构建硫氧还蛋白肽适配体组合库实验
实验材料E.coli MC 1061 (Bio-Rad)硫氧还蛋白表达载体质粒DNA 洗脱液试剂、试剂盒DNA 聚合酶DNA 连接酶小牛肠碱性磷酸酶(CIP)限制性内切核酸酶反应缓冲液4dNTPTris·Cl培养基仪器、耗材QIAquick 胶回收试剂盒质粒制备试剂盒DNA 合成仪16℃ 和 95℃ 水浴PCR 纯化柱电转仪实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 用自动 DNA 合成仪合成如下的 91-碱基的随机寡核苷酸和 17-碱基的引物。分别用水溶解使其终浓度为 1 ug/ul。寡核苷酸 : 5'-GACTGACTGGTCCG (NNK)20GGTCCTCAGTCAGTCA-3'。此处 N 代表 A,G,C 或 T; K 代表 G 或 C。引物:5'-CTGACTGACTGAGGACC-3'。2. 按顺序加入下列试剂到一 1.5 ml 离心管中(终体积 890 ul):......阅读全文
构建硫氧还蛋白肽适配体组合库实验
实验方法原理 实验材料 E.coli MC 1061 (Bio-Rad)硫氧还蛋白表达载体质粒DNA 洗脱液试剂、试剂盒 DNA 聚合酶DNA 连接酶小牛肠碱性磷酸酶(CIP)限制性内切核酸酶反应缓冲液 4dNTPTris·Cl培养基仪器、耗材 QIAquick 胶回收试剂盒质粒制备试剂盒DNA 合
构建硫氧还蛋白肽适配体组合库实验
实验材料E.coli MC 1061 (Bio-Rad)硫氧还蛋白表达载体质粒DNA 洗脱液试剂、试剂盒DNA 聚合酶DNA 连接酶小牛肠碱性磷酸酶(CIP)限制性内切核酸酶反应缓冲液4dNTPTris·Cl培养基仪器、耗材QIAquick 胶回收试剂盒质粒制备试剂盒DNA 合成仪16℃ 和 95℃
用肽适配体正向分析细胞过程实验2
辅助方案 肽适配体靶点的鉴定实验方法原理通过配对相互作用或捕获法鉴定的肽适配体的假定靶点应当通过遗传学测试进行验证,例如:1. 用免疫沉淀法确定体内适配体的相互作用;2. 通过上位(显)性分析以确定适配体在与靶蛋白相同的区域发挥功能;3. 比较由靶蛋白删除或过表达引起的表型与由适配体造成的表型。实验
肽适配体的亲和力成熟实验
实验材料质粒 DNA酵母株试剂、试剂盒Taq 聚合酶10×缓冲液引物dATPdGTPdCTPdTTPMgCl2MnCl2完全极限(CM) 缺失成分培养基和平板Xgal 平板仪器、耗材PCR 管PCR 纯化柱自动热循环器30℃ 培养箱实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 制备
用肽适配体正向分析细胞过程实验
实验方法原理 实验材料 用于遗传学筛选的酵母株肽适配体库试剂、试剂盒 完全极限(CM) 缺失成分液体培养基和平板仪器、耗材 30℃ 培养箱实验步骤 1. 用高效乙酸锂转化法将 50~100 ug 肽适配体库(在 pJM-2 或 pJM-3 中)转化酵母筛选株(106~107 转化株)。将转化株涂布到
肽适配体的亲和力成熟实验
实验方法原理 实验材料 质粒 DNA酵母株试剂、试剂盒 Taq 聚合酶10×缓冲液引物 dATPdGTP dCTPdTTPMgCl2 MnCl2完全极限(CM) 缺失成分培养基和平板Xgal 平板仪器、耗材 PCR 管PCR 纯化柱自动热循环器 30℃ 培养箱实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「
利用双杂交系统相互作用阱/筛选特定蛋白的肽适配体...
利用双杂交系统相互作用阱/筛选特定蛋白的肽适配体实验实验方法原理 实验材料 DNA酵母株试剂、试剂盒 PCR 引物聚乙二醇甘油存储液Tris·ClX-gal 平板完全极限(CM) 缺失成分培养基和平板仪器、耗材 30℃ 和 42℃ 培养箱或水浴实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其
用肽适配体正向分析细胞过程实验1
实验材料用于遗传学筛选的酵母株肽适配体库试剂、试剂盒完全极限(CM) 缺失成分液体培养基和平板仪器、耗材30℃ 培养箱实验步骤1. 用高效乙酸锂转化法将 50~100 ug 肽适配体库(在 pJM-2 或 pJM-3 中)转化酵母筛选株(106~107 转化株)。将转化株涂布到 10 cm Glu/
【卡梅德生物】噬菌体展示肽库构建与筛选
噬菌体是一种感染细菌的病毒,具有能够在其表面展示外源肽或蛋白质的能力。通过基因工程方法,研究人员可以将外源DNA序列插入到噬菌体外壳蛋白的编码区,使得外源肽与外壳蛋白共同表达,形成展示在噬菌体表面的融合蛋白。噬菌体展示技术是一种重要的生物技术,它可以用于发现新的药物靶点、疫苗设计以及研究蛋白质-蛋白
合成肽疫苗的构建
合成肽疫苗能克服常规疫苗的缺点,很早就被认为是动物传染病预防用的终极疫苗。然而多年的研究结果表明,合成肽疫苗免疫动物后所起的免疫保护作用并没有象人们当初设想的那样理想,同时证明了构建的合成肽疫苗的抗原性及其免疫原性要受到其自身组成及宿主免疫系统等多种因素的影响。 在诱导机体产生免疫的过程中,单
两企业联手构建靶向疗法组合
今日,Verastem Oncology公司宣布,与日本Chugai Pharmaceutical公司达成一项全球独家许可协议,Verastem获得Chugai开发的RAF/MEK抑制剂CH5126766(CKI27)的全球开发和推广权益。目前,CH5126766正被开发治疗携带KRAS突变的实
利用双杂交系统相互作用阱/筛选特定蛋白肽适配体实验
实验材料DNA酵母株试剂、试剂盒PCR 引物聚乙二醇甘油存储液Tris·ClX-gal 平板完全极限(CM) 缺失成分培养基和平板仪器、耗材30℃ 和 42℃ 培养箱或水浴实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 使用标准的亚克隆技术,将编码诱饵蛋白的 DNA 插入 PEG20
关于合成肽疫苗的构建介绍
合成肽疫苗能克服常规疫苗的缺点,很早就被认为是动物传染病预防用的终极疫苗。然而多年的研究结果表明,合成肽疫苗免疫动物后所起的免疫保护作用并没有象人们当初设想的那样理想,同时证明了构建的合成肽疫苗的抗原性及其免疫原性要受到其自身组成及宿主免疫系统等多种因素的影响。 在诱导机体产生免疫的过程中,单
肽库合成技术及文库介绍
肽库是用于从大批量多肽中筛选极少量具关键生物活性的多肽的一种方法,在生物学和化学研究中,肽库是一种强大的筛选工具,在蛋白质组学及其相关领域应用范围非常广泛,如药物研发、蛋白-蛋白相互作用、抗原表位筛选、GPCR配体筛选、蛋白功能分析、酶底物或抑制剂筛选、信使分子研发及多肽/蛋白信号对答等。1. 截头
pⅧ噬菌粒库的构建
实验概要本实验构建了pⅧ噬菌粒库,主要包括:载体的准备,插入片段的准备,连接插入片段与BstⅪ消化的p8V5载体及扩增与储存。主要试剂p8V5噬菌粒载体(AHymaxlnc)LB氨苄青霉素培养基(1%蛋白胨,0,5%酵母提取物, 0.5% NaCl,100ug/m1氨苄青霉素)BstⅪ限制性内切酶(
合成肽疫苗的构建及分子组成
发展史 早在18世纪末期,英国人Edward Jenner首先用牛痘材料接种儿童来预防天花,获得成功,这就是人类历史上第一个生物制品———牛痘疫苗的问世。从此,人们开始运用疫苗来预防或治疗许多种疾病。传统疫苗是将病原微生物通过物理的或化学的方法灭活或将其毒力减弱,以及天然的弱毒微生物而制备成的
合成肽疫苗的发展史及构建
发展史 早在18世纪末期,英国人Edward Jenner首先用牛痘材料接种儿童来预防天花,获得成功,这就是人类历史上第一个生物制品———牛痘疫苗的问世。从此,人们开始运用疫苗来预防或治疗许多种疾病。传统疫苗是将病原微生物通过物理的或化学的方法灭活或将其毒力减弱,以及天然的弱毒微生物而制备成的
配体与活化介质的偶联实验
试剂、试剂盒磷酸盐缓冲液Affi-Gel 10磷酸钠(50 mmul L)乙醇胺实验步骤材料磷酸盐缓冲液(50 mmol/L;PH7.5~8,0)Affi-Gel 10(Bio-Rad Laboratories)磷酸钠(50 mmul/L),含 NaCl(1mol/L)(PBS)乙醇胺(100 mm
配体与活化介质的偶联实验
配体与活化介质的偶联实验 试剂、试剂盒 磷酸盐缓冲液 Affi-Gel 10 磷
配体与活化介质的偶联实验
试剂、试剂盒 磷酸盐缓冲液Affi-Gel 10 磷酸钠(50 mmul L)乙醇胺实验步骤 材料磷酸盐缓冲液(50 mmol/L;PH7.5~8,0)Affi-Gel 10(Bio-Rad Laboratories)磷酸钠(50 mmul/L),含 NaCl(1mol/L)(PBS)乙醇胺(100
运用肽库筛选磷酸化激酶motif方法
Screening Kinase Phosphorylation Motifs Using Peptide LibrariesIsaac A. Manke and Michael B. YaffeCenter for Cancer Research, Massachusetts Institute
基于适配体构建百草枯残留检测免疫新方法
近日,贵州大学Liu等人成功地制备了一种灵敏度高、选择性好、稳定性好的百草枯层析试纸条(CS)。与以前报道的基于免疫分析的层析纸条不同,该研究使用了聚二烯丙基二甲基氯化铵(PDDA)作为T线上的强大捕获分子,可以使制备的CS在储存过程中具有很高的稳定性。同时,使用百草枯PQ-15适配体,它是一种用于
肽质量检索实验
基本方案 其他方案 实验方法原理 实验材料 蛋白样品
肽质量检索实验
实验方法原理 实验材料 蛋白样品仪器、耗材 质谱仪实验步骤 鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念:(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的,通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被
配体配体相互作用特点
中文名称配体-配体相互作用英文名称ligand-ligand interaction定 义泛指不同配体之间的相互作用。如受体上有多个配体结合位点时,一个配体与受体的结合可能影响另一个配体与受体的结合。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)
科学家构建出中国种子性状数据库
植物性状是表征环境适应策略与资源分配模式的关键指标,为理解物种分布、群落构建及生态系统功能提供了重要基础。近年来,全球及区域尺度的植物性状数据库不断完善,推动了宏观生态学、功能生态学及生物多样性保护等领域的发展。然而,现有数据库主要聚焦于叶片等生长器官,种子、果实等繁殖器官的记录相对不足,形成显著的
科学家构建首个油菜基因转录数据库
近日,中国农业科学院油料作物研究所油料作物基因组学与抗病性改良创新团队破译了油菜基因组的全转录信息密码,构建了油菜十万余个基因的转录全景图,使得油菜基因功能研究第一次有了标准的可参考的基因转录数据库,将有力支撑油菜功能基因的相关研究。该项研究成果在线发表在《植物学报(The Plant Jour
Nature:用二维码构建“DNA编码库”
麻省沃尔瑟姆市(Waltham, Massachusetts)的一座钢筋混泥土建筑的二楼,一个实验室冰箱里的塑料盒中,包含着无数种化学分子。这些分子是葛兰素史克制药公司(GlaxoSmithKline,GSK)合成的带DNA标签的分子,数目达到万亿种——这是银河系恒星数目的10倍。 各大制药公
研究构建综合性的新生RNA数据库
动态解析基因组转录调控是解读细胞命运和疾病发生机制的关键。然而,传统RNA测序技术受限于高丰度稳态RNA,难以捕捉转录活动的即时变化。近年来,新生RNA测序技术成为实时监测转录动态的关键工具。相较于传统RNA测序技术,新生RNA测序技术可从新生RNA即时表达情况、转录暂停情况及非编码转录调控元件的活
OpenSPR分子互作助力口服型肺炎纳米靶向药物研究(二)
实验设计针对通过随机肽库筛选得到的12肽段(ADGVGDAESRTR),先用Nicoya 公司的OpenSPR 独有的LSPR技术测定了CP与壳聚糖的结合亲和力;以混和肽作为阴性对照(S1),快速动力学参数分析发现CP是壳聚糖很强的特异配体,结合常数为5.27×10-8M(KD)(Figure1