西南大学学者发现油斑病果皮中挥发性成分的变化
柑橘是世界上广泛种植的果树作物之一。油斑病是柑橘类水果的一种生理病症，发生在收获期和收获后贮藏期间。目前已在各种柑橘作物中发现这种病症，对果实质量带来严重影响。油斑病的典型症状包括油腺破裂，油腺相邻的表皮呈现组织坏死，形成不规则形状的黄色，绿色或棕色斑点等。有研究表明在果实生长、成熟和贮藏期间的昆虫攻击，机械损伤和气候变化，可能导致油斑病的发生。机械损伤是导致油脂从腺体释放的原因。此外，有研究揭示了柑橘中的油斑病与柑橘皮油脂释放之间的密切关系。有研究报道柑橘皮油脂和橙油的主要成分二柠檬烯可以诱导油斑病。因此，研究参与皮脂释放的影响对于对于了解油斑病致病机制是非常重要的。柑橘果皮类萜代谢相关基因的相对表达模式 本研究的主要目的是研究柑橘油斑病果皮中挥发性成分浓度变化及萜类化合物代谢相关基因的表达谱，以此探究油斑病的分子机制。因此，本研究采用气相色谱-质谱法（GC-MS）研究挥发性成分的变化，利用RNA-Seq技术探索柑橘果实......阅读全文
于军研究组：首次利用RNAseq解析小鼠乳腺转录组学
乳腺是哺乳动物特有的器官, 90%的发育过程集中在出生之后。近期来自中科院北京基因组研究所，中国科学院大学等处的研究人员首次利用RNA-seq技术对小鼠乳腺发育进行转录组学研究, 包括怀孕期、哺乳期和退化期小鼠乳腺的基因表达情况，并解析了怀孕哺乳周期乳腺的关键调控基因。 作为哺乳动
新平台让单细胞RNAseq进一步升级
最近，麻省理工学院的研究人员，通过将复杂的RNA测序技术与分离单个细胞及其后代的新装置相结合，可追踪来自一个“祖先”的几代细胞的详细谱系。 这种技术——可随着细胞的分化跟踪基因表达的变化，对于研究干细胞或免疫细胞如何成熟，可能是特别有用的。它还可以阐明癌症是如何发展的。 相关研究结果发表在1
刘澎涛博士：单细胞RNAseq解析干细胞异质性
最近，在国际著名学术期刊《Genome Biology》发表的一项研究中，来自英国威康信托基金会桑格研究所、剑桥大学、上海交通大学等处的研究人员，采用单细胞转录组分析来解析造血干细胞（HSCs）的分子异质性。这项研究论证了单细胞转录学用于解析干细胞区室中的细胞过程和谱系异构性的效用。 英国威康
10X－Genomics的技术助力单细胞RNASeq方法的开发
生物通报道 10X Genomics和Fred Hutchinson癌症研究中心的研究人员近日开发出一种新的单细胞RNA测序方法，可实现数千个免疫细胞的分析。这项成果于本周发表在《Nature Communications》上。 以往的群体分析掩盖了单细胞的异质性，而单细胞RNA测序（scRN
铜基锂电池集流体的质量要求
铜基锂电集流体复合带表面应平直,光亮，不应有油斑或其他杂物，不得有目视可见的氧化物及氮化物，不应有皱边、孔眼、裂缝、折痕、压线等缺陷，允许有轻微的加工条纹和辊印、边缘应整齐，无裂口。
Nature子刊:深度学习预测传统RNASeq无法检测的选择性剪接
项目负责人Yi Xing博士是CHOP计算和基因组医学中心主任，本周他与博士生Zijun Zhang和Zhicheng Pan在《Nature Methods》报道了这款DARTS的框架。DARTS，又称为深度学习加强的RNA-seq转录剪接分析（Deep-learning Augmented
油松节的生理特性
本品呈扁圆节段状或不规则的块状，长短粗细不一。外表面黄棕色、灰棕色或红棕色，有时带有棕色至黑棕色油斑，或有残存的栓皮。质坚硬。横截面木部淡棕色，心材色稍深，可见明显的年轮环纹，显油性；髓部小，淡黄棕色。纵断面具纵直或扭曲纹理。有松节油香气，味微苦辛。
“宇花18号”花生入选国家粮油生产主导品种
“宇花18号”荚果、籽仁和内种皮颜色 青岛农业大学供图日前，农业农村部遴选2022年粮油生产主导品种主推技术，发布了主导品种主推技术的通知，其中共遴选了14个花生品种，而青岛农业大学农学院教授王晶珊团队培育的“宇花18号”入选。据介绍，“宇花18号”是全国首个兼具高油、高油酸、耐盐碱特质的新品种。
基因测序技术（一）
什么是基因测序 基因组携带了个体的全部遗传信息，基因测序能够加深对疾病尤其是恶性肿瘤的分子机制理解，在诊断与治疗方面都发挥着重要作用。从1953年沃森和克里克发现DNA分子双螺旋结构到2001年首个人类基因组图谱的绘制完成，越来越多的人们意识到基因测序在生物医学中的重要作用。 所谓基因测
应用Arraystar－ChIRP测序和RNA测序于糖尿病性肾病研究
美国德克萨斯大学安德森癌症研究中心Farhad R. Danesh教授主要从事肾脏病理的基础与临床研究。近期，其实验室通过Arraystar RNA-seq发现lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠体内低表达。表达谱芯片及Arraystar CHIRP-seq等证明，Tug1能够直接结合PGC
新的基因组工具组合或可梳理疾病的因果关系
近日，奥地利科学院分子医学研究中心（CeMM）的研究人员Christoph Bock在基因组生物学会议上发言称，新的基因组工具组合可以帮助研究人员梳理疾病的因果关系。 他认为，单细胞RNA-seq和ATAC-seq等方法可以帮助人们深入了解疾病发展过程中发生的情况，但它们无法建立因果关系。Bo
研究比较芯片和测序在分析无细胞胎儿RNA转录组上的能力
来自GenomeWeb的消息——美国塔夫茨医学中心（Tufts Medical Center）的一组研究人员最近评估了芯片和新一代测序在分析无细胞胎儿RNA中基因表达的能力，这些胎儿RNA来自羊水上清。 他们发现，表达芯片带来了基因表达的更广泛视图，特别是对低浓度或降解的样品，而在这一方面，R
应用Arraystar－ChIRP测序和RNA测序于糖尿病性肾病研究
美国德克萨斯大学安德森癌症研究中心Farhad R. Danesh教授主要从事肾脏病理的基础与临床研究。近期，其实验室通过Arraystar RNA-seq发现lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠体内低表达。表达谱芯片及Arraystar CHIRP-seq等证明，Tug1能够直接结
应用Arraystar－ChIRP测序和RNA测序于糖尿病性肾病研究
美国德克萨斯大学安德森癌症研究中心Farhad R. Danesh教授主要从事肾脏病理的基础与临床研究。近期，其实验室通过Arraystar RNA-seq发现lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠体内低表达。表达谱芯片及Arraystar CHIRP-seq等证明，Tug1能够直接结合PGC
大型遗传学研究投入新一代测序的怀抱
了解自然发生的遗传变异如何影响基因表达水平是在分子水平了解复杂性状的第一步。表达数量性状基因座(eQTL)定位研究试图通过基因分型和测定个体的全基因组表达水平，对影响/关联基因表达水平的所有基因组区域进行定位。 在目前的小型和中型基因表达研究中，RNA-seq技术几乎取代了芯片技术。然而，
DNA芯片技术和RNA测序有啥不同？
日本推理小说家东野圭吾的作品《白金数据》中描述了这样一个未来世界：日本政府秘密建立名为“白金数据”的数据库。该库搜集了全国人民的DNA数据，通过对犯罪分子留在现场的毛发、体液等证物进行比对，警方可以高效、快速、准确锁定真凶。借助“白金数据”的帮助，一个检举率100%、冤案率0%的理想法制社会构建完
如何选择合适的基因表达分析方法？
选择合适的基因表达分析方法需要考虑多个因素，以下是一些关键的考虑点和相应的建议：研究目的：如果是初步筛选差异表达的基因，定量 PCR（qPCR）或微阵列芯片可能是合适的选择。若要全面了解整个转录组的情况，RNA 测序（RNA-seq）则更为合适。样本数量和规模：对于少量样本，qPCR 通常具有较高的
科学家找到深度学习基因组学应用的一顶“黑帽子”
研究人员首次将深度学习与贝叶斯假设检验结合，利用深度学习强化RNA可变剪接分析的准确性。 在生命科研领域，常有人说深度学习的基因组学应用好比是“一个盲人在一间黑暗的房子里寻找一顶并不存在的黑色帽子”。言下之意，是遗憾深度学习的基因组学应用并没有给人们带来太多惊喜。不过，近日宾夕法尼亚大学和费
利用Ion半导体测序开展基因表达谱分析
新一代测序技术的出现改变了基因表达谱分析和转录组研究。在其他方法还依赖预知信息进行杂交探针或qPCR引物设计时，RNA-Seq技术可直接对测序文库中任一RNA分子进行无假设的分析。RNA-Seq技术不单能测定转录本数，研究表达水平差异 [1]，还能检测序列特异的信息，如转录本的起始和终止位
plos－biology：我们对基因表达数据存在普遍误解
数据可重复性一直以来都是实验生物学的一个主要问题，随着基因组技术的发展以及相关数据复杂性的不断提高，这一问题的严重性又得到了很大程度地提升。 11月12日，特拉维夫大学的Shir Mandelbaum，Zohar Manber，Orna Elroy-Stein和Ran Elkon在《PLOS
HPV全转录组测序技术可实现癌前病变与基因分型双检测
宫颈癌位列女性恶性肿瘤发病率的第2位。据世界卫生组织（WHO）报道，每年约有新增病例53万，其中发展中国家占80％。目前，宫颈癌和癌前病变的最佳检测方法是组织活检，但这种检测不仅昂贵而且是侵入性的。虽然科学家也开发了一些侵入性小的诊断方法，但往往不够准确或无法预测癌前病变。截止到目前，有16种高风险
单核RNA测序的芯片现已上市
高通量的单核RNA测序方法——DroNc-Seq才刚刚在《Nature Methods》上发表。一转眼，相应的芯片已经上市。Dolomite Bio公司针对DroNc-Seq推出一款新的芯片，可实现高通量的单核RNA-Seq分析。 DroNc-Seq方法在Broad研究所的张锋（Feng
石乐明：快乐行走在药物基因组学研究路上
淡泊名利的石乐明非常重视自己国家“千人计划”入选者的身份，他说，这与他参与的大型国际合作研究计划密切相关，在10多个国家100多个单位的近200名科学家参与的MAQC/SEQC大型国际合作研究计划中，作为领衔者，“千人计划”的身份是自己重要的“名片”，更是自己身为中国学者的骄傲。 石乐明的研
Mol－Cell－|－史俊炜课题组找到白血病治疗新靶点
急性髓系白血病（Acute Myeloid Leukemia, AML）是成年人中最为常见的急性白血病，其特征为造血前体细胞的增殖异常和分化能力减弱，造成大量未成熟的白细胞在骨髓、外周血，甚至其他组织聚集，而其他正常血细胞的数量急剧减少。大量的研究表明，AML由一系列在髓系前体细胞的基因突变最终
20分文章中的RNA甲基化，热度与实力并存
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用，表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》（影响因子：23
原来是这两种酶造成了新冠病毒对胰腺的伤害
2019年12月，在中国湖北省武汉市确认了一群原因不明的肺炎患者感染了一种新型冠状病毒，即2019-nCoV，这是以前在人类或动物中未发现的。流行病学证据提示大多数这些患者去过武汉当地的海鲜市场，并且从这些患者中获得的病毒的基因序列与蝙蝠中鉴定的高度相似。由于相似，该病毒随后被重命名为SARS-
芯片与测序（一）
在高通量检测这个领域里，基因芯片和二代测序这对相爱相杀的cp，原本均是了解基因组结构和功能的绝佳高手，如今为了一争高下，又是闹的不开交。这不，基因芯片仗着自己老大哥的身份，手持一个二维的DNA探针阵列所形成的三维地图，以数以万计的探针做方向标，能按图索骥的找到基因组的特定位置，且结合完整成熟的指控分
关于血色病性心肌病的病发原因分析
1、原发性血色病长期被认为是遗传性疾病但其遗传学基础至今仍有争论血色病遗传的精确方式，由于种种原因难以阐明。第一，导致小肠过度吸收铁的基本原因的生化过程尚未弄清，因此缺乏可应用的确切方法，以鉴别受累者的类型第二该病的临床表现差异显著，受年龄、性别(男性比女性多9倍)肝损害以及促进铁吸收的条件因子
QIAGEN推出液体活检新产品
也许你正在用Apple Pay，但是你大概还不知道，液体活检（Liquid biopsy）与Apple Pay一样是2015年度的十大突破技术。这是一种非侵入性的方法，可以利用体液（如血液），在癌症等疾病的早期检测和分析疾病，带来更好的预后和治疗。 为了促进液体活检研究的数据分析，QIAGEN
20分文章中的RNA甲基化，热度与实力并存
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用，表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》（影响因子：23.3