重组DNA的分离、克隆与测序实验手册
edited by Bruce A. Roe Judy S. Crabtreeand Akbar S. KhanDepartment of Chemistry and Biochemistry The University of Oklahoma &nb......阅读全文
重组DNA的分离、克隆与测序实验手册
edited by Bruce A. Roe Judy S. Crabtreeand Akbar S. KhanDepartment of Chemistry and Biochemistry The Uni
重组DNA的分离、克隆与测序实验手册6
Electroporation ProtocolPreparation of Electro-competent Cells:1. Grow XL1-Blue cells on a tetracycline plate (20 ug tet/ml of LB agar)2. Inoculate 3
重组DNA的分离、克隆与测序实验手册4
H. Fragment purification on Sephacryl S-500 spin columnsDNA fragments larger than a few hundred base pairs can be separated from smaller fragments by
重组DNA的分离、克隆与测序实验手册5
C. Random fragment end-repair, size selection, and phosphorylationSince both sonicated and nebulized DNA fragments usually contain single-stranded end
重组DNA的分离、克隆与测序实验手册7
III. Methods for DNA isolationA. Large scale double-stranded DNA isolationThe method used for the isolation of large scale cosmid and plasmid DNA is a
重组DNA的分离、克隆与测序实验手册3
G. Bacterial cell maintenanceFour strains of E. coli are used in these studies: JM101 for M13 infection and isolation (4), XL1BMRF' (Stratagene) f
重组DNA的分离、克隆与测序实验手册8
B. Midiprep double-stranded DNA isolationA midi-prep double-stranded DNA isolation has been developed to generate a sufficient amount of template DNA
重组DNA的分离、克隆与测序实验手册2
C. Restriction digestionRestriction enzyme digestions are performed by incubating double-stranded DNA molecules with an appropriate amount of restrict
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定1
重组DNA是在体外用限制性内切酶,将不同来源的DNA分子进行特异地切割,获得的目的基因或DNA片段与载体重新连接,从而组成一个新的DNA杂合分子。重组的DNA分子能够通过一定的方式进入相应的宿主细胞,在宿主细胞中进行无性增殖,获得大量的目的基因或DNA片段,此过程称基因克隆。重组的DNA分子也能够在
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定3
当多克隆位点有外源DNA片段插入时,破坏此酶的N端阅读框架,产生无α互补功能的N端片段,因此在带有外源DNA片段的细菌在含有IPTG/X-gal的培养基上呈白色,见图7-11 。如果外源DNA插入片段相当短,不破坏β-半乳糖苷酶的氨基端氨基酸序列的阅读框,有时产生的重组体菌落不呈白色而是呈浅蓝色。4
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定2
(1)CaCl2处理以后的转化: 当细菌处于0℃、二价阳离子(如Ca2+、Mg2+等)低渗溶液中时,细菌细胞膨胀成球形,处于感受态;此时转化混合物中的DNA形成抗DNA酶的羟基-钙磷酸复合物粘附于细胞表面,重组DNA在42℃短时间热冲击后吸附在细胞表面,在丰富培养基中生长数小时后,球状细胞恢复原
测序污染有多危险,如何防范与去除[实验手册]
一些研究表明,目前已经公布的基因组存在多种污染,随着这个问题越来越突出,我们需要找出方法来应对 生物通报道:Supratim Mukherjee在进行数据分析的时候,发现数以百计的微生物基因组中会重复出现同一种噬菌体序列,这令他感到很惊讶。这位来自劳伦斯伯克利国家实验室的生物信息学家最开始是为
差异表达-cDNA-的重新扩增、克隆与测序实验
从丙烯酰胺凝胶上切下潜在的差异表达 cDNA 之后,用同一种锚定-任意引物组合重新扩增 cDNA, 反应条件与最初 PCR 相同。重新扩增的产物,可以进行克隆和测序,以供进一步分析。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒琼脂糖凝胶蒸馏水DNA 点样染料甘油蒸馏水溴
差异表达-cDNA-的重新扩增、克隆与测序实验
试剂、试剂盒 琼脂糖凝胶蒸馏水 DNA 点样染料甘油蒸馏水 溴酚蓝 二甲苯腈 FF溴化乙锭溶液任意引物(H-AP)cDNAdNTP 混合液未标记的锚定引物载体特异性引物PCR 缓冲液Tris-HClKClMgCl2明胶 TaqDNA 聚合酶仪器、耗材 电泳装置离心管热循环仪薄壁 PCR 管UV 透射
差异表达-cDNA-的重新扩增、克隆与测序实验
试剂、试剂盒 琼脂糖凝胶 蒸馏水 DNA 点样染料 甘油 蒸馏水 溴酚蓝 二甲苯腈 FF 溴化乙锭
DNA重组实验方法
[实验原理]DNA重组是将外源DNA与载体分子连接,这样重新组合的DNA叫做重组体或重组子。DNA重组的方法主要有粘端连接法和平端连接法。 重组的DNA分子是在DNA连接酶的作用下,有Mg2+、ATP存在的连接缓冲系统中,将分别经酶切的载体分子与外源DNA分子进行连接。常用的DNA连接酶是T4噬
菌落-PCR-分析克隆的重组体实验
实验方法原理 菌落PCR(Colony PCR)可不必提取基因组DNA,不必酶切鉴定,而是直接以菌体热解后暴露的DNA为模板进行PCR扩增,省时少力。使用载体上的通用引物,进行重组体的筛选或者DNA测序分析。最后的PCR产物大小是载体通用
菌落-PCR-分析克隆的重组体实验
试剂、试剂盒 溴化乙锭Taq 延伸 PCR 添加剂Tween2010% 溶液dNTP 溶液PCR 缓冲液 热稳定 DNA 聚合酶引物仪器、耗材 无菌枪头琼脂糖凝胶电泳设备和试剂实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂溴化乙锭Taq 延伸 PCR 添加剂(Stratagene)Tween20,10%
菌落-PCR-分析克隆的重组体实验
菌落 PCR 分析克隆的重组体实验试剂、试剂盒溴化乙锭Taq 延伸 PCR 添加剂Tween2010% 溶液dNTP 溶液PCR 缓冲液热稳定 DNA 聚合酶引物仪器、耗材无菌枪头琼脂糖凝胶电泳设备和试剂实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂溴化乙锭Taq 延伸 PCR 添加剂(Stratagen
DNA片段的亚克隆实验
实验材料 DNA试剂、试剂盒 CIPdNTPDNA聚合酶T4聚合酶DTTATP仪器、耗材 水浴锅电泳仪培养箱实验步骤 1. 在20 μl 反应体积内用合适的酶完全消化DNA。75℃加热15 min,灭活酶。如若无需进一步的酶促处理,接歩骤6。2. 如果5’磷酸需要去除,加入2 μl 10×CIP
DNA片段的亚克隆实验
基本方案 凝胶块中DNA连接 实验材料 DNA 试剂、试剂盒
重组克隆的概念
中文名称重组克隆英文名称recombinant clone定 义含有重组核酸分子或其片段的分子克隆或细胞克隆。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
分子克隆实验DNA片段与载体连接方法介绍
DNA分子与载体分子连接是克隆过程中的重要环节之一,方法有:①粘性末端连接,DNA片段两端的互补碱基顺序称之为粘性末端,用同一种限制性内切酶消化DNA可产生相同的粘性末端。在连接酶的作用下可恢复原样,有些限制性内切酶虽然识别不同顺序,却能产生相同末端。②平头末端连接,用物理方法制备的DNA往往是平头
生物安全与重组DNA技术
重组DNA技术涉及到组合不同来源的遗传信息,从而创造自然界以前可能从未存在过的遗传修饰生物体(genetically modified organisms,GMOs)。最初,在分子生物学家中有人担心这些生物体可能具有不可预测的不良性状,一旦从实验室逸出将带来生物学危害。这种担心在 197
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体1
载体(vector)是携带靶DNA(目的DNA)片段进入宿主细胞进行扩增和表达的运载工具。常用的载体是通过改造天然的细菌质粒、噬菌体和病毒等构建而成。目前已构建成的载体主要有质粒载体、噬菌体载体、病毒载体和人工染色体等多种类型,亦可根据其用途不同分为克隆载体和表达载体二类。载体的构建和选择应考虑以下
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体3
在作为载体时,这些噬菌体有一个很大的优点,即克隆到M13mp载体的外源DNA片段(双链),在子代噬菌体便成为了单链形式。故应用M13mp进行克隆,可方便地分离到大量含有外源DNA某一单链的DNA分子。这种单链DNA可在下列工作中作模板:①主要用作双脱氧链终止法进行DNA序列测定的模板;②制备仅有一条
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体2
二、噬菌体载体作为细菌寄生物的噬菌体,大多数具有编码多种蛋白质的基因,能利用宿主细胞的蛋白质合成体系,进行生长和增殖。构建的噬菌体载体,以λ噬菌体、M13和粘粒最为常用。㈠ λ噬菌体载体野生型λDNA是一种基因组为4.8 kb的线性双链DNA,全部序列已知,共编码50多个基因。其中约一半基因参与
克隆化酵母DNA的操作实验
实验材料 酵母实验步骤 将待研究的基因亚克隆到YIP质粒。2. 用限制性内切酶在克隆化基因内部切开,使质粒线性化。3. 用1~10 μg DNA加上担体DNA转化适合的菌株,通过质粒上带的标记进行选择,在选择培养基上纯化几个转化子,制备DNA,应用Southern 杂交确证整合是否发生在所期
分子克隆实验载体DNA的选择
①质粒:质粒是细菌染色体外遗传因子,DNA呈环状,大小为1-200千碱基对(kb)。在细胞中以游离超螺旋状存在,很容易制备。质粒DNA可通过转化引入寄主菌。在细胞中有两种状态,一是“紧密型”;二是“松弛型”。此外还应具有分子量小,易转化,有一至多个选择标记的特点。质粒型载体一般只能携带10kb以下的
DNA的重组连接实验原理和步骤
一、实验目的 用T4DNA连接酶将载体pBR322 EcoR Ⅰ-CIP处理的DNA片段,与目的基因5.4KbEcoR Ⅰ片段连接起来,构建体外重组DNA分子,同时学习几种DNA连接的方法。 二、实验原理 重组的DNA分子是在T4DNA连接酶的作用下,有Mg