探索RNA与蛋白的相互作用，你需要这两种检测
从DNA到蛋白质，这是一个相当复杂的过程。转录DNA的代码，这只是万里长征的第一步。随后，大量蛋白质编辑RNA，带领它从细胞核到细胞质，控制其稳定性，并指导其翻译。 据印第安纳大学的副教授Sarath Chandra Janga介绍，数百个RNA结合蛋白（RBP）参与了这个过程。Janga正在维护一个人类RNA结合蛋白的数据库，他估计大约有3000个人类蛋白质与RNA结合，其中1400个已通过实验确认。基于这一现象，许多科学家正在鉴定哪些RNA与哪些蛋白质相结合。 科学家有两个主要选择：核糖核蛋白免疫沉淀（RIP）和紫外交联免疫沉淀（CLIP）。两者都利用RNA结合蛋白的抗体来pull down结合的RNA，不过操作方法略有不同。杜克大学医学中心的Jack D. Keene教授表示：“两种方法各有用途，也各有缺点。”Keene教授是研究RNA调控的专家，曾在九十年代发明了最初的方法。 RIP vs. CLIP 在开展......阅读全文
多聚腺苷酸聚合酶的本质是蛋白质还是RNA
不对,多聚腺苷酸聚合酶是mRNA转录后加工过程用来加多聚腺苷酸尾巴的,既不需要摸板也不要引物,还有RNA聚合酶不需要引物
RNA干涉(RNA－Interference，RNAi)（2）
早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上，但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释，使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足，Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动，将目的基因之标的序列以反向重复的方式，由
RNA提取时RNA降解原因
1 ) 新鲜细胞： 裂解液的量不足，使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织： 某些含有内源性核酸酶的样品，很难避免RNA酶的降解，建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎，并且，匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品： 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放，然后转移到-70℃冰箱存
RNA干扰技术(RNA－interference，RNAi)
1995年，康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫（C. elegans）中的par-1基因时，发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达，而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA（sense RNA）以期观察到基因表达的增强。但得到的结果
RNA干涉(RNA－Interference，RNAi)（1）
基因沉默（gene silencing）是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面，基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物（genetically modified organisms）的障碍，另一方面，它又是植物抵抗外来核酸入侵（如病毒）的一种反应，为植物抗病毒的遗传育
浙大揭示新冠病毒RNA非编码区域与宿主蛋白质互作网络
近日，浙江大学生命科学研究院冯新华、蒋超、任艾明、杨兵实验室在美国微生物协会（American Society for Microbiology）旗下的期刊mSystems杂志上合作发表了题为“High-sensitivity profiling of SARS-CoV-2 noncoding
硝酸纤维素滤膜结合实验确定RNA蛋白质解离常数实验
利用硝酸纤维素滤膜结合可以测定蛋白与 DNA、RNA 间的结合，该方法的基础在于大多数蛋白可以与硝酸纤维素滤膜结合，如果蛋白质和核酸结合，那么该复合物也可以与硝酸纤维素滤膜结合，但是这种结合必须能够承受过滤压力，并且蛋白质在结合到硝酸纤维素滤膜上时还能够保持与核酸的结合。在本实验来源「RNA 实验指
中外学者Nature子刊发文：环状RNA翻译出抑癌蛋白质！
由中山大学、复旦大学、暨南大学、美国安德森癌症中心等多家单位发表一项发现：使用翻译组测序技术，在脑胶质瘤细胞中发现了数千种可能翻译的环状RNA（circRNA），其中320个有差异表达现象，并具体验证了一种名为LINC-PINT的环状RNA可编码长度为87个氨基酸的蛋白质PINT87aa。 近
硝酸纤维素滤膜结合实验确定RNA蛋白质解离常数实验
实验方法原理 利用硝酸纤维素滤膜结合可以测定蛋白与 DNA、RNA 间的结合，该方法的基础在于大多数蛋白可以与硝酸纤维素滤膜结合，如果蛋白质和核酸结合，那么该复合物也可以与硝酸纤维素滤膜结合，但是这种结合必须能够 承受过滤压力，并且蛋白质在结合到硝酸纤维素滤膜上时还能够保持与核酸的结合，
补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用
实验材料 蛋白酶K 试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液 非变性胶电泳缓冲液 结合缓冲液
补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间作用实验
基于补骨脂素光化学反应的 RNA-蛋白分子复合物分析法，能够在数据相对缺乏的情况下分析生理条件下的 RNA-蛋白复合物的拓扑构象。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验材料蛋白酶K试剂、试剂盒变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙
硝酸纤维素滤膜结合实验确定RNA蛋白质解离常数实验
实验方法原理 利用硝酸纤维素滤膜结合可以测定蛋白与 DNA、RNA 间的结合，该方法的基础在于大多数蛋白可以与硝酸纤维素滤膜结合，如果蛋白质和核酸结合，那么该复合物也可以与硝酸纤维素滤膜结合，但是这种结合必须能够 承受过滤压力，并且蛋
RNA提取心得（组织RNA提取和培养细胞的RNA提取）
一.组织RNA提取 1.最好新鲜组织，这样RNA提取的效果比较好，这是肯定的。 2. 如果不是新鲜的（最好在半年之内，-80℃或者液氮中冻存的）组织，注意不要反复冻融，从冰冻状态拿到0-4℃，注意不要拿到常温，待组织解冻后，用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织，称重后，放到预冷的匀浆器中，然后
反义技术——RNA干扰（RNA－interference，RNAi）
最近由于RNA干扰（RNA interference，RNAi）的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的（1），是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步，已经有许多这方面的综述发表（2-4）。RNA干扰是由长的双链 RNA
RNA干扰相关知识RNARITS）
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing（RITS）：是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质，通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。
RNA分离与分析实验_分离RNA
实验材料标记细胞试剂、试剂盒乙酸缓冲液仪器、耗材漩涡器实验步骤1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液，用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀，每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚，充分混匀，于 60
RNA干扰相关知识RNARISC
RNA-induced silencing complex（RISC）：一种RNA-蛋白质复合物，通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC，miRNA组装miRISC。RISCs（无论siRISC还是miRISC）包括两种类型：切割型和不切割型。
RNA降解
新鲜细胞：如果试剂没有问题，且外源性污染也可以排除，那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如 果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞，一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织：某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏，胸腺等)，即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是：在液氮条件下将组织
RNA电泳
RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and TransferUsing glyoxal
RNA提取
RNA提取（主要内容如下）Tips for Handing RNA Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum Basic Procedures for Handing
Quantitating－RNA
RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an
RNA标记
RNA labeling (Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes 32P-pCp 3' End-labeling
RNA标记
RNA标记是将标记物（如放射性同位素、荧光素或酶）共价地连接到RNA，通过检测标记物，进而实现对RNA鉴别和检测的目的。RNA标记在分子探针领域应用广泛，在疾病诊断方面也很有前景。 理想的RNA标记方法应符合以下要求： 1. 操作简单，灵敏度高 2. 不影响碱基配对的特异性 3. 不影响RN
RNA－电泳
①电泳RNA 所用器械如制胶的模具、梳子、电泳槽等用肥皂粉洗干净后用双蒸水冲洗二遍后在室温晾干备用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %琼脂糖凝胶,倒胶时溴化乙锭(E直接加入凝胶中。③制备好的琼脂糖凝胶板放入电泳槽后再加入经高压灭菌过的1XTBE ,液面只能刚好同胶面平齐,缓冲液不要淹过胶面。④点样
RNA－Electrophoresis
Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th
指导RNA
中文名称指导RNA英文名称guide RNA;gRNA定 义一种小分子RNA，约含60～80个核苷酸，在RNA编辑中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或删除的信息。由小环DNA及大环DNA编码的指导RNA均带有编辑区的序列信息，可介导编辑过程。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调
RNA电泳
· RNA Gel (Crawford Lab)· Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis. · Northern
RNA－剪接
中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定 义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子，连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互...
亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用实验实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构，亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合，插入碱基。浓度较高时，亚甲基蓝带阳离子，可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。实验材料 RNA试剂、试
通过Sapphire平台研究基于荧光的一种蛋白质RNA相互作用...
通过Sapphire平台研究基于荧光的一种蛋白质-RNA相互作用的小分子调节剂Azure Biosystems国立首尔大学化学系CRI化学蛋白组学Wan Gi Byun团队在《Chembiochem》发表了他们最新的研究成果，基于荧光的紧密结合分析发现了一种蛋白质-RNA相互作用的小分子调节剂。那为