引领成果,颠覆性实现多模态整合、原位动态捕捉、极限样本兼容、百万级通量等技术突破,彻底打破传统单细胞测序技术局限。Stereo-cell技术特点总结。“一次实验就能捕获百万数量细胞,并且获取形态、转录和蛋白特征,实现更深度地解析细胞的病理状态。”华大生命科学研究院研究员刘传宇表示,“Stereo-cell是单细胞组学迈向临床细胞组学的里程碑,有望在疾病机制研究和临床转化中发挥巨大潜力。”据悉,Stereo-cell基于高密度DNA纳米球(DNB)阵列芯片,在无须依赖特定设备进行细胞分隔封装的情况下,直接对细胞进行原位捕获和转录组测序,实现从百个至百万个量级细胞的无偏捕获,同步解析细胞的转录、蛋白信号与形态学信息,......阅读全文

单细胞表观组学:单细胞ChIPseq解码细胞命运决定机制

  在国家重点研发计划“干细胞及转化”重点专项(批准号:2017YFA0103402)等资助下,北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬课题组近期突破单细胞表观遗传研究的瓶颈,开发了两种具有普适性、操作简单、风格迥异的单细胞ChIP-seq技术,可适应于不同课题研究需要,解析发育与疾

细胞生物学实验技术

细胞生物学实验技术METHODS AND TECHNIQUES第一节显微技术光学显微镜:以可见光(或紫外线)为光源。电子显微镜:以电子束为光源。一、光学显微镜(一)普通光学显微镜1、构成:①照明系统②光学放大系统③机械装置2、原理:经物镜形成倒立实像,经目镜进一步放大成像。3、分辨力:指分辨物体最小

细胞生物学技术展望

尽管研究细胞结构与功能的方法和技术已经有了重大突破,但科学探索的脚步从来就不会停歇。2012年,也许我们会看到更多成像技术的出现,更多的荧光蛋白工具,超高分辨率成像技术进入新的应用领域。无论如何,细胞成像方法上的每一个技术进步都将让我们更深入地了解细胞内部的世界。 在几年前的2008年,细胞成像技术

宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组

  来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。   由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。   宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术,并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增

细胞衰老的溶酶体代谢组学研究的新突破

  溶酶体对细胞代谢至关重要,并异质地参与各种细胞过程。测量溶酶体代谢异质性的能力对于理解它们的生理作用至关重要。  2021年6月14日,中国科学技术大学熊伟与仓春蕾共同通讯在Nature Methods 在线发表题为“Metabolomic profiling of single enlarge

布鲁克发布全新空间单细胞代谢组学研究策略

  摘要  * 创新的无偏原位空间单细胞代谢组学(SSCM)能够以单细胞分辨率实现高通量代谢组织样本表征;  * 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技术可在大视场内提供几乎无伪影的小分子图像;  * 创新的 4D-代谢组学可通过 CCS-Predict

复旦大学发表蛋白质组学新技术

  复旦大学现代色谱分离分析实验室的研究人员设计出一种基于芯片的二维液相色谱系统,可在质谱分析之前去除血浆样品中的高丰度蛋白。这项成果于近日发表在《Analytical Chemistry》上。  对于血浆样品的质谱分析,一个重大挑战是高丰度蛋白往往占据了主要信号,而掩盖了人们感兴趣的低丰度蛋白的信

2015-年代谢组学技术高级培训班通知

      代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科,是系统 生物学的重要组成部分。已在疾病诊断、医药研发、精准医学、营养食品科学、 毒理学、环境学,植物学等领域得到广泛应用。      中国的代谢组学与国际在同步发展,到目前为止,中国人发表的代谢组学相 关的文章数量已在国际上排第

代谢组学技术在临床医学中的应用

  代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新发展起来的一门学科,它通过对人体内小分子代谢物(50~1,500 Da)进行精准定性定量,分析代谢物与人体生理病理变化的关系,研究疾病发生发展、寻找疾病生物标记物、预测疾病预后等。代谢组学在临床诊断上将有广阔的发展前景,主要应用方向有四个方面:在临床诊断(B

蛋白质组学哪些技术需要进行重复实验?

Label free需要进行三次重复,而iTRAQ、TMT一般建议客户做3次实验重复,如果实验方案后期设计了大量的验证实验如WB或ELISA等,最好做也能做两次重复;如果不进行重复实验后期的验证实验也少,在后期发表文章的时候结果可能会受到一些审稿人的质疑,从而影响文章的发表,特别是一些高分杂志较

华盈视角:蛋白质组学——质谱技术

蛋白质作为功能的直接执行者,在生物医学领域中有着重要意义,检测蛋白质表达、修饰、互作等有助于我们理解生命机体的各类机制和活动规律,为疾病的治疗、诊断,药物的开发、优化等提供有力的支持。质谱技术作为检测蛋白质组学的主流技术,有必要了解其核心原理,才能更好的服务于科学问题的解决。1.质谱的原理: 质谱是

全面解读药物基因组学基因检测技术

全面解读药物基因组学基因检测技术FDA和CFDA分别于2010和2012年将CYP2C19基因检测的重要性说明纳入氯吡格雷的药物说明书。在国内,阜外医院已完成氯吡格雷用药基因检测超过20000例,居全国单中心检测量之首。以下列出了药物基因组学涉及的主要基因及对应的个体化用药:(4)  以下为上述三大

技术组学研究汞及纳米材料环境健康效应

成都市疾病预防控制中心邹海民研究员  成都市疾病预防控制中心邹海民研究员发表主题为“技术组学研究汞及纳米材料环境健康效应”的精彩报告。报告介绍了采用HPLC-ICP-MS/MS建立食用菌6砷形态(砷胆碱、砷甜菜碱、亚砷酸盐、二甲基砷、一甲基砷和砷酸盐)和4种汞(无机汞、甲基汞、乙基汞苯基汞)的分离检

“鸟枪法(shotgun)”定量蛋白质组学技术

  1999年,Yates研究组提出“鸟枪法”(shotgun),其基本技术路线是针对液体或SDS-PAGE条带的复杂混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物,然后对肽混合物进行多维毛细管液相色谱分离和串联质谱分析以及数据库检索,从而确定蛋白质的种类,可同时鉴定成百上千种蛋白质。他们把这种思路称

蛋白质组学实用分析技术一览

分析其实也属于技术的一部分,且在蛋白质组学研究中显得尤为重要,因为蛋白质组学研究提供的数据是生物学上最庞大的,而且蛋白质组比基因组具有更大的复杂性,因此蛋白质组信息学更有挑战性。今天小编先抛砖引玉地介绍几个常用的分析方法和软件。蛋白质定性分析蛋白质定性分析通常是指利用质谱法进行蛋白质鉴定和序列分析。

单细胞组学解码泛癌肿瘤微环境中的T细胞

T细胞是最关键的抗肿瘤免疫细胞。肿瘤微环境中存在“肿瘤浸润T细胞”亚群,能够对肿瘤抗原产生反应,肩负着清除肿瘤细胞的重任,也是摧毁癌细胞的“主力军”。然而,随着肿瘤发展,这些英勇的“战士”常常陷入功能失调状态,“战斗力”大幅下降,被科学家称为“T细胞耗竭”。越来越多的证据表明,不同癌症的肿瘤微环境对

单细胞蛋白质组学:让细胞个体研究更加精细

    细胞是生命活动的基本单元。对细胞的精确认知是理解细胞在生理和病理过程中功能的先决条件。    在组织、器官或个体中,细胞具有非常大的异质性,而传统的研究手段针对大量细胞进行分析,得到的是大量细胞的平均结果,无法区分不同细胞个体对于大量样品结果的具体贡献值,从而忽视或掩盖了单细胞的个体差异,不

北大汤富酬课题组发表单细胞表观多组学测序技术新成果

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

发现组学力量,共推组学发展

  分析测试百科网讯 2020年11月27日,由赛默飞世尔科技主办、分析测试百科网协办的组学技术前沿创新高峰论坛在成都隆重举行。本次会议旨在“发现质谱力量”,邀请国内组学领域大咖共讨质谱在组学研究中的“力量”,期望共同推动中国组学研究发展。赛默飞中国区色谱与质谱业务应用支持总监薄涛博士主持大会开幕赛

赛默飞组学技术前沿创新高峰论坛,带您发现组学的力量

  分析测试百科网讯 2020年11月27日,由赛默飞世尔科技主办、分析测试百科网协办的组学技术前沿创新高峰论坛在成都隆重举行。本次会议旨在“发现质谱力量”,邀请国内组学领域大咖共讨质谱在组学研究中的“力量”,期望共同推动中国组学研究发展。  赛默飞中国区色谱与质谱业务应用支持总监薄涛博士主持本次大

利用植物表型组学挖掘基因组学的成果

到2050年,全球人口将达到97亿,预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标,作物产量需每年增长2.4%,但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素,但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可

大咖云集,共襄单细胞多组学及空间组学线上峰会

  2009年,第一篇单细胞mRNA测序的文章的发表,标志着单细胞转录组测序的时代正式来临。2013年,单细胞测序技术被《Nature Methods》评为年度技术。同年,《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。  目前,基于单细胞技

大咖云集,共襄单细胞多组学及空间组学线上峰会

  2009年,第一篇单细胞mRNA测序的文章的发表,标志着单细胞转录组测序的时代正式来临。2013年,单细胞测序技术被《Nature Methods》评为年度技术。同年,《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。  目前,基于单细胞技

布鲁克4D蛋白质组学新技术斩获HUPO-2020科学技术奖

  摘要prm-PASEF®方法大幅提高4D-靶向蛋白质组学定量能力Matthias Mann 实验室利用dia-PASEF®、超低流量Evosep色谱和TIMS/PASEF装置的进一步的改进实现单个细胞鉴定超过1000种蛋白质布鲁克获得Albert Heck实验室的PhoX交联剂许可,caps-P

植物学技术:细胞伤口愈合实验

原理:细胞伤口愈合实验被研究者广泛应用和改进,用来研究各种实验条件比如基因敲除和化疗在细胞迁移和增殖中的作用。该实验操作简单,费用廉价,实验条件容易根据不同的目的改进。该方法的基本原理是,在单层培养细胞间制作划痕以产生愈伤区域,然后监控该伤口周围细胞的向划痕迁移的现象,即伤口愈合。改变细胞迁移和/或

Science最新综述-|-空间组学技术概览与展望,详解技术原理与优势

  导读  几乎所有看似无限复杂的生物学都发生在三维空间中。在生物体内,细胞必须在三维组织中相互作用和组合,每个细胞的位置与其固有性质一样重要,决定着组织的功能或疾病的功能障碍。因此,即使在研究简单生物体或单个组织的结构时,不仅需要破译成千上万个细胞的分子谱,还需要了解空间环境如何以及造成怎样的影响

我国在单细胞蛋白质组学研究获突破

  浙江大学化学系微分析系统研究所方群教授团队,联合北京大学医学部精准医疗多组学研究中心主任黄超兰教授团队,在单细胞蛋白质组学分析研究领域取得突破性进展。研究论文近日在线发表在美国《分析化学》杂志上。  黄超兰介绍,近年来,基于细胞群体内的蛋白质组学研究,已越来越难以满足对生命功能深入探究的需要。从

定量蛋白质组学揭开巨噬细胞活化的秘密

巨噬细胞活化是许多疾病发展过程中的关键步骤,包括动脉疾病。最近,布莱根妇女医院和哈佛医学院的研究人员通过蛋白质组学及其他分析,强调了PARP9和PARP14在调节巨噬细胞活化中的作用。这项成果发表在《Nature Communications》上。布莱根妇女医院的Masanori Aikawa及其同

什么是糖组学

聚糖作为生物体的一部分,在细胞识别间占有重要地位.影响生物体的基本生命过程.对糖进行研究已成为生命科学领域研究的热点.糖组学是随之发展起来的研究聚糖结构和功能的一门新的学科,