你不能失去的3230个基因

一项新的研究表明,我们体内两万个基因中有15%起着关键作用,即使发生很小的突变也可以在我们出生前将我们杀死。这项发现能够帮助研究者们更好地找到引起疾病的基因。 “任何能够帮助我们更好的理解疾病的遗传基础的信息都是无价的。” 来自雷克雅未克的一位从事解码的遗传学家Kári Stephánsson这么说。 这项新的研究最近发布在一个样本库中,目前还没有发布到同行评审的杂志上。研究者比较了六万人的编码蛋白质的外显子,这个人数比之前的实验多出一个数量级。该实验由来自哈佛大学马萨诸塞州学院的遗传学家Daniel MacArthur主导,研究者分别从世界各地采集外显子集合。在这些基因中,研究者发现1000个发生变异的基因位点,变异的位置因人而异。 MacArthur团队计算了每一个基因随机发生突变的概率,与实际发生突变的概率相比较,其中3230个基因突变概率远少于预期值,甚至不发生致病性突变。 这些数据表明,这些基因中的其中一个......阅读全文

安捷伦推出最新人全外显子靶向序列富集工具

安捷伦科技公司与维康信托基金会桑格研究院和 Gencode 研究团队合作开发了用于新一代测序的最新人全外显子靶向序列富集工具        2010 年 8 月 4 日,加利福尼亚州圣克拉拉市和英国剑桥市 — 安捷伦科技公司(NYSE:A)今日推出用于新一代 DNA 测序的 SureSel

Nature子刊:外显子组测序揭示体细胞突变

  半侧巨脑综合症HME是一种罕见的严重大脑发育畸形,患者大脑两个半球之一过度生长,造成大脑发育不对称。在患有严重癫痫的儿童中常常诊断出这种疾病,而其病因还鲜为人知。目前该疾病的治疗手段是通过手术摘除大脑的患病部分,但手术会对患者的语言和认知能力造成损害。   加利福尼亚大学的研究团队发现,半侧巨

首个EGFR外显子20插入突变肺癌(NSCLC)靶向疗法!

  Rybrevant(amivantamab)是一种具有免疫细胞导向活性的EGFR-MET双特异性抗体,靶向激活和耐药EGFR及MET突变及扩增。  --强生(JNJ)旗下杨森制药近日宣布,欧盟委员会(EC)已附条件批准EGFR-MET双特异性抗体Rybrevant(amivantamab-vmj

外显子捕捉的操作步骤及其基本原理

⑴基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕捉序列”下游的克隆位点上。⑵将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviralpackagingcellline)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋白质)成为反转录病毒在

人类外显子组迄今最全遗传变异记录公布

  近期发布的几组研究报告显示,科学家们正以前所未有的力度考察人类的遗传变异。其中在一项关于人类基因组外显子组(蛋白质编码区)的深度分析中,研究人员提供了迄今为止有关该区域最全面的遗传变异记录;而在另一项研究中,科学家们改进了对基因变体的解读。  基因组分析 外显子组领先  简单来说,外显子组就是遗

Nature最新成果:外显子测序找到罕见基因突变

  来自Broad研究所、麻省总医院等知名生物医学研究机构的研究人员发现了一种称为APOA5的基因发生罕见突变,会增加个体早期心脏病发作的风险。这些突变能令APOA5 基因失去作用,同时增加血液中的甘油三酯含量。  这一新发现与近期其它遗传方面的成果,尤其是APOC3 保护性基因突变(降低甘油三酯水

汕大女博导外显子组测序发现白内障突变

  汕头大学-香港中文大学联合汕头国际眼科中心的张铭志教授,从事眼科临床专业逾30年,专业方向白内障、青光眼、视光等,是我国最早开展白内障超声乳化手术和白内障屈光手术的知名专家之一,对合并有白内障青光眼的手术治疗,其研究结果引起国际同行的高度关注,并建立手术治疗模型。近年来将临床研究与基础研究相结合

Nature子刊:外显子测序助力遗传病诊断

  德州大学健康科学中心休斯顿UTHealth和巴黎的研究人员发现,TGFB2基因突变会引起一系列系统性并发症,包括致命的胸主动脉瘤和颅内动脉瘤。这一新综合症具有与Marfan综合症和Loeys-Dietz综合症类似的症状,但并不完全相同。文章于7月8日发表在Nature Genetics杂志网

对于不明原因的肝病,外显子组测序显神威

  据统计,大约两成肝病患者患有“不明原因的肝病”,就是将甲、乙、丙、丁、戊型肝炎病毒全查一遍,也找不到致病的原因。这让医生和患者都很郁闷。不过,最新研究表明,外显子组测序能够发现部分患者中的突变。  耶鲁大学医学院和密歇根大学的研究人员近日对19名不明原因的肝病患者进行了深度表型分析和外显子组测序

大批量小细胞肺癌外显子组测序完成

  本周《自然―遗传学》上的两份报告介绍了科学家针对82个小细胞肺癌样本的外显子组测序分析工作。他们为干预治疗找到了数个潜在标靶。   小细胞肺癌(SCLC)是一种侵入性癌症,其肿瘤较难被发现。这种肺癌很少能通过手术治愈,从而使得对肿瘤的基因组的系统性分析变得困难。这也是首次科学家得出82个SCL

Science:外显子组测序让“生命密码”解读更容易

        简单来说,外显子组就是遗传代码中蛋白质编码的组分,占整个基因组的1%-2%。测序仪每跑一次仅能读取一定数量的碱基,但通过测序外显子组,研究人员能更快地生成更多的碱基。与全基因组相比,它也可以用更低的成本做出更好的分辨率。   位于荷兰内梅亨的拉德伯德大学医学中心转译基因组学教授 J

安捷伦推出全新SureSelect人全外显子UTR捕获试剂

  超乎寻常的效率;为次日测序准备好外显子样品   2012年11月8日,加利福尼亚州圣克拉拉市 ― 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)11月8日宣布推出新一代靶向序列捕获测序产品 SureSelect 人全外显子 V5 以及 V5 + UTR。做为此项技术的发起机构,新型的全外显子捕获解决方案

Nature:外显子测序发现促心肌梗死风险基因

  近日,来自美国的科学家在著名国际期刊Nature发表了他们的最新研究成果,他们通过对心肌梗死病人进行外显子测序发现两个蛋白编码基因的罕见突变可能会导致心肌梗死患病高风险。这项研究对临床预测心肌梗死发病,针对性开发治疗药物具有重要意义。  研究人员指出,心肌梗死(MI)是全世界范围内致死率非常高的

外显子测序发现急性红细胞白血病新突变

  急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序技

外显子测序发现急性红细胞白血病新突变

急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序技术,

外显子测序发现急性红细胞白血病新突变

  急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序技

全外显子测序和高通量测序一样吗

能否简述下全外显子测序和普通的基因测试、全基因组测序有什么不同...全外显子组测序,是指利用序列捕获技术将只占基因组1%的外显子进行高通量测序,从而检测出约85%的致病突变,测序深度更高,数据更有效,变异检测更准确。全基因组测序,是利用高通量测序平台对一种生物的基因组中的全部基因进行测序,可以同时

NimbleGenSeqCap用于加拿大一4000外显子组测序项目

  最近罗氏NimbleGen的SeqCap EZ Exome产品被加拿大多伦多一医院基因组服务中心选中,用于一个癌症生物标记物研究。该中心将开展一项4000个外显子组测序项目,用于发现癌症相关的生物标记物。   第一批购买的产品还包括一台Caliper Sciclone NGS Work

外显子测序发现急性红细胞白血病新突变

   急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序

外显子基因为什么保守?《Nature-Genetics》出新答案了!

   基因的基本结构分外显子和内含子,比较不同物种的基因发现外显子序列通常是保守的,而内含子序列则很少保守。外显子的种间差异不大,换句话说,人和老鼠、线虫的外显子基因都很相似。  这种相似性的科学解释是,外显子是生物体生存的关键区域,这部分区域的许多变异都会导致死亡表型,所以未存于世。内含子由于没有

NimbleGen大麦外显子组捕获快速定位多节矮秆突变基因

在农业生产中,性状相关的基因定位对于科学育种十分重要,传统的遗传重组定位具有指导意义和实用价值,但传统方法周期长、耗费大。随着二代测序的发展,DNA测序速度大大加快、成本大大降低,使得通过测序法进行的基因定位(mapping-by-sequencing)成为越来越多动植物研究的主要手段。对合适的样本

NEJM:外显子组测序有助于慢性肾病的诊断

  外显子组测序在某些临床领域正成为新兴的一线诊断方法,但对于大多数成人疾病,它在诊断上的作用尚未得到验证。这其中就包括慢性肾病。据统计,全球每十个人中就有一个受到慢性肾病的困扰。  近日,美国哥伦比亚大学的肾脏科主任Ali Gharavi领导的研究团队在《新英格兰医学杂志》上发表文章称,外显子组测

为什么QPCR引物设计在跨外显子的接头区

如果反转录体系里面有基因组残留,而且你的引物没有跨内含子,这样的情况下就很容易造成你的Ct偏小(除了cDNA扩增外,基因组的模板也会作为模板进行扩增,导致模板起始量偏高);cDNA逆转后是切除内含子的,而基因组是存在内含子的,如果你的引物设计在了跨两个外显子的区域,则只能扩增cDNA而不扩增基因组。

NEJM发布基因组和外显子组测序的临床指南

  谁也没想到基因组测序技术这么快就进入了临床实践。现在,已经不少医生在测序的帮助下解决了之前难以确诊的疾病,尤其是罕见的儿童疾病。两位著名学者在六月十九日的《新英格兰医学》杂志上发表文章,为医生们提供了测序临床应用的入门指南,帮助他们更有效的利用这一新技术。   “这篇文章为医生们提供了可以遵循的

-外显子测序可达25%疾病诊断率,撼动传统检测地位

  来自贝勒医学院分子遗传和人类遗传学儿科、贝勒医学院人类基因组测序中心以及德克萨斯大学健康科学中心的一项最新研究表明,在对3386名患者进行外显子测序后,有四份之一的患者找到了遗传疾病相关的基因。  一年前,由贝勒医学院全基因组实验室主任Yaping Yang教授和医学遗传实验室主任Christi

外显子测序产前诊断及儿科疾病诊断的新秀

  本周末,由美国贝勒医学院与香港中文大学联合举办的第一届贝勒医学院-香港中文大学临床遗传学大会如期在著名的威尔斯亲王医院召开。来自贝勒医学院,香港中文大学,香港大学,复旦大学,北京协和医院,马来西亚大学,墨尔本大学等数十个中美及周边国家学术与临床机构的专家学者齐聚一堂,进行了为期两天的学术报告与交

外显子测序——产前诊断及儿科疾病诊断的新秀

  本周末,由美国贝勒医学院与香港中文大学联合举办的第一届贝勒医学院-香港中文大学临床遗传学大会如期在著名的威尔斯亲王医院召开。来自贝勒医学院,香港中文大学,香港大学,复旦大学,北京协和医院,马来西亚大学,墨尔本大学等数十个中美及周边国家学术与临床机构的专家学者齐聚一堂,进行了为期两天的学术报告与交

安捷伦科技推出外显子基因芯片,扩展基因表达分析市场

    2010 年 11 月 3 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日宣布推出基于 SurePrint G3 外显子基因芯片的外显子分析解决方案。该解决方案大大扩展了安捷伦基因表达试剂、芯片和生物信息学软件产品的市场。这套全新的系统将于 11 月中旬面世,研究

Twist-Bioscience与因美纳建立疾病研究外显子解决方案

  Twist Bioscience 周二表示,它已与因美纳建立合作伙伴关系,以生产用于疾病研究的 Illumina Exome 2.0 Plus 面板的联合品牌 Twist Bioscience。  根据合作伙伴关系,Twist 将生产 Exome 2.0 Plus 面板,该面板可用于因美纳测序仪

肝脏样本外显子组测序,揭示肝硬化中的复杂突变景观

  正常组织随着年龄的增长而累积遗传变化,但是在慢性退行性疾病的情况下,体细胞突变是否促进非恶性细胞的克隆扩增(clonal expansion)尚不清楚。  在一项新的研究中,来自美国国家糖尿病、消化与肾疾病研究所和德克萨斯大学西南医学中心的研究人员通过对来自82名患者的患病肝脏样本进行外显子组测