核酸序列分析实验

实验方法原理针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和功能位点的位置,以及标记已知的序列模式等过程。在此过程中,确认一段 DNA 序列是一个基因需要有多个证据的支持。一般而言,在重复片段频繁出现的区域里,基因编码区和调控区不太可能出现;如果某段 DNA 片段的假想产物与某个已知的蛋白质或其它基因的产物具有较高序列相似性的话,那么这个 DNA 片段就非常可能属于外显子片段;在一段 DNA 序列上出现统计上的规律性,即所谓的“密码子偏好性”,也是说明这段 DNA 是蛋白质编码区的有力证据;其它的证据包括与“模板”序列的模式相匹配、简单序列模式如 TATA Box 等相匹配等。一般而言,确定基因的位置和结构需要多个方法综合运用,而且需要遵循一定的规则:对于真核生物序列,在进行预测之前先要进行重复序列分析,把重复序列标记出来并除去;选用预测程序时要注意程序的物种特异性;要弄清程序适用的是基因组序列还是 cDN......阅读全文

DNA-序列分析技术

            实验方法原理 本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDeoy TM Terminator

依赖核酸序列的扩增技术的定义和原理

1.概述:依赖核酸序列的扩增(Nucleic acid sequence-based amplification,NASBA),又称自主序列复制系统(self- sustainedsequence replication,3SR)或再生长序列复制技术。1990年Guatelli等首先报道了这一技术.

核酸免疫实验

基 本 方 案 1 小 鼠 注 射 接 种DNA在免疫前应先阅读动物处理(附 录 2C) 和 接 种 的(附 录 2E) 指导说明。在正式实验之前需先进行肌肉和皮下注射练习; D N A 的精准注射对于免疫成功起关键作用。可以 用 India ink (或相同的染料)来定位注射的部位是否正确。材料2

核酸染色实验

实验方法原理 在一般情况下,通过盐酸水解后使 DNA 残基分解碱基,然后从碳键处打断糖苷键而游离出醛基,再与无色复红液(Schiff)进行反应,形成紫红色的复合物(DNA)。常用 Feuhgen-Rossenbeck 染色法(孚尔根染色法)。实验材料 石蜡组织切片试剂、试剂盒 Schiff 试剂染色

核酸电泳实验

琼脂糖凝胶电泳是分离鉴定和纯化DNA片段的标准方法。该技术操作简便快速,可以分辨用其它方法(如密度梯度离心法)所无法分离的DNA片段。当用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙啶EB(德元国际Cat# LY5009)染色,在紫外光下至少可以检出1-10ng的DNA条带,从而可以确定DNA片段在凝胶中的位置。此外

核酸免疫实验

介绍了用表达抗原的 DNA 增强免疫应答的途径。介绍了核酸免疫的两种方法:①注射含有 DNA 表达载体的生理盐水;② 用 基 因 枪 注 射 DNA。还包括了基因枪方法中使用的 DNA 包被金珠的制备和保存方法。实验步骤基 本 方 案 1 小 鼠 注 射 接 种DNA在免疫前应先阅读动物处理(附 录

DNA序列分析技术1

物种的遗传多样性在本质上是DNA 一级序列的多样性。近年来,随着DNA 测序技术的迅速发展和日益普及,DNA 测序在遗传多样性的研究中正在起着越来越大的作用。本章将介绍目前在遗传多样性研究中常用的一种手动和一种全自动双链DNA 测序方法。1.DNA 模板的制备在遗传多样性的研究中,由于样本量一般都较

DNA序列分析技术2

3)电泳电极缓冲液 1 倍TBE(pH 值8.0)预电泳 30 分钟至1 小时恒温方式 测序胶板上夹盖铝恒温板电泳温度 50℃左右电泳条件 恒功率 90~110W电泳时间 2.5 小时至5 小时4)干胶制备和压片电泳结束后取下胶板,用工具撬开玻璃板,使胶留在其中一块板上。将裁剪好的新华3 号滤纸在胶

随机序列库的纯化实验

实验方法原理实验材料DNA 库试剂、试剂盒氢氧化铵正丁醇TE 缓冲液尿素上样缓冲液NaCl乙醇仪器、耗材荧光薄层层析板(VWR)紫外灯剃刀刀片小孔注射器能耐受极端温度的 13 ml 离心管(Sarstedt)90℃水浴旋转混合器实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 寡核苷酸

随机序列库的纯化实验

            实验方法原理 实验材料 DNA 库 试剂、试剂盒 氢氧化铵

随机序列库的纯化实验

实验方法原理 实验材料 DNA 库试剂、试剂盒 氢氧化铵正丁醇TE 缓冲液 尿素上样缓冲液NaCl 乙醇仪器、耗材 荧光薄层层析板(VWR)紫外灯剃刀刀片小孔注射器能耐受极端温度的 13 ml 离心管(Sarstedt) 90℃水浴旋转混合器实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他

氨基酸序列测定实验

基本方案 测定通过 SDS-PAGE 转移到 PVDF 膜上样品的氨基酸序列 辅助方案 准备SDS-PAGE蛋白质样品             实验方法原理

氨基酸序列测定实验

实验方法原理 实验材料 分离胶和积层胶溶液还原型谷胱甘肽干粉试剂、试剂盒 4 × 凝胶缓冲液10 × 下槽缓冲液10 × 上槽缓冲液甲醇转移缓冲液0.1%(V/V)考马斯亮蓝的 50%甲醇溶液10%(V/V)乙酸的 50%甲醇溶液仪器、耗材 微量注射器或凝胶加样吸头PVDF 膜小型电转装置自动蛋白质

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验

方案1 两相柱测序仪的样品上样实验实验材料样品溶液试剂、试剂盒甲醇(HPLC级)三氟乙酸(TFA)仪器、耗材双向测序柱(Agilent)氮气供应设备聚丙烯试管样品加样器上样漏斗实验步骤一、浸润层析柱1.将准备好的两相柱的亲水段(凸向接头)移开,放在一边。2.将柱的疏水段(凹向接头)和上样漏斗装配在一

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验

方案1 两相柱测序仪的样品上样实验 方案2 将蛋白质从凝胶电转移至 PVDF 膜实验 方案3 检测 PVDF 膜上的蛋白质实验 方案4 浓缩聚丙烯酰胺凝胶上的蛋白质点实验 方案5 磷酸化多肽的固相微量测序实验 方案6 羧基端序列分

无心畸胎序列征病例分析

 女,30岁,孕2产0,妊娠14周初次来我院检查。患者既往体健,无特殊病史,无药物过敏史,家族无遗传疾病史及双胎史,孕期无特殊接触史,既往月经规律,1年前曾因早孕胚胎停止发育人工流产1次。 此次超声显示:宫腔内可见2个胎儿回声,位于1个羊膜囊内。正常胎儿:双顶径28mm,股骨长15mm,胎心搏动规律

功能基因cDNA序列的分析

(一) cDNA序列的测定一.原理DNA 序列测定技术,目前主要是根据Sanger 等提出的酶法和Maxam和Gilber 提出的化学降解法,这两种方法的原理大致相同。这里主要介绍Sanger 的酶法——双脱氧链终止法。双脱氧链终止法是Sanger 等人于1977 年建立起来的。它是利用了2'

核酸染色实验——DNA

核酸是细胞内的一种大分子化合物,核酸不仅存在于细胞核内,也存在于细胞质中,动物、植物和微生物等都含有核酸。核酸可分为核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)。经过染料和化学试剂,能够清楚地显示 DNA 和核仁组成区嗜银蛋白(AgNOR)物质。实验方法原理在一般情况下,通过盐酸水解后使 DNA 残基

电泳分离的蛋白质肽谱和序列分析实验

方案1 蛋白质的过甲酸氧化实验 方案2 蛋白质还原和S-羧甲基化:大规模方法 方案3 蛋白质还原和S-羧甲基化:微量方法 方案4 用Ellman 试剂测定自由巯基和二硫键实验 方案5 蛋白质的胰酶消化实验 方案6 用溴化氰切割 M

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验4

方案4 浓缩聚丙烯酰胺凝胶上的蛋白质点实验实验材料包含目的蛋白的二维电泳凝胶点试剂、试剂盒丙烯酰胺混合物(30%)琼脂糖 50g L考马斯亮蓝染色液脱色液平衡缓冲液10 X 聚丙烯酰胺电泳缓冲液浓缩胶仪器、耗材巴氏滴管聚丙烯管Protean II xi 2-D 电泳槽(Bio-Rad)注射器试管管式

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验3

方案3 检测 PVDF 膜上的蛋白质实验实验材料含目的蛋白的 PVDF 膜试剂、试剂盒考马斯亮蓝染色液脱色液仪器、耗材塑料容器实验步骤1.依方案2 电转移后,将 PVDF膜迅速放于塑料容器中,并加人考马斯亮蓝染色液浸没膜。室温下染 5〜10 min 。2.弃去染色液,加人脱色液浸没膜,在 PVDF

电泳分离的蛋白质肽谱和序列分析实验

实验材料 冻干的纯化蛋白样品试剂、试剂盒 甲酸氢溴酸过氧化氢NaOH 固体仪器、耗材 旋转蒸发器小试管实验步骤 1.加入 100ul 过氧化氢到 900ul 甲酸中,在室温下放置让,将反应产生过甲酸 (HCOOOH)。2.在冰上冷冻过甲酸至 0°C。3.在预冷的小试管中,将蛋白质溶解于 50ul 过

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验2

方案2 将蛋白质从凝胶电转移至 PVDF 膜实验实验材料含目的蛋白样品的聚丙烯酰胺凝胶( 未染色)试剂、试剂盒CAPS甲醇转移缓冲液仪器、耗材电印迹设备塑料容器聚偏二氟乙烯(PVDF)膜实验步骤要点:为了避免凝胶或膜的蛋白质污染,进行以下操作时需戴手套。1.凝胶电泳之后,立即将凝胶转移到一个塑料容器

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验5

方案5 磷酸化多肽的固相微量测序实验实验材料放射性标记的多肽试剂、试剂盒碳二亚胺试剂偶联缓冲液甲醇-水多肽溶剂S3 (氯丁烷 正丁醇)闪烁液仪器、耗材ATZ-收集器加热块小滴管Mylar 聚酯薄膜蛋白质测序仪闪烁计数器Sequelon-AA 试剂盒测试管实验步骤1.将放射性标记的肽段在小试管中溶解于

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验6

方案6 羧基端序列分析实验实验材料利用一维或二维聚丙烯酰胺凝胶分离的蛋白质或溶液中的蛋白质试剂、试剂盒乙酸酐 二甲基吡啶烷基化乙内硫酰脲 (ATH) 氨基酸标准品溴甲基萘的乙腈溶液考马斯亮蓝(R250)二异丙基乙胺(DIEA)的庚烷溶液乙酸乙酯甲醇N-甲基咪唑的乙腈溶液异氰酸苯酯的乙腈溶液哌嗪硫氰酸

蛋白质内序列分析用肽段的分离与纯化实验

            试剂、试剂盒 考马斯亮蓝 G 乙酸 甲醇 Achromobacter 胰蛋白酶 I 三氟乙酸 乙腈 2-丙醇

蛋白质内序列分析用肽段的分离与纯化实验

分子生物学中最重要的环节之一是对微量蛋白质进行分析,使对编码待研究蛋白的 cDNA 序列的克隆成为可能。为有效地做到这一点,通常需要知道蛋白质的内序列。在这一方面,肽段的有效分离是极重要的。本实验来源于蛋白质纯化与鉴定实验指南,作者:朱厚础。试剂、试剂盒考马斯亮蓝 G乙酸甲醇Achromobacte

蛋白质内序列分析用肽段的分离与纯化实验

试剂、试剂盒 考马斯亮蓝 G乙酸甲醇Achromobacter 胰蛋白酶 I 三氟乙酸乙腈2-丙醇仪器、耗材 SpeedVac 型旋转浓缩器Tween-20UltrafreeTM MC 滤器C18 反相 HPLC 柱实验步骤 材料与设备考马斯亮蓝 G(0.05% 的乙酸-20% 甲醇溶液)乙酸 (5

PK120-的纯化及肽段氨基酸序列分析实验

实验材料PK-120试剂、试剂盒Q-Sepharose 树脂S-Sepharose 树脂Hudroxyapatite 羟基磷灰石Sephacryl S-200 凝胶赖氨酸内切酶乙腈三氯醋酸仪器、耗材Applied Biosystems model 477A 气相蛋白质测定仪Applied Biosy

PK120-的纯化及肽段氨基酸序列分析实验

实验方法原理 实验材料 PK-120试剂、试剂盒 Q-Sepharose 树脂S-Sepharose 树脂Hudroxyapatite 羟基磷灰石Sephacryl S-200 凝胶赖氨酸内切酶乙腈三氯醋酸仪器、耗材 Applied Biosystems model 477A 气相蛋白质测定仪A