科学家揭示了竞争性内源RNA作用于经典的双负反馈回路

竞争性内源RNA (ceRNA)假说提出了一种调节生物学过程的内在机制。miRNA是调控生物功能的核心分子,ceRNA(如高表达的mRNA)可以中合miRNA,通过类似海绵吸水的效应来调控生物过程。但是ceRNA的动态变化是否能通过ceRNA来影响miRNA的活性,进而调控重大疾病仍然存在争议。 来自中科院上海营养与健康研究所,上海生物化学与细胞生物学研究所,复旦大学的研究人员发表了题为“Competitive endogenous RNA is an intrinsic component of EMT regulatory circuits and modulates EMT”的文章,揭示了动态诱导的竞争性内源RNA直接作用于经典的双负反馈回路,并对EMT的动态调控起核心作用。动态诱导的竞争性内源RNA调控上皮间质转化示意图 这一研究成果公布在国际学术期刊Nature Communications上,由营养与健康研......阅读全文

RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)

基因沉默(gene silencing)是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面,基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物(genetically modified organisms)的障碍,另一方面,它又是植物抵抗外来核酸入侵(如病毒)的一种反应,为植物抗病毒的遗传育

RNA干扰技术(RNA-interference,RNAi)

1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫(C. elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达,而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察到基因表达的增强。但得到的结果

RNA提取时RNA降解原因

1 ) 新鲜细胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织: 某些含有内源性核酸酶的样品,很难避免RNA酶的降解,建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎,并且,匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品: 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放,然后转移到-70℃冰箱存

哪些内源性因素可以导致癌症产生?

(1)遗传因素 真正直接遗传的肿瘤只是少数不常见的肿瘤,遗传因素在大多数肿瘤发生中的作用是增加了机体发生肿瘤的倾向性和对致癌因子的易感性,即所谓的遗传易感性,包括染色体不稳定、基因不稳定以及微卫星不稳定。如家族性结肠腺瘤性息肉者,因存在胚系细胞APC基因突变,40岁以后大部分均有大肠癌变;Brca-

内源性的凝血途径都有哪种类型?

内源性凝血途径是指参加的凝血因子全部来自血液(内源性)。临床上常以活化部分凝血活酶时间(APTT)来反映体内内源性凝血途径的状况。内源性凝血途径是指从因子Ⅻ激活,到因子X激活的过程。当血管壁发生损伤,内皮下组织暴露,带负电荷的内皮下胶原纤维与凝血因子接触,因子Ⅻ即与之结合,在HK和PK的参与下被活化

xCELLigence-系统内源性GPCRs-细胞功能研究(一)

xCELLigence系统实时评测内源性G-偶联蛋白受体(GPCRs)功能Jeff Irelan 美国圣地亚哥ACEA Biosciences 公司Jonathan H. Morgan 美国弗吉尼亚州Manassas ATCC 产品经理前言    G-偶联蛋白受体(GPCRs),即 7-跨膜蛋白

xCELLigence-系统内源性GPCRs-细胞功能研究(三)

内源性GPCR功能图。优化检测参数后,使用治疗相关 GPCRs 的一组 43 个小分子与多肽调节子,对本研究中所用的细胞类型的功能反应进行检测(参见表 1)。该组药物指向的24 个受体家族,包括 50种潜在性反应受体,代表所有主要的 GPCR 偶联类型(Gs、Gi、Gq、G12/13)。使用

内源DHA合成新发现:鱼类健康的秘密

在水产养殖领域,由于脂肪肝引发的肝胆综合征已成为发病率高且危害严重的一类脂质代谢障碍性疾病。在哺乳动物和养殖鱼类中的研究均表明,摄食omega-3多不饱和脂肪酸,特别是二十二碳六烯酸,对于预防和减轻脂肪肝具有重要作用,但是内源合成的DHA对肝脏脂质稳态的作用和机制尚不明晰。近日,中国科学院水生生物研

xCELLigence-系统内源性GPCRs-细胞功能研究(二)

材料与方法    细胞系与培养条件:细胞系来自于ATCC。按照 ATCC 的建议进行HeLa(#CCL-2)、U2OS (#HTB-96)、SH-SY5Y(#CRL-2266)、CHO-K1 (#CCL-61)、人血管内皮细胞(HUVEC;# PCS-100-010 批号 5857037

抗原呈递细胞的内源性抗原

  内源性抗原是指细胞自身合成的抗原,如肿瘤抗原和病毒蛋白抗原等。内源性抗原在细胞内生成后,可被存在于胞质中的蛋白酶体,即小分子聚合多肽体(LMP)降解成小分子多肽;小分子多肽与热休克蛋白70/90在胞质内结合后,经抗原肽转运体(TAP)转运到内质网中,通过加工修饰成为具有免疫原性的抗原肽;抗原肽与

动物消化实验中内源指示剂有哪些

动物消化实验中内源指示剂有哪些  一、化学分析法  化学分析法是指对饲料、动物组织及动物排泄物的化学成分进行分析测定,而主要是定量分析。化学分析法包括饲料分析、血液分析、尿液分析及粪便分析。通过有关化学成分的测定,可为动物营养物质需要量的确定和饲料营养价值的评定提供基础数据,为机体营养缺乏症的早期诊

RNA提取心得(组织RNA提取和培养细胞的RNA提取)

一.组织RNA提取 1.最好新鲜组织,这样RNA提取的效果比较好,这是肯定的。 2. 如果不是新鲜的(最好在半年之内,-80℃或者液氮中冻存的)组织,注意不要反复冻融,从冰冻状态拿到0-4℃,注意不要拿到常温,待组织解冻后,用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织,称重后,放到预冷的匀浆器中,然后

RNA干扰相关知识RNARITS)

RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质,通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。

RNA干扰相关知识RNARISC

RNA-induced silencing complex(RISC):一种RNA-蛋白质复合物,通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC,miRNA组装miRISC。RISCs(无论siRISC还是miRISC)包括两种类型:切割型和不切割型。

反义技术——RNA干扰(RNA-interference,RNAi)

最近由于RNA干扰(RNA interference,RNAi)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA干扰是由长的双链 RNA

RNA分离与分析实验_分离RNA

实验材料标记细胞试剂、试剂盒乙酸缓冲液仪器、耗材漩涡器实验步骤1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀,每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚,充分混匀,于 60

Nature-Medicine:关闭内源性脂质合成-抑制癌症

  美国Salk研究所的研究人员发现一种脂肪代谢关键酶:ACC是肿瘤生长所必需的,为此研究人员采取了一种新的计算化学方法,来设计这种酶的高效变构抑制剂,并证明这种抑制剂在动物模型和肺癌细胞的有效性。  这一研究成果公布在Nature Medicine杂志上,最新Nature也公布关于ACC的重要结构

特征性研究:内源性GPCRs-细胞功能图研究

前言G-偶联蛋白受体(GPCRs),即 7-跨膜蛋白,是当今临床与科研药物的单一治疗靶点,也是迄今发现最大的靶点家族。据推测人基因组中,该家族的功能成员超过300个,涉及多种不同细胞与组织间的广泛信号途径。研究证实,对GPCR功能的调节,有助于免疫学、神经病学、心脏病学与肿瘤学领域多种疾病的治疗。通

文蛤分泌内源性红霉素助力构筑免疫屏障

11月29日,美国科学院院刊PNAS在线刊发了海洋所刘保忠课题组题为The mud-dwelling clam Meretrix petechialis secretes endogenously synthesized erythromycin 的研究论文。该研究首次发现埋栖贝类文蛤能在体内特定细

蛋白质的内源性荧光与荧光探针

  利用荧光光谱法研究蛋白质一般有两种方法。一是测定蛋白质分子的自身荧光(内源荧光),另一种是当蛋白质本身不能发射荧光时,通过非共价吸附或共价作用向蛋白质分子的特殊部位引入外源荧光(也称荧光探针),然后测定外源荧光物质的荧光。   蛋白质的内源荧光  含有芳香族氨基酸(色氨酸(tryptophan

RNA标记

RNA labeling (Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes  32P-pCp 3' End-labeling

RNA电泳

RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and  TransferUsing glyoxal

RNA提取

RNA提取(主要内容如下)Tips for Handing RNA Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum  Basic Procedures for Handing

RNA电泳

·         RNA Gel (Crawford Lab)·         Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis. ·         Northern

RNA降解

新鲜细胞:如果试剂没有问题,且外源性污染也可以排除,那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如  果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞,一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织:某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏,胸腺等),即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮条件下将组织

RNA-剪接

中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定  义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子,连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

RNA标记

RNA标记是将标记物(如放射性同位素、荧光素或酶)共价地连接到RNA,通过检测标记物,进而实现对RNA鉴别和检测的目的。RNA标记在分子探针领域应用广泛,在疾病诊断方面也很有前景。 理想的RNA标记方法应符合以下要求: 1.  操作简单,灵敏度高 2.  不影响碱基配对的特异性 3.  不影响RN

RNA-电泳

①电泳RNA 所用器械如制胶的模具、梳子、电泳槽等用肥皂粉洗干净后用双蒸水冲洗二遍后在室温晾干备用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %琼脂糖凝胶,倒胶时溴化乙锭(E直接加入凝胶中。③制备好的琼脂糖凝胶板放入电泳槽后再加入经高压灭菌过的1XTBE ,液面只能刚好同胶面平齐,缓冲液不要淹过胶面。④点样

RNA-Electrophoresis

Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th

Quantitating-RNA

RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an