AACR:“GENIE”呼之欲出,志在共享癌症基因组临床数据
11月6日,Genomeweb报道,美国癌症研究协会(AACR)推出了一项叫做“GENIE”的国际基因组和临床数据共享项目,旨在将不同癌症中心的基因组和结果数据汇总起来。 该项目中的“GENIE”寓意Genomics(基因组学)、Evidence(证据)、Neoplasia(肿瘤)Information(信息)Exchange(交换),是这5个单词的首字母缩写。 “GENIE”项目的启动阶段由来自美国,加拿大和欧洲的七个创始成员和两个信息合作伙伴参与,共享他们拥有的肿瘤患者临床测序数据。 这个联盟的创始成员包括: 荷兰乌德勒支个性化癌症治疗中心(the Center for Personalized Cancer Treatment in Utrecht, the Netherlands);波士顿Dana-Farber癌症研究所(Dana-Farber Cancer Institute in Boston);法国维勒瑞......阅读全文
高原鱼类进化与功能基因组学科组
青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii),隶属于鲤科裂腹鱼亚科,是国家二级保护动物,仅分布于典型高原咸水湖泊—青海湖中,是维持青海湖“水-鸟-鱼”生态链稳定的核心物种。青海湖裸鲤是鲤科鱼类中唯一一种适应青海湖高盐碱水环境的自然群体,是研究高原鱼类适应进化的良好素材。青海湖裸鲤
协同创新驱动农业基因组学发展
“作为生物技术领域最基础的学科,农业基因组学研究不仅需要国内外科学家同行的协同创新,更需要与生物技术产业发展需求无缝衔接,才能发挥出农业基因组学的最大潜能。基于这种认识,在国家农业科技创新联盟的框架下,建立农业基因组学的协同创新联盟就显得十分迫切。”中国农科院科技局局长梅旭荣表示。 7月24
Nature发布比较基因组学研究重要发现
来自杜克大学医学院、Brigham妇女医院和哈佛医学院的研究人员,发现了一个机制可以解释:一些遗传突变在一种基因组中会致病,而在另一种基因组中则为良性的原因。 在发表于6月29日《自然》(Nature)杂志上的研究论文中,研究人员比较了成千上万的人类致病突变与大约100个动物物种的相似序列。
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染
Neogen农业基因组学解决方案(二)
遗传异常测试遗传病不仅会导致生产商的经济损失,还会对牲畜造成过大的压力。在接种前的遗传测试可以给生产商提供必要的信息,以做出最佳的接种决定,从而避免遗传病,诸如:• 小腿弯曲(多发性关节硬化症)• 神经性脑积水(NH)• 先天性西昌趾(挛缩性蜘蛛指综合征)• 肺发育不良,并全身水肿(PHA)
美国推动基因组学转向临床医学
美国政府将用数亿美元积极推动基因组学向临床医学的转化,探索基因组学的新前沿。12月6日,国立卫生研究院(NIH)所属国家人类基因组研究所宣布一项为期4年、资助经费4.16亿美元的新计划经费实施方案,促进该所旗舰项目“大规模基因组测序计划”。该项目致力于探索罕见遗传疾病的起因、加速基因组
基因组学推动生命科学大步向前
2010年下旬,河南安阳曹操墓真伪之辩正酣。而一则来自上海的重磅消息更是引发了多方关注。复旦大学现代人类学教育部重点实验室宣布,向全国征集曹姓男性DNA样本,拟用基因组科学的手段验证出土的头骨是否为曹操本人。 一下子,基因组科学成为热门,这一话题“落入寻常百姓家”。 事实上,伴随着2
英国基因组学研究进展迅速
随着基因数据的逐渐增多,临床医生能够更好地治疗患者,同时减少医疗事故的发生。英国国家医疗服务体系(National Health Service,NHS)中的许多遗传学中心现在都在使用芯片和外显子测序。 近日,英国卫生大臣Jeremy Hunt和生命科学部长George Freeman将宣布新
研究指出基因组学引领生物育种变革
记者从近日举行的第五届国际农业基因组会议暨深圳国际食品谷研讨会上获悉,现代农业研究已迈入生物组学大数据时代,特别是基因组学及其衍生技术在生物育种中发挥着重要的引领作用。 基因组学是对生物体所有基因进行集体表征、定量研究及不同基因组比较研究的一门交叉生物学学科。基因组学主要研究基因组的结构、功能
Neogen农业基因组学解决方案(一)
纽勤农业基因组学: 增强全球食品安全纽勤的子公司GeneSeek 是全球领先的农业基因组学实验室,自1998 年起便开始提供全面的兽医和农业基因组学诊断解决方案。在农产品生产商需要就畜群作出决定时,GeneSeek 可为其提供必要的信息,进而为农场内的食品安全问题提供基因组学解决方案。GeneS
2011国际基因组学大会在长春召开
10月23日,由中科院、吉林省政府主办的2011国际基因组学大会暨中国北方药用物种基因组学转化研究中心成立仪式在吉林省长春市举行。海内外200多名知名专家学者出席大会。 与会专家学者围绕“基因组学时代的机遇与挑战”主题,从“基因组科学”“基因组技术”“基因组信息学与计算生物学”,及“基因组
全面解读药物基因组学基因检测技术
全面解读药物基因组学基因检测技术FDA和CFDA分别于2010和2012年将CYP2C19基因检测的重要性说明纳入氯吡格雷的药物说明书。在国内,阜外医院已完成氯吡格雷用药基因检测超过20000例,居全国单中心检测量之首。以下列出了药物基因组学涉及的主要基因及对应的个体化用药:(4) 以下为上述三大
Neogen农业基因组学解决方案(三)
猪的基因组学解决方案GeneSeek 的猪基因组学解决方案为窥探猪的遗传结构打开了一个重要的窗口,包括是否易感染治疗昂贵的疾病以及繁殖中对想要性状的锁定。GeneSeek猪全基因组低密度微珠芯片该微珠芯片提供约 10,000个 SNP,包括经常使用的 USDA血统和身份 SNP、用于识别品种的 SN
Nature发布单细胞基因组学新技术
胚胎是如何形成我们肺脏、肌肉、神经和其他组织中的细胞的?一种新的方法可以解码使得胚胎万能细胞能够增殖并转变为机体许多特化细胞类型的遗传指令。 一开始是一团相同的细胞,随着增殖不断地改变形状和功能,最终变为我们肺脏、肌肉、神经和机体所有其他特化组织中的细胞。胚胎拥有这种创造奇迹的能力。
2013国际基因组学大会在青岛召开
10月29日,由中科院北京基因组研究所、中国遗传学会、中国海洋大学等单位主办的“2013国际基因组学大会”在青岛召开。来自美国、加拿大、德国、瑞士等国家的著名科学家和我国相关领域的知名学者与会,以“基因组学的突破和转化”为主题,交流和研讨基因组学研究的最新进展和成果。 本届大会首次为海洋与水产
Illumina推出全球首个基因组学孵化器
Illumina公司是生命科学工具和遗传变异及功能分析集成系统的领先的开发商、制造商和销售商。它不仅能为基因分型、拷贝数变异分析、甲基化研究、基因表达分析以及DNA、RNA、蛋白质的低复制率分析等提供创新的排序和基于阵列的解决方案,同时,它还为消费者的基因组学和诊断学研究进展提供工具和服务。Il
美X大奖基因组学挑战赛流产
图片来源:美国国家人类基因组研究所 美国X大奖基金会宣布废止其备受瞩目的奖金为1000万美元的基因组学挑战赛。报名截止时,该比赛仅吸引了两组竞争者参加。不过发言人表示,取消竞赛的决定与参赛人数无关。 7年前,阿康基因组学X大奖高调设立。该奖项旨在通过提供1000万美元奖金,推动医学基因组
单分子遇上基因组学:会擦出什么火花
当单分子遇上基因组学,它们会擦出什么样的火花?著名华人学者谢晓亮(Sunney Xie)博士围绕这个话题,在《美国医学会杂志》(JAMA)上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授,也任北京大学生物动态成像中心主任。 谢博士写道,单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于
华大基因携手爱丁堡大学,共促基因组学研究
2012年7月24日,深圳华大基因研究院与英国爱丁堡大学签署合作协议,宣布双方将在基因组领域展开广泛的科研合作,通过汇聚中英两国研究专长,加速基因组学在人类健康和农业及其他相关领域的创新和发展。 在签署的合作备忘录中,双方将着眼于对人类和其他生物的科学认识,通过共同努力,对遗传信息进行深入
英国成立功能基因组学实验室
近日,英国科研与创新署(UKRI)宣布,医学研究理事会(MRC)、剑桥大学米尔纳治疗研究所(MTI)等联合成立功能基因组学实验室,作为英国卓越研究中心和国家资源中心,汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识,加速新药物和诊断方法的研究发现,巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。 该实验
PNAS:从基因组学角度剖析“你幸福吗?”
好的心态会对你的基因产生影响。在首个该类研究中,来自加州大学洛杉矶分校和北卡罗来纳大学的研究人员调查了积极心理状态对于人类基因表达的影响。他们发现,不同类型的快乐对人类基因组的影响有着很大的差异。研究报告在线发表在《PNAS》杂志上。 那些有着高水平实现幸福感(eudaimonic w
英国成立功能基因组学实验室
近日,英国科研与创新署(UKRI)宣布,医学研究理事会(MRC)、剑桥大学米尔纳治疗研究所(MTI)等联合成立功能基因组学实验室,作为英国卓越研究中心和国家资源中心,汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识,加速新药物和诊断方法的研究发现,巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。 该实验
国际遗传和医学基因组学大会近日召开
日前,安捷伦科技有限公司作为主要赞助商参与了于6月9日至11日在香港大学举行的国际遗传和医学基因组学大会。该次国际会议由美洲华人遗传学会和香港医学遗传学会在历年分别举办的国际学术会议的基础上首次联合举办。会议吸引了国内外从事遗传学和医学基因组学研究的知名学者参与。诺贝尔奖获得者Oliver Smit
全国玉米功能基因组学研究协作平台建立
近日,由中国农业科学院生物技术研究所、安徽农业大学和齐鲁师范学院共同主办的第四届全国玉米功能基因组学术研讨会在海南三亚召开。会议旨在通过创新共享玉米EMS突变体库种质材料,搭建全国玉米功能基因组研究协作平台,协力推动我国玉米功能基因组学研究迈上新台阶。 中国农业科学院生物技术研究所所长李新海致开
科学家绘制肝癌药物基因组学“蓝图”
8月1日,国际学术期刊Cancer Cell 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所惠利健研究组、中国科学院上海营养与健康研究所李亦学研究组、第二军医大学附属东方肝胆外科医院张海斌研究组以及南京大学医学院附属鼓楼医院施晓雷合作的题为A Pharmacogenomic Landscape
解局:腾飞前夜的基因组学检测市场
2001年是一个遥远的年份。那一年,维基百科刚刚上线,苹果公司推出了第一代iPod,微软的操作系统也仅停留在Windows XP。但如果论对未来的影响,这些成果或许都比不上人类基因组草图的公布。在短短的15年里,基因/基因组测序从昂贵的科研项目,迅速成为了可靠且价格合适的工具。它推动了靶向药物与
深度解读:个人基因组学的现状与发展
什么是Personal Genomics? Personal Genomics,一般翻译为“个人基因组学”。是基因组学的一个分支,主要关注个人基因组的测序和分析。 1990年开始发起的浩大的“人类基因测序计划”是从大量的个体中获取基因信息,综合之后建立一个具有“参考价值”的人类“平均”基因组
谢晓亮:当单分子遇上基因组学
当单分子遇上基因组学,它们会擦出什么样的火花?著名华人学者谢晓亮(Sunney Xie)博士围绕这个话题,在《美国医学会杂志》(JAMA)上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授,也任北京大学生物动态成像中心主任。 谢博士写道,单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于
解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序
“桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、 有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983