Science:绘制“垃圾DNA”的新技术

在很长一段时间内被认作是“垃圾DNA”,我们现在知道了基因间的一些区域也执行着至关重要的功能。这些DNA区域突变可以严重损害人类的发育,有可能在生命后期导致一些严重的疾病。然而直到现在,都难以寻找调控DNA区域。 德国慕尼黑工业大学计算生物学教授Julien Gagneur,马克斯普朗克生物物理化学研究所(MPI) 的Patrick Cramer教授领导科学家们,现在开发出了一种方法来寻找活化和控制基因的调控DNA区域。 我们DNA中的基因包含着详细的蛋白质装配指令,这些蛋白质“工人”执行和控制着我们细胞中几乎所有的过程。为了确保每种蛋白都在适当的时间及我们身体的正确部位完成任务,对应基因的活性必须受到严格控制。基因间的DNA调控区域接管了这一功能,充当了复杂的控制机器。 马克斯普朗克生物物理化学研究所所长Patrick Cramer教授解释说:“一些DNA调控区域对于人类发育、组织保护和免疫应答等至关重要。此外,它们......阅读全文

远古DNA揭示了史前美洲人复杂的基因学

  对远古DNA所进行的一个综合性的、跨越半球的研究提示,人类在美洲的定居过程是非常复杂的。根据对首批美洲人基因组的分析结果,南北美洲首批定居者的人群动态无法用简单的人口模型或播散模式进行解释。尽管人们对人类最初迁徙进入北美和南美的时间和数目给予了很多关注,但他们对人群此后在整个美洲大陆的扩张则关注

用大片段基因组-DNA-克隆直接筛选-cDNA实验

试剂、试剂盒 扩增缓冲液DNA 聚合酶 DNaseI限制性内切核酸酶ATP链霉亲和素-磁珠结合缓冲液T4DNA 连接酶热稳定 DNA 聚合酶琼脂糖凝胶BACDNA缺口平移缓冲液杂交液平末端 cDNACot1 基因组 DNA胞浆 poly(A)+RNAdNTP 溶液DNA 分子质量标志物寡

Science:“复活”人类基因组中的古老DNA

  尽管尼安德特人(Neanderthal)已经在三万年前灭绝,但其基因组片段仍在现代人群中延续。科学家们通过新分析法,研究了665名欧洲和东亚人的全基因组测序数据,这些数据来自于千人基因组计划。研究显示,显示超过20%的尼安德特人基因组仍存在于现代人群中。文章于一月二十九日发表在Science杂志

灰色血小板致病基因被找到-为DNA检测提供希望

  据美国物理学家组织网近日报道,英国研究人员威廉・乌威哈恩德斯教授、康尼利斯・阿尔伯斯博士和法国的帕基塔・吕尔登博士合作研究,发现了灰色血小板综合征的致病基因,为以后对该病症进行DNA检测诊断提供了希望。  灰色血小板综合征在上世纪70年代首次确诊,是一种罕见的血症,一

基因图谱显示同人精子间亦存DNA差异

   北京时间7月23日消息,人类精子争夺卵子的“比赛”看起来就像一群蝌蚪在争先恐后地蠕动,但哪一个精子获胜,结果是大不一样的。一项新研究显示,即使是来自同一个人的精子细胞,也存在显著的遗传差异。   科学家首次获得了来自同一个人的近100个精子的基因图谱。这些结果确认了科学家早已知道的一个事实:每

用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法(一)

一种用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法 来源:方统科技----------------------------------------------------------------------------------摘要: 本文介绍了一种用于PCR的植物基因组DNA的快速制备方法。该方法

基因组是生命“蓝图”?优质DNA或需“后天培养”!

  近日,研究人员发现婴幼儿成长的早期环境可能会成为引发其成年期炎症,进而引起包括心血管疾病,糖尿病,自身免疫性疾病和痴呆在内的大多数老年疾病。  除此之外,这项研究也从另一个从前未被人们所重视的角度揭示了人类炎症形成的内在机制。  将环境暴露与炎症生物标志物联系起来为我们开启了一扇崭新的科学大门,

土壤基因组DNA提取试剂盒使用说明

本试剂盒提供了从各种来源的土壤中快速简便的提取基因组DNA的方法。土壤样品中存在大量的抑制因子如腐殖酸、金属离子等,这些物质即使微量存在于纯化后的DNA中也会对下游反应,如对PCR、限制性酶切等产生影响。因而纯化土壤DNA的关键在于如何有效的去除土壤中的抑制因子。采用本公司特有的DNA-only硅胶

提取的基因组DNA有RNA-污染如何解决?

得到的基因组在进行常规下游实验如,PCR、酶切、分子杂交等生物学实验时如不能顺利进行,主要因为DNA 样品不纯,含有蛋白、有机溶剂和盐类等杂质影响内切酶或DNA 聚合酶的活性。 1)实验过程中没有有效使用RNase A,应严格按照实验要求进行。 2)RNase A失活: RNase A应

新型DNA修复试剂盒有望用于基因治疗

使用一种可能改变游戏规则的DNA修复工具包,在患者提取的肾细胞中修复导致儿童和年轻人衰弱遗传性肾脏疾病的基因突变。这项由布里斯托尔大学科学家开发的研究成果发表在《Nucleic Acids Research》杂志上。在这项新研究中,这个国际团队描述了他们如何创造出一种DNA修复工具,从基因上修复有缺

定位全基因组范围DNA修复的新方法

  北卡罗来纳大学的研究人员近日开发出一种全基因组范围的测序分析,可定位DNA切除修复。这种被称为切除修复测序(XR-seq)的方法发表在新一期的《Genes & Development》杂志上。  这项研究的通讯作者是北卡罗来纳大学医学院生物化学及生物物理系的Aziz Sancar以及芝加哥大学人

110个癌症相关基因!最新测序技术解析“DNA成环”

  在有史以来最全面的研究中,英国伦敦癌症研究所的科学家们发现了110个与乳腺癌风险增加有关的基因。  这项研究采用了一种先进的遗传学技术:Capture Hi-C分析与遗传性乳腺癌相关的DNA区域图谱,由此确定了增加女性患病风险的实际基因。  这一研究成果公布在Nature Communicati

Pyrosequencing-DNA分析系统:基因甲基化研究的最佳工具

甲基化研究对于基因的调控和肿瘤的发生有非常密切的关系。在一般正常的细胞中,基因调控区CpG岛处于非甲基化的状态。而当细胞发生癌变后,这些CG区域往往呈现甲基化状态。英国医学刊物《the Lancet》报道奥地利因斯布鲁克医学院的专家们早就可以通过检测大便中DNA的甲基化变化,把健康人的大便与结肠癌患

美国放行基因编辑蘑菇和玉米-不含任何外源DNA

   美国农业部对采用基因编辑技术的新型作物网开一面,是由于基因编辑后的作物,不含任何新引入的遗传物质或外源DNA。当技术飞奔时,既面临重新定义转基因,也要思考监管如何收放。   在不到一周的时间里,美国农业部相继豁免了一种基因编辑蘑菇和一种基因编辑玉米的监管。   它们都采用了一种名为CRISPR

植物基因组DNA提取、酶切及电泳分析

一、目的  掌握植物基因组DNA提取的一般方法及注意事项。大分子量DNA分子的酶切分析。  二、原理  十六烷基三乙基溴化胺是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7mol/L NaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3  mol/L

用超声波处理人类基因组DNA

Purpose:To break up high molecular weight human placental DNA into fragment sizes of 500 bp or less which can be used as competitor DNA in Southern an

outhern印迹及基因组DNA杂交技术实验——Southern-印迹

实验方法原理硝酸纤维膜或尼龙滤膜对单链DNA的吸附能力很强,当电泳后凝胶经过DNA变性处理,覆以上述滤膜,再于其上方压上多层干燥的吸水纸,借助它对深盐溶液的上吸作用,凝胶上的单链DNA将转移到滤膜上。转移是原位的,即DNA片段的位置保持不变。转移结束后,经过80℃烘烤的DNA,将原位地固定于膜上。实

什么是支持基因测序发现DNA生命奥秘的源源动力?

  基因检测是利用科技手段,对基于个体基因、分子、细胞等进行检测,通过海量生物信息学数据的精准分析,为医疗机构提供疾病诊断的依据,从而在此基础上为病人提供个性化治疗服务;此外,也可以用于疾病风险的预测,还能正确选择药物,避免药物滥用和药物不良反应。目前,基因检测在疾病风险预测、临床诊断辅助、癌症早筛

DNA的化学检测项目介绍结核杆菌基因检测(PCR)

结核杆菌基因检测(PCR)介绍:  结核分枝杆菌在体外培养周期长,阳性检出率不高,因此对临床的早期诊断和确定药物治疗都带来一定的困难,应用聚合酶链反应(PCR)技术检测结核分枝杆菌,能大大提供结核分枝杆菌的检出率和检出特异性,有利于临床即使治疗。标本采自患者的痰、支气管分泌物、脑脊液、心包积液、胸腔

植物组织制备基因组DNA实验——氯化铯法

利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。在提取过程中,染色体会发生机械断裂,产生大小不同的片段,因此分离基因组DNA时应尽量在温和的条件下操作,如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀过程要轻缓, 以保证得到较长的DNA。实验方法原理加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即

植物基因组DNA提取、酶切及电泳分析

实验概要掌握植物基因组DNA提取的一般方法及注意事项。大分子量DNA分子的酶切分析。实验原理十六烷基三乙基溴化胺(CTAB)是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7mol/L  NaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3 mol/L  NaCl)时,从溶液中

Illumina推出Nextera-DNA-Flex全基因组测序制备产品

  近日,Illumina宣布推出一款全新的全基因组测序(WGS)文库制备产品——Nextera DNA Flex,它让全血和唾液样本省去了样本制备,也让文库制备流程跳过了一些繁琐步骤,比如DNA的机械片段化、定量和归一化。Nextera DNA Flex提供了一个快速、整合的流程,适合广泛的应用,

基因组DNA提取常见问题及解决方案

基因组DNA提取常见问题及解决方案

用大片段基因组-DNA-克隆直接筛选-cDNA实验

本方案使用克隆在 BAC 载体上的一段 500kb 的人基因组 DNA 连续序列,直接筛选与其互补的的 cDNA。但本方法也可适用于任意大小的基因组靶 DNA。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒扩增缓冲液DNA 聚合酶 DNaseI限制性内切核酸酶ATP链霉亲和素

基因测序仪Out!DNA计算机除了诊断还能“配药”

  随着基因测序技术的不断发展,它被广泛应用于诊断和治疗罕见病、简单遗传疾病和癌症等疾病。不过,以编码的DNA序列为运算对象建立的一种信息技术形式开发而出的DNA计算机,具有实时探测和监控基因突变等细胞内一切活动的特征信息,确定癌细胞等病变细胞以及自动激发微小剂量的治疗效果 。  近日,位于荷兰南部

人类基因组DNA提取的原理和方法

实验目的:  1.熟悉分子生物学实验的操作特点。2.掌握人类基因组DNA提取的基本原理。3.熟悉人类基因组DNA提取的基本方法。4.熟悉琼脂糖凝胶电泳的原理和操作。实验原理:用细胞裂解液裂解细胞膜,收集细胞核,加入SDS破裂核膜,用蛋白酶K使核蛋白降解成小片段并从DNA上解离下来,经苯酚﹑氯仿抽提去

进化新方式?线粒体DNA会插入我们的基因组

  剑桥大学和伦敦玛丽女王大学的研究人员表明,线粒体DNA也会出现在一些癌症DNA中,这表明它就像一块创可贴,试图修复我们遗传密码的损伤。这项研究成果于10月5日发表在《Nature》杂志上。  线粒体是细胞内的微小细胞器,它们像电池一样,以ATP分子的形式为细胞提供能量。每个线粒体都有自己的DNA

用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法(二)

2 结果与讨论2.1 PCR模板DNA的快速制备本方法是将少量植物叶片在TE溶液或去离子水中,经钨合金珠在离心管内的振荡破碎,直接获得DNA溶液。用多功能组织细胞研磨器(MTM-60)一次可操作60个样品。琼脂糖凝胶电泳表明,用TE和去离子水都可获得分子量较大的DNA片段(图1A)。用TE制备的DN

PNAS:新型DNA分析策略助力土壤宏基因组研究

  对于土壤微生物来说,这是最好的时代。虽然没有人进行过准确的调查,但一勺土壤中就容纳了数千亿个微生物细胞,包含成千上万的物种。密歇根州立大学(MSU)微生物生态学中心的特聘教授Jim Tiedje指出:“土壤是地球上最多样的微生物栖息地,但我们很少了解土壤微生物的身份和功能。”Tiedje和M

基因组直接测序法检测DNA的甲基化

基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解反应