AACR：“GENIE”呼之欲出，志在共享癌症基因组临床数据
11月6日，Genomeweb报道，美国癌症研究协会（AACR）推出了一项叫做“GENIE”的国际基因组和临床数据共享项目，旨在将不同癌症中心的基因组和结果数据汇总起来。 该项目中的“GENIE”寓意Genomics（基因组学）、Evidence（证据）、Neoplasia（肿瘤）Information（信息）Exchange（交换），是这5个单词的首字母缩写。 “GENIE”项目的启动阶段由来自美国，加拿大和欧洲的七个创始成员和两个信息合作伙伴参与，共享他们拥有的肿瘤患者临床测序数据。 这个联盟的创始成员包括： 荷兰乌德勒支个性化癌症治疗中心（the Center for Personalized Cancer Treatment in Utrecht, the Netherlands）；波士顿Dana-Farber癌症研究所（Dana-Farber Cancer Institute in Boston）；法国维勒瑞......阅读全文
治疗鼻咽癌新策略：药物基因组学
鼻咽癌是我国华南地区高发的肿瘤类型，但过往对其癌症发生机制和分子分型的研究较少，因而在鼻咽癌的临床治疗中，尚缺乏有效的精准治疗策略。化疗和放化疗是鼻咽癌治疗常用的手段，尤其是对于中晚期或者癌转移患者。但是，如何为不同类型的鼻咽癌患者提供最佳的个性化药物治疗方案，仍是临床上亟待解决的难题。 澳门
谢晓亮：当单分子遇上基因组学
当单分子遇上基因组学，它们会擦出什么样的火花？著名华人学者谢晓亮（Sunney Xie）博士围绕这个话题，在《美国医学会杂志》（JAMA）上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授，也任北京大学生物动态成像中心主任。 谢博士写道，单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于
解码“基因组学之父”桑格：测序，测序，测序
“桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’，他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础，彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、 有一天，65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验，转身走出实验室，宣布自己正式退休。那一年是1983
基因组学常规流程中SPIA通路分析方法
基因组学常规流程中通过实验样本组与组之间的比较得到成千上百的差异基因，再通过通路分析，从生物学角度探究差异基因的功能。但是常规的ORA、FCS方法往往忽视了基因在通路中复杂的相互作用关系，所以给大家介绍一种考虑更周全的分析方法SPIA。 SPIA整合了差异倍数、基因集显著性和拓扑分析，为每条通路计算
桫椤保护基因组学研究取得新进展
中国科学院华南植物园研究员康明团队在国家自然科学基金、广东省重点领域研发计划、广东基础与应用基础研究旗舰项目等项目的资助下，基于三种桫椤属植物的全基因组重测序数据，在树蕨保护基因组学研究方面取得新进展。相关成果近日发表于《植物杂志》（The Plant Journal）。 树蕨是一类形态独特的
973计划支持蔬菜基因组学研究取得重要进展
在973计划的支持下，中国农业科学院蔬菜花卉研究所黄三文研究员的研究团队构建了包含360多万个位点的黄瓜全基因组遗传变异图谱，为全面了解黄瓜这一重要蔬菜作物的进化及多样性提供了新思路，并为全基因组设计育种打下了基础。该研究成果于10月21日由《自然 遗传学》杂志在线发表。 黄瓜是最重要
基因组学大牛Science发布癌症重大成果
Whitehead研究所的科学家们发现，称作为“隔绝邻域”的环状染色质结构遭到破坏可以激活能够推动侵袭性肿瘤生长的癌基因。这一研究发现对于癌症诊断及治疗均具有重大的意义。相关论文发布在《科学》(science)杂志上。 领导这一研究的是Whitehead生物医学研究所的Richard A Yo
安捷伦财政收入:－诊断和基因组学增长快
安捷伦科技公司在周三收市后宣布，其第三财季的收入较去年同期下降4%，但诊断和基因组学部门的收入增加54%。 在截至7月31日的第三财季，该公司总收入达16.5亿美元，低于去年同期的17.2亿美元，但略微高于华尔街预计的16.4亿美元。 按业务部门来分，诊断和基因组
Nature论述：单细胞基因组学揭开“免疫新世界”
人类对生命的好奇，从来没有减退。一个多世纪以来，科学家们一直试图解析构成我们机体的成千上万亿个细胞，从一米长的神经元到8微米宽的红细胞。他们希望从中找到解析重要生理、病理过程，挖掘重要的细胞类型和信号通路。 但是，过去几十年，包括荧光抗体标记技术、DNA和RNA测序技术等在内的研究工具却不能解
测序技术发展过快？基因组学千万大奖告吹
X奖基金会近日决定取消了奖金高达1000万美元的基因组学Archon X奖(Archon Genomics X Prize)，因为基因组测序成本的直线下降已使得竞争毫无意义。 X奖基金会的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了关闭竞赛的决定。他表示，这是因为如今
王宪辉：“寂寞”基因组学和“爱热闹”蝗虫
中国“天眼”建成启用，“悟空”“墨子”发射成功，“蛟龙”号深海科考，体细胞克隆猴成功培育……自从2013年7月17日习近平总书记视察中国科学院并提出“四个率先”要求以来，中国科学院实施“率先行动”计划、加快改革创新发展，产出了一批具有重大国际影响力的标志性科技创新成果，为实施创新驱动发展战略、
蛋白基因组学研究揭示肝癌发生和发展机制
慢性乙肝病毒（hepatitis B virus，HBV）感染是导致我国肝癌发生的最主要原因，约85%的肝癌患者携带HBV感染标志。肝癌的发生发展是一个非常复杂的生物学过程，受到机体的系统性调控，基因突变会对HBV相关肝癌的表型产生怎样的影响，目前这方面的研究报道较少，亟待深入探究。同时，新药研
Nat－Rev－Cancer综述：肿瘤蛋白质基因组学
导 读 肿瘤蛋白质基因组学（Cancer proteogenomics）是将基于质谱（MS）的蛋白质丰度和翻译后修饰（PTM）信息与临床前肿瘤模型和肿瘤样本的基因组、表观基因组和转录组数据相结合的组学技术。基因组学和表观基因组学为解释可能发生的生物过程提供了基础知识，蛋白质组学是对已经发
首个植物功能基因组学智能问答系统PlantGPT问世
近日，中国科学院院士、华南农业大学教授刘耀光和研究员祝钦泷团队联合清华大学，开发了一个以拟南芥为基础的植物功能基因组学专家问答系统PlantGPT，通过融合检索增强生成技术和大语言模型微调方法，实现了对植物功能基因组学专业问题的精准回答与分析。相关成果在线发表于《先进科学》（Advanced S
基因组学家Venter融资7000万开发抗衰老新药
美国基因组学家克雷格·文特尔(Craig Venter)称，已融资7000万美元，用以新成立一家生物科技公司，该公司将致力于抗衰老新药的研发工作。 文特尔今天表示，已从投资者那里融资7000万美元，用以成立Human Longevity(以下简称“HLI”)公司。H
单细胞基因组学：通往个体化医疗之门
随着第二代测序技术的普及，单细胞测序迎来了迅猛发展。 近日，南方科技大学生物学系副教授贺建奎在美国冷泉港参加了单细胞分析会议后，在科学网博客里写道：“这是一个非常令人激动的前沿学术会议，我深深地体会到了单细胞基因组学时代的来临。” 他对《中国科学报》表示：“单细胞基因测序技术的突破，只是开了
基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破
深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据，首次对苔类目级系统框架进行了重建，得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员，通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员，深圳华大生命科学研究院联合培养研究
利用植物表型组学挖掘基因组学的成果
到2050年，全球人口将达到97亿，预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标，作物产量需每年增长2.4%，但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素，但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可
8位大牛畅谈基因组学的未来
过去几十年已经彻底改变了遗传学和基因组学，那么，下一个十年呢？《PLOS Biology》请了不同领域的8位牛人科学家，谈谈他们的预测。无一例外，所有预测都指向更大规模和更多类型的数据。当然，这些大牛都很乐观，许了遗传学和基因组学一个光明的未来。 Wellcome Trust Sanger研究
英国｜基因组学和基因编辑：未来的研究方向
英国下议院（House of Commons）的科学技术委员会（Science and Technology Committee）发起对基因组学（Genomics）和基因编辑（Genome editing）的调查，呼吁这些新兴的科学领域的研究能提供其影响人类健康、植物、动物和生态系统的证据。20
宏基因组学：查明微生物身份新手段
背景 《美国医学会杂志》(JAMA)近期刊发了一篇题为《利用不需培养的宏基因组学测序技术研究产志贺毒素大肠杆菌O104∶H4暴发株》的研究论文，引起了学界和社会的广泛关注。这篇论文中应用了一种称为“宏基因组学”的技术方法，不通过培养，直接从病人样品中检测分析其携带的病原微生物，甚至可以
双相情感障碍功能基因组学研究新进展
双相情感障碍（Bipolar disorder，BPD）是常见的重性精神障碍。流行病学发现，BPD具有较高的发病率和死亡率。研究表明，BPD的发生与遗传和环境因素有关。BPD的遗传力为80%左右，表明遗传因素在BPD的发生中起主要作用。全基因组关联研究（GWAS）已报道许多BPD风险基因座（lo
基因组学突破性成果：斑马鱼序列解析
人类发育，生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体，但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里，斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。在《自然》杂志网站发表的两篇文章里1,2，报道了斑马鱼参考基因组序列和完成超过10,000个蛋白编码基因的断裂性突变体的鉴
顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱
基因组中表观遗传变化是能遗传的，近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析，从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。 文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
Optalysys光计算发力中国基因组学市场
“国际基因组学大会”由华大基因主办，是基因组学领域最具影响力的国际性学术年会。该盛会不仅汇聚了生物组学的专家泰斗和企业精英进行深入的学术交流，更促进了基因组学领域在全球范围内的合作、创新与应用。今年ICG-12大会更是吸引了全球领先的光计算研发公司Optalysys参加，其公司创始人兼CEO N
2年Science基因组学文章引用次数高达100
据The Scientist报道，一篇发表在Science杂志上的基因组学文章成为基因组学领域热门的文章，从2007年发表后，总的引用次数高达100次。 这篇文章即是：V. Nene et al., “Genome sequence of Aedes aegypti, a major ar
张锋等人Cell发表空间基因组学最新成果
如果要观察细胞，我们常常需要显微镜。现在，科学家已经开发出一种方法，可通过细胞自身的遗传物质对细胞进行“拍摄”，进而生成独特的可视化图像。虽然当前该方法生成的图像比传统显微镜图像要模糊，但这种方法或许可以帮助科学家们改进癌症治疗，并探索人类神经系统的形成过程等。 在今日发表于Cell杂志的重磅
水稻基因组学与农业应用研讨会召开
由华大基因研究院举办的“水稻基因组学与农业应用研讨会”近日在深圳召开。 作为世界上最早种植水稻的国家，水稻一直在我国粮食生产中起着举足轻重的作用。华大基因等国内多家单位曾于2002年率先合作完成籼稻基因组框架图与精细图的绘制工作，并在美国《科学》杂志发表科学专论。
北方药用物种基因组学转化研究中心成立
在10月23日，中国北方药用物种基因组学转化研究中心正式揭牌，这标志着我国药用物种基因组学转化研究进入到一个新的发展阶段。 该中心是由中国科学院北京基因组研究所和吉林紫鑫药业股份有限公司共同发起建立的集基础研究、资源保护和应用开发为一体，以长白山脉传统中草药相关生物物种为对象，以加速中医
基因组学北京市重点实验室正式启动
2011年12月5日，ABO成员北京诺赛基因组研究中心有限公司暨国家人类基因组北方研究中心承担的“基因组学北京市重点实验室”正式启动。同时组建了包括沈岩院士、程京院士、贺福初院士等6位院士在内的第二届国家人类基因组北京研究中心学术委员会。 基因组学重点实验室将整合高通量测序和以“云计