埃博拉病毒突变速度没有像担心的那样快
2014年11月从马里获得的病人血液样本中分离出的埃博拉病毒。 一项新的研究表明，引起西非地区正在爆发的埃博拉疫情的病毒没有早先报告所提出的那样快速地突变。这可帮助缓解人们的恐惧，因为较快的突变速度会赋予病毒新的特性，而后者又可帮助病毒更有效地传播并对目前的治疗产生抵抗性。2013年在西非开始的埃博拉疫情爆发是历史记载中规模最大、持续时间最长的埃博拉疫情，而对该病毒的测序只发表过几次。而基于这些有限测序数据所做的分析提示，该病毒突变的速度比先前观察的要快两倍。为了进一步表征该病毒的突变速度，T. Hoenen和同事从两个分别于不同的时间进入西非国家马里的埃博拉感染集群中取得了样本，并对其进行了测序。 研究人员将此次的测序数据结果与之前分析过的测序数据相比较，这整个过程跨越了9个月的时间，研究结果表明该病毒的突变速度与过去在中部非洲埃博拉疫情爆发时所做的......阅读全文
全基因组测序溯源在三文鱼水产病毒防控的应用
坚守50多天的北京零本地报告新增被打破。人们还来不及享受太多复工复产、神兽回笼、生活的常态化，防疫形式骤然严峻。拎着菜篮子一头雾水，三文鱼、水产会传播冠状病毒吗？病毒究竟从哪里来？ 流行病学调查和病毒毒株溯源尤为重要。新冠病毒在传播过程中会发生突变。基因测序能够找出这些突变差异。将病例与已知毒株比对
英国发布新型冠状病毒完整基因组测序结果
前段时间一种与“非典”病毒相近的新型冠状病毒的出现曾引起各方高度关注，英国卫生部门日前发布了这种病毒的完整基因组测序结果，希望有助于对其研究和防治。 新型冠状病毒之所以引起高度关注，是因为曾造成极大恐慌的“非典”（ＳＡＲＳ）病毒与它同属冠状病毒。但基因分析显示，与新型冠状病毒
新冠病毒RNA直接测序－这次科学家得到了什么？
澳大利亚墨尔本大学微生物和免疫学系的Lachlan Coin和Sebastian Duchene团队及合作者，提供了新冠病毒的第一个直接RNA序列，详细介绍了该冠状病毒亚基因组长度的mRNA结构，并描述了从共享数据中揭示的冠状病毒进化遗传学的各个方面。相关论文3月7日发布于预印本服务器bioRx
武大联合团队开发纳米孔靶向测序－快速“捕获”新冠病毒
武汉大学联合团队创新性开发了纳米孔靶向测序检测方法（NTS），能大幅提升病毒阳性检出率，并能实现当天同时检测新冠和其他10大类、40种常见呼吸道病毒并监测病毒突变。 3月7日，该团队在预印版平台medRxiv发表题为《纳米孔靶向测序精准全面检测新冠病毒以及其他呼吸道病毒》的研究论文。 既往
首次！纳米孔测序让流感病毒终于“无所遁形”|－Nature
4月12日，这项研究的领导者、美国疾病控制和预防中心（CDC）的微生物学家John Barnes在给bioRxiv服务器（生命科学领域专有的预印本文献库）的预印本（a preprint posted）中介绍了这项工作，他说：“我们第一次可以真正开始观察基因组在其原始状态的本质，这确实开始开辟了很
Cell公布最新基因组测序结果
去年夏天西非埃博拉爆发的早期阶段，科学家们以空前的规模和速度测序了这种致命病毒的基因组，为人们揭示了许多疫情蔓延的关键信息，比如说病毒只通过人与人接触传播，病毒在多次传播中获得了许多新突变等等。 虽然埃博拉爆发最糟糕的时期已经过去，但这场疫情并未结束，还有许多问题需要人们去解答。为此，哈佛大学
不同二代测序平台用于临床肿瘤样本体细胞突变检测的...
使用二代测序技术检测肿瘤组织FFPE样品中的DNA体细胞突变用于临床分子诊断存在的问题是，DNA质量和数量的变异较大，以及检测到的低频突变难以用二代测序以外的其他技术予以验证。以下实验测评了MiSeq和Ion Proton两个平台检测体细胞突变的表现，分别选用了 TruSeq Amplicon
Nature子刊：肝癌基因组测序揭示与饮酒相关的突变特征
肝癌是对人类健康危害最大的癌症之一。大家都知道，饮酒是肝癌的主要危险因素。近日，法国的一个研究小组收集了大量肿瘤基因组信息，概括了与饮酒及其他环境暴露有关的突变特征。这项成果发表在《Nature Communications》上。 研究人员深入挖掘了250多个现有的肝癌基因组序列，并新测序了
Nat－Genet.:外显子测序技术确定罕见脑癌的突变位点
近日发表在Nature Genetics杂志上的文章称，麻省综合医院科学家发现一个与罕见脑瘤乳头状颅咽管瘤(papillary craniopharyngioma)相关的基因。该发现为治疗该难治型脑瘤带来了希望。 颅咽管瘤(Craniopharyngiomas)生长在颅底，接近垂体、下
Nature：全基因组测序重新定义癌症之王基因组突变蓝图
近日，一项发表于国际著名杂志Nature上的研究论文中，来自英国和澳大利亚的研究人员对100位胰腺癌患者癌症组织的基因组进行了深入分析，结果发现了4种不同的亚型，这或许可以帮助后期开发治疗胰腺癌患者的新型疗法。文章中研究人员利用全基因组测序技术揭示了肿瘤基因组结构性改变的光谱模式，该技术可以帮助
新冠病毒突变基本饱和？高福、张文宏这样预判
近日，有流行病学专家发表言论认为，新冠病毒的突变基本上已饱和了。新冠病毒当真已经“变无可变”了吗？ 新冠病毒突变基本饱和？高福、张文宏这样预判 在此前的学术会议上，多位专家也曾讨论过新冠病毒变异将往何处去的问题—— 复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏强调机体免疫力对病毒突变的压力。他表示
关键突变T372A或致新冠病毒跨种传播
据美国《科学新闻》杂志网站12日报道，美国科学家在最新一期《细胞》杂志刊文指出，单一突变T372A或是新冠病毒感染人体细胞的“罪魁祸首”，最新研究有助科学家开发出更好的新冠肺炎疗法或疫苗。 在最新研究中，来自弗吉尼亚理工大学的科学家分析了18.2万个新冠病毒基因组，探究可能有助于病毒适应人类并
墨西哥美国等国出现发生突变的甲型流感病毒
墨西哥、美国和加拿大发现突变病毒，可能更具侵入性 据墨西哥流行病学与疾病控制中心负责人表示，墨西哥检测到发生突变的甲型H1N1流感病毒。类似情况在美国和加拿大也被发现，这让学者非常担心，因为有可能新病毒具有更强侵入性。 病毒出现新变种 俄新社5月15日报道，当天墨西哥流行
乙型肝炎病毒YMDD基因突变检测芯片试剂盒
乙肝病毒YMDD基因突变检测芯片试剂盒是专门为服用或准备服用拉米夫定（贺普丁）的慢性乙肝患者设计生产的。 该产品可以准确检测出拉米夫定（贺普丁）耐药病毒株的存在，为临床医生及时发现HBV病毒变异，调整治疗方案提供有效帮助，避免拉米夫定因耐药性无效用药及由此带来的副作用、减轻患者不必要的经济负担，具
英国发现新冠病毒突变体传播能力提高70％
人们在英国伦敦圣潘克拉斯火车站等待登上开往法国巴黎的最后一班火车。图片来源：STEFAN ROUSSEAU 一种变异的新冠病毒不仅为英国即将到来的圣诞节蒙上阴影，还将伦敦、英格兰东南部和东部部分地区的新冠疫情防控级别从第三级提升至新增加的第四级。 12月8日，在英国冠状病毒疫情传播例行会议上
乙型肝炎病毒YMDD基因突变检测芯片试剂盒
乙肝病毒YMDD基因突变检测芯片试剂盒是专门为服用或准备服用拉米夫定（贺普丁）的慢性乙肝患者设计生产的。 该产品可以准确检测出拉米夫定（贺普丁）耐药病毒株的存在，为临床医生及时发现HBV病毒变异，调整治疗方案提供有效帮助，避免拉米夫定因耐药性无效用药及由此带来的副作用、减轻患者不必要的经济负担
HBV变异对乙肝病毒检测的影响
［摘 要］ 目的：了解无锡地区HBV前C／C基因变异情况,探讨基因变异对乙肝病毒标志物(HBVM)及HBV DNA定量的影响。方法： HBVM用时间分辨荧光定量试剂检测;HBV DNA定量PCR以德国Roche Lightcycler 荧光定量扩增仪检测;HBV DNA前C／C测序使用①德国Roc
新一代超高通量基因组测序系统－GS－FLX开创科研无限新...
新一代超高通量基因组测序系统 GS FLX开创科研无限新可能GS FLX系统是由罗氏454生命科学公司推出的目前应用最广的超高通量基因组测序系统，研究人员利用高准确性、长读长的GS FLX系统快速的获得高质量的生物数据，取得科研突破性进展。自GS系统问世以来，于世界顶级杂志共发表250余篇高质量
全球首个测定HIV药物耐受性突变的NGS技术
治疗HIV感染的抗逆转录病毒疗法的使用在过去十年里急剧增长，而且这种疗法也是目前全球采用的终止艾滋病公共卫生威胁计划的一部分；据世界卫生组织数据显示，HIV药物耐受性的并发性增长会通过抵消抗逆转录病毒药物抑制HIV及AIDS进展的作用，从而就会破坏掉科学家们多年来的努力；因此检测患者对HIV药物
新冠病毒刺突蛋白突变对病毒感染性和抗原性有什么影响
不准确的消息是可以促进病毒细胞融合 。2020年7月17日，国家食品药品监督管理局王佑春还有黄维金他们两个作为国际顶级杂志《细胞》的共同通信在线发表了题为SARS－CoV－2突变对病毒感染性和抗原性的影响的文章。研究论文，该研究其实已经观察了80个突变和26个糖基化位点对康复期患者中和抗体和血清的感
北京又新增36例，河北3例－基因测序发现病毒来自欧洲
6月14日0—24时，31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例49例，其中境外输入病例10例（四川4例，重庆2例，陕西2例，上海1例，福建1例），本土病例39例（北京36例，河北3例）；无新增死亡病例；新增疑似病例1例，为本土病例（四川1例）。 当日新增治愈出院病例1例，解
病毒的DNA测序，以期开发下一代癌症疫苗
通常，98%的宫颈癌是由人乳头瘤病毒（human papillomavirus, HPV）引起，而HPV疫苗可以预防HPV感染，使宫颈癌发病率降低约71%。此外，研究表明约20％-40％的人类癌症由细菌和病毒引起，了解并鉴定哪些细菌和病毒会导致癌症，这对预防癌症意义深远。来源于：pixabay
测序技术揭示沙特阿拉伯爆发的MERS冠状病毒
来自沙特阿拉伯王国，美国，加拿大和英国的研究人员利用测序技术发现中东地区新型的MERS冠状病毒可以在人与人之间传播。 研究人员通过测序技术与临床检测技术相结合来研究爆发的MERS冠状病毒，科学家们发现院内的传播可以是致命性的。 在爆发中，23个人被诊断为冠状病毒的感染，65
加拿大完成流感病毒基因测序－疫苗最早11月问世
新华网渥太华5月6日电 加拿大卫生官员6日在渥太华举行的新闻发布会上宣布，加科学家已经完成对3个甲型H1N1流感病毒样本的基因测序工作，这是世界上首次完成对这种新病毒的基因测序，将为研制疫苗打下基础。 加拿大国家微生物学实验室科学家在新闻发布会上介绍说，完成基因测序可以使科学家掌握甲型H1
北大等研究成果或将提供新型冠状病毒测序手段
近日，北京大学的黄岩谊和谢晓亮研究团队联合清华大学王建斌研究团队在国际权威学术期刊《美国科学院院刊》发布研究论文，称已开发出名为SHERRY的转录组测序快速建库新方法，这一方法有望助力于新型冠状病毒的测序。 测序技术 核糖核酸（RNA）是存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。目
新冠病毒基因组测序的方法有哪几种？
新冠病毒基因组测序的方法有宏基因组测序和靶向测序。
新冠病毒研究用水系列：测序仪用水对结果的影响
基因测序技术是一种基因检测技术，也被称为DNA测序技术，是进行分子生物学研究和基因改造的基础，也是解锁人类生命奥秘的重要方式之一。基因测序技术发展了40余年，已在众多领域被广泛应用，包括生物的基因组图谱绘制、物种进化演替过程、表观遗传学、疾病相关基因的确定和诊断等等。近年来，基因测序相关产品和技术由
便携式基因组测序装置可快速检测埃博拉病毒
[导读] 本周出版的英国《自然》杂志上发表的一项传染病学研究论文,描述了一个可以被装入行李箱并运输到现场使用的埃博拉病毒基因组测序监测系统,这个系统在收集样本后24小时内就可以得出结果。 该便携式基因组测序装置可插入笔记本电脑USB接口 科技日报北京2月4日电 （记者张梦然）本周出版的英
DNA测序PCR测序反应
1. 取0.2 ml的PCR管，用记号笔编号，将管插在颗粒冰中，按下表加试剂： 所加试剂 测定模板管 标准对照管 BigDye Mix 1 μl 1 μl 待测的质粒DNA 1 μl － pGEM-3Zf (+) 双链DNA － 1 μl 待测DNA的正向引物 1 μl － M13(
DNA测序的测序技术
高通量测序技术（High-throughput sequencing）又称“下一代”测序技术（Next-generation sequencing technology），以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等，主要有以