两篇Nature子刊：测序为寄生虫病研究提速
今日，两个多国研究团队分别对几种疟原虫基因组进行了测序，得到了其基因组组成的清晰图谱，研究指出了根除这一寄生虫疾病面临的新挑战，也为疟疾药物和疫苗研发提供了初步的路线图。 间日疟原虫Plasmodium vivax (P. vivax)是除非洲以外最广为传播的引发人类疟疾的寄生虫，而食蟹猴疟原虫Plasmodium cynomolgi (P. cynomolgi)是P. vivax近亲，它感染亚洲的旧大陆猴。研究人员分别对这两种疟原虫进行了基因组分析，文章均发表在这两项研究均发表在Nature Genetics杂志上。 “坏消息是间日疟原虫P. vivax基因组中存在的突变比我们预想的要多得多，这使其更容易规避我们使用的药物和疫苗武器，”两篇文章共同的资深作者，纽约大学基因组和系统生物学的Jane Carlton教授说。“不过，现在我们也对自己所面临的风险更加了解，可以更深入分析间日疟原......阅读全文
PNAS：基因组测序的惊人发现
科学家们发现，水母（平凡的海洋生物）经过漫长的进化变成了生活在其它动物体内的奇特寄生虫。这项研究发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 Myxozoa是感染无脊椎动物和脊椎动物宿主的微小寄生虫，由少数几个细胞组成。美国堪萨斯大学的研究人员对这种生物进行了基因组测序，发现它们实际上是高度
盘点基因组测序的最新成果
近日，the scientist杂志发表文章盘点了最近发布的几项基因组测序成果，一起来看看吧。 昏睡病传播者 种属：采采蝇(Glossina morsitans morsitans) 基因组：360 million bp 国际舌蝇基因组计划(International G
GenomeBiology发布基因组测序重要成果
Genome Biology杂志发布了远东豹（Far Eastern Amur leopard）的首个全基因组序列，为人们揭示了肉食对基因多样性和种群规模的影响。“我们将远东豹基因组与其它哺乳动物基因组进行比较，发现肉食似乎是很强的选择压力。这种现象在杂食动物和食草动物中并不明显。举例来说，牛吃肉对
Nature发布基因组测序惊人发现
来自冲绳科学技术研究院大学(OIST)的一支研究团队与合作者们，完成了对两个称作为柱头虫(acorn worm)的小水生生物物种的测序，显示相比于许多其他动物，我们与柱头虫共享了更多的基因，确立了它们是我们的远亲。研究结果发布在《自然》（Nature）杂志上。 研究发现，所有后口动物（deut
全基因组测序各步骤工具
全基因组测序（WGS）是下一代测序技术，用于快速，低成本地确定生物体的完整基因组序列。基因组的深度测序对于临床研究的意义重大，解读WGS数据并了解基因组突变在健康和疾病中的重要性是精准医疗的基石。WGS分析流程能分为三大块，数据处理、检测变异和综合分析，具体如下图所示：由于WGS现在已经非常成熟了，
宿主对抗寄生虫不惜“杀敌一千自损八百”
疟疾是世界上最致命的疾病之一，仅2020年全球就有62.7万人死于疟疾。在严重的情况下，患者会出现危险的低血糖水平。这种并发症在儿童中尤其危险，如果不及时治疗可能会致命，但它为什么会发生一直是一个长期的谜。现在，在周五(7月15日)发表在《Cell Metabolism》杂志上的一项研究中，研究人员
Nature：寻找疟原虫耐药基因
对疟原虫(malaria parasites)进行的全基因组测序研究(Whole-genome sequencing)发现了与疟原虫对青蒿素类抗疟药(artemisinin-based drug)耐药机制有关的基因组位点。这一发现有助于科学家们发现疟原虫的耐药机制，以及这种耐药机制的传播
美科学家开发疟疾疫苗：接种弱化活疟原虫
2016年4月,中国报告了最后一例本地原发疟疾病例，5年多之后，世界卫生组织（WHO）宣布中国通过消除疟疾认证。然而，在全球范围内，疟疾负担依然严重，尤其在非洲这片重灾区，每年全球疟疾病例的90%以上均在非洲。 美国国家过敏和传染病研究所疟疾免疫和疫苗学实验室主任Patrick Duffy教授
新技术加速新药发现
对分子目标的高通量筛选虽早已成为生物制药产业早期药物发现的首选模式，但近年来才被用于抗寄生虫病新药的筛选。随着越来越多的寄生虫基因序列的破译，研究人员使用高通量筛选和化合物库的机会增多，预计这一方法将更显其重要性。 典型的高通量筛选方法可在成百上千大量化合物的筛查中确定分子目标，尤其是在以寄生
Cell｜代谢重编程——疟原虫肝脏阶段快速生长的关键
疟疾是一种由寄生虫通过受感染的雌性按蚊叮咬传至人类并威胁生命的疾病。共有5种寄生虫会导致人类疟疾，其中恶性疟原虫和间日疟原虫危害最大。多年以来，疟疾的研究重点主要放在致病的红细胞内期，但是恶性疟原虫能够对青蒿素在内的所有针对红细胞内期阶段的药物迅速产生耐药性，因此亟需新药【1】。针对红细胞外期阶
寻找疟原虫耐药基因
对疟原虫(malaria parasites)进行的全基因组测序研究(Whole-genome sequencing)发现了与疟原虫对青蒿素类抗疟药(artemisinin-based drug)耐药机制有关的基因组位点。这一发现有助于科学家们发现疟原虫的耐药机制，以及这种耐药机制的传播
破解疟疾传播路径之谜
疟疾是世界上最致命的传染病之一。尽管人们作出了巨大的控制和努力，全球仍有近一半的人口生活在有感染疟疾风险的地区。据世界卫生组织最新估计，疟疾每年导致近2.5亿人感染，60多万人死亡。鲜为人知的是，除了对现代人类造成巨大影响之外，疟疾还强烈地影响了人类的进化史。马克斯·普朗克—哈佛研究中心（MPI-E
破解疟疾传播路径之谜
疟疾是世界上最致命的传染病之一。尽管人们作出了巨大的控制和努力，全球仍有近一半的人口生活在有感染疟疾风险的地区。据世界卫生组织最新估计，疟疾每年导致近2.5亿人感染，60多万人死亡。 鲜为人知的是，除了对现代人类造成巨大影响之外，疟疾还强烈地影响了人类的进化史。 马克斯·普朗克—哈佛研究中心
破解疟疾传播路径之谜
疟疾是世界上最致命的传染病之一。尽管人们作出了巨大的控制和努力，全球仍有近一半的人口生活在有感染疟疾风险的地区。据世界卫生组织最新估计，疟疾每年导致近2.5亿人感染，60多万人死亡。鲜为人知的是，除了对现代人类造成巨大影响之外，疟疾还强烈地影响了人类的进化史。马克斯·普朗克—哈佛研究中心（MPI-E
帮助某些蚊虫散播疟疾的基因
两项比较蚊虫基因组的研究开始为一个百年之谜提供了答案：为什么只有某些吸血的按蚊属会传播人类的疟疾。按蚊有400多种，但只有大约60种会传播在人类中引起疟疾的寄生虫。因为科学家们在1个多世纪之前就发现了这一选择性能力，因此其生物学基础受到人们积极的探索。为了调查其背后的基因组学，一个由Daniel
Science：必需基因已被揭示，消除疟疾指日可待！
疟原虫，尤其是恶性疟原虫，是地球上最致命的生物之一，它的致病性在很大程度上归因于其独特的基因组组成。这种寄生虫的基因组绝大多数偏向于A -T碱基对（ > 80 % ），这使得科学家们难以应用基本的分子生物学技术对其进行研究。最近，南佛罗里达大学的一个研究团队利用恶性疟原虫基因组成的这种奇特现象
Science：必需基因已被揭示，消除疟疾指日可待
疟原虫，尤其是恶性疟原虫，是地球上最致命的生物之一，它的致病性在很大程度上归因于其独特的基因组组成。这种寄生虫的基因组绝大多数偏向于A -T碱基对（ > 80 % ），这使得科学家们难以应用基本的分子生物学技术对其进行研究。最近，南佛罗里达大学的一个研究团队利用恶性疟原虫基因组成的这种奇特现象
江陆斌小组揭示恶性疟原虫免疫逃逸分子机制
记者从中科院上海巴斯德研究所获悉，该所江陆斌研究组在最新研究中，首次发现恶性疟原虫在人体内实现免疫逃逸的表观遗传分子机制，为研制新型疟疾疫苗提供了实验基础。日前，相关研究成果在线发表于《自然》杂志。同时，针对该研究结果，该刊还专设“疟疾论坛”板块进行了讨论。来自美国Stowers医学研究所的Je
人类基因组测序先驱欲进军生物医疗测序领域
J. Craig Venter(中)希望通过利用基因组学实现对抗衰老的目标 美国人类基因组测序先驱J. Craig Venter将和其新创立的公司Human Longevity Inc.(HLI)进军生物医疗测序领域。HLI是“基因组学和细胞的诊断与治疗公司”，计划于今年夏季启动，终极目标
突破耐药基因组测序缺陷－靶向测序对抗耐药菌新契机
自以抗生素为代表的抗菌剂问世以来，细菌对人类健康的危害得到了极大的控制。然而进入21世纪后，情况好似走入了另一个极端——由于抗生素滥用所致的耐药菌的出现以及广泛传播。这是由于在药物的选择压力下，敏感菌株被抑制或杀灭，天然耐药或获得性耐药菌株则继续生存、繁殖和克隆传播，导致细菌的耐药性增高。 细
国内首个菊花脑基因组测序纳米孔测序再发高分论文
菊属植物种类繁多，又含多种栽培种，兼具观赏和药用价值，且染色体组结构从2n=18到8n=72之间，十分复杂，多年来难以攻破。 中药所所长陈士林研究员、副研究员宋驰博士等利用ONT平台解析了可能代表栽培菊属祖先基因组的二倍体菊花脑基因组，分析表明其演化受重复序列爆发和近期WGD事件的驱动，该基因
新突破！掌上测序仪首次完成人类全基因组测序
最近，英国牛津大学（Oxford University）Wellcome Trust人类遗传学中心（Wellcome Trust Centre for Human Genetics）和在基因组分析领域领先的英国公司Genomics plc宣布，首次使用掌上纳米孔测序仪完成了多个人类全基因组测序和
人类基因组测序先驱欲进军生物医疗测序领域
J. Craig Venter(中)希望通过利用基因组学实现对抗衰老的目标。 美国人类基因组测序先驱J. Craig Venter将和其新创立的公司Human Longevity Inc.(HLI)进军生物医疗测序领域。HLI是“基因组学和细胞的诊断与治疗公司”，计划于今年夏季启动，终极目
简述单分子测序技术—第三代测序技术的基因组测序应用
由于具有读长长的特点，SMRT测序平台在基因组测序中能降低测序后的Contig数量，明显减少后续的基因组拼接和注释的工作量，节省大量的时间[25]。Christophern等[26]仅仅用0.5*的Pacbio RS系统长度的数据与38*的二代测序(NGS)的测序数据，对马达加斯加的一种指猴基因
OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序
鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫，地理分布广，感染率高，寄生于人体盲肠，导致人体慢性感染，对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同
“寄生虫”DNA片段会破坏癌症基因组稳定性
27日的《科学》杂志发表了一项研究，揭示了人类基因组中一类可“跳跃”的DNA片段——被称为遗传“寄生虫”的LINE-1（L1）元件，如何成为破坏癌症基因组稳定性的主要力量。基因组的不稳定正是癌症演化的温床，为恶性细胞提供了更多生长、适应和逃避治疗的机会。该研究挑战了传统观点，发现了对癌症基因组有全面
4月6日《科学》杂志精选
东南亚抗药性疟疾的根源 研究人员在恶性疟原虫——这是一种主要的疟疾寄生虫——的某个染色体上发现了一个特定区域，该区域可帮助解释这种在东南亚的寄生虫是如何对目前这一代的以青蒿素为基础的药物产生抗药性的。目前，以青蒿素为基础的组合疗法几乎代表了所有疟疾流行国家中的第一线的治
全球首个万种原生生物基因组计划正式发布
近日，全球首个万种原生生物基因组计划（Protist 10000 Genomes Project， 简称P10K）正式发布，旨在绘制万种代表性原生生物基因组图谱，建立一个大规模的原生生物遗传资源数据库。 原生生物是生物五界（植物界、真菌界、动物界、原生生物界和原核生物界）之一，主要是由单细胞真
研究团队均可加入！万种原生生物基因组计划启动！
近日，全球首个万种原生生物基因组计划（Protist 10000 Genomes Project， 简称P10K）正式发布，旨在绘制万种代表性原生生物基因组图谱，建立一个大规模的原生生物遗传资源数据库。 原生生物是生物五界（植物界、真菌界、动物界、原生生物界和原核生物界）之一，主要是由单细胞
法国拟建高速基因组测序分析平台
法国总理菲利普17日在巴黎宣布，法国在法兰西岛大区（又称“巴黎大区”）和中部奥弗涅—罗讷—阿尔卑斯大区启动建设两个高速基因组测序分析平台，以推动法国基因组相关研究的发展。 法国政府去年6月提出“法国基因组医学2025”计划，这两个基因组测序分析平台的建设就隶属该计划，预计将于2018年正式开始