试剂、试剂盒40% (m V) 19:1丙烯酰胺 双丙烯酰胺16%聚丙烯酰胺凝胶10×TBE缓冲液尿素10% (m V)过硫酸铵TEMED甲酰胺加样缓冲液仲丁醇(2-丁醇)二乙醚1 mol L MgCl2仪器、耗材Saran保鲜膜或其他可透紫外光的塑料膜增感屏(如 Lightning PlusDuPont NEN)手提式短波长紫外光源硅化的玻璃棉干冰 乙醇浴(-78℃)实验步骤1) 制备一块20cm×40 cm×1.5 mm的变性胶,带有4个样品孔,孔宽为3 cm。对于分离约10〜45个碱基长的寡核苷酸,用16%的聚丙烯酰胺/尿素胶(对于更长的寡核苷酸用8%或6%的聚丙烯酰胺/尿素胶)。让胶聚合30 min以上,然后30 W预电泳 >1 h。2) 将各寡核苷酸溶于甲酰胺加样缓冲液中至终体积200μL , 65℃加热15 min以去除 DNA 二级结构。各孔中分别加50μL样品,在30 W电泳约4 h,直至溴酚蓝移至胶的75......阅读全文
试剂、试剂盒 无菌的过滤水乙腈乙酸铵正丁醇不含指示染料的甲酰胺凝胶加样缓冲液甲酰胺指示染料混合液甲醇:水溶液寡核苷酸洗脱缓冲液TE 溶液合成寡核苷酸粗制品仪器、耗材 MillexHV 滤器石蜡封口膜或荧光薄层层析板Sep-Pak 传统层析柱注射器紫外灯水浴加热器实验步骤 材料缓冲液和溶液稀释缓存液至
试剂、试剂盒 无菌的过滤水 乙腈 乙酸铵 正丁醇 不含指示染料的甲酰胺凝胶加样缓冲液
试剂、试剂盒无菌的过滤水乙腈乙酸铵正丁醇不含指示染料的甲酰胺凝胶加样缓冲液甲酰胺指示染料混合液甲醇:水溶液寡核苷酸洗脱缓冲液TE 溶液合成寡核苷酸粗制品仪器、耗材MillexHV 滤器石蜡封口膜或荧光薄层层析板Sep-Pak 传统层析柱注射器紫外灯水浴加热器实验步骤材料缓冲液和溶液稀释缓存液至适当浓
分子杂交技术 互补的核苷酸序列通过Walson-Crick 碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA 分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DN
这一实验方案分为 6 个阶段。第 1 阶段:降解 RNA 的去磷酸化; 第 2 阶段:完整 RNA 去帽; 第 3 阶段:RNA 寡核苷酸的制备; 第 4 阶段:RNA 寡核苷酸与细胞 RNA 的连接; 第 5 阶段:反转录; 第 6 阶段:扩增。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康
试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 仪器、耗
目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱
第 3 阶段:RNA 寡核苷酸的制备选择离 T7 或 T3RNA 聚合酶作用位点下游约 lOObp 处可以线性化的质粒 [见图 25-3(b)]。因为来自多克隆位点回文序列的引物用于 PCR 效果不好,因此比较理想的是用在多克隆位点克隆进某个插入片段的质粒。一个已经验证过的质粒是 pBS-S
实验材料 λ噬菌体臂 大肠杆菌菌株 用于λ噬菌体的包装抽提物 试剂、试剂
实验方法原理噬菌体展示技术是将外源基因与噬菌体的表面蛋白基因融合,在融合了外源基因的噬菌体颗粒的表面就会表达相应的外源蛋白,即外源基因编码的蛋白被展示在噬菌体颗粒的表面。实验材料载体tRNA抗体寡核苷酸试剂、试剂盒抗生素储存液BCIP葡萄糖储存液X-Gal磁珠洗液蛋白酶抑制剂RNase 抑制剂TEN
互补的核苷酸序列通过Walson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。 杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DNA或总RNA。根据使用的方
PCR技术代替了为测序而反复进行的分子克隆和模板制备步骤。PCR技术与自动测 序技术相结合后,它将成为一种最快、最有效的测定核苷权序列的方法。本章主要综 述各种测模板的制备以及如何完成PCR产物的直接测序。与传统的将PCR片段克隆入质 粒或病毒基因组相比,直接序列分析有两个主要的优点:1)由于它是一
试剂、试剂盒 ATP 结合缓冲液 变性溶液 二硫苏糖醇 EDTA 乙醇激酶 连接酶
利用核苷酸交换和剪切技术进行DNA碎裂和定向进化 实验材料 T4 DNA 连接
实验方法原理 在分子克隆中没有比分离缺乏相应的 mRNA 5' 末端的序列特征结构的 cDNA 克隆更易失败的了。通常存在于 cDNA 基因文库中的部分克隆,由于反转录酶未能沿全长 mRNA 模板延伸完全,合成的 cDNA 第一条链往往 5' 末端不完整。实验材料 
实验方法原理 在分子克隆中没有比分离缺乏相应的 mRNA 5' 末端的序列特征结构的 cDNA 克隆更易失败的了。通常存在于 cDNA 基因文库中的部分克隆,由于反转录酶
独体—基于纤连蛋白类型Ⅲ结构域框架的抗体模拟 Akiko Koide and Shohei Koide  
实验方法原理 在用 oligo (dT) 引物构建的 cDNA 文库中,偶而发生部分 cDNA 克隆缺失了与靶 mRNA 3' 末端互补的序列。这部分序列到底是在 cDN
试剂、试剂盒 ATP结合缓冲液变性溶液二硫苏糖醇EDTA乙醇激酶 连接酶缓冲液酚氯仿筛选缓冲液SDS醋酸钠TET4 噬菌体 DNA 连接酶T4 噬菌体多核苷酸激酶合成的寡核苷酸[a-32P]ATP非变性聚丙烯酰胺凝胶仪器、耗材 烤盘结晶皿平头镊子装有防水黑墨水注射器硝酸纤维素滤膜Sephadex G
连接反应的策略 可以采用几种策略来进行外源DNA片段和质粒载体的连接。对此,可依据外源DNA片段未的性质,以及质粒载体与外源DNA上限制酸切位点的性质来作出选择。(一)外源DNA片段未的性质带有各种未的外源DNA的克隆方法见下表:──────────────────────
核酸分子杂交技术由于核酸分子杂交的高度特异性及检测方法的灵敏性,它已成为分子生物学中最常用的基本技术,被广泛应用于基因克隆的筛选,酶切图谱的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突变的检测等。其基本原理是具有一定同源性的原条核酸单链在一定的条件下(适宜的温室度及离子强度等)可按碱基互补原成双链。杂交的
4. 免疫印迹检测外源蛋白的展示情况pDTSPLAY-B 空载体生成的噬菌体表面不含外源基因,仅有带有 6 个组氨酸标签和 Myc 标签的锚定蛋白(基因 Ⅲ 编码),此蛋白 SDS-PAGE 中的条带在 65 kDa 的位置(实际 Mr 为 45 kDa)。pDISPLAY-B 载体中插入外
实验方法原理 在用 oligo (dT) 引物构建的 cDNA 文库中,偶而发生部分 cDNA 克隆缺失了与靶 mRNA 3' 末端互补的序列。这部分序列到底是在 cDNA 合成过程中还是在分子克隆中怎样缺失和在哪个环节中缺失的尚不清楚。第一链 cDNA 的随机断裂,在合成第二链 c
实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3 COS-7 细胞 载体 pBluescriptⅡ
实验材料pAS38pAS45pAS47试剂、试剂盒聚乙二醇(PEG) 氯化钠溶液HEPES 缓冲液涂布溶液Tris 缓冲盐水TBS-Tween-20琼脂糖-磷酸溶液仪器、耗材LBSOCYT实验步骤3.1 实物库构建我们用 Kunkel 突变技术构建大多数的实物库虽然我们证明了 AB 链套
在用 oligo (dT) 引物构建的 cDNA 文库中,偶而发生部分 cDNA 克隆缺失了与靶 mRNA 3' 末端互补的序列。这部分序列到底是在 cDNA 合成过程中还是在分子克隆中怎样缺失和在哪个环节中缺失的尚不清楚。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理在用 o
在分子克隆中没有比分离缺乏相应的 mRNA 5' 末端的序列特征结构的 cDNA 克隆更易失败的了。通常存在于 cDNA 基因文库中的部分克隆,由于反转录酶未能沿全长 mRNA 模板延伸完全,合成的 cDNA 第一条链往往 5' 末端不完整。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂
可利用合成双链寡核苷酸筛选构建于λ噬菌体的 cDNA 表达文库,以鉴定与特异 DNA 结合蛋白质相对应的克隆(Singhetal.1988,Vinsonetal.1988)。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。试剂、试剂盒ATP结合缓冲液变性溶
M13 噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技术中的应用实验实验材料 羧苄青霉素氯霉素大肠杆菌 CJ236试剂、试剂盒 生理磷酸缓冲液超纯甘油PBS-T 缓冲液PBS-T-BSA 缓冲液仪器、耗材 2YT 培养基SOC 培养基实验步骤 下述方法描述了 P8 库的设计(见 12.3.1)、构建(见
本章描述了改进融合蛋白在 M13 噬菌体颗粒表面展示水平的一个方法。向 M13 衣壳锚定蛋白引入突变后,蛋白质展示水平约能增加两个数量级。本实验来源「现代蛋白质工程实验指南」〔德〕K.M.阿恩特、K.M.米勒编著。实验材料羧苄青霉素氯霉素大肠杆菌 CJ236试剂、试剂盒生理磷酸缓冲液超纯甘油PBS-