NatCommun：人工智能帮助找到导致胃癌的基因突变！
在一项开创性研究中，来自新加坡基因组研究所（GIS）科技研究局的研究人员开发了一种全新的机器学习计算机模型（一种人工智能模型，AI）来准确寻找肿瘤突变。他们还发现了一个非编码DNA的新基因突变可能导致了胃癌。这项研究开发出的新技术将在未来帮助研究人员探索其他肿瘤中非编码DNA突变的影响。图片来源：Agency for Science, Technology and Research (A*STAR), Singapore 癌症是全球最大的致死因之一，而胃癌是全球第四最致命的癌症。癌症由于DNA突变导致细胞异常生长所致。我们基因组中那2%的可编码DNA已经得到了充分的研究，但是其他98%的非编码DNA仍然处于无人所知的状态。非编码DNA可以调节基因活性，而越来越多的证据表明这些基因区域的基因突变也会促使癌症的发生发展。 在这项研究中，研究人员创造了两种AI方法扫描212个胃癌组织的全基因组，如果使用现有的标准模式计算机，需......阅读全文
Nature重要发现：独特的非编码RNA
我们的皮肤表皮是由许多不同细胞类型构成的混合体，每种细胞类型都有非常明确的职责。这样复杂的组织，其生成或分化在细胞水平上需要进行大量的协调，这一过程发生故障可以导致灾难性的后果。现在，来自斯坦福大学医学院的研究人员确定了这一分化过程的一个主要调控因子。研究成果发表在12月2日的《自然》(Natu
长链非编码－RNA（lncRNA）研究策略
长链非编码 RNA（long noncoding RNA，lncRNA）指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子，它们不编码蛋白，位于细胞核或胞质内，具有保守的二级结构。研究显示，lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能，它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作
长链非编码RNA调控肿瘤生长
人类基因组能够产生10000多种长链非编码RNA(lncRNA)，但是至今为止，人们只知道几十种lncRNA分子的功能。 加州大学圣地亚哥分校的Liuqing Yang等人发表在Nature上的一项研究成果表明，两种lncRNAs可以与雄激素受体结合并控制其功能。雄激素受体是一种转录因
非编码小RNA的结构和功能
中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定 义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生
非编码小RNA的基本信息
中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定 义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生
非编码RNA为癌症研究提供新思路
澳大利亚纽卡斯尔大学和中国科技大学等机构合作完成的两项最新研究表明，非编码RNA（核糖核酸）在癌症治疗方面存在巨大潜力，有助于开发出新型的癌症靶向治疗方法。 非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA。长期以来，全球各地开展的癌症研究主要针对能编码蛋白质的基因，这些基因只占人类基因组的2%。 发表
深入研究非编码RNA的新工具
最近，加拿大多伦多大学Donnelly中心的一个研究小组，开发出了一种方法，可使科学家们能够深入探索“ncRNAs在人类细胞内做了什么”。 这项研究发表在5月19日的《Molecular Cell》杂志，同一天，来自新加坡基因组研究所的Yue Wan研究组与斯坦福大学的Howard Chang
可以促进癌细胞生长的非编码RNA
国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》发表西奈山伊坎医学院教授Benjamin Greenbaum的一篇研究文章。研究人员在癌细胞中发现了一组可以激发免疫反应的非编码RNA分子，它们具有与病原体相似的一些特征。由于这些分子在癌细胞中表达并扩增，它们造成的免疫反应有可能影响癌细胞的生长。 研究
出人意料的非编码RNA调控
为了将六英尺多的DNA塞进细胞核里，细胞将基因组紧紧缠绕在组蛋白核心上形成核小体，并最终将其包装成紧密的染色质。DNA转录的时候需要打开核小体，而胚胎干细胞的染色质重塑复合体esBAF可以做到这一点。它不仅会打开需要转录的DNA，还暴露了促进转录的启动子和增强子。 基因组测序研究最近显示，增强
如何揭开长非编码RNA的神秘面纱
长非编码RNA(lncRNA)长达两百个核苷酸以上的转录本，但并不编码任何蛋白质。尽管如此，长非编码RNA在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性，说明lncRNA的调控具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA(也称lincRNA)位于细胞核，它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠，
带你走进神秘的长链非编码RNA
长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子，它们并不编码蛋白，而是以RNA的形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究
长链非编码RNA:－从科研到临床
长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子；根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA；它具有多种作用机制，比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结构
长期被误解－非编码RNA存在“认知黑洞”
在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质，其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质，却又会转录出非编码RNA，它们对生命活动起什么作用？是进化的冗余还是神秘的缓存？ 《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文，他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免疫
智力障碍相关非编码基因突变发现
科技日报北京6月6日电 （记者张梦然）新一期《自然·医学》发表的一项大规模遗传学研究结果显示，相比目前已知的其他任何非性别相关基因，RNU4-2基因的罕见突变，可能是更多临床诊断智力障碍病例的一个促进因素。新发现有望促进对特定神经发育疾病的诊断和治疗。智力障碍是一种神经发育疾病，其特征为智力功能以及
Cell封面故事：抗癌向着非编码RNA开炮
一种常见儿童血癌中对触动及推动肿瘤生长和进展的因子开展大型遗传分析，来自纽约大学Langone医学中心的研究人员报告称，他们鉴别出了一个可能的、治疗这种疾病的新药物靶点。 T细胞急性淋巴母细胞性白血病（T-cell acute lymphoblastic leukemia）是一种最常见且具有侵
单革：非编码RNA的探索者
日前，国际知名杂志《自然·结构和分子生物学》刊发了中国科学技术大学单革教授的一篇文章，他的实验室发现了一类新型环状非编码RNA，并揭示了其功能和功能机理，相关成果得到了新华社、中科院官网等媒体关注。 记者了解到，在2012年9月，《自然·通讯》也在线发表了单革的研究成果，那次他发现了曾被认为是
非编码RNA的功能引发国际研究热潮
由1962年诺贝尔生理学或医学奖获得者英国科学家克里克和美国科学家沃森提出的分子生物学中心法则认为，遗传信息是从DNA（脱氧核糖核酸）传递给mRNA（信使核糖核酸），再从mRNA传递给功能蛋白质，由此来完成遗传信息的转录和翻译过程的。 根据这一中心法则，mRNA似乎只有唯一的
Science首次证实全新基因的非编码来源
在过去的几年里，科学家们已逐渐认识到基因组中本来是非编码的区域，确实有可能形成新基因。事实上，相关物种基因组的比较也甚至指出，这种从头形成基因的方式也许是一种普遍模式。 来自加州大学戴维斯分校的研究人员近期发现了在6种果蝇株系中全部或部分表达的142个转录子，对应于果蝇参考基因组(refe
中国科大发现新型非编码RNA
最近，中国科学技术大学单革教授实验室在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)发表研究性论文，报导了其实验室发现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能和功能机理。 非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起
长期被误解－非编码RNA存在“认知黑洞”
在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质，其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质，却又会转录出非编码RNA，它们对生命活动起什么作用？是进化的冗余还是神秘的缓存？ 《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文，他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免
长链非编码RNA与淋巴瘤
类基因组中仅有1.5%~2.0%编码蛋白的基因得以稳定转录，而剩余的绝大多数RNA无编码蛋白的功能。长链非编码RNA（lncRNA）是一类异质性的非编码RNA，根据lncRNA的功能，可将其分为信号分子、诱饵分子、引导分子和骨架分子4类。人们以往仅将这些不具编码功能的RNA视为进化过程中产生的废
胃癌治疗
在中国，胃癌是常见癌种之一 。2020年3月，中国迎来首个胃癌免疫疗法——百时美施贵宝（BMS）的PD-1抑制剂纳武利尤单抗注射液。它被NMPA批准用于治疗既往接受过两种或两种以上全身性治疗方案的晚期或复发性胃或胃食管连接部腺癌患者。这一获批突破了中国胃癌治疗“后线缺药”的僵局，对于重振晚期胃
DNA折纸“巧手”织就单质非晶金属
近日，中国科学院院士汪卫华团队提出了一种基于DNA折纸模板的单质金属非晶化新策略，通过在DNA框架中心构建具有近五重对称特征的纳米限域空间，在常压、室温条件下实现了非晶态银纳米结构的可控构筑和原子制造。相关成果发表于《材料展望》（Materials Futures）。记者获悉，该创新策略为非晶态金属
DNA编码分子库为药物发明提供便利
随着DNA编码分子库持续扩大以及新的筛选方法不断开拓未知生物学领域，DNA编码分子库将成为制药行业研发新药的支柱之一。 在美国马萨诸塞州沃尔瑟姆市一座混凝土建筑的二楼，一台普通实验室冰箱的塑料盒子里放着一根透明试管，里面则含有天文数字尺度的混合物。这个分子库里冷冻的是由总部位于英国伦敦的制药公
DNA编码化学库新技术助推药物研发
科技日报讯 （记者张梦然）近年来，科研人员虽然在分子疗法开发方面取得了重要进展，但新发现的活性物质数量依然不足。现在，美国哈佛大学和瑞士苏黎世联邦理工学院共同开发的DNA编码化学库（DEL）技术提供了新的解决方案。该技术能在几周内自动化合成并测试数十亿种化合物，还能用于生产更大的药物分子，这类药物将
北京生科院发表环形非编码RNA识别新技术
2月28日，国际学术期刊Briefings in Bioinformatics 发表了中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队题为Circular RNA identification based on multiple seed matching 的最新研究成果。因为目前在环形RNA识别方面存
JCI：促发儿童骨肿瘤的非编码RNA
尤文氏肉瘤是骨或其周围软组织癌症，主要影响儿童和年轻成人。尤文氏肉瘤的特点是易位事件的发生，即RNA结合蛋白——EWS与转录因子如FLI1的融合。 以前的研究工作表明，该融合蛋白EWS-FLI1通过改变基因表达，促进癌症，但融合蛋白作用的靶基因是未知的。 发表在Journal of Clin
Nature：像海绵一样的非编码RNA
一种称为RsmZ的小分子RNA具有特殊的功能：屏蔽细菌中抑制翻译的蛋白的作用，最新一项研究揭示了这种RNA如何能完成其功能的分子机制，指出RsmZ像海绵一样能吸收多种阻遏蛋白（repressor proteins）。 小 RNA（small RNAs 或 sRNAs）是一类长度为40-400个
Cell:长期被误解－非编码RNA存在“认知黑洞”
在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质，其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质，却又会转录出非编码RNA，它们对生命活动起什么作用？是进化的冗余还是神秘的缓存？ 《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文，他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免疫
非编码RNA－Nfi调控水稻固氮酶活性
近日，生物所微生物功能基因组创新团队林敏课题组在水稻根际联合固氮施氏假单胞菌中发现新型非编码RNA参与协同调控固氮酶活性，为进一步揭示生物固氮网络调控机制奠定了重要理论基础。该成果发表在最新一期的经典微生物学杂志《应用环境微生物学（Applied and Environmental Micro