昆明动物所在预测蛋白质功能位点方面取得重要进展
随着蛋白质结构信息的不断积累，以及结构基因组学不断的发展，越来越多的功能未知但结构已知的蛋白质提交到了国际大分子数据库中(PDB数据库)，这些蛋白质的功能及其功能位点需要注释。而随着实验生物学的不断发展，以前一些已知功能的蛋白质的功能及其功能位点可能需要重新注释。因此，发展一种精确快速的可用于大规模功能注释的算法是结构生物信息学的重要研究内容之一。尽管已有许多算法用来对蛋白质结构或序列进行功能注释，但这些算法的精确性，敏感度等需要更进一步的提高。 日前，中国科学院昆明动物研究所黄京飞研究员指导的博士研究生李功华，开发出一个新的预测蛋白质功能位点的算法（CMASA）。这个算法相对于其它已知的算法具有更高的精确性和敏感性，而且具有计算速度快的特点。利用CMASA，黄京飞研究员课题组研究人员对PDB数据库中的酶进行了催化位点的注释并发现了166个新的未被注释的酶的催化位点。 该研究工作已发表在......阅读全文
“敦煌遗书数据库”建成投用
3月10日，在十四届全国人大二次会议甘肃代表团开放团组活动上，敦煌研究院党委委员、保护研究部副部长汪万福代表介绍，该院“流失海外敦煌文物数字化复原项目”迈出实质步伐，“敦煌遗书数据库”业已建成投用。 汪万福说，敦煌研究院还组建了甘肃省敦煌文物保护研究中心，建成国内首座文物保护领域多场耦合实验室
英国启动细胞产品试验数据库
英国细胞治疗产品行业现在拥有了一个数据库，该数据库囊括了该国所有正在进行之中的临床试验项目。建立这个数据库的目的是要扩大研究合作，将更多的早期试验推进到后期开发阶段。 囊括21个研究项目 这个数据库包括21个细胞治疗研究项目，由英国细胞疗法中心(CTC)发起，并得到了英国技术战略委员
生命科学国外重要数据库
EMBL数据库结构EMBL数据库的基本单位也是序列条目，包括核甘酸碱基排列顺序和注释两部分。序列条目由字段组成，每个字段由标识字起始，后面为该字段的具体说明。有些字段又分若干次子字段，以次标识字或特性表说明符开始，最后以双斜杠“//”作本序列条目结束标记。条目的关键字包括ID（序列名称），DE（序列
国内首个向量数据库标准发布
11月15日，中国信通院联合腾讯云计算（北京）有限责任公司、中移（苏州）软件技术有限公司等多家企业共同编制的、国内首个向量数据库标准正式发布，将为我国向量数据库研发、测试及选型提供重要参考，推动我国人工智能产业高质量发展。 向量数据能够从多个维度记录事物特征，是人工智能时代的基础数据形式。人工
siRNA数据库与设计工具
siRNA DatabaseSearchable database of Silencer ™ Validated and Pre-designed siRNAs to >34,000 human, mouse, and rat targets. All siRNAs in the database
植物生物学研究数据库
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
首个免疫衰老多组学数据库设立
记者12月17日从中国科学院基因组所（国家生物信息中心）了解到，该所研究员张维绮团队、鲍一明团队与中国科学院动物研究所研究员刘光慧、曲静研究组合作，建立了免疫衰老领域首个多组学数据库Immunosenescence Inventory，旨在为整合和分析与免疫衰老相关数据提供一体化平台。随着全球人口老
美国CDC将建炭疽杆菌公共数据库
日前，美国疾病预防控制中心（CDC）表示，将在亚特兰大建立一个有关炭疽杆菌的公共数据库。CDC称，已经在寻找可以建立这一公共数据库的承包商。 这一举动源于6月份在亚特兰大实验室发生的炭疽杆菌事件。由于实验室部分研究人员，在让炭疽杆菌失去活性时未遵守适当程序，便将可能含有活菌样本转移到安
建立临床数据库的好处有哪些？
建立临床数据库具有以下诸多好处： 1. 提高医疗质量：通过对大量病例数据的分析，可以发现治疗过程中的优势和不足，从而优化治疗方案，提高医疗效果和患者的预后。 2. 支持临床研究：为医学研究提供丰富的数据资源，有助于发现疾病的发病机制、危险因素和新的治疗靶点，推动医学科学的发展。 3. 促进个性
全球最大自闭症数据库上线
总部位于美国纽约的Simons基金会日前宣布，全球最大的自闭症数据库（SSC）正式上线并向全球科学家开放。目前已有来自美国、加拿大、中国、法国、冰岛、澳大利亚、爱尔兰、巴西和卡塔尔等17国家相关机构的自闭症研究人员，通过云端查询等方式使用了这一数据库。 SSC包含近2600个家庭的基因组序列数
英特尔将建帕金森患者数据库
帕金森症的患者通常都会被要求尽可能细致地做好自己的病情记录，以便于医生判断病情的进展。但不少患者都抱怨，我虽然正视自己的病情，但帕金森病并不是我生活的全部啊，按医生要求那样的忠实完整记录自己的病情？说起来容易做起来难！ 好消息是，现在的病情监测可以很容易了。拜可穿戴技术所赐，帕金森病患者运
美国CDC将建炭疽杆菌公共数据库
日前，美国疾病预防控制中心（CDC）表示，将在亚特兰大建立一个有关炭疽杆菌的公共数据库。CDC称，已经在寻找可以建立这一公共数据库的承包商。 这一举动源于6月份在亚特兰大实验室发生的炭疽杆菌事件。由于实验室部分研究人员，在让炭疽杆菌失去活性时未遵守适当程序，便将可能含有活菌样本转移到安全措施
天津建成食品污染物数据库
日前从天津市卫生计生委、市卫生监督所获悉，为了扩大食品污染物及有害因素监测覆盖面，实现对食源性疾病的主动监测，该市食品安全风险监测区域已覆盖全市16个区县，食源性疾病监测哨点医院已由18家增加到33家，并已形成了市食品污染物数据库。 根据目前在食品安全领域担负的职责，该市卫生计生部门规划建立了
全球最大地震数据库建成
国际地震学中心绘制的2万次地震数据集。 2004年苏门答腊岛地震、2008年中国汶川地震、2010年海地地震、2011年日本地震，在每次灾难中，故事都是相同的：一场地震在毫无征兆的情况下发生，夺走成千上万条生命，并且摧毁了像沙子城堡一样的建筑。 地球科学家依然无法预测一场大地震
Nature：癌症数据库ClinVar打破Myriad垄断
去年，美国最高法院判定Myriad Genetics持有的BRCA1和BRCA2 DNA序列测试ZL无效，美国最高法院判定也意味着未来美国国内的癌症检查价格将变得更加便宜、普遍。 BRCA1基因的发现和致病相关性是Mary-Claire King博士在1990年发现，尽管当时她的研
我国首个寻亲DNA数据库在京建立
科技日报消息，我国第一个专门面向失散人员的寻亲DNA数据库日前在京宣告建立。据数据库建设方中科院北京华大方瑞司法物证鉴定中心的有关负责人介绍，通过该库，寻亲工作将变得方便快捷。同时，该库将免费为我国失散人群提供寻亲帮助，包括港澳台地区。 据悉，该库的第一批样本检测用试剂已经得到了美国
全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的
代谢组学常使用的数据库
代谢组主要是对小分子代谢物（一般50-1500 Da）进行高通量定性和定量分析，代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据，方便后续的代谢组学数据分析，揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。 目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD
TPC：中国数据库性能破世界纪录
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497431.shtm
武汉将建温室气体排放因子数据库
武汉碳减排协会今天发布消息称，作为国家确定的7个碳排放权交易试点之一的武汉碳交易系统今年内将全面上线。 武汉碳减排协会会长程致舜说，交易系统技术层面的准备已经完成，不同物品在各环节的碳排放量都可以清楚地查询到。 据介绍，根据与法国波尔多市签署的友城合作协议，一个中法温室气体排放试点评
学术数据库免费时代何时来临
“北大买不起知网，研究者看不起论文”，逐年上涨的论文数据库使用费令学术界叫苦不迭。26日是第16个世界知识产权日，让我们探讨一下如何在保护知识产权的同时，解决商业数据库“坐地起价”之怪现状。 学术资源的“商业化” 本月初，北京大学官网发布了通知，称因中国数据库商涨价过高，图书馆将停用“中国知
全球首个活人脑细胞数据库公布
据美国《科学》杂志在线版29日消息称，艾伦脑科学研究所日前公布了全球首个活人大脑细胞数据库，该数据库信息可公开获取。在人类理解大脑的道路上，这一成就为科学家提供了深入探究人脑的重要资源，同时以前所未有的独特性，帮助医学界确定健康与患病大脑之间的不同。 2002年，微软公司共同创始人之一保罗·艾
英政府设数据库保留无罪者DNA
据《自然》网站报道，今年早些时候，英国政府曾计划将无罪的普通人的DNA保留在其大型公安数据库中，一时间引起舆论纷纷。欧洲人权法庭后来裁决，无罪者的DNA不应该被保留。 近日据英国媒体报道，从一些泄露出来的电子邮件得知，英国政府仍然决定保留无罪者的DNA，但时间不是之前所称的12年，而是6年
欧盟酒精饮料地理标志进入公共数据库
欧委会官网7月26日消息。公共数据库“eAmbrosia -欧盟地理标志注册”于2019年4月推出，现包含了在欧盟注册的烈酒地理标志（GIs）。可获取信息包括烈酒地理标志的应用、发布或注册状态，以及它们受到官方保护的法律依据。eAmbrosia的设计目标是成为欧盟地理标志（EU GIs）的一站式
中国盐湖资源与环境科学数据库建成
9日，中国科学院青海盐湖研究所历时6年建成的中国盐湖资源与环境科学数据库通过科技部验收，这也是中国唯一数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统。 盐湖资源是中国西部地区特色资源之一，也是中国具有相对国际优势的无机矿产资源，其中的钾、锂、硼、铷、铯等资源成分关系国家的资源安全和战略安全，对
法律纠纷延迟大型毒性数据库启动
研究人员表示，一个包含近万种化学物质的大型健康风险数据库或将让预测此前不存在任何数据的千万种消费化学品的毒性变得更加容易。但相关法律争议却意味着，他们不能像希望的那样公开这一数据库。 一个包含近万种化学物质的药物毒性数据库或能减少动物安全测试的需求。 “这个数据库具有能够挽救数百万动物的潜力
上海有机所推出含氟试剂数据库
有机氟化合物由于独特的理化和生物性能，在医药、农药、先进材料等领域发挥作用。含氟试剂是发展有机氟化合物合成方法的基础，也是氟化学领域发展的基石。然而，含氟试剂的结构、性质、功能等信息分散于文献中，不便于合成化学家查找和使用。因此，亟需专业平台来全面了解和积累含氟试剂的结构、性质、功能等信息。近日
研究发布大豆多维组学数据库SoyOmics
大豆（Glycine max (L.) Merr.）是重要的粮油作物之一，其产量提升、品质改进关乎全球人口的需求和利益。高通量测序技术的发展促使大豆组学研究不断深入。实现大豆多维组学数据的整合分析，将会为大豆遗传育种提供有力支持。 近日，中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜团队联合北京基因组
首个CRISPR/Cas9靶序列数据库
近期，来自美国国立卫生研究院和瑞典乌普萨拉大学的研究人员，在国际著名学术期刊《Nucleic Acids Research》上发表的一项研究中，首次提出了一个已在斑马鱼中经过实验验证的CRISPR/Cas9靶序列数据库。 CRISPR及CRISPR相关蛋白（Cas9），是在古细菌和细菌中发现的
各种模式生物必需基因在线数据库
Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation