新一批敲除小鼠序列数据存入基因银行
美国得克萨斯州基因组医学研究所将其敲除小鼠库的超过275000个核苷酸序列信息存入了美国国立卫生研究院的基因银行。 以休斯敦为根据地的得克萨斯州基因组医学研究所于今年5月加入国际敲除小鼠协会。在美国国立卫生研究院号召在国际科学界广泛分享小鼠研究信息后,该研究所表示愿意向美国健康研究院提供基因序列信息。 得克萨斯州基因组医学研究所表示,这些信息是从C57BL/6小鼠胚胎干细胞库抽取,并且存入基因银行的基因组调查序列分部。 该研究所表示,这次存入新型的规模是自1982年基因银行创立以来最大一次。基因银行GenBank(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/),是美国国家卫生院(National Institute of Health, NIH)于1988年成立,1992年起,资料库即为Natioan Center for Biotechnology Information (NCBI)所管理。 美国国......阅读全文
Nature完成桉树基因组测序
一个横跨五大洲的科学团队宣布,巨桉(Eucalyptus grandis)的基因组测序已经完成,巨桉是世界上最广泛种植的树木之一。这一成果于六月十一日发表在Nature杂志上。 巨桉生长速度快,可以用作燃料和木材,是纤维、纸浆、生物燃料、药物和工业用油的重要可再生原料。这种树木原产于澳大利亚东
让基因组测序绕过PCR
在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-
什么是基因组测序技术
自1998年美国塞莱拉遗传公司组建以来,人类基因组研究开始由两部分科学家同时展开,分别是由公共经费支持的人类基因组工程和美国塞莱拉遗传公司。在研究过程中,他们也分别采用了两种不同的测序和分析的方法。塞莱拉公司的核心分析方法被称为"霰弹法",人类基因组工程则采用了"克隆法"。所谓"霰弹法",其实是一种
基因组测序拯救鸮鹦鹉
为了保护极度濒危的新西兰鸮鹦鹉kakapo,几乎所有剩余个体的基因组都已被测序,这为其保护管理提供了重要信息。 新西兰鸮鹦鹉kakapo(Strigops habroptila)有几个特性。它是世界上最重的鹦鹉,有的雄性甚至超过3公斤,被认为有达90年的最长寿命。它是唯一一种不会飞的鹦鹉,通过
我国完成小麦A基因组测序
本报讯(记者丁佳)5月10日,《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果,该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。 这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究,全面揭示了小麦A基因组的结构和
人类全基因组测序计划
全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部(DOE)与美国国家卫生研究院(NIH),分别在1986年与1987年加入人类基
白肉灵芝完成基因组测序
在韶关产业园种植的白肉灵芝。吴清平团队 供图 近日,中国工程院院士、广东省科学院微生物研究所名誉所长吴清平团队完成了第一个白肉灵芝全基因组测序。据悉,这是世界上首次对白肉灵芝的基因组进行组装和注释。相关研究发表于《G3:基因,基因组,遗传学》(G3-Genes Genomes Genet
简化基因组测序好做吗
简化基因组方法是一种利用酶切技术、序列捕获芯片技术或其他实验手段降低物种基因组复杂程度,进而研究基因组各类遗传结构性变异的技术手段。目前常见的简化基因组技术包括RAD(Restriction site Associated DNA)和GBS(Genotyping By Sequencing)。这些技
基因组测序的具体过程
讲起来很复杂哈,简单来说,就是边合成边测序,把所要测序的序列通过各种手段来建库,然后加上5‘和3’都加上接头,放在一个小玻璃片一样的芯片上,上面一般是8个lane,把样品加入到lane上之后和上面长好的接头序列相结合(之前的建库时加的接头与之反向互补),然后再经过PCR扩增的过程形成一个DNA簇,然
表观遗传大牛张毅揭示DUX基因簇对于发育不是必需的
卵母细胞中的母体因子如何触发合子基因组激活(ZGA)是发育生物学中一个长期存在的问题。 最近对2细胞样胚胎干细胞(2C样细胞)的研究表明,DUX家族的转录因子是胎盘哺乳动物中ZGA的关键调节因子。 DUX在ZGA中的具体作用,还不是很清楚。 2019年5月27日,哈佛医学院张毅团队在Natur
研究首次揭示骨髓增殖性肿瘤新的致病因素
4月6日,中国医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学研究所)研究员马小彤,教授程涛、肖志坚,主任医师张磊等在《自然-通讯》上发表一项研究首次揭示了GADD45g基因沉默是骨髓增殖性肿瘤(MPN)新的致病因素,阐明了GADD45g作用的下游分子机制以及其在患者细胞中低表达机制,为开发新的MPN治疗
研究首次揭示骨髓增殖性肿瘤新的致病因素
4月6日,中国医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学研究所)研究员马小彤,教授程涛、肖志坚,主任医师张磊等在《自然-通讯》上发表一项研究首次揭示了GADD45g基因沉默是骨髓增殖性肿瘤(MPN)新的致病因素,阐明了GADD45g作用的下游分子机制以及其在患者细胞中低表达机制,为开发新的MPN
m6A-RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成研究(一)
目前来说,调控m6A修饰过程的阅读蛋白共有9种功能,今天不会大家一一来讲,而是主要讲参与蛋白编码过程的YTHDF1蛋白,它主要通过与mRNA的m6A位点结合,在脑神经发育[1],多巴胺分泌[2]和突触形成[3]等过程中起重要作用。文章导读:2018年10月31日,美国芝加哥大学何川团队,上海科技大学
上海生科院等建立“类精子细胞”的单倍体细胞系
2012年,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所李劲松研究组与徐国良研究组合作从小鼠的精子中建立了孤雄单倍体胚胎干细胞,并证明这些细胞能够代替精子使卵母细胞“受精”产生半克隆小鼠,该项研究成果成功入选2012年中国科学十大进展。然而,单倍体细胞随着体外培养传代,特别是经过遗传编
基因敲除技术的研究进程
基因敲除技术是20世纪80年代发展起来的,是建立在基因同源重组技术基础以及胚胎干细胞技术基础上的一种新分子生物学技术。所谓胚胎干细胞(EmbryonicStem cell,ES)是从着床前胚胎(孕3—5天)分离出的内细胞团(Inner cellmass,ICM)细胞,它具有向各种组织细胞分化的多分化
基因敲除技术的研究历史
基因敲除技术是20世纪80年代发展起来的,是建立在基因同源重组技术基础以及胚胎干细胞技术基础上的一种新分子生物学技术。所谓胚胎干细胞(EmbryonicStem cell,ES)是从着床前胚胎(孕3—5天)分离出的内细胞团(Inner cellmass,ICM)细胞,它具有向各种组织细胞分化的多分化
基因敲除技术的研究历史
基因敲除技术是20世纪80年代发展起来的,是建立在基因同源重组技术基础以及胚胎干细胞技术基础上的一种新分子生物学技术。所谓胚胎干细胞(EmbryonicStem cell,ES)是从着床前胚胎(孕3—5天)分离出的内细胞团(Inner cellmass,ICM)细胞,它具有向各种组织细胞分化的多分化
我国学者发现延缓衰老“基因疗法”
中国科学院动物研究所研究员刘光慧等首次利用全基因组CRISPR/Cas9筛选体系在人间充质干细胞中鉴定出新的衰老调控基因,并在此基础上开发了可延缓机体衰老的新型“基因疗法”。该研究于1月7日在线发表于《科学转化医学》,为延缓衰老、防治衰老相关疾病提供了干预靶标与新型策略。 细胞衰老是器官乃至个体
众多学者介绍基因编辑的最新进展
CRISPR/Cas9系统以前所未有的DNA编辑能力,正在彻底改变基因组改造,这也引发了新的研究、ZL之争和一些伦理问题。在近日举办的2016基因编辑、基因沉默和基因治疗方面的研究进展大会上,一些研究人员介绍了一些让人兴奋的新进展。 解决导入问题 据Bio-iT World报道,这次大会的一
众多学者介绍基因编辑的最新进展
CRISPR/Cas9系统以前所未有的DNA编辑能力,正在彻底改变基因组改造,这也引发了新的研究、ZL之争和一些伦理问题。在近日举办的2016基因编辑、基因沉默和基因治疗方面的研究进展大会上,一些研究人员介绍了一些让人兴奋的新进展。 解决导入问题 据Bio-iT World报道,这次大会的一
众多学者介绍基因编辑的最新进展
CRISPR/Cas9系统以前所未有的DNA编辑能力,正在彻底改变基因组改造,这也引发了新的研究、ZL之争和一些伦理问题。在近日举办的2016基因编辑、基因沉默和基因治疗方面的研究进展大会上,一些研究人员介绍了一些让人兴奋的新进展。 解决导入问题 据Bio-iT
研究发现新“暗物质蛋白”作为胚胎发育命运的细胞质“开关”
翻译与代谢的相互调控是细胞可塑性的基础。胚胎早期发育可分为着床前和着床后两个阶段,对应体外培养时两种稳定且可互相转变的多能性干细胞状态:原始态(Naïve)与始发态(Primed)。早期发育与多能干细胞命运在表观遗传、转录、代谢等层次已有研究,而在翻译阶段,此前主要聚焦于已知蛋白的翻译,基因组中
大肠杆菌基因组基因无痕敲除的优化方法
近几十年来, 大肠杆菌是基因工程、 代谢工程和合成生物学等领域的重要工具菌株,是生产重组蛋白、氨基酸、有机酸、能源物质和一些重要化工产品的主力微生物之一。为使大肠杆菌获得新的性状和生产能力, 基因敲除及基因敲入是构建新型大肠杆菌的重要手段。 近几十年来, 大肠杆菌是基因工程、 代谢工程和合成
小鼠胚胎干细胞培养实验
体外分化法 实验方法原理 胚胎干细胞在体内外可以分化为各种类型的细胞。我们的体外分化方法有利于神经前体细胞通过在最少量的培养基内选择(第3步),在有bFGF存
人类干细胞使截瘫小鼠再次移动
据外媒报道,现在有一些截瘫的小鼠能够再次行走,或者至少接近这样做,这多亏于人类干细胞。人类干细胞基本上帮助弥合了科学家们在动物脊髓研究领域的空白。这项研究由以色列理工学院Shulamit Levenberg博士领导的一个小组进行。 人类干细胞.jpg 研究人员通过从人类志愿者口腔粘膜
小鼠神经干细胞的流式染色
实验概要小鼠神经干细胞的流式染色主要试剂荧光标记抗体CD133-PE、EGF-Alexa647,10μg/ml的PI,染色液主要设备15 mL离心管、10%FBS包被的玻璃巴斯德管、移液枪、70 μm细胞滤膜、4℃低温离心机实验步骤(1)接神经干细胞的分离和纯化最后一步。去上清,用染色液重悬细胞,向
小鼠胚胎干细胞培养实验
体外分化法 实验方法原理 胚胎干细胞在体内外可以分化为各种类型的细胞。我们的体外分化方法有利于神经前体细胞通过在最少量的培养基内选择(第3步),在有bFGF存
小鼠胚胎干细胞培养实验
实验方法原理 胚胎干细胞在体内外可以分化为各种类型的细胞。我们的体外分化方法有利于神经前体细胞通过在最少量的培养基内选择(第3步),在有bFGF存在的情况下扩增(第4步)并最终分化在第5步。细胞全程培养在37℃,5%CO2,100%湿度条件下。一般体外诱导向神经细胞方向分化,也可以采用低浓度的RA进
胚胎发育组织保护干细胞基因组和发育疾病起源机制被揭示
上海交通大学医学院研究员洪登礼团队首次揭示了胚胎发育组织保护其干细胞基因组的机制,并证明该机制与发育疾病(如儿童肿瘤)的发生密切相关,将为进一步研究发育疾病的发病学和预防医学提供重要的理论和实验指导;基于所揭示机制,研发可以预测和预防儿童白血病发生的试剂盒和药品。12月5日,相关研究发表于《自然》杂
基因敲除小鼠模型-竟然发现了关节炎生长机制?
关节炎是运动系统最常见的疾病,也是导致病患丧失行动能力的重要原因之一。据统计,我国约有骨关节炎患者1.8亿,医疗费用占GDP的0.5%,给家庭和社会造成沉重负担,已成为世界性重大公共卫生问题和临床医学难题。关节内成分复杂,有滑膜、软骨、软骨下骨等多种组织结构,至今关节炎的发病机制尚未完全明确。