用制备凝胶电泳纯化寡核苷酸实验

试剂、试剂盒丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵NNN'N'-四甲基乙二胺合成的互补寡核苷酸仲丁醇(2-丁醇)二乙醚NaOAcMgCl2乙醇TBE甲酰胺加样缓冲液TE仪器、耗材SpeedVac 旋转浓缩仪实验步骤材料与设备丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵(10%;w/v)N,N,N',N'-四甲基乙二胺 (TEMED)合成的互补寡核苷酸(含待分离序列特异性 DNA 结合蛋白的识别序列)仲丁醇(2-丁醇)二乙醚NaOAc(3mol/L)MgCl2(1mol/L)乙醇(100% 和 75%;v/v)SpeedVac 旋转浓缩仪(SavantInstruments,Inc.)试剂TBE(10x)甲酰胺加样缓冲液TE(配方,见“试剂的配制”,P.131~138.)操作程序聚丙烯酰胺凝胶的制备1) 制备 20-cm×40-cm×1.5-mm 的凝胶,有 4 个宽 3 cm 的加样孔。对长度范围约为 10~45 碱基......阅读全文

大小排阻层析法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

            试剂、试剂盒 氯仿 EDTA 乙醇 酚:氯仿 乙酸钠 TE Tris-Cl Tris-SDS

大小排阻层析法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

放射性标记的寡核苷酸用于酶促反应如引物延伸反应时,需要完全除去未掺入的放射性标记物。本方案介绍的是利用大小排阻层析时寡核苷酸与单核苷酸移动速率差异,分离放射性标记的寡核苷酸与未掺入的放射性标记物的方法。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒氯仿EDTA乙醇酚:氯仿乙酸

大小排阻层析法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

试剂、试剂盒 氯仿EDTA乙醇酚:氯仿乙酸钠TETris-ClTris-SDS 层析缓冲液放射性标记的寡核苷酸纯化的原料仪器、耗材 凝胶过滤树脂破璃棉巴斯德吸管实验步骤 材料溶液和缓冲液稀释贮存液至适当浓度。氯仿任选,见步驟 7。EDTA(0.5mol/L,pH8.0)乙醇酚:氯仿任选,见步骤 7。

用大肠杆菌-Klenow-片段标记合成的寡核苷酸实验

            试剂、试剂盒 甲酰胺加样缓冲液 大肠杆菌 DNA 聚合酶 IKlenow 片段 变性聚丙烯酰胺凝胶 寡核苷酸引物 寡核苷酸模板 [α-32P]dNTP

用大肠杆菌-Klenow-片段标记合成的寡核苷酸实验

试剂、试剂盒 甲酰胺加样缓冲液大肠杆菌 DNA 聚合酶 IKlenow 片段变性聚丙烯酰胺凝胶寡核苷酸引物 寡核苷酸模板[α-32P]dNTP仪器、耗材 磷荧光粘贴标签水浴或模块实验步骤 材料溶液和缓冲液稀样贮存液至适当浓度。甲酰胺加样缓冲液10XKlenow 缓冲液酶与缓冲液大肠杆菌 DNA 聚合

用大肠杆菌-Klenow-片段标记合成的寡核苷酸实验

通常利用 T4 噬菌体多核苷酸激酶催化的磷酸化反应进行寡核苷酸的标记。但有时需要标记比活度更高的放射性标记的探针,最理想的情况下,磷酸化反应中每一个寡核苷酸分子上有一个 32P 原子掺人。而用大肠杆菌 DNA 聚合酶 IKlenow 片段合成与寡核苷酸互补的一条 DNA 链,可获得更高比活度的探针。

半制备规模单链RNA纯化(一)

Sean M. McCarthy and Martin GilarWaters Corporation, Milford, MA, U.S.引言寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98~99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中,杂质聚集在一起,即使是一

制备肌动蛋白实验——从肌肉制备丙酮粉用于纯化肌动蛋白

实验材料肌球蛋白试剂、试剂盒肌球蛋白抽提溶液仪器、耗材离心机实验步骤1. 抽提肌球蛋白时得到的沉淀物用 3 倍于沉淀物体积的肌球蛋白抽提溶液抽提 10 分钟。肌球蛋白抽提溶液:0.5 mol/L KCl0.1 mol/L K2HPO42. 抽提物离心(GSA 转头,13000 r/min,17310

聚合酶链反应构建重组DNA

实验材料 DNA试剂、试剂盒 TE无水乙醇DNA聚合酶CTP仪器、耗材 电泳仪离心机PCR仪实验步骤 1.  制备模板DNA,如DNA不是经氯化铯梯度纯化的,100℃煮沸10 min 以灭活核酸酶。 2.  制备寡核苷酸引物,若PCR产物要进行平端克隆,就应该对引物的5’端羟基进行磷酸化处理。 图一

细菌细胞的制备实验实验——70S核糖体的纯化

实验材料核糖体试剂、试剂盒致密偶联缓冲液仪器、耗材Beckman Vti50 转头实验步骤1. 采用 Beckman Vti50 转头和 7% 至 30% (w/v) 的线性蔗糖梯度沉降来纯化 70S 真细菌的核糖体。这一步可以确保大的蛋白质聚集物不会与 70S 核糖体一起沉淀下来。并可以产生致密偶

简并寡核苷酸诱变实验

实验材料 大肠杆菌试剂、试剂盒 DNA聚合酶dNTP甘油NaClEDTASDS无水乙醇仪器、耗材 水浴锅离心机分光光度计实验步骤 1.  设计寡核苷酸,其3‘端含有由8个核苷酸组成的回文结构,且包含某一限制性内切酶的识别位点;如果可能的话,5’端也应有一含某个限制性内切酶位点的序列。中间区段则应含目

简并寡核苷酸诱变实验

小段DNA序列中产生大量突变             实验材料 大肠杆菌 试剂、试剂盒

聚合酶链反应构建重组DNA

2016年09月12日 15:27   来源:上海江林生物科技有限公司>>进入该公司展台 实验材料DNA试剂、试剂盒TE无水乙醇DNA聚合酶CTP仪器、耗材电泳仪离心机PCR仪实验步骤1.  制备模板DNA,如DNA不是经氯化铯梯度纯化的,100℃煮沸10 min 以灭活核酸酶。 2.  制备寡核苷

生物素酰化探针的制备实验——随即寡核苷酸引物合成法

实验材料DNA试剂、试剂盒dNTP生物素klenow酶TEEDTALiCl乙醇仪器、耗材离心机培养箱实验步骤1.  在1. 5 ml 离心管中加入500 ng~2 μg 模板DNA,加水至总体积为34 μl。 2.  在沸水中变性DNA 5 min 置于冰浴5 min,稍加旋离。3.  按顺序加入下

简并寡核苷酸诱变实验

本方法的一个重要特点就是将单链的简并寡核苷酸转变成同源双链分子后直接克隆进常规载体。由于不同的寡核苷酸可通过其3’末端的回文结构杂交,因此,寡核苷酸实际上起互为引物的作用,在大肠杆菌DNA聚合酶I klenow片段作用下延伸。实验材料大肠杆菌试剂、试剂盒DNA聚合酶dNTP甘油NaClEDTASDS

关于寡核苷酸探针的制备的介绍

  进行分子突变需要大量的探针拷贝,后者一般是通过分子克隆(molecular cloning)获得的。克隆是指用无性繁殖方法获得同一个体、细胞或分子的大量复制品。当制备基因组DNA探针前,应先制备基因组文库,即把基因组DNA打断,或用限制性酶作不完全水解,得到许多大小不等的随机片段,将这些片段体外

用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端

            试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 仪器、耗材 特殊设备

半制备规模单链RNA纯化

引言寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98~99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中,杂质聚集在一起,即使是一般大小的21基体寡核苷酸的总产率也达到67~90%,较长链的寡核苷酸的产率相应较低。研究人员通常需要使用纯度高于初步合成混合物的材料。因此,

半制备规模单链RNA纯化

  寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98~99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中,杂质聚集在一起,即使是一般大小的21基体寡核苷酸的总产率也达到67~90%,较长链的寡核苷酸的产率相应较低。研究人员通常需要使用纯度高于初步合成混合物的材料。因此,

实验室六种常用纯化制备纯水的方法

实验室纯水的制备方法有多种,最常用的为离子交换、活性炭吸附、微孔过滤、超滤、反渗透、紫外线照射等六种。  1 .离子交换法   离子交换法是以圆球形树脂(离子交换树脂)过滤原水,水中的离子会与固定在树脂上的离子交换。常见的两种离子交换方法分别是硬水软化和去离子法。硬水软化主要是用在反渗透

线粒体分离实验—用蔗糖密度梯度法纯化线粒体

实验材料线粒体悬液试剂、试剂盒蔗糖溶液Tris-HClEDTA仪器、耗材Bockman SW28 号转头实验步骤1. 在用于 Bockman SW28 号转头(或与其等同的产品)的 Uitradear 离心管中,小心地在 15 ml 1.5 mol/L 的蔗糖溶液上加一层 15 ml 1.5 mol

质粒DNA的制备和纯化

实验概要质粒(plasmid)是一种染色体外的稳定遗传因子,大小从1~200kb不等,为双链、闭环的DNA分子,并以超螺旋状态存在于宿主细胞中。质粒主要发现于细菌、放线菌和真菌细胞中,它具有自主复制和转录能力,能在子代细胞中保持恒定的拷贝数,并表达所携带的遗传信息。质粒在细胞内的复制一般有两种类型:

溶菌酶的制备、纯化和鉴定

实验概要制备、纯化和鉴定溶菌酶实验原理溶菌酶,全称为1,4-β-N-溶菌酶,又称粘肽N-乙酰基胞壁酰水解酶,属于α-乳白蛋白家族。人们对溶菌酶的研究始于上世纪初,英国细菌学家Fleming发现人的唾液、眼泪中存在有溶解细菌细胞壁的酶,因其具有溶菌作用,故命名为溶菌酶;此后人们在微生物、植物、无脊椎动

常用纯化制备纯水的方法

  实验室纯水的制备方法有多种,最常用的为离子交换、活性炭吸附、微孔过滤、超滤、反渗透、紫外线照射等六种。  1 .离子交换法  离子交换法是以圆球形树脂(离子交换树脂)过滤原水,水中的离子会与固定在树脂上的离子交换。常见的两种离子交换方法分别是硬水软化和去离子法。硬水软化主要是用在反渗透(RO)处

用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端(二)

第 3 阶段:RNA 寡核苷酸的制备选择离 T7 或 T3RNA 聚合酶作用位点下游约 lOObp 处可以线性化的质粒 [见图 25-3(b)]。因为来自多克隆位点回文序列的引物用于 PCR 效果不好,因此比较理想的是用在多克隆位点克隆进某个插入片段的质粒。一个已经验证过的质粒是 pBS-S

DNA片段的亚克隆实验——基本方案

所谓亚克隆就是对已经获得的目的DNA片段进行重新克隆,其目的在于对目的DNA进行进一步分析,或者进行重组改造等。亚克隆的基本过程包括:(1)目的DNA片段和载体的制备;(2)目的DNA片段和载体的连接;(3)连接产物的转化;(4)重组子筛选。实验材料DNA试剂、试剂盒CIPdNTPDNA聚合酶T4聚

DNA片段的亚克隆实验

实验材料 DNA试剂、试剂盒 CIPdNTPDNA聚合酶T4聚合酶DTTATP仪器、耗材 水浴锅电泳仪培养箱实验步骤 1.  在20 μl 反应体积内用合适的酶完全消化DNA。75℃加热15 min,灭活酶。如若无需进一步的酶促处理,接歩骤6。2.  如果5’磷酸需要去除,加入2 μl 10×CIP

DNA片段的亚克隆实验

基本方案 凝胶块中DNA连接             实验材料 DNA 试剂、试剂盒

蛋白质纯化所需的生物提取物制备的实验

实验步骤 一、化学法和酶法细胞裂解 微量的细胞裂解经常通过化学法或酶法或二者共同采用来完成。例如, 超声和弗式细胞压碎器 (Frenchpress 均质机) 都不便于用在收集小于或等于 5 mL 的培养液的情况,而且应用这些

蛋白质纯化所需的生物提取物制备的实验

实验步骤一、化学法和酶法细胞裂解微量的细胞裂解经常通过化学法或酶法或二者共同采用来完成。例如, 超声和弗式细胞压碎器 (Frenchpress 均质机) 都不便于用在收集小于或等于 5 mL 的培养液的情况,而且应用这些机械的方法经常会遇到过度的产热和样品被氧化等问题。微量细胞裂解的简化方面的重大进