通过超滤去除DNA扩增产物中的寡核苷酸及过剩dNTP
PCR 反应结束后,从扩增 DNA 产物中去除扩增反应残余下来的寡核苷酸引物,引物二聚体及 dNTP 是非常必要的。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理PCR 反应结束后,从扩增 DNA 产物中去除扩增反应残余下来的寡核苷酸引物,引物二聚体及 dNTP 是非常必要的。首先,DNA 扩增目的产物内残余的 dNTP 可以在剩余热稳定 DNA 聚合酶的作用下填平已被限制性内切核酸酶切割产生的 DNA 产物的黏末端,使后者难以被进一步克隆。其次,过量的寡核苷酸引物可导致用第一次 PCR 扩增的 DNA 产物作模板再进行第二次 PCR 扩增反应的效率降低。最后,引物二聚体内部的众多的限制性核酸内切酶酶切位点可与扩增 DNA 片段两末端的酶切位点竞争限制性核酸内切酶,从而影响扩增 DNA 片段的薄切效率。实验材料扩增反应产物试剂、试剂盒氯仿乙醇乙酸钠TE仪器、耗材制备性离心机或小型离心机浓缩器实验步骤一、材料1. 缓......阅读全文
Nature:反义寡核苷酸治疗的逆袭
Rochester大学医学中心、Isis制药公司和Genzyme公司的科学家通过反义寡核苷酸治疗,在小鼠肌肉细胞中消除了一类有害的RNA,成功逆转了强直性肌营养不良症的症状,文章发表在8月2日的Nature杂志上。 反义寡核苷酸ASO能特异性的对基因进行knockdown,能够帮助治疗与R
简并寡核苷酸引物PCR-(DOPPCR)
实验方法原理显微切割或流式分选的染色体经过PCR扩增制备整条染色体的DNA,被认为是对某条染色体全部涂染的高质量探针的首选途径。对于单个染色体、多色FISH(M-FISH)或光谱核型分析中所有24条染色体的涂染均是此种情况。下面提供的操作程序是简并寡核苷酸引物PCR(DOP-PCR)最原始操作程序的
关于寡核苷酸探针的制备的介绍
进行分子突变需要大量的探针拷贝,后者一般是通过分子克隆(molecular cloning)获得的。克隆是指用无性繁殖方法获得同一个体、细胞或分子的大量复制品。当制备基因组DNA探针前,应先制备基因组文库,即把基因组DNA打断,或用限制性酶作不完全水解,得到许多大小不等的随机片段,将这些片段体外
寡核苷酸的合成方式及用途
寡核苷酸(Oligonucleotide),一般是指2~10核苷酸残基以磷酸二酯键连接而成的线性多核苷酸片段,但在使用这一术语时,对核苷酸残基的数目并无严格规定,在不少文献中,把含有30甚至更多核苷酸残基的多核苷酸分子也称作寡核苷酸。寡核苷酸可由仪器自动合成,它可作为DNA合成的引物(Primer)
寡核苷酸5末端磷酸化实验
试剂、试剂盒 T4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液 Tris-Cl T4噬菌体多核苷酸激酶 寡核苷酸 [γ-32P]ATP
简并寡核苷酸引物PCR-(DOPPCR)
基本方案 实验方法原理 显微切割或流式分选的染色体经过PCR扩增制备整条染色体的DNA,被认为是对某条染色体全部涂染的高质量探针的首选途径。对于单个染色体、多
关于寡核苷酸的基本信息介绍
寡核苷酸(Oligonucleotide),一般是指2~10核苷酸残基以磷酸二酯键连接而成的线性多核苷酸片段,但在使用这一术语时,对核苷酸残基的数目并无严格规定,在不少文献中,把含有30甚至更多核苷酸残基的多核苷酸分子也称作寡核苷酸。寡核苷酸可由仪器自动合成,它可作为DNA合成的引物(Prime
寡核苷酸5末端磷酸化实验
以下介绍的是标记 10pmol 高比活度的寡核苷酸的反应,标记不同量的寡核苷酸可以通过增加或减少反应体积而保持各组分的相应浓度来实现。也可用类似的反应条件,将非放射性的磷酸加到用于定点突变的合成寡核苷酸 5'末端。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒T4噬菌
用制备凝胶电泳纯化寡核苷酸实验
试剂、试剂盒 丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵 NNN'N'-四甲基乙二胺合成的互补寡核苷酸仲丁醇(2-丁醇)二乙醚 NaOAcMgCl2 乙醇TBE 甲酰胺加样缓冲液 TE仪器、耗材 SpeedVac 旋转浓缩仪实验步骤 材料与设备丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵(10%;w/v)N,
寡核苷酸探针在溶液中的杂交实验
试剂、试剂盒 寡核苷酸杂交液 寡核苷酸预杂交液 SSC 或 SSPE TEAC1 洗涤液 TMAC1或 TEACl TMAC1 洗涤液
寡核苷酸探针在溶液中的杂交实验
试剂、试剂盒 寡核苷酸杂交液寡核苷酸预杂交液SSC 或 SSPETEAC1 洗涤液TMAC1或 TEAClTMAC1 洗涤液核酸和寡核苷酸放射性标记的寡核苷酸探针仪器、耗材 杂交装置振荡培养器实验步骤 材料溶液和缓冲液稀释贮存液至适当浓度。寡核苷酸杂交液6XSSC(或 6XSSPE)0.05mol/
用于表达监测的寡核苷酸分析实验1
用于表达监测的 mRNA 的扩增及其与寡核苷酸分析芯片的杂交实验材料样品 RNA试剂、试剂盒Superscript cDNA kit (Life Technologies)RNA 酶抑制剂制备对照转录池酚 氯仿 异戊醇乙酸铵乙醇10 X 转录缓冲液10 X rNTP 混合液T7 RNA 聚合酶RNe
寡核苷酸探针在溶液中的杂交实验
Jabobs等 ( 1988)介绍了在含季铵盐缓冲液中杂交的方法与原理。下述为该法的简单变通方案。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒寡核苷酸杂交液寡核苷酸预杂交液SSC 或 SSPETEAC1 洗涤液TMAC1或 TEAClTMAC1 洗涤液核酸和寡核苷酸放射性标
关于同聚寡核苷酸末端连接的基本介绍
同聚寡核苷酸末端连接(也叫同聚物加尾连接、同聚末端连接),是在脱氧核苷酸转移酶(terminal transferase,也称DNA 转移酶、末端转移酶) 的作用下可以在DNA 的3'; 一羧基端合成低聚多核苷酸(添加同聚物造成延伸部分)。如果把所需要的DNA 片段接上低聚腺嘌呤核苷酸(d
寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验
实验材料 适用于转化的大肠杆菌菌株 用于转化的大肠杆菌 TG1 感受态菌试剂、试剂盒 ATPPE1缓冲液PE2 缓冲液噬菌体 T4 DNA 连接酶噬菌体 T4 多核苷酸激酶大肠杆菌 DNA 聚合酶ⅠKlenow 片段M13 噬菌体通用测序引物含 4 种 dNTP 的 dNTP 溶液诱变的 M
用于表达监测的寡核苷酸分析实验2
数据分析与处理以及数量评定实验步骤1.用 Affymetrix Gene Chip 软件进行最初的数据处理。通过检测图像像素值,此软件测定每种寡核苷酸探针的荧光强度从而计算出每种转录本的简化值。此简化值被称为「平均差异」,它通过确定某一特定转录本在所有引物对中的特异信号而得(即将某一特定转录本由完全
应用混合寡核苷酸引物引导的cDNA扩增
实验方法原理 对于仅仅知道某种蛋白质的部分序列,而要克隆其基因的最佳方法是,利用已知氨基酸序列设计相应的寡核苷酸,用此寡核苷酸作为探针去筛选基因文库钓取全长基因或者用寡核苷酸作为引物进行 PCR 扩增靶基因。这两种方法都会遇到寡核苷酸所编
等位基因特异的寡核苷酸的定义
中文名称等位基因特异的寡核苷酸英文名称allele specific oligonucleotide;ASO定 义与基因点突变热点区互补的人工合成的寡核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
关于寡核苷酸酶的基本信息介绍
寡核苷酸酶是核糖核酸(RNA)的深加工产品,可用作核苷酸类药物的中间体,而核苷酸类药物在抗癌、抗病毒、治疗心血管疾病、糖尿病及干扰诱导等方面具有独特的疗效。5';-核苷酸主要产品有5';-腺苷酸(5';-AMP)、5';-胞苷酸(5';-CMP)、5';-尿苷
用制备凝胶电泳纯化寡核苷酸实验
用制备凝胶电泳纯化寡核苷酸实验 试剂、试剂盒 丙烯酰胺 双丙烯酰胺 尿素
用制备性凝胶电泳纯化寡核苷酸
试剂、试剂盒40% (m V) 19:1丙烯酰胺 双丙烯酰胺16%聚丙烯酰胺凝胶10×TBE缓冲液尿素10% (m V)过硫酸铵TEMED甲酰胺加样缓冲液仲丁醇(2-丁醇)二乙醚1 mol L MgCl2仪器、耗材Saran保鲜膜或其他可透紫外光的塑料膜增感屏(如 Lightning PlusDuP
用制备凝胶电泳纯化寡核苷酸实验
试剂、试剂盒丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵NNN'N'-四甲基乙二胺合成的互补寡核苷酸仲丁醇(2-丁醇)二乙醚NaOAcMgCl2乙醇TBE甲酰胺加样缓冲液TE仪器、耗材SpeedVac 旋转浓缩仪实验步骤材料与设备丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵(10%;w/v)N,N,N'
寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验
本文介绍了由 Zoller 和 Smith 的双引物技术(1984,1987) 结合 Kunkel 的诱变体产量富集方法(1985) 构成的经典方案。本方案中使用的单链 DNA 模板含有较高的尿嘧啶残基,因为它们是从生长于 dut 和 ung 基因突变大肠菌中的 M13 噬菌体中制备的(见方案 1)
寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验
实验材料 适用于转化的大肠杆菌菌株 用于转化的大肠杆菌 TG1 感受态菌 试剂、试剂盒 ATP
分子遗传学词汇寡核苷酸定点诱变
中文名称:寡核苷酸定点诱变英文名称:oligonucleotide-directed mutagenesis定 义:用人工合成的寡核苷酸在特定位点导致突变。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
什么是寡核苷酸与多核苷酸?
2~20个核苷酸连接而成的化合物叫寡核苷酸。20个以上的核苷酸组成的化合物叫多核苷酸。核酸是一种多核苷酸。
用随机寡核苷酸引物从mRNA合成cDNA探针
实验方法原理 本方案以 poly(A) + RNA 作为模板,通过随机引物反应合成 cDNA 探针,这类探针可用于 cDNA 文库的差异筛选。实验材料 反转录酶反转录酶缓冲液随机脱氧核苷酸引物模板 mRNA试剂、试剂盒 乙酸铵DTTEDTA乙醇HClNaOH酚氯仿胰 RNA 酶抑制剂SDS Tris
Nature新文章:反义寡核苷酸治疗的逆袭
MECP2基因编码生成同名的一种蛋白,MECP2蛋白水平对于正常脑功能至关重要。一些导致蛋白低表达的突变可引起Rett综合征,基因复制导致蛋白过度表达则可造成MECP2重复综合征。两种均为严重令人衰弱的儿童神经系统疾病。 2007年,研究证实了可以逆转疾病小鼠模型Rett综合征症状。由Bayl
应用混合寡核苷酸引物引导的cDNA扩增(MOPAC)
对于仅仅知道某种蛋白质的部分序列,而要克隆其基因的最佳方法是,利用已知氨基酸序列设计相应的寡核苷酸,用此寡核苷酸作为探针去筛选基因文库钓取全长基因或者用寡核苷酸作为引物进行 PCR 扩增靶基因。这两种方法都会遇到寡核苷酸所编码的 遗传密码子的简并性问题。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译
用随机寡核苷酸引物从mRNA合成cDNA探针
本方案以 poly(A) + RNA 作为模板,通过随机引物反应合成 cDNA 探针,这类探针可用于 cDNA 文库的差异筛选。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理本方案以 poly(A) + RNA 作为模板,通过随机引物反应合成 cDNA 探针,这类探针可用于 cDNA