外显子组测序并不一定带来正确的诊断

美国医学遗传学学会(ACMG)的临床遗传学年会于3月24-28日在美国盐湖城举行。埃默里遗传学实验室的研究人员在会议上表示,外显子组测序数据的初步分析并不一定能带来正确的诊断,需要再次检查。 埃默里大学医学院的教授、遗传实验室的主管Madhuri Hegde在她的报告中举了两个病例,说明研究人员在初步分析中如何误入歧途,但最终通过使用不同的检测方法,或利用不同的样品重复外显子组检测,找到了真正的致病突变。她认为,外显子组数据的再次分析和重新解释能够提高外显子组测序的诊断率。 Hegde介绍的第一个病例是一名12岁的女孩。她具有视网膜营养不良、认知功能受损以及其他症状,并在埃默里遗传实验室接受了外显子组测序。数据表明,其ARID1B基因的第3外显子可能含有一个致病变异,而此基因的其他致病突变之前也有报道。 然而,研究人员后来发现,患者的母亲也携带同样的变异,但没有类似的症状。进而发现,临床实验室用于解释的ARID1B基因......阅读全文

外显子测序揭示复发突变的预后

  研究人员对肿瘤做了外显子测序,并且将其与超过450名骨髓瘤患者获得的正常样品进行了匹配,这450名患者都是通过国家癌症研究所的骨髓瘤XI实验招募的,这是一个使用依靠临床结果、分子细胞遗传学和数据等等进行的精密或者不精密骨髓瘤治疗项目的临床3期实验。  在所有骨髓瘤样本中出现的基因突变频率,他们发

Nature外显子测序发现癌症等相关突变

  来自西雅图儿童医院,芝加哥大学等处的研究人员发表了题为“De novo germline and postzygotic mutations in AKT3, PIK3R2 and PIK3CA cause a spectrum of related megalencephaly syn

外显子测序发现早期胚胎致死基因突变

  King Faisal Specialist医院和Fowzan Alkuraya研究中心的团队对辣子两个怀孕有苦难的家庭女性进行了同和性作图和外显子测序,这些女性即使进行体外受精,怀孕也十分困难。研究人员本周在《Genome Biology》上报道了他们的结果,他们发现,TLE6中的突变似乎在早

Nature-Gen:外显子测序发现肺癌新突变基因

  最近,来自美国几所主要大学和俄罗斯ITMO大学的研究人员,在肺癌细胞中发现了一些新的驱动突变(driver mutations),可能用于基因靶向治疗和免疫治疗。相关研究结果发表在最新一期的《Nature Genetics》杂志。  在超过1000名肺癌或鳞状细胞癌患者中,研究者对他们的肿瘤外显

Nature子刊:外显子组测序揭示体细胞突变

  半侧巨脑综合症HME是一种罕见的严重大脑发育畸形,患者大脑两个半球之一过度生长,造成大脑发育不对称。在患有严重癫痫的儿童中常常诊断出这种疾病,而其病因还鲜为人知。目前该疾病的治疗手段是通过手术摘除大脑的患病部分,但手术会对患者的语言和认知能力造成损害。   加利福尼亚大学的研究团队发现,半侧巨

Nature最新成果:外显子测序找到罕见基因突变

  来自Broad研究所、麻省总医院等知名生物医学研究机构的研究人员发现了一种称为APOA5的基因发生罕见突变,会增加个体早期心脏病发作的风险。这些突变能令APOA5 基因失去作用,同时增加血液中的甘油三酯含量。  这一新发现与近期其它遗传方面的成果,尤其是APOC3 保护性基因突变(降低甘油三酯水

汕大女博导外显子组测序发现白内障突变

  汕头大学-香港中文大学联合汕头国际眼科中心的张铭志教授,从事眼科临床专业逾30年,专业方向白内障、青光眼、视光等,是我国最早开展白内障超声乳化手术和白内障屈光手术的知名专家之一,对合并有白内障青光眼的手术治疗,其研究结果引起国际同行的高度关注,并建立手术治疗模型。近年来将临床研究与基础研究相结合

外显子测序发现急性红细胞白血病新突变

急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序技术,

外显子测序发现急性红细胞白血病新突变

  急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序技

外显子测序发现急性红细胞白血病新突变

   急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序

外显子测序发现急性红细胞白血病新突变

  急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序技

肝脏样本外显子组测序,揭示肝硬化中的复杂突变景观

  正常组织随着年龄的增长而累积遗传变化,但是在慢性退行性疾病的情况下,体细胞突变是否促进非恶性细胞的克隆扩增(clonal expansion)尚不清楚。  在一项新的研究中,来自美国国家糖尿病、消化与肾疾病研究所和德克萨斯大学西南医学中心的研究人员通过对来自82名患者的患病肝脏样本进行外显子组测

关于全外显子测序技术

在过去10年里,随着高通量测序技术的出现与发展,科研与临床医学领域的遗传学检测范围不断扩大,检测速度不断加快。时至今天,DNA测序技术不仅推进了遗传学研究,也被用于各种遗传疾病的检查。特别是利用全外显子组测序(whole exomesequencing,WES)与全基因组测序(wholegenome

Nat-Genet.:外显子测序技术确定罕见脑癌的突变位点

  近日发表在Nature Genetics杂志上的文章称,麻省综合医院科学家发现一个与罕见脑瘤乳头状颅咽管瘤(papillary craniopharyngioma)相关的基因。该发现为治疗该难治型脑瘤带来了希望。   颅咽管瘤(Craniopharyngiomas)生长在颅底,接近垂体、下

PNAS:外显子变异检测——全基因组测序比全外显子测序更强大

  目前,全外显子测序和全基因组测序技术在遗传分析和发现导致疾病发生的潜在基因突变方面应用越来越广泛,随着测序技术的不断迭代更新,越来越成熟,昂贵的价格会逐渐降低,那么在排除价格因素之后,全外显子测序和全基因组测序在检测外显子突变方面究竟谁更加强大呢?来自美国的科学家对这一问题进行了相关研究,其研究

两篇Cell子刊:全外显子测序凸现孤独症隐性突变

  虽然在许多家庭中孤独症的可遗传性很明显,但人们找到的可遗传突变并不多。这主要是因为孤独症相关突变非常多样,让人很难建立起清晰的遗传模式。此前人们鉴定了一些与孤独症有关的de novo拷贝数突变和点突变,现在,波士顿儿童医院的研究人员对大量中东地区和美国的孤独症家庭进行了全外显子组测序,发现一

全外显子组测序追踪找到了白血病复发的基因突变

  近日,来自圣犹大儿童研究医院的研究人员发表在国际著名杂志Journal of the American Medical Association上的一篇研究论文中表示,他们已经使用了全外显子组测序对急性淋巴性白血病(Acute lymphoblastic leukemia,ALL)患者机体的基因组

外显子组测序技术用于发现急性红细胞白血病新突变应用

  急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序技

外显子的跳跃突变的介绍

  超过一半的基因编码区的单核苷酸突变引起的疾病都是影响了RNA的剪切。例如这些突变导致基因的外显子缺失,被称为外显子跳跃现象。如果能将外显子重新恢复到基因转录本中去将会给许多疾病的治疗带来曙光。AdrianKrainerandLucaCartegni开发了一种新的方法ESSENCE(exon-sp

Nature发布外显子组测序新成果

  一项新遗传学研究揭示了与严重儿童癫痫相关的两个新基因,并为确定治疗靶点提供了一种新策略。这项研究采用了一种称之为外显子组测序(exome sequencing)的先进遗传学技术,来搜寻不遗传的新突变。研究结果表明,它或许是发现及证实许多致病基因突变的一种高效的方法。相关论文发表在8月11日的

Science大型低成本,外显子测序成果

  来自华盛顿大学医学院,霍德华休斯医学院等处的研究人员利用一种新型技术,完成了多达2446个样品外显子测序分析,找到了自闭症谱系障碍(ASD,Autism Spectrum Disorder)的多个频发突变,不仅为治疗ASD疾病提供了新思路,而且也提出了一种低成本,多基因测序新方法。相关成

全外显子测序和高通量测序一样吗

能否简述下全外显子测序和普通的基因测试、全基因组测序有什么不同...全外显子组测序,是指利用序列捕获技术将只占基因组1%的外显子进行高通量测序,从而检测出约85%的致病突变,测序深度更高,数据更有效,变异检测更准确。全基因组测序,是利用高通量测序平台对一种生物的基因组中的全部基因进行测序,可以同时

外显子组测序技术应用于发现急性红细胞白血病AEL新突变

  急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序技

精准医疗,全外显子组测序立功啦

  精准医疗计划(Precision Medicine Initiative)是美国奥巴马总统在2015年国情咨文演讲中宣布的一项新的国家项目,并称将为建立大量志愿者服用药物的生理和基因资料、建立个人基因组与癌症相关突变靶标、数据标准开发与保密等工作投资共计2.15亿美元。  精准医疗无疑是医疗技术

外显子测序成诊断遗传病新希望

  当一个婴儿迟迟不会爬或说话,或者出现其他症状表明其可能有遗传性疾病时,家长寻找答案的过程通常是漫长且令人沮丧的。医生可能会安排一系列的测试,但仍不能得出一个特定的诊断结果。   现在,价格便宜的DNA测序能有助于揭示这些神秘疾病的原因。该方法是对病人编码蛋白质的DNA中的1%(外显子组)进行测

外显子测序发现新的渐冻人基因

  最近,由美国马萨诸塞大学医学院(UMMS)John Landers博士带领的一个国际科学家小组,利用一种创新的外显子组测序策略发现,TUBA4A——编码Tubulin Alpha 4A蛋白质的基因,与家族性肌萎缩性侧索硬化症(ALS,一种致命的神经系统疾病,也被称为葛雷克氏症)有关。相关研究结果

全外显子组测序接近成为“新家族史”

  贝勒医学院分子和人类遗传学儿科学系、人类基因组测序中心和德克萨斯大学健康科学中心的研究人员曾经报道称,在3386名接受全外显子组检测的患者当中,有大约四分之一的患者被诊断为一种已知的遗传疾病。  最近在《Journal of the American Medical Association》(J

外显子组测序发现新的单基因疾病

  根据《美国人类遗传学杂志》本周发表的一篇文章,CHAMP1基因上新获得的突变可能导致一种疾病,具体特征为语言障碍、智力缺陷和一些罕见的面部特征。  德国和荷兰的研究小组对五名儿童开展了外显子组测序。这五个人没有亲属关系,但都有着严重的语言障碍、智力缺陷,以及罕见但类似的面部特征。将这些儿童的蛋白

全外显子测序和全基因检测的区别

全外显子测序和全基因检测的区别:全外显子组测序,是指利用序列捕获技术将只占基因组1%的外显子进行高通量测序,从而检测出约85%的致病突变,测序深度更高,数据更有效,变异检测更准确。全基因组测序,是利用高通量测序平台对一种生物的基因组中的全部基因进行测序,可以同时检测到外显子、内含子和调控序列,价格较

不必凑样品-让外显子组测序立即开展

  随着新一代测序的渐渐普及,人们对外显子组测序表现出了浓厚的兴趣,因为成本更低,而数据也更容易阐释。Life Technologies公司也顺应潮流,推出新的Ion AmpliSeq™外显子组试剂盒(Ion AmpliSeq™ Exome Kit)。此试剂盒带来了出色的外显子组覆盖度和均一