NatCommun:人工智能帮助找到导致胃癌的基因突变!
在一项开创性研究中,来自新加坡基因组研究所(GIS)科技研究局的研究人员开发了一种全新的机器学习计算机模型(一种人工智能模型,AI)来准确寻找肿瘤突变。他们还发现了一个非编码DNA的新基因突变可能导致了胃癌。这项研究开发出的新技术将在未来帮助研究人员探索其他肿瘤中非编码DNA突变的影响。图片来源:Agency for Science, Technology and Research (A*STAR), Singapore 癌症是全球最大的致死因之一,而胃癌是全球第四最致命的癌症。癌症由于DNA突变导致细胞异常生长所致。我们基因组中那2%的可编码DNA已经得到了充分的研究,但是其他98%的非编码DNA仍然处于无人所知的状态。非编码DNA可以调节基因活性,而越来越多的证据表明这些基因区域的基因突变也会促使癌症的发生发展。 在这项研究中,研究人员创造了两种AI方法扫描212个胃癌组织的全基因组,如果使用现有的标准模式计算机,需......阅读全文
长链非编码RNA:-从科研到临床(一)
概述长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子;根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA;它具有多种作用机制,比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结
eLife:首次发现促癌非编码RNA因子—LAST
中国科学技术大学吴缅教授研究组发现一条受c-Myc转录激活的长非编码RNA。 中国科学技术大学吴缅教授研究组发表了题为“LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA
曹雪涛院士Science揭示重要非编码RNA
来自第二军医大学、中国医学科学院和浙江大学医学院的研究人员,发现一种名为lnc-DC的长链非编码RNA控制了人类树突状细胞的分化。 领导这一研究的是我国著名的免疫学家曹雪涛(Xuetao Cao)院士。其现任职第二军医大学、中国医学科学院和浙江大学医学院,主要从事肿瘤免疫治疗和分子免疫
关键非编码RNA分子促进皮肤癌恶化
在最近一项研究中,图尔库大学中心医院和西方癌症中心(FICAN West)的研究人员发现了一种新的RNA分子PRECSIT,它参与调节了皮肤鳞状细胞癌的生长和侵袭过程。将来,PRECSIT可能会成为检测快速进展或扩散的鳞状细胞癌的新标志物,以及有可能成为新疗法的靶标。 皮肤癌是世界上最常见的癌
Science子刊专题:癌症中的非编码RNA
非编码RNA(尤其是microRNA)是众多细胞过程的关键调控子,与发育和癌症进程密切相关。本期Science Signaling杂志通过专题“Noncoding RNAs in cancer”,介绍了这类分子的生理和病理学功能。 发现哺乳动物基因组中的非编码RNA,不仅揭示了一类新的生物学调
Nature里程碑研究:新型非编码反义RNA
在研究帕金森氏病的过程中,一个国际研究小组获得了一个可以提高工业蛋白质合成用于治疗用途的新发现。他们设法了解了非蛋白质编码RNA的一个新功能:借助这类称作“反义”的非编码RNA的活性可以提高编码基因的蛋白质合成活性。相关成果发表在10月14日的《自然》(Nature)杂志上。 为了合成蛋白
非编码RNA-Nfi调控水稻固氮酶活性
近日,生物所微生物功能基因组创新团队林敏课题组在水稻根际联合固氮施氏假单胞菌中发现新型非编码RNA参与协同调控固氮酶活性,为进一步揭示生物固氮网络调控机制奠定了重要理论基础。该成果发表在最新一期的经典微生物学杂志《应用环境微生物学(Applied and Environmental Micro
出人意料的新才能:非编码RNA
在《来自基因组暗物质的lncRNA、ciRNA和miRNA》一文中我们提到:人类基因组中也存在大量被称为基因组“暗物质(dark matter)”的非编码序列,包括基因间非编码序列、内含子非编码序列等。所谓基因组“暗物质”,其实就是基因组中的非编码RNA——不包含用于制造蛋白质的版图,构成了超过
JCI:促发儿童骨肿瘤的非编码RNA
尤文氏肉瘤是骨或其周围软组织癌症,主要影响儿童和年轻成人。尤文氏肉瘤的特点是易位事件的发生,即RNA结合蛋白——EWS与转录因子如FLI1的融合。 以前的研究工作表明,该融合蛋白EWS-FLI1通过改变基因表达,促进癌症,但融合蛋白作用的靶基因是未知的。 发表在Journal of Clin
非编码RNA的调控作用研究计划项目指南
基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制重大研究计划2016年度项目指南 非编码RNA是由基因组转录产生的一类不同于mRNA的遗传信息分子。对真核细胞中非编码RNA及其基因的发掘和功能研究,有可能揭示一个由非编码RNA介导的遗传信息传递方式和表达调控网络,从不同于蛋白质编码基因的角度注释和
【盘点】长链非编码RNA的研究进展
非编码RNA在生命调控过程中扮演着重要角色,近年来的研究成果常入选CNS年度十大科学突破。人类基因组转录区高达76%,但转录产物中只有不到2%是编码蛋白质的mRNA,其他均为非编码RNA,其中microRNA (miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)等调控
Cell:长期被误解-非编码RNA存在“认知黑洞”
在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质,其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质,却又会转录出非编码RNA,它们对生命活动起什么作用?是进化的冗余还是神秘的缓存? 《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文,他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免疫
DNA编码化学库新技术助推药物研发
科技日报讯 (记者张梦然)近年来,科研人员虽然在分子疗法开发方面取得了重要进展,但新发现的活性物质数量依然不足。现在,美国哈佛大学和瑞士苏黎世联邦理工学院共同开发的DNA编码化学库(DEL)技术提供了新的解决方案。该技术能在几周内自动化合成并测试数十亿种化合物,还能用于生产更大的药物分子,这类药物将
DNA编码分子库为药物发明提供便利
随着DNA编码分子库持续扩大以及新的筛选方法不断开拓未知生物学领域,DNA编码分子库将成为制药行业研发新药的支柱之一。 在美国马萨诸塞州沃尔瑟姆市一座混凝土建筑的二楼,一台普通实验室冰箱的塑料盒子里放着一根透明试管,里面则含有天文数字尺度的混合物。这个分子库里冷冻的是由总部位于英国伦敦的制药公
长链非编码RNA编码多肽的系统挖掘和鉴定研究新进展
6月13日,Molecular & Cellular Proteomics在线发表了中国科学院生物物理研究所研究员杨福全团队和中科院院士陈润生团队,关于长链非编码RNA(lncRNA)编码多肽的系统挖掘和鉴定的研究论文Deeply Mining a Universe of Peptides En
进化分析揭示编码区和非编码区RNA编辑的功能调控效应
2017年3月,国际知名学术期刊PLOS Genetics在线发表了斯坦福大学Jin Billy Li课题组和中山大学生命科学学院张锐课题组共同研究的题为“Evolutionary analysis reveals regulatory and functional landscape of c
非结核分枝杆菌的DNA结构如何?
非结核分枝杆菌(Nontuberculous mycobacteria,NTM)的DNA结构与结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)相似,都是双链环状DNA分子。NTM的基因组大小约为4.5-5.5 Mb,包含约4000个基因。 NTM的基因组中包含了许多与代谢、
复旦公布曹操家族DNA:非夏侯氏抱养
曹操画像 复旦课题组发布曹操家族DNA研究结果 由于家族基因间没有关系,“曹操是汉代丞相曹参后人”这一说法有误;而现有的夏侯氏基因与曹操家族基因也不一致,因此曹操从夏侯氏抱养的说法也不准确。新民网记者今天(11日)获悉,复旦大学课题组宣布完全确定曹操家族DNA,围绕曹操及其家族的身世、遗传之
非放射性地高辛标记DNA探针法
实验概要掌握非放射性地高辛标记DNA探针法。 实验原理以往人们是用放射性同位素来标记探针DNA。近年来,非同位素标记方法发展很快,已有取代同位素标记法的趋势。地高辛配基随机标记DNA探针法,是较为成功的一种非同位素标记方法(Saiki等,1985)。其原理是:用化学方法把类固醇类半抗原地高辛分子连
如何预防胃癌?
饮食健康:避免暴饮暴食、过度饮酒、吃辛辣、油腻、刺激性食物等,多吃蔬菜、水果、粗粮等富含纤维素的食物。 合理用药:避免滥用非甾体抗炎药、激素类药物等对胃黏膜有刺激作用的药物,如果必须使用,应在医生指导下进行。 改善生活方式:保持良好的心态,避免过度疲劳和精神紧张,保证充足的睡眠。 定期体检
如何预防胃癌?
健康饮食:保持健康的饮食习惯,摄入足够的蔬菜、水果和全谷类食物,减少摄入高脂肪、高盐和高糖的食物。 避免食用腌制、烟熏和烤制的食物:这些食物中含有亚硝酸盐等致癌物质,长期食用会增加患胃癌的风险。 戒烟限酒:长期大量饮酒和吸烟都会增加患胃癌的风险,因此应尽量戒烟限酒。 避免长期使用非甾体抗炎
非离断式RouxenY吻合在远端胃癌根治术后的应用
远端胃大部切除术后行BillrothI或BiIIrothII式消化道重建已历经120余年。至今仍为十分普及的手术。既往由于强调胃癌患者的生存期。对于这两种术式的不足并无过多争论。随着胃癌患者生存期延长,对术后生活质量的重视程度逐渐提高,对消化道重建方式的研究也越来越引起学者们的关注。研充发现相对于B
非编码RNA的调控作用机制研究计划项目指南
非编码RNA是由基因组转录产生的一类不同于mRNA的遗传信息分子。对真核细胞中非编码RNA及其基因的发掘和功能研究,有可能揭示一个由非编码RNA介导的遗传信息传递方式和表达调控网络,从不同于蛋白质编码基因的角度注释和阐明基因组的结构与功能,深入阐明生命活动的本质和规律。 一、科学目标 本重大
长链非编码RNAs介导的表观遗传调控基础
近日,中国科学院昆明动物研究所李家立、胡新天和郑永唐课题组与中国科学技术大学生命科学学院汪香婷课题组、武汉生命之美生物科技公司合作,揭示了长链非编码RNAs在灵长类大脑发育和老化过程中表达动态变化和作用。该研究成果以Annotation and cluster analysis of spati
生物所揭示非编码RNA协同调控固氮机制
近日,中国农业科学院生物技术研究所微生物功能基因组创新团队林敏课题组在水稻根际联合固氮施氏假单胞菌中发现新型非编码RNA参与协同调控固氮酶活性,为进一步揭示生物固氮网络调控机制奠定了重要理论基础。相关研究成果在线发表于《应用环境微生物学(Applied and Environmental Mic
非编码small-RNA参与缺氧下的血管生成(一)
非编码RNA是近年来转录组学研究的热点,其中,long non-coding RNA(lncRNA),microRNA,circularRNA是大家研究的非常多的非编码。其实,在small non-coding RNAs世界,除了我们熟知的microRNA之外,还包括piwi-interac
中国科大在非编码RNA研究中取得重要进展
近日,中国科学技术大学生命科学学院吴缅、梅一德教授研究组揭示了长片段非编码RNA通过调控肿瘤细胞瓦伯格(Warburg)效应促进肿瘤生长的作用机制,相关研究成果在线发表于国际杂志Cell的子刊Molecular Cell。 相对于正常细胞,肿瘤细胞的代谢方式在整体上发生了改变,其中一个
非编码RNA调控作用机制重大研究计划项目申报
关于发布“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”重大研究计划2014年度项目指南的通告 国科金发计〔2014〕59号 国家自然科学基金委员会现发布重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”2014年度项目指南,请申请人及依托单位按项目指南中所述的要求和注意事
调节免疫应答的新途径——长链非编码RNA
“我们需要知道细菌感染引发的炎症反应是由什么来调节该过程的。”该研究的领导者,UTA大学化学副教授Subhrangsu Mandal说。 “如果我们能做到这一点,我们就可以控制中枢神经系统炎症性疾病,迄今为止这些疾病一直难以治疗,如败血症和脑膜炎,以及癌症和肌肉营养不良,它们也可以看作一种炎症
2017年不能错过的长非编码RNA研究推荐
2017年即将过去,这一年的非编码RNA研究取得了很多重磅级成果。与早先的主要是在不同类型的疾病(癌症)中大规模鉴定非编码RNA,今年的研究是对非编码RNA机制的更深入探索,给我们展现了作用方式更丰富多彩的非编码RNA世界。图片来源于网络 一 长非编码RNA(lncRNA) 长非编码RNA是