用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法(一)

一种用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法 来源:方统科技----------------------------------------------------------------------------------摘要: 本文介绍了一种用于PCR的植物基因组DNA的快速制备方法。该方法只需将少量(4~6mg)植物叶片、适量(200μl) TE缓冲液、和一粒钨合金珠放入离心管,在组织细胞研磨器中振动5min破碎组织后,直接取1μl DNA溶液作为PCR的模板。本方法具有简单快速、成本低、扩增效果好等优点,特别适合于大量样品的基因型检测。 王兰1, 2 龙云铭2 刘耀光21 华南农业大学农学院,广东省植物分子育种重点实验室 2 华南农业大学生命科学学院,广东省教育厅植物功能基因组与生物技术重点实验室摘要:本文介绍了一种用于PCR的植物基因组DNA的快速制备方法。该方......阅读全文

用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法(一)

一种用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法 来源:方统科技----------------------------------------------------------------------------------摘要: 本文介绍了一种用于PCR的植物基因组DNA的快速制备方法。该方法

用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法(二)

2 结果与讨论2.1 PCR模板DNA的快速制备本方法是将少量植物叶片在TE溶液或去离子水中,经钨合金珠在离心管内的振荡破碎,直接获得DNA溶液。用多功能组织细胞研磨器(MTM-60)一次可操作60个样品。琼脂糖凝胶电泳表明,用TE和去离子水都可获得分子量较大的DNA片段(图1A)。用TE制备的DN

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(一)

摘  要:制备大量生物样品的模板DNA用于PCR检测是费时费人工的工作。本文介绍一种高通量的植物基因组DNA(gDNA)快速制备及其用于PCR基因型检测的操作方法。将一小段单子叶植物苗叶片(长度约30 mm或40 mm,与96方孔板的孔深大致相同) 或一小块(约2~4 mg)双子叶植物叶片放入9

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(四)

2.3  高通量的分子标记检测 本方法制备的DNA浓度虽然低,用96针复制器加入0.5~1 µL模板进行33~35个PCR循环就可获得足够浓度的产物,并不需要加入特别多的Taq酶(甚至使用量为每45~50 µL PCR反应液1 U也能扩增分子标记)。该方法已对数万份水稻样品进行了分子标记(S

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(三)

将纯化定量的水稻品种(93-11)基因组DNA标准样品(0.5~8 ng)与1.0 µL本方法制备的水稻品种(02428)基因组DNA混合作为模板,用InDel 标记引物(表1)进行PCR扩增和PAGE检测。箭头指某反应(或2个反应之间)其02428与93-11条带的信号值大致相等(即DNA

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(二)

1.2  植物材料  1.2.1 水稻秧苗。将1.6-mL 96方孔板底部用6 mm电钻头打穿,或将旧96孔PCR板的底部剪去约4 mm。使用时将方孔板压入少量泥巴。每孔放入1粒萌动的水稻种子,在自然日光下(或人工气候箱)生长至3~4片叶。其他植物小苗也可用类似方法种植。 1.2.2 水稻大植株的鲜

植物组织pcr

   直接PCR(Direct PCR)使用未纯化的样本进行PCR扩增,无需核酸纯化步骤,为DNA扩增带来前所未有的便捷。如果您研究领域涉及基因分型、转基因、质粒检测、基因敲除分析、DNA来源鉴定、物种鉴定、SNP分析等,请看完下面的介绍吧。  直接PCR需要的试剂  样本裂解液   样本裂解液可自

植物组织直接PCR

实验概要本实验以拟南芥叶片为试材介绍了一个不用提取DNA直接进行PCR的简单方法。主要试剂0.25N   NaOH0.25N    HClNP-40缓冲液:0.5N Tris-HCI, pH8.0 ,25% NP-40实验步骤1. 取面积约为lmm2的植物叶片放在500ul离心管中,加入40ul的0

让基因组测序绕过PCR

 在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-

植物基因组DNA的RFLP

实验概要本实验介绍了植物基因组DNA的RFLP多态性分析的原理及操作步骤。通过本实验可了解不同植物或同一植物不同个体之间基因组DNA顺序的差异性,掌握DNA限制性酶切片段长度多态性研究的基本方法。实验原理DNA多态性是指DNA碱基顺序的差异性。这种差异性不仅存在于不同的植物之间,也存在于同一种植物的

植物基因组提取(CATB法)

一、实验目的 掌握植物总DNA的抽提方法和基本原理。学习根据不同的植物和实验要求设计和改良植物总DNA抽提方法。 二、实验原理 通常采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)

让基因组测序绕过PCR扩增

  在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR

昆明植物所在植物基因组印迹研究中取得进展

蓖麻基因组印迹以及其甲基化分析  基因组印记 (genetic imprinting)是一种非常重要的表观遗传学现象之一。在配子或合子发育过程中,来自亲本的等位基因或染色体发生了差异的表观修饰,导致了亲本等位基因的差异表达(即印迹基因)。在植物中基因组印迹主要发生在被子植物的三倍体胚乳组织

开花植物“统治”植物界或因基因组瘦身

  据英国广播公司(BBC)1月14日报道,开花植物为什么会后来居上超越蕨类植物等,传遍世界各地并成为最主要的陆生植物?这一问题曾让达尔文困惑不已。现在,美国微生物学家表示,“基因组瘦身”或是开花植物遍布地球的“秘密武器”。  1898年,达尔文在《物种起源》一书中提出一个令他颇为不解的问题。他说,

迄今最古老植物基因组破译

  一个国际科研团队对在利比亚撒哈拉沙漠考古遗址收集的新石器时代的西瓜种子进行测序,破译了迄今最古老的植物基因组。对6000年前的西瓜种子进行测序,为西瓜的驯化提供了新线索,有助研究如何增强西瓜的抗旱、抗病虫害能力。相关论文发表于最近的《分子生物学与进化》杂志。  科学家们普遍认为西瓜来自非洲,但究

植物组织制备基因组DNA实验

氯化铯法 CTAB法             实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则

植物组织制备基因组DNA实验

实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部, 从而达到提取的目的。实验材料 植物组织试剂、试剂盒 抽提缓冲液十二烷基肌氨酸钠TE异丙醇溴化乙锭氯化铯仪器、耗材 离心机实验步骤   收取1

SDS法提取植物基因组DNA

本方法由Dellaporta,Wood和Hicks(1983)的方法修改而成。其基本原理是研磨的组织细胞用热的SDS裂解后,加入高浓度的KAc,0℃放置以除去蛋白和多糖类杂质,最后用乙醇或异丙醇沉淀。一 材料、试剂和仪器1 材料 新鲜的组织材料或-80℃冻存的材料2 试剂(1)提取缓冲液Tris-H

基因组DNA提取与PCR扩增技术

一、基因组DNA提取实验目的基因组DNA的制备是基因分析的前提。 本实验要求掌握基因组DNA提取的基本方法。实验原理 DNA在生物体内是与蛋白质形成复合物的形式存在的。核酸与蛋白质之间的结合力包括离子键、氢键、范德华力等,破坏或降低这些结合力就可把核酸与蛋白分开。 DNA、RNA所含有的嘌呤环和嘧啶

植物所等破译构树基因组

  构树(Broussonetia papyrifera)又称纸皮树、肥猪树,为桑科构属多年生阔叶乔木,自然分布于我国大部分地区和东南亚,是一种典型的乡土树种和先锋植物。构树雌雄异株,种子数量多,易繁殖,生长快,表型性状和遗传多样性丰富,基因组紧凑,可作木本植物研究的模式材料。同时,构树有着悠久的开

首个蕨类植物基因组测序完成

蕨类植物是地球上最多样化的植物种群之一,也是仅有的没有完成基因组测序的主要植物种群。2018年7月18日,美国康奈尔大学研究人员在《自然-植物》期刊上发表了其完成蕨类植物基因组测序的结果。 蕨类植物的基因组较大,可以拥有多达720对染色体,包含多达1480亿个碱基对的DNA序列(Gb)。相比之

利用CTAB法提取植物基因组DNA

一、实验原理 CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)是一种去污剂,可溶解细胞膜并能与核酸形成复合物,该复合物在高离子强度(0.7mol/L)的溶液里是可溶的,通过离心可将复合物同蛋白质、多糖类物质分开。在酚仿变性的条件下,去除残留的CTAB和蛋白质等杂质,然后利用异戊醇或无水乙醇将DNA分

所有开花植物同类的基因组秘密

  一个无油樟花。   据科学家们报告,代表最古老开花植物世系——一种有着乳白色花的小灌木——的单一物种的基因组序列终于被找到了,这让人们对开花植物是如何演化的提供了关键性的见解。研究当今地球上植物多样化的进化生物学家对无油樟(Amborella trichopoda)——该植物代表了被子植物

数字PCR在-药物基因组检测的应用

  能够通过PCR技术实现药物基因组的检测,提高合理用药水平,具有通量较高,操作简单,仪器设备易普及等优点。    数字PCR冷知识:胎儿性别不是只有B超可以看出来,一只精通数字PCR的科研狗,也可以测出来。

数字PCR技术精确检测癌症基因组扩增

  来自斯坦福大学以及Bio-Rad的研究人员证实,数字PCR系统能够精确测定长期存放的癌组织样本中的癌症基因组扩增。该研究成果发表在《Translational Medicine》杂志上。   某些拷贝数变异(如基因组扩增)可能导致特定癌基因的过表达,推动癌症发展。靶定扩增的癌基因有望实现癌

植物所发现植物细胞器基因组新的演化模式

  质体和线粒体是内共生起源的细胞器,在高等植物中有不同的遗传特征,相较于动态复杂的线粒体基因组,质体基因组的结构和序列更保守。在基部维管植物石松类卷柏科植物中,这两种细胞器基因组表现出相似的特征,但是造成二者趋同演化的机制尚不清楚。   中国科学院植物研究所研究员张宪春研究组从事石松类和蕨类植物的

昆明植物所破译稻属植物5个物种全基因组

  亚洲栽培稻(一般称为水稻)是世界上最重要的粮食作物之一,是中国第一大粮食作物,养活了80%以上的中国人口。在水稻与其它约23个物种共同组成的稻属植物中,它和7个稻种(普通野生稻、尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展颖野生稻、长雄蕊野生稻和南方野生稻)都是AA基因组类型,这些水稻近缘物种间断分

上海植物逆境中心建立植物基因组精确定点修饰技术

  中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组近日通过模仿和改造微生物中的一种抵御外源侵染的防护机制,成功开发出一种能对植物基因组进行精确定点修饰的技术,从而使高效植物分子改良性状成为可能。这一适用于植物的CRISPR/Cas技术就像一把剪刀可以对基因组任意感兴趣的位置进行编辑,它的成功开发将革命

植物基因组“剪刀”-被成功打造-可编辑基因组任意位置

中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组通过模仿和改造微生物中的一种抵御外源侵染的防护机制,成功开发出能对植物基因组进行精确定点修饰的技术,从而使高效植物分子改良性状成为可能。这一适用于植物的CRISPR-Cas技术就像一把剪刀,可以对基因组中任意感兴趣的位置进行编辑,它的成功开发将革命性地改变

高通量植物(转)基因检测的利器植物材料直接PCR技术

  高通量植物(转)基因检测的利器---植物材料直接PCR技术   摘要: 北京百泰克生物技术有限公司暨推出通用植物总RNA提取试剂盒(RP3301)成功解决了各种难提植物RNA的问题后,新近又针对高通量植物DNA的提取扩增推出了最新产品——植物直接PCR试剂盒(PR7501),该试剂盒不需要