最新研究告诉你癌症个性化治疗的必要性
最近，一个西奈山医学院伊坎研究所的试点项目结果显示在许多临床实验室中，多维的个性化基因组分析对于病人的治疗来说比特定基因的筛查面板更加有效。该西奈山科研团队的科学家们使用了一套完整的基因组分析方法完成了其个性化癌症治疗技术的开发与测试。 随着NGS技术运行成本的逐渐降低，临床实验室快速配备了针对于不同癌症肿瘤DNA致病突变筛查面板。癌症患者肿瘤组织中携带的特定遗传变异对于指导病人的癌症个性化治疗至关重要。在目前的癌症个性化治疗项目中，研究人员与临床医生通常都会同时收集病人基因组成的相关数据与其肿瘤组织的测序数据，通过比较探明个性化遗传分析对于病人癌症治疗的作用。 “为每一位病人裁剪癌症治疗方案是一件引人入胜的事情。每一种肿瘤都有其独特的信号通路与遗传特征，这些因素直接影响着肿瘤的发病与癌症的临床疗效。”文章的第一研究作者，西奈山伊坎研究所遗传学和基因组学助教以及临床基因组信息学主任陈荣博士向读者解释道（陈荣博士之前的一篇......阅读全文
2022年NGS新一代测序市场规模将达300亿美元
2014年全球下一代测序（NGS）市场规模为20亿美元，预计2022年市场值达300亿美元。全基因组测序技术发展最快，逐渐霸占NGS市场。肿瘤研究和产前检测位居NGS应用市场的前二甲。行情分析：预计2022年市场值达300亿美元。根据Grand View Research 2015年9月的报道，20
研究揭示个人生理数据暗藏疾病玄机
日前，当代的生物学传奇人物之一、现年78岁的Leroy Hood在《自然-生物技术》上发表了他的最新研究成果《关于个性化的、密集的和动态数据云的108个人的健康研究》，探寻个性化的生理数据之于健康管理的意义。 Leroy Hood是人类基因组计划的发起人之一，同时是美国科学院、工程院、医学院
Naturebiotechnology：研究揭示个人生理数据暗藏疾病玄机
日前，当代的生物学传奇人物之一、现年78岁的Leroy Hood在《自然-生物技术》上发表了他的最新研究成果《关于个性化的、密集的和动态数据云的108个人的健康研究》，探寻个性化的生理数据之于健康管理的意义。 Leroy Hood是人类基因组计划的发起人之一，同时是美国科学院、工程院、医学院、
－药明康德6500万美元收购NextCODE－成立生物信息公司
2015年1月11日，药明康德在官网上发布新闻，宣布以6500万美元现金收购NextCODE Health公司。NextCODE是业界领先的基因分析和生物信息公司，在美国和冰岛有运营实体。药明康德计划将NextCODE与药明康德基因中心合并，成立一家新公司WuXi NextCODE Genomi
北大系统生物医学研究所成立－尹玉新任所长
北京大学系统生物医学研究所于6月17日宣告成立。全国人大常委会副委员长、北京大学医学部主任韩启德出席研究所成立大会并题辞"问题导向，学科交叉，克服浮躁，追求原创"。 北京大学基础医学院院长教授任该所所长。据尹玉新介绍，系统生物学是研究一个生物系统中所有组成成分（基因、mRNA、蛋白质
数据分析与报告解读，未来将在基因测序行业里愈加重要
人类基因组测序工作的完成为人类生命科学研究开辟了一个新纪元，对整个生物学研究以及我们自身都具有深远的影响和重大意义。对于生命奥秘的探索，如果说此前人们还一直在混沌中碰壁，那么人类基因组计划的完成无疑是一线曙光，它开辟了从基因组层面上整体研究生命现象的新领域，并为这一领域的研究照亮了方向，带动了整
－【Cell综述】从癌症基因组到精准肿瘤学
迅速发展的基因组技术让有限的肿瘤活检材料获得更广泛的分子分析,从而促进更广泛地实施个性化癌症治疗。以基因组为基础通过不同肿瘤的患者分类化目前还不太可能取代在解决临床需要时对组织来源的考虑，包括开发和实施新的合理目标的肿瘤疗法。 1是否要再分类 在本综述的讨论中考虑以基因组为基础的病人分类,要
刘伯宁：后基因组时代10年间生命科学的发展与挑战
8月2日，我国科学家利用“全基因组关联分析”的方法，在人类1号染色体上发现了肝癌的易感基因区域。这将为肝癌的风险预测、早期预防和个体化治疗提供理论依据。 事实上，自2000年人类基因组草图绘制完成迄今，科学家已经相继发现70余种疾病的易感基因，基于此的基因诊断产业已经初现端倪，但10
Genome－Biology：新技术90分钟完成全基因组序列分析
美国国家儿童医院（Nationwide Children's Hospital）的研发人员最近在Genome Biology上发布了一个自主开发的分析软件，表示这个软件使寻找全基因组致病变异从几周缩短到按几十个小时。 第一个人类基因组测序完成耗时大约13年，耗费30亿美元，而现在技术测序技术的
上海交大教授通过7000个癌症基因组分析找到全新靶标
生物通报道：来自上海交通大学医学院，德州大学健康科学中心等处的研究人员解析了33类肿瘤的7000例临床病人基因组，将识别的47,000多个突变数据映射至已发现的蛋白结构上，用以寻找各类型肿瘤全新靶标，并找到了非小细胞肺癌的全新靶标PDE10A。 这一研究成果公布在AJHG杂志上，文章的通讯作者
上海交大教授通过7000个癌症基因组分析找到全新靶标
来自上海交通大学医学院，德州大学健康科学中心等处的研究人员解析了33类肿瘤的7000例临床病人基因组，将识别的47,000多个突变数据映射至已发现的蛋白结构上，用以寻找各类型肿瘤全新靶标，并找到了非小细胞肺癌的全新靶标PDE10A。这一研究成果公布在AJHG杂志上，文章的通讯作者分别是上海交通大学医
科学家研发国际首个整合宏微观基因组综合分析工具
近日，记者从中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室、方宗熙海洋生物进化与发育研究中心获悉，中国工程院院士包振民和教授王师团队在基因组系统解析工具开发方向取得重要进展。据悉，团队开发出国际首个整合宏观/微观进化基因组和功能基因组的综合分析工具PanSyn，研究成果发表在《自然协议》。PanS
透过大规模基因组分析推出－泛癌症图谱－开启癌症治疗
【Technews科技新报】美国国立卫生研究院（NIH）资助的研究团队已经完成了一份详细的基因组分析，这个被称为泛癌症图谱（PanCancer Atlas）的研究结果收录了 27 篇论文，并包含了 33 种癌症、1 万多个种不同肿瘤分子和临床讯息的数据资料。 泛癌症图谱主要是针对癌症基因组
Nature－Genetics公布又一大规模癌症基因组分析结果
超过20个研究机构的63位研究人员公布了一项包括30,000多人血液样本的大规模研究成果，通过这项分析，研究人员确定了13种胶质瘤新遗传危险因素，这揭示了增加胶质瘤易感性的个体DNA的特殊差异，同时也首次为临床医师提供了一种能区分成胶质细胞瘤和非胶质母细胞瘤等胶质瘤类型的新方法。 这一研究成果
新方法可实现多环境数据的全基因组关联分析
全基因组关联分析是在自然群体中将标记基因型与复杂性状表型关联以挖掘复杂性状基因的方法，在动物、植物、林木和人类遗传中广泛应用。近日，华中农业大学植物科学技术学院教授章元明团队在植物学领域期刊额《分子植物》（Molecular Plant）上发表了研究论文，报道了全基因组关联分析方法学研究的突破性
谷子单倍体型图谱及全基因组关联分析研究出炉
由中国农科院作物所、中科院上海生科院植生生态所国家基因中心、中科院遗传发育所等8家单位合作，在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和大量农艺性状的全基因组关联分析，该成果于6月24日在Nature Genetics(自然-遗传学)发表，标志着我国在谷子遗传学研究领域取得了重要的突破。
美国科学家开发出快速精准肿瘤基因组分析软件
美国 Mayo Clinic的研究人员设计了一款可识别肿瘤基因改变的软件——BIMA V3(Binary Indexing Mapping Algorithm，version 3)，比其他常用基因测序程序速度快20倍，准确度高25%。 成对测序技术是一种复杂的昂贵的技术，可用
版纳植物园完成蓖麻基因组bZIP家族鉴定与表达分析
蓖麻是双子叶胚乳型植物的典型代表，是大戟科中重要的油料作物，其种子油被广泛地应用在工业上。bZIP(basic leucine zipper)转录因子广泛分布于真核生物中，在植物中涉及多种生物进程，其中ABF亚族更是ABA信号途径中重要的调控因子。 中国科学院西双版纳热带植物园分子遗传
Affymetrix无创非侵入性膀胱癌基因组分析获得资助
2016年3月8日，来自加州圣克拉拉的消息 -Affymetrix公司（纳斯达克代码：AFFX）今天宣布已经获得了Innovate UK（IUK）的一项资助，以证明利用该公司的OncoScan® FFPE Assay Kit对尿液样本进行非侵入性的膀胱癌基因组分析的健康医疗和经济价值。膀胱癌在
Nature：通过全球宏基因组分析，将已知的蛋白家族数量翻倍
想象一下，科学家们用手电筒探索一个黑暗的房间，却只能清楚地辨认出光束范围内的东西。说到微生物群落，他们历来无法看到光束之外的东西---更糟糕的是，他们甚至不知道这个房间有多大。 在一项新的研究中，来自美国劳伦斯伯克利国家实验室和加州大学伯克利分校等研究机构的研究人员通过研究微生物群落中的蛋白功
多模式基因组分析预测肺癌患者对免疫治疗的反应
约翰霍普金斯Kimmel癌症中心、Bloomberg~Kimmel癌症免疫治疗研究所和约翰霍普金斯大学医学院的研究人员开发了一种综合基因组方法，这可能有助于医生预测哪些非小细胞肺癌患者对免疫检查点抑制剂治疗有反应。 免疫检查点抑制剂正在改变癌症治疗领域。然而，这些成功是有限的，因为缺乏生物标志
二倍体人类基因组的首次全面分析
2003年人类基因组测序的完成可谓生命科学史上的一个里程碑。然而，这个项目并非没有缺陷。最终组装好的序列，也就是人们所说的参考基因组，是由单倍体序列组成，但是人类基因组却是二倍体的。 近日，美国的一组研究人员首次对二倍体的人类基因组进行了全面分析，并将其结果发表在《Nature Methods
突破性单细胞表观基因组与转录组分析新技术
由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法，使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》（Nature Methods）上的实验方案，可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。 近年来单细胞测序技术发展迅速，被广泛用于研究细胞间的基因表达谱（转录组）
新研究实现脊椎动物基因组复制的可视化分析
近日，中山大学海洋科学学院副教授卢建国团队成功构建脊椎动物基因组复制数据库DupScan和一站式分析平台，实现了脊椎动物基因组复制的的可视化分析。相关研究发表于Nucleic Acids Research。卢建国副教授为该论文第一作者和通讯作者，硕士研究生黄沛霖为第二作者，南开大学计算机学院刘健教授
基因组分析证实日本人祖先与东南亚古人相关
日本参与的一项最新国际研究发现，日本绳文人与东南亚古人的基因序列相似度更高，这从基因上证明了绳文人和东南亚的部分古人存在深度关联，有助解开两者的起源之谜。 日本金泽大学、丹麦国家历史博物馆、马来西亚理科大学等机构的研究人员共同开展了这项研究。 绳文人是指约１．６万年前至约３０００年前生
遗传发育所等完成短花药野生稻基因组测序及分析
稻属是从事植物比较、进化和功能基因组学研究的理想系统。野生稻蕴含着宝贵的基因资源。为了更好地利用稻属的野生资源，美国亚利桑那大学的Rod Wing教授在2009年发起了国际稻属基因组计划(I-OMAP)，旨在构建稻属所有物种的全基因组序列图谱，并在此基础上开展比较、进化和功能基因组学研究。
综述：全基因组时代基因连锁分析的原则、方法和应用
许多年来，连锁分析（linkage analysis）都是对孟德尔疾病和具有家族聚集倾向的复杂性状进行遗传作图（genetic mapping）的主要工具。而近几年来，随着研究焦点向常见变异（common variants）的转移，全基因组关联研究（genome-wide association
Nature子刊：拨开基因组的迷雾
在人类基因组计划的早期，人们热情高涨。尽管人类基因组计划是一项耗资巨大的艰难工程，但它将在临床诊疗领域带来无法估量的回报。一旦我们获得了人类生命的蓝图，就能够揭开大量人类疾病的遗传基础，个性化诊疗将得以实现，医疗领域也将因此迎来一场革命。 至少，人们当初是这样期待着。 然而，“在人类
转移性肿瘤与原发性肿瘤之间的基因组差异是什么？
肿瘤转移性扩散涉及肿瘤细胞从原发性肿瘤中分离、迁移、二次组织定植和生长的多步骤过程。分析原发性肿瘤和转移性肿瘤之间的基因组差异，并量化它们对治疗耐药性的影响有助于研究和利用治疗干预措施，建立更有效、更个性化的治疗方法。 由于获取原发性和转移性肿瘤的泛癌队列难度大，关于两个肿瘤阶段之间的大规模比
美审计署调查显示DNA测试公司结论可信度不高
据美国物理学家组织网7月26日报道，美国政府调查人员向国会报告称，号称能预测遗传疾病的个性化DNA测试可能会误导消费者，其能提供的有用信息其实并不太多。 美国审计署进行的一项秘密调查显示，基于同一个人的DNA，四家基因测试公司却给出了相互矛盾的预测结果。调查人员还发现，这些测试结果也