陈功友教授973项目多篇文章解析新机理

来自上海交通大学农业与生物学院的陈功友教授2008年6月进入上海交大组建了“植物-病原物互作功能基因组学”实验室,之后邹华松博士和邹丽芳博士先后加盟,主要从事稻黄单胞菌引起的水稻白叶枯病和水稻细菌性条斑病发生机理与控制的基础研究。 近期这一实验室发表了多篇文章,分别解析了水稻白叶枯病菌和稻黄单胞菌的致病遗传学新机理,相关成果公布在Applied and Environmental Microbiology,以及Microbiology杂志上。 第一篇文章“The Ketoglutarate Transport Protein KgtP is Secreted through the Type III Secretion System and Contributes to Virulence in Xanthomonas oryzae pv. oryzae”主要揭示水稻白叶枯病菌如何利用二羧酸转运蛋白从......阅读全文

深度解读:个人基因组学的现状与发展

  什么是Personal Genomics?  Personal Genomics,一般翻译为“个人基因组学”。是基因组学的一个分支,主要关注个人基因组的测序和分析。  1990年开始发起的浩大的“人类基因测序计划”是从大量的个体中获取基因信息,综合之后建立一个具有“参考价值”的人类“平均”基因组

解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序

  “桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、   有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983

植物基因组学国家重点实验室2014夏季青年学术论坛召开

  中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因组学国家重点实验室2014年度夏季青年学术论坛于7月24日至25日成功召开。实验室的职工、博士后、研究生以及客座人员等共350余人参加了此次论坛。实验室副主任储成才研究员致开幕词,指出实验室青年学术论坛进一步推动了实验室的内部交流,希望青年人员以此为平台,

植物基因组学国家重点实验室2012年度青年学术论坛

  植物基因组学国家重点实验室2012年度青年学术论坛于2013年1月10日至11日召开。实验室课题组长、工作人员和研究生共计450余人出席了此次论坛。实验室主任左建儒研究员代表实验室学术委员会主任方荣祥院士致开幕词。左建儒研究员引用“他山之石,可以攻玉”、“三人行,必有吾师”,充分肯定了

2年Science基因组学文章引用次数高达100

  据The Scientist报道,一篇发表在Science杂志上的基因组学文章成为基因组学领域热门的文章,从2007年发表后,总的引用次数高达100次。   这篇文章即是:V. Nene et al., “Genome sequence of Aedes aegypti, a major ar

973计划支持蔬菜基因组学研究取得重要进展

  在973计划的支持下,中国农业科学院蔬菜花卉研究所黄三文研究员的研究团队构建了包含360多万个位点的黄瓜全基因组遗传变异图谱,为全面了解黄瓜这一重要蔬菜作物的进化及多样性提供了新思路,并为全基因组设计育种打下了基础。该研究成果于10月21日由《自然 遗传学》杂志在线发表。   黄瓜是最重要

水稻基因组学与农业应用研讨会召开

  由华大基因研究院举办的“水稻基因组学与农业应用研讨会”近日在深圳召开。  作为世界上最早种植水稻的国家,水稻一直在我国粮食生产中起着举足轻重的作用。华大基因等国内多家单位曾于2002年率先合作完成籼稻基因组框架图与精细图的绘制工作,并在美国《科学》杂志发表科学专论。

基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破

深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据,首次对苔类目级系统框架进行了重建,得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员,通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员,深圳华大生命科学研究院联合培养研究

基因组学家Venter融资7000万开发抗衰老新药

          美国基因组学家克雷格·文特尔(Craig Venter)称,已融资7000万美元,用以新成立一家生物科技公司,该公司将致力于抗衰老新药的研发工作。   文特尔今天表示,已从投资者那里融资7000万美元,用以成立Human Longevity(以下简称“HLI”)公司。H

宏基因组学:查明微生物身份新手段

  背景   《美国医学会杂志》(JAMA)近期刊发了一篇题为《利用不需培养的宏基因组学测序技术研究产志贺毒素大肠杆菌O104∶H4暴发株》的研究论文,引起了学界和社会的广泛关注。这篇论文中应用了一种称为“宏基因组学”的技术方法,不通过培养,直接从病人样品中检测分析其携带的病原微生物,甚至可以

利用植物表型组学挖掘基因组学的成果

到2050年,全球人口将达到97亿,预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标,作物产量需每年增长2.4%,但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素,但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可

英国|基因组学和基因编辑:未来的研究方向

  英国下议院(House of Commons)的科学技术委员会(Science and Technology Committee)发起对基因组学(Genomics)和基因编辑(Genome editing)的调查,呼吁这些新兴的科学领域的研究能提供其影响人类健康、植物、动物和生态系统的证据。20

王宪辉:“寂寞”基因组学和“爱热闹”蝗虫

   中国“天眼”建成启用,“悟空”“墨子”发射成功,“蛟龙”号深海科考,体细胞克隆猴成功培育……自从2013年7月17日习近平总书记视察中国科学院并提出“四个率先”要求以来,中国科学院实施“率先行动”计划、加快改革创新发展,产出了一批具有重大国际影响力的标志性科技创新成果,为实施创新驱动发展战略、

海南大学团队定义植物基因组学“终极参考图谱”

近日,记者从海南大学获悉,该校三亚南繁研究院陈飞教授团队首次构建了“分型端粒到端粒超级泛基因组”理论体系,实现了植物基因组从个体单倍型完整到群体遗传多样性全覆盖的技术跨越。相关成果发表在国际期刊《植物科学趋势》。植物基因组研究长期受制于参考基因组的局限——传统组装难以解析着丝粒、端粒等复杂区域,且无

8位大牛畅谈基因组学的未来

  过去几十年已经彻底改变了遗传学和基因组学,那么,下一个十年呢?《PLOS Biology》请了不同领域的8位牛人科学家,谈谈他们的预测。无一例外,所有预测都指向更大规模和更多类型的数据。当然,这些大牛都很乐观,许了遗传学和基因组学一个光明的未来。  Wellcome Trust Sanger研究

基因组学突破性成果:斑马鱼序列解析

  人类发育,生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体,但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里,斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。在《自然》杂志网站发表的两篇文章里1,2,报道了斑马鱼参考基因组序列和完成超过10,000个蛋白编码基因的断裂性突变体的鉴

Optalysys光计算发力中国基因组学市场

  “国际基因组学大会”由华大基因主办,是基因组学领域最具影响力的国际性学术年会。该盛会不仅汇聚了生物组学的专家泰斗和企业精英进行深入的学术交流,更促进了基因组学领域在全球范围内的合作、创新与应用。今年ICG-12大会更是吸引了全球领先的光计算研发公司Optalysys参加,其公司创始人兼CEO N

Nat-Rev-Cancer综述:肿瘤蛋白质基因组学

导 读       肿瘤蛋白质基因组学(Cancer proteogenomics)是将基于质谱(MS)的蛋白质丰度和翻译后修饰(PTM)信息与临床前肿瘤模型和肿瘤样本的基因组、表观基因组和转录组数据相结合的组学技术。基因组学和表观基因组学为解释可能发生的生物过程提供了基础知识,蛋白质组学是对已经发

安捷伦财政收入:-诊断和基因组学增长快

  安捷伦科技公司在周三收市后宣布,其第三财季的收入较去年同期下降4%,但诊断和基因组学部门的收入增加54%。   在截至7月31日的第三财季,该公司总收入达16.5亿美元,低于去年同期的17.2亿美元,但略微高于华尔街预计的16.4亿美元。   按业务部门来分,诊断和基因组

基因组学大牛Science发布癌症重大成果

  Whitehead研究所的科学家们发现,称作为“隔绝邻域”的环状染色质结构遭到破坏可以激活能够推动侵袭性肿瘤生长的癌基因。这一研究发现对于癌症诊断及治疗均具有重大的意义。相关论文发布在《科学》(science)杂志上。  领导这一研究的是Whitehead生物医学研究所的Richard A Yo

张锋等人Cell发表空间基因组学最新成果

  如果要观察细胞,我们常常需要显微镜。现在,科学家已经开发出一种方法,可通过细胞自身的遗传物质对细胞进行“拍摄”,进而生成独特的可视化图像。虽然当前该方法生成的图像比传统显微镜图像要模糊,但这种方法或许可以帮助科学家们改进癌症治疗,并探索人类神经系统的形成过程等。  在今日发表于Cell杂志的重磅

蛋白基因组学研究揭示肝癌发生和发展机制

  慢性乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是导致我国肝癌发生的最主要原因,约85%的肝癌患者携带HBV感染标志。肝癌的发生发展是一个非常复杂的生物学过程,受到机体的系统性调控,基因突变会对HBV相关肝癌的表型产生怎样的影响,目前这方面的研究报道较少,亟待深入探究。同时,新药研

单细胞基因组学:通往个体化医疗之门

  随着第二代测序技术的普及,单细胞测序迎来了迅猛发展。  近日,南方科技大学生物学系副教授贺建奎在美国冷泉港参加了单细胞分析会议后,在科学网博客里写道:“这是一个非常令人激动的前沿学术会议,我深深地体会到了单细胞基因组学时代的来临。”  他对《中国科学报》表示:“单细胞基因测序技术的突破,只是开了

测序技术发展过快?基因组学千万大奖告吹

  X奖基金会近日决定取消了奖金高达1000万美元的基因组学Archon X奖(Archon Genomics X Prize),因为基因组测序成本的直线下降已使得竞争毫无意义。   X奖基金会的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了关闭竞赛的决定。他表示,这是因为如今

Nature论述:单细胞基因组学揭开“免疫新世界”

  人类对生命的好奇,从来没有减退。一个多世纪以来,科学家们一直试图解析构成我们机体的成千上万亿个细胞,从一米长的神经元到8微米宽的红细胞。他们希望从中找到解析重要生理、病理过程,挖掘重要的细胞类型和信号通路。  但是,过去几十年,包括荧光抗体标记技术、DNA和RNA测序技术等在内的研究工具却不能解

整合基因组和组织学信息-基因组学公司联手开拓新前沿

  10x Genomics公司宣布收购位于瑞典斯德哥尔摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空间基因组学(spatial genomics)领域的领先公司。空间基因组学是一个新兴领域,它不但让研究人员可以获得单细胞内的基因组数据

昆明植物所在南方菟丝子基因组学研究中取得进展

  自然界绝大部分植物都通过叶片的光合作用和根部的水分和营养吸收维持自养生存,而寄生植物则是一类通过寄生在自养植物上获取能量和营养的植物。寄生植物独特的起源、演化和特殊生理生态长期以来吸引着研究者的目光。旋花科茎寄生植物菟丝子寄生行为在实验室中方便控制和观察,近年来已成为许多探索寄生植物生理生态和进

Autoimmunity:能研究细胞表观基因组学特性的新型工具

  如今研究人员都知道,表观基因组在控制DNA表达上扮演着关键角色,而且表观基因组的一系列改变与多种健康问题直接相关,比如癌症、自身免疫性障碍等多种疾病,但目前科学家们关于表观基因组并不是知道地很多,甚至也并没有工具去研究表观基因组。图片来源:CC0 Public Domain  刊登在国际杂志Au

探秘基因组学-首期兴隆湖科学大讲堂开讲

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499442.shtm1953年4月25日,科学家发现了DNA双螺旋的结构,分子生物学时代被开启,人类通过携带着生命遗传信息的DNA,逐渐揭开了生命之迷。在那之后,越来越多的科学家们投入到关于生命科学、人类

北方药用物种基因组学转化研究中心成立

在10月23日,中国北方药用物种基因组学转化研究中心正式揭牌,这标志着我国药用物种基因组学转化研究进入到一个新的发展阶段。  该中心是由中国科学院北京基因组研究所和吉林紫鑫药业股份有限公司共同发起建立的集基础研究、资源保护和应用开发为一体,以长白山脉传统中草药相关生物物种为对象,以加速中医