Thescientist为你解读神秘的eRNA
近年来科学家们发现,增强子也常常转录成RNA,不过他们还不能确定这些eRNA有何功能。日前,The scientist杂志刊发文章对这种神秘的eRNA进行了解读。 增强子大约发现于三十五年前,关于这一元件还有许多的未解之谜。与启动子不同的是,增强子能够上调较远距离的基因,这一距离并不一定,不过一般认为低于100kb。虽然增强子调控的基因大多与之相近,但也不全是这样。以人类基因组中的发育基因Sonic hedgehog为例,它的增强子离启动子差不多有1Mb远。 增强子在人体生物学中具有关键性的作用。有研究曾构建了人类基因组中的增强子表达图谱,发现增强子在不同细胞类型之间存在差异性的表达 。另外与外显子相比,人类疾病相关的单核苷酸变异能够在增强子和启动子中得到更好的体现。 2010年,哈佛医学院的神经生物学家Michael Greenberg领导研究团队在Nature杂志上发表文章指出,增强子能够转录为RNA。研究人员对体......阅读全文
关于增强子的分类介绍
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类: ①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性,只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下,才能发挥其功能。 ②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如,金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录,又可受类固醇
基因组精确注释新方法:增强子鉴定新技术
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所动物功能基因组学创新团队研发出增强子鉴定新技术。该技术与传统技术相比,平均分辨率提高了约10倍,为基因组的精确注释提供了新方法。相关研究成果发表在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上。 增强子是一种基因组非编码区的顺式调控元件,
最广泛的人类基因组相互作用图谱
最近,英国剑桥Babraham研究所和伦敦Francis Crick研究所的研究人员,开发并使用了一种新的技术,将基因组拼图中的点连接起来。就像连接点拼图,需要完成才能看到整幅图片,研究者的这项分析把称为启动子和增强子的调控因子连接起来,并指出了它们在小鼠和人类基因组中长距离内的物理相互作用。确
关于双顺反子mRNA的侧翼序列的介绍
侧翼序列包括前导区、尾部区、调控区,调控区又包括启动子、增强子、终止子等: 1、前导区和尾部区 此二区被转录并参与成熟mRNA的组成,但不被翻译,前者位于转录起始点和第一外显子之间,相当于mRNA5’端的非翻译区(5’UT);后者位于最末外显子和终止子之间,相当于mRNA3’端非翻译区(3
侧翼序列的主要组成
侧翼序列包括前导区、尾部区、调控区,调控区又包括启动子、增强子、终止子等:1、前导区和尾部区 此二区被转录并参与成熟mRNA的组成,但不被翻译,前者位于转录起始点和第一外显子之间,相当于mRNA5’端的非翻译区(5’UT);后者位于最末外显子和终止子之间,相当于mRNA3’端非翻译区(3'U
单细胞染色质图谱|揭示转录因子网络和细胞谱系关系
2019年10月8日,美国圣地亚哥的Salk研究所的Geoffrey Wahl团队在Cell Reports杂志上发表文章“Single-Cell Chromatin Analysis of Mammary Gland Development Reveals Cell-State Transcr
研究发现影响血液干细胞中特殊基因表达的关键元件
基因转录通常会被启动子和调节元件(比如增强子和沉默子)之间的染色质环来进行调节,不同的转录因子(TFs,transcription factors)能够与这些调节元件结合,并以一种细胞类型特异性的方式来调节启动子-增强子环。尽管其在控制基因表达方面发挥着重要作用,但转录因子如何促进启动子-增强子
Nature子刊发布最全面的基因组“通讯录”
启动子是控制基因开或关的关键DNA片段,它们的功能异常与多种疾病有关。科学家们在人类基因组中全面分析了启动子和增强子的远距离互作,绘制了迄今为止最全面的启动子互作图谱,有助于进一步理解疾病的遗传学基础。 这份图谱记录了上百万的启动子互作。“这就像是一本通讯录,现在我们知道通讯录中谁和谁在通话,
增强子的定义
增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域,与蛋白质结合之后,基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游,也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因,这是因为染色质的缠绕结构,使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
血病相关的基因突变及临床解释CBFB基因
该基因编码的蛋白质是属于pebp2/cbf转录因子家族的异二聚体核心结合转录因子的β亚单位,该转录因子家族主要调控造血(例如runx1)和成骨(例如runx2)特异性基因的宿主。β亚单位是一种非DNA结合调节亚单位;当复合物与各种增强子和启动子(包括小鼠白血病病毒、多瘤病毒增强子、T细胞受体增强子和
CBFB基因的结构和作用
该基因编码的蛋白质是属于pebp2/cbf转录因子家族的异二聚体核心结合转录因子的β亚单位,该转录因子家族主要调控造血(例如runx1)和成骨(例如runx2)特异性基因的宿主。β亚单位是一种非DNA结合调节亚单位;当复合物与各种增强子和启动子(包括小鼠白血病病毒、多瘤病毒增强子、T细胞受体增强子和
基因捕获技术:-创建人类单倍体细胞库
日前,使用名为“基因捕获”(gene trap)的技术,奥地利的研究人员建立了一个人类单倍体细胞库,这个细胞库汇集了3000 多种细胞系,每个细胞系都具有一种不同的突变基因。相关的研究论文发表在8月25日的Nature Methods杂志上。渥太华大学教授William Stanford
CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激...(二)
3. CRISPR-dCas9-SunTag-VP64系统单独对Sox2基因进行内源激活,也能有效获得iPS研究者单独选取了能对Sox2进行激活的SgRNA进行iPS诱导,发现在有效激活内源Sox2基因表达的情况下,能成功得到诱导性多能干细胞,并能稳定增殖传代。得到iPS通过体内体外实验,如干细胞基
科学家发现基因表达调控核心复合物LDB1/SSBP2的分子机制
12月31日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了题为Crystal structure of human LDB1 in complex with SSBP2 的论文,该项工作由中国科学院生物物理研究所许文青/梁栋材课题组和美国国立卫生研究院Ann Dean课题组合作完成。 增强子是
科学家揭示基因表达调控核心复合物LDB1/SSBP2的分子机制
近期,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了题为Crystal structure of human LDB1 in complex with SSBP2 的论文,该项工作由中国科学院生物物理研究所许文青/梁栋材课题组和美国国立卫生研究院Ann Dean课题组合作完成。 增强子是一种控制
LSC功能和特性的染色质三维调控景观获揭示
角膜缘干细胞(limbal stem cell,LSC)位于角膜与结膜交界处的角膜缘区域,在角膜上皮稳态维持、角膜透明性和完整性中发挥关键作用。近日,中山大学中山眼科中心欧阳宏团队研究发现影响LSC功能和特性的染色质三维调控景观。相关研究发表于《自然-通讯》。李名森副研究员为该论文第一作者,欧阳宏教
真核基因表达载体的构建
提高目的基因在哺乳动物细胞中表达的策略:1、DNA水平:增加基因拷贝数(1)高拷贝载体;(2)基因共扩增;2、转录水平:利用强启动子、增强子,可诱导启动子,如CMV、Tet;3、翻译水平:优化翻译起始序列和非编码区序列。本篇文章来源于网络,如有异议请联系我们,我们将在3个工作日内作出处理。
你可能提过很多质粒-却不一定知道这些
经常提质粒吗?熟练之后,提质粒乃至质粒构建都很简单。但如果真问起一些质粒的细节,可能很多人回答不了。不信随我看看。 质粒组成要素 一个合格的质粒含有以下组成部分: 复制起始位点 Ori 即控制复制起始的位点。原核生物 DNA 分子中只有一个复制起始点。而真核生物 DNA 分子有多个复制起始位点。
如何跑赢种猪育种效率“竞赛”
猪肉占我国居民肉类消费的60%,随着生活水平的提高,人们对瘦肉的消费需求量逐步提高,我国养猪业主体也过渡到养瘦肉猪。 现代养猪业中,瘦肉猪养殖占90%以上,当前国际上猪育种主要工作是对杜洛克、长白、大白等少数几个当家瘦肉猪品种进行产肉性能改良。 华中农业大学教授赵书红告诉《中国科学报》,
结构基因的侧翼序列的介绍
1、前导区和尾部区 此二区被转录并参与成熟mRNA的组成,但不被翻译,前者位于转录起始点和第一外显子之间,相当于mRNA5’端的非翻译区(5’UT);后者位于最末外显子和终止子之间,相当于mRNA3’端非翻译区(3'UT)。前导区和尾部区转录后的相应序列在mRNA中起维持mRNA稳定性的
癌基因的激活方式有哪些?
(1)插入强启动子或增强子 (2)基因突变 (3)基因扩增 (4)基因重排或染色体易位。 肿瘤的发生与发展往往涉及多种癌基因的激活。
CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激活细胞
题目:CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus Enables Reprogramming to Pluripotency 期刊:Cell stem cell 影响因子:23.3
CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激活细胞
题目:CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus Enables Reprogramming to Pluripotency 期刊:Cell stem cell 影响因子:23.3
胰腺癌致病关键,也许藏在基因启动子中
过去 10 年来,对于肿瘤进行测序极大地增加了人们对于癌症的认识。根据不同的基因突变,许多看似相同的肿瘤被分成了许多亚型,而以此为基础,越来越多的个性化肿瘤药物相继出现。 不过,这些努力绝大部分都集中在人类染色体上的基因外显子部分。事实上,人类 21000 个基因的外显子序列仅仅占到了全部染色
双向启动子可以协调调控反向运行的基因
新的分析发现,发散性转录(一个启动子引导两个相邻基因向相反方向表达)在生命的所有领域都是保守的。 与生物学教科书中描述的相反,细菌和古生菌可以在基因组上以相反的方向进行转录。这要归功于双向启动子——RNA聚合酶可以在DNA序列上跳动,并以或另一种方式移动产生mRNA转录本。 5月6日发表在N
增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示
广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作,首次报道了植物中的增强子转录,初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》(Genome Biology)。 增强子是一种40
增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示
广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作,首次报道了植物中的增强子转录,初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》(Genome Biology)。 增强子是一种40
“超级增强子”调控关键基因-科学家为其编目录
据物理学家组织网10月10日报道,最近,美国怀特黑德生物医学研究所科学家发现了一套称为“超级增强子”的基因调控器,能控制、影响人类和小鼠的大量细胞型。研究人员指出,超级增强子富集在基因组的变异区,而这些变异区与多种疾病谱系密切相关,所以它们最终可能在疾病诊断与治疗方面发挥重要作用。相关论文在线发
马铃薯低温糖化-关键基因活跃之谜揭开
安徽农业大学获悉,该校园艺学院教授朱晓彪团队与国内外团队合作,揭开了马铃薯低温糖化关键基因活跃之谜。该项研究成果为研究植物逆境应答相关基因的调控和适应提供了很好的模型系统。相关研究成果近日发表于植物学领域期刊《植物细胞》。马铃薯块茎含水量较高,通常在低温下贮藏,以减少发芽和病害带来的严重损失。然而,
简述原癌基因的活化机制
从正常的原癌基因转变为具有使细胞转化功能的癌基因的过程,称为原癌基因的活化。原癌基因活化的机制主要有四种:获得强启动子与增强子;染色体易位;基因扩增;点突变。