昆明动物所在预测蛋白质功能位点方面取得重要进展
随着蛋白质结构信息的不断积累，以及结构基因组学不断的发展，越来越多的功能未知但结构已知的蛋白质提交到了国际大分子数据库中(PDB数据库)，这些蛋白质的功能及其功能位点需要注释。而随着实验生物学的不断发展，以前一些已知功能的蛋白质的功能及其功能位点可能需要重新注释。因此，发展一种精确快速的可用于大规模功能注释的算法是结构生物信息学的重要研究内容之一。尽管已有许多算法用来对蛋白质结构或序列进行功能注释，但这些算法的精确性，敏感度等需要更进一步的提高。 日前，中国科学院昆明动物研究所黄京飞研究员指导的博士研究生李功华，开发出一个新的预测蛋白质功能位点的算法（CMASA）。这个算法相对于其它已知的算法具有更高的精确性和敏感性，而且具有计算速度快的特点。利用CMASA，黄京飞研究员课题组研究人员对PDB数据库中的酶进行了催化位点的注释并发现了166个新的未被注释的酶的催化位点。 该研究工作已发表在......阅读全文
化学键能数据库iBonD在京发布
3月15日，清华大学基础分子科学中心和南开大学元素有机化学国家重点实验室程津培教授研究组在京发布了国际上首个涵盖全面、数据可靠、使用快捷方便、专业权威的网络版化学键能数据库iBonD1.0版。 键能是化学领域中最基础参数之一，因该参数直接反映出化合物的稳定性以及判断化学反应是否能发生，从而成为
天津工生所举行TotalPatentZL数据库培训
为提高TotalPatent数据库在科研中的实际使用效果，7月13日，中科院天津工业生物技术研究所信息资源中心特邀LexisNexis北方区培训讲师岳亭为职工和研究生进行TotalPatent数据库培训。 岳亭介绍了TotalPatent数据库的内容、功能及检索方法，从
中国BIGD跻身国际生物组学数据库
测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代，海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究，基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究，组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出，搭建组学数据库，实现海量信息的存储、整合及
“中医药临床证据数据库”正式启动
4月22日，中医药临床证据数据库”启动仪式在杭州举行。国家食品药品监督管理局原副局长任德权、中国工程院院士、天津中医药大学校长张伯礼、李兰娟院士、李幼平教授、牛津大学临床实验中心和流行病学研究中心主任、牛津大学中国项目主任陈铮明教授及出席第二届循证中医药学国际论坛大会的数百名代表共同参与见证。中
全球最大癌症基因数据库发布
美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库，为研究者们提供了迄今为止最全面的方式，搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。 周一NCI在一份声明中称，基于基因组学研究的新数据库，将对全球开放获取，预计将有助于研究人员加快新药的开发，同时能够更
上海有机所推出含氟试剂数据库
有机氟化合物由于独特的理化和生物性能，在医药、农药、先进材料等领域发挥作用。含氟试剂是发展有机氟化合物合成方法的基础，也是氟化学领域发展的基石。然而，含氟试剂的结构、性质、功能等信息分散于文献中，不便于合成化学家查找和使用。因此，亟需专业平台来全面了解和积累含氟试剂的结构、性质、功能等信息。近日，中
“中国科学引文数据库”将面向全球推出
中国科学院国家科学图书馆近日与美国汤姆森科技信息集团共同宣布，将联手向全球推出“中国科学引文数据库”（CSCD），该数据库将依托ISI Web of Knowledge平台，让全世界更多的科研人员了解中国的科研发展及动态。 “中国科学引文数据库”由中国科学院历时20年组织研发，作为国内首个引文数据库
基因组所完成开发RiceWiki数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台，是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。 水稻是人类重
我国建成污染源信息数据库
在召开的“全国污染源普查总结表彰电视电话会议”上，环保部部长周生贤说，首次全国污染源普查进行了规模空前的入户登记、调查核实，全面掌握了我国污染源排放的基本情况，建立了统一的全国污染源信息数据库，完善了环境统计方式方法等。 “普查成果来之不易，需把成果转化好、应用好。”周生贤强
欧盟酒精饮料地理标志进入公共数据库
欧委会官网7月26日消息。公共数据库“eAmbrosia -欧盟地理标志注册”于2019年4月推出，现包含了在欧盟注册的烈酒地理标志（GIs）。可获取信息包括烈酒地理标志的应用、发布或注册状态，以及它们受到官方保护的法律依据。eAmbrosia的设计目标是成为欧盟地理标志（EU GIs）的一站式
中国盐湖资源与环境科学数据库建成
9日，中国科学院青海盐湖研究所历时6年建成的中国盐湖资源与环境科学数据库通过科技部验收，这也是中国唯一数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统。 盐湖资源是中国西部地区特色资源之一，也是中国具有相对国际优势的无机矿产资源，其中的钾、锂、硼、铷、铯等资源
研究开发表观组关联分析数据库
近日，由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub： a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核
山西建立国内首家计生科学数据库
被科学界誉为“试管婴儿之父”的美籍华人科学家张民觉先生研究资料数据库建设项目，近日在山西省人口计生委科学研究所启动。 张民觉是山西岚县人，他一生致力于生殖生理学科研究，是“试管婴儿”技术的奠基者，也是口服避孕药的发明人。张民觉虽身居海外，却时刻关注着祖国计生科学的发展，1991年将其
Science：全球首个活人脑细胞数据库公布
据美国《科学》杂志在线版29日消息称，艾伦脑科学研究所日前公布了全球首个活人大脑细胞数据库，该数据库信息可公开获取。在人类理解大脑的道路上，这一成就为科学家提供了深入探究人脑的重要资源，同时以前所未有的独特性，帮助医学界确定健康与患病大脑之间的不同。 2002年，微软公司共同创始人之一保罗·艾
Nucleic－Acids－Research发布最全面的microRNA数据库
基因是蛋白质的蓝图，而microRNA可以帮助细胞决定是否要根据这些蓝图制造蛋白。研究者们常常会面临这样的问题：某个与疾病有关的基因受到哪些microRNA的调控？或者，患者体内发现的某种microRNA负责调控什么基因？这些问题的答案，可以帮助医生和研究者们操纵机体中的致病蛋白水平（尤其是癌症
我国首次发布海洋化合物数据库
昨日，在青岛举行的“2018年全球海洋院所领导人会议”上，青岛海洋科学与技术试点国家实验室学术委员会主任、中国工程院院士管华诗发布了海洋试点国家实验室海洋天然产物三维结构数据库。这是我国首次正式发布海洋化合物数据库。 管华诗表示，海洋是一个巨大的药源宝库，迄今为止，人们已经发现了约3万个结
科学家打造“食物周期表”数据库
人类摄入的植物和动物超过3万种。但在大多数情况下，人们对它们的成分知之甚少。研究人员只彻底分析了几百种最常见食物的分子成分，这让人们的营养知识留有巨大空白。中国种植的红藜麦。图片来源：STR/AFP VIA GETTY IMAGES据《科学》报道，上周，食品科学家和活动人士启动了一个旨在缩小这一知识
大白菜突变体库数据库建立
大白菜属十字花科芸薹属，以结球叶片为食用器官，原产于中国，栽培历史悠久，是我国的重要蔬菜作物之一。大白菜全基因组测序和群体变异组解析已经完成，大量基因等待着农业科学家去诠释其功能。突变体是开展植物功能基因组学研究的重要材料，但小范围获得突变体进行单个基因研究已经不能满足科研和育种的需要。所以，在功能
多组学数据库“齐聚荟”－助力油菜“全能”竞技
油菜产业集观赏、蜜源、生态、经济作物等多种功能于一身，是新兴的“全能选手”。围绕油菜，我国科学家近年来实现了从理论、技术、产品到转化的链式创新，推动了我国油菜基础研究与应用步入世界第一方阵。 然而，如何将基础研究中长期积累的资源和多组学数据优势转化成育种优势，仍是当前乃至未来很长一段时期油
深圳发布食品安全标准比对数据库
日前，深圳市食品药品监管局发布国内首个“全球食品安全标准与技术法规动态比对数据库”，旨在为提升食品安全技术标准、食品药品安全监管科技水平和突发事件快速反应能力提供技术支撑。图片来源于网络 据深圳市食药监局副局长李忠介绍，该局历时近两年建成的全球食品安全标准与技术法规动态比对数据库，在我国食品
基因序列排序与整理、数据库比对与意义
由于定序系统的定序方法都是将体细胞内的基因序列打断成很多段落后，再利用DNA扩增的方式原理，在扩增的同时借由侦测萤光的方式（将不同碱基原料接上萤光讯号，只要这有接讯号的碱基被合成了，即会发出不同强度的萤光讯号）即能得到大量的片段式基因序列。经数字化后的基因序列需经整理将每段落的头尾相接成一个完整的基
众包个体基因数据库缓慢发展
Yaniv Erlich 计算遗传学家Yaniv Erlich因其建立了世界最大“家谱”而引人注目。而目前，他的DNA.land又引发新一轮个体基因数据库“众包热潮”。 早在2013 年，Erlich 团队就发表了一篇论文，介绍了如何利用公共资源，通过交叉比对的方法确定遗传学研究参与者的个人身
《清洁能源》期刊正式被EI数据库收录
5月21日，记者从国家能源集团北京低碳清洁能源研究院（简称低碳院）获悉，国家能源集团主管的《清洁能源》（Clean Energy）期刊已正式被Ei Compendex（简称EI）收录，这是《清洁能源》杂志创刊以来的突出成果和一个重要里程碑，标志着该杂志国际影响力的大幅提升。 《清洁能源》创刊
GCMS数据库都告诉我们什么？
现在我们越来越多的需要GC-MS进行相关的分析检测工作，但是，GC-MS在定量之余更能给我们许多定性未知物的信息，各种数据库则是其强大的后援，今天，我们就来说说这数据库检索的门道。GC-MS常见数据库介绍谱库检索是定性分析最为广泛的辅助手段之一。通常GC-MS仪器的数据系统软件都配有不同的质谱数据库
llumina向ClinVar数据库贡献人类遗传变异
近日，来自圣地亚哥的消息– Illumina公司（纳斯达克股票代码：ILMN）宣布，它已向美国国家生物技术信息中心（NCBI）主办的公共数据库ClinVar贡献了超过95,000个人类遗传变异（信息）。Illumina所贡献的信息包括从致病变异到良性变异在内的各种类别的变异，这些变异是在Illu
苏州大学建成服装用人体数据库
近日，由苏州大学承担的“中国服装用人体数据库建设”项目通过了中国纺织工业联合会的鉴定。鉴定专家认为，该项目为实现智能化人体信息数据的产业化应用提供了很好的技术支撑。 人体轮廓数据，又称体表尺寸，是服装制作的依据，构建相关数据库系统则成为服装行业急需的基础设施。但我国人口众多，数据采集
大型衰老相关基因表达谱数据库建成
英国《自然·通讯》杂志30日发表的一项研究称，包括人类在内的4个物种的大型衰老相关基因表达谱数据库建成。德国科学家团队分析数据后发现，衰老相关基因的表达变化与退行性慢性病相关基因的表达变化轨迹一致，但与癌症的相反。 对衰老及衰老相关疾病的研究，一直是人类医学的难题。但随着“衰老基因”的确定，衰
DNA数据库：游走在科学与伦理的边缘
你可以抛弃你的电脑，并留下你的手机在家里，但你不能逃脱你的DNA，因为他是属于你的唯一特征，但是现在它被越来越多的贡献给了某些政府当局。 世界各国当局政府打着打击恐怖主义和犯罪的旗号，正在搜集数以百万计公民的遗传信息。以美国为代表，最高法院近期就备份了许多被捕嫌疑人的DNA数据信息。英国警
金融机构批量迁移，国产数据库“东风”起
数据库、操作系统和芯片，被视为现代信息技术领域的三大核心，是基础软件“皇冠上的明珠”。随着我国自研数据库能力不断提升，持续经受考验，从银行到保险公司，从到制造企业到新零售行业，越来越多的企业开始将核心业务系统搭载到国产数据库之上。 两年内或迎“起飞” 数据库是计算机系统中用于存储、管理和组织
建立临床数据库时需要注意哪些问题？
在建立临床数据库时，需要注意以下几个重要问题： 1. 数据标准化：确保收集的数据遵循统一的标准和格式，包括疾病诊断标准、实验室检测指标的单位和正常范围、患者人口学信息的记录方式等。 2. 数据质量控制：实施严格的数据质量检查流程，例如检查数据的完整性、准确性和一致性。对缺失值、异常值和错误数据进