多篇文章介绍掌上测序仪的新兴应用

Oxford Nanopore的MinION掌上测序仪近来有点火。这边厢,公司正忙着升级仪器,发布新产品;那边厢,用户也在不断发表研究成果,从全长cDNA测序到快速的病原体测序。 上个月,康涅狄格大学健康中心的研究人员在BioRxiv预印本网站上发表了一项成果。他们利用MinION对四个果蝇基因的cDNA进行了测序,并鉴定出那些基因所表达的近8000个全长亚型。 在此之前,研究人员已经利用PacBio的技术对全长的cDNA亚型进行测序,但“此平台的高额费用可能让一些用户望而却步,”作者指出,而MinION“需要很少的资金投入,可以产生非常长的读取,并有望彻底改变转录组鉴定以及基因组学的其他领域”。 “我们预计全转录组的纳米孔测序将成为鉴定转录本亚型的一种快速而强大的方法,特别是随着技术通量和准确性的改进,以及文库制备的简化甚至省略,”研究人员总结道。 其他研究小组也报告了MinION在病原体分析上的应用。例如,英国伯......阅读全文

CRISPR先驱发表研究新成果

  细菌和古生菌一直在与入侵者做斗争,为此它们演化出了多种防御机制,CRISPR-Cas适应性免疫系统就是其中之一。Cas1-Cas2蛋白复合体会捕获30–40bp的外源DNA,将它们整合到CRISPR的间隔区,形成自己的免疫记忆。如果这种外源DNA再次入侵,细菌就能够及时将其剪切,从而保护自身安全

Cell发表衰老研究重要成果

  衰老是一个复杂的生物学过程,伴随着有毒蛋白质聚集物在细胞中数量递增。科学家们将它们视作是阿尔茨海默氏症、亨廷顿氏病和帕金森病等各种神经退行性疾病的病因。然而目前对于这些有毒蛋白质聚集物的确切作用仍知之甚少。  现在由马克斯普朗克生物化学研究所(MPIB)的F.-Ulrich Hartl带领的一个

大数据研究:杰青也要跳槽?他们都去了哪?

1杰青基金概况  杰青基金设立于1994年,是经时任总理李鹏同志批准设立、用于培养造就拔尖人才的专项基金。  该项目支持在基础研究方面已取得突出成绩的青年学者自主选择研究方向开展创新研究,促进青年科学技术人才的成长,培养造就一批进入世界科技前沿的优秀学术带头人。  该项目要求申请人年龄不超过45周岁

北大研究员发表癌症研究新成果

  PTEN是一个重要的肿瘤抑制基因,许多肿瘤都存在PTEN突变、下调或功能障碍。PTEN的磷酸酶活性依赖于膜转位(激活),已知组蛋白去乙酰化酶HDAC抑制剂(尤其是曲古菌素A)能够促进PTEN的膜转位,但人们并不清楚这背后的具体机制。  多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,不同类型

Nature在线发表4篇华人研究

  对于华人学者在学术界做出的突破性研究,我们总是倍感亲切。今日,在顶尖学术期刊《自然》在线发表的多篇文章中,我们很高兴地看到,有4篇生物医药领域的研究来自于华人学者的课题组。在这篇文章里,我们也将为各位读者介绍这4篇论文。  Yueh-hsiu Chien课题组  A multi-cohort s

Nature-Medicine发表HIV研究新成果

  HIV在世界范围内广泛传播,严重威胁着人类的健康。近年来HIV防治工作已经取得了很大的进展,新HIV感染者的数量大大减少,HIV感染者的寿命也显著延长。然而,科学家们仍未找到治愈这种疾病的有效途径,也没有开发出相应的疫苗。  HIV是高度变异的病毒,能在感染过程中对免疫应答做出适应。Alabam

Science发表干细胞研究重要成果

  斯坦福大学和东京大学的研究人员在Science杂志上发表文章指出,调整膳食可以去除造血干细胞。这种膳食疗法有望替代化疗和放疗,显著降低骨髓移植的毒副作用。  缬氨酸是一种需要从膳食中获取的必需氨基酸。研究显示,缺乏缬氨酸的膳食可以有效去除小鼠的造血干细胞,成功移植其他小鼠的造血干细胞。缬氨酸缺乏

Cell发表干细胞研究新成果

  并非所有的干细胞都是完全一样。当一些正忙于再生受损的组织时,它们安静的兄弟们则充当了战略后备人员只在需求上升时才会踏入。来自斯托瓦斯医学研究所(Stowers Institute for Medical Research)的研究人员现在发现了一条重要的分子信号,它使得静息状态的小鼠造血干

Cell子刊发表CRISPR研究新成果

  能够编辑所需序列,在其中添加、删除、激活或抑制特异的基因,制定化的基因组编辑技术具有很大的潜力应用于医学、生物技术、食品和农业等领域。   现在,来自北卡罗来纳州立大学的研究人员和同事们,针对帮助驱动CRISPR-Cas基因组编辑系统的6个核心分子元件展开了调查。他们的研究论文发表在《分

张锋Cell发表CRISPR研究新成果

  来自Broad研究所、东京大学的研究人员,在新研究中揭示出了Cpf1/向导RNA/靶DNA复合物的晶体结构。这一重要的研究成果发布在4月21日的《细胞》(Cell)杂志上。  Broad研究所核心成员张锋(Feng Zhang)博士及东京大学医学科学研究所基础医学系Osamu Nureki教授是

《自然》发表验证STAP细胞的研究论文

  日本发育生物学研究所小保方STAP细胞是2014年最著名的学术不端闹剧,从2014年1月在《自然》发表两篇论文,随后被人指出论文存在伪造部分研究数据的嫌疑,被日本理化研究所调查证实存在学术不端,很快人们发现这一突破研究无法被重复而怀疑全面伪造,并被进一步调查,相关研究人员或者认为没有错误,或者认

Science发表基因组研究重要成果

  科学家们日前发现,人类基因组的遗传学差异主要来自于拷贝数变异(CNV)。在此之前人们对CNV的了解并不多,因为CNV一直是基因组测序的一大挑战。  华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler领导研究团队克服了这一困难。他们对来自全球125个族群的人进行了深度基因组测序,全面分析了基因组中的SN

吉林大学发表癌症研究重要成果

  宫颈癌是全球女性癌症死亡的第四大原因,在中国每年有近150000例新诊断的病例。宫颈癌在发展中国家尤其常见,因为在那里早期筛查还不普遍。科学家们发现,几乎所有宫颈癌都是人乳头瘤病毒(HPV)感染引起的,HPV引起的宫颈癌会发生LKB1(Liver kinase B1)突变失活。但他们还不清楚LK

华裔学者Cell发表lncRNA研究的利器

  长非编码RNA(lncRNA)是长达两百个核苷酸以上的转录本,绝大多数位于细胞核内。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。在测序技术的帮助下,人们已经发现了数千种lncRNA,但这些lncRNA的生物学功能依然

Science发表基因组研究重要成果

  科学家们日前发现,人类基因组的遗传学差异主要来自于拷贝数变异(CNV)。在此之前人们对CNV的了解并不多,因为CNV一直是基因组测序的一大挑战。  华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler领导研究团队克服了这一困难。他们对来自全球125个族群的人进行了深度基因组测序,全面分析了基因组中的SN

《Science》发表中科院研究成果

来自中国科学院南京地理与湖泊研究所,美国北卡罗琳娜大学的研究人员在Science(317卷)发表了今年夏季太湖蓝藻水华大量暴发的现场报道。 原文检索:Science 31 August 2007:Vol. 317. no. 5842, p. 1166 DOI: 10.1126/science.3

植物种子大小研究综述发表

  植物种子大小是重要的产量性状,种子大小的调控也是重要的发育生物学问题。因此,解析种子大小调控的分子机制,可以为作物的高产育种提供理论基础和基因资源。近年来植物种子大小的调控机制研究进展迅速,目前已成为植物领域研究的热点和前沿。  中国科学院遗传与发育生物学研究所李云海研究组长期致力于植物种子大小

中大长江学者发表肿瘤研究新成果

  骨肉瘤也叫成骨肉瘤,是较常见的发生在20岁以下的青少年或儿童中的一种恶性骨肿瘤,在小儿骨恶性肿瘤中最多见,约为小儿肿瘤的5%。目前,原发性非转移骨肉瘤患者的五年总体生存率是75%到77%,而转移性骨肉瘤的五年总生存率则不到20%。尽管现在有多种治疗方法,但是,患者的肿瘤转移和复发,仍然提出了一个

江南大学PNAS发表肿瘤研究新成果

  近日来自江南大学、香港中文大学和中科院的研究人员发表了题为“Transient receptor potential channel TRPC5 is essential for P-glycoprotein induction in drug-resistant cancer cells ”的

中南大学Hepatology发表癌症研究新成果

  来自中南大学湘雅医院的研究人员证实,BTBD7蛋白促进了肝癌上皮间质转化(EMT),可作为肝癌的一个预后生物标记物。相关研究在线发表在6月12日国际著名肝脏疾病杂志Hepatology(最新影响因子11.665)上。   论文的通讯作者是中南大学湘雅医学研究实验中心的申竑(Hong She

他们,是院士,也是战士

   她是李兰娟,从2003年抗击非典,到2013年防控H7N9禽流感,再到此次阻击新冠肺炎疫情,始终冲在第一线。当年逾古稀的她摘下口罩,脸上压痕清晰可见的照片令人动容。  他是张伯礼,推动中医药进方舱医院,探索中西医联合诊治。在武汉做完胆囊摘除手术后,又投入到紧张的工作中。  他是黄璐琦,作为国家

他们,闪耀在西部边疆

日前,在由中宣部、教育部和中央广播电视总台联合主办的2022最美教师发布仪式上,高校银龄教师支援西部计划教师团队获评“最美团队”。南开大学退休教师韩长利和另外4位教师作为银龄教师代表上台领奖。 在南开大学,像韩长利这样的银龄教师还有很多。 他们坚守教育初心、退休不褪色,带着教育部和南开

他们只是“贪玩”的孩子

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/10/488237.shtm 采访刚开始,李涛(化名)向《中国科学报》提出了一个记者此前从未听到过的要求—— “你写报道的时候,能不能别用感叹号啊?” 李涛是国内某“双一流”高校化学专业一名大四学生

他们,是院士也是战士

钟南山,84岁再战防疫最前线李兰娟,年过古稀仍奔波一线陈薇,大年初二就奔赴武汉……他们,是院士,也是战士感谢他们感谢所有为防疫而努力的人

他们只是“贪玩”的孩子

  采访刚开始,李涛(化名)向《中国科学报》提出了一个记者此前从未听到过的要求——  “你写报道的时候,能不能别用感叹号啊?”  李涛是国内某“双一流”高校化学专业一名大四学生。不久前,他的一篇学术论文发表在某国际顶级学术刊物上,吸引了很多媒体的关注。不过,他并不喜欢其中一些报道的表述,“一句话后面

人类演化研究团队发表青藏高原考古研究新成果

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505261.shtm人类究竟是在何时、以怎样的适应性策略实现了高原的终年定居,并最终形成独特的人群与文化,是目前考古学与人类学界所关注的重要议题。近年来,青藏高原的史前考古与DNA研究取得了一系列重大发现

癌症研究大师Cell子刊发表新研究成果

  来自哈佛医学院的研究人员证实,SPOP通过促进ERG癌蛋白泛素化和降解抑制了前列腺癌进展。这一重要的研究发现发布在9月3日的《分子细胞》(Molecular Cell)杂志上。  哈佛大学医学院病理学系的WenyiWei博士及著名癌症遗传学家Pier Paolo Pandolfi是这篇论文的共同

他们的研究与所有人的健康相关,你却容易忽略!

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510694.shtm文 | 廖洋 刘阳秋高气爽,玉露生凉。刚刚度过了炎炎夏日,你有没有衣物发霉的困扰?明明是洗干净的衣服,为什么还是会发霉、发臭呢?近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所(以下简称“青

上海交大Hepatology发表肿瘤研究新成果

  来自上海交通大学、复旦大学和第二军医大学的研究人员,采用外显子组测序方法揭示出了肝母细胞瘤(hepatoblastoma)的一些新突变和癌基因,并证实它们与Wnt信号通路以及泛素连接酶复合体相关。这项研究已被在国际著名肝脏疾病杂志Hepatology(最新影响因子12.003)接受并在线发布。 

动物所发表造血干细胞研究综述

  造血发生是一个动态有序的过程,其维持依赖于一群数量极其稀少的多能干细胞——造血干细胞。造血干细胞一方面通过自我更新维持造血干细胞库的稳定,另一方面通过分化产生各种类型的成熟血细胞。为了描绘造血干细胞完整的分化过程,科学家在2000年首次提出了经典的造血层级结构(hematopoietic hie