Benchmarker一种可靠的对GWAS数据进行挖掘的算法
全基因组关联研究（GWAS）针对大量人群寻找有助于常见的多基因特征（如身高或肥胖）的基因。这些综合性研究经常发现大量微小的遗传变异，这些变异在高龄，肥胖等人群中更常发生。但这种相关性并不一定意味着因果关系的存在。 虽然有许多计算算法可用于帮助提取GWAS结果，但很难知道选择哪一种。研究人员在《American Journal of Human Genetics》杂志上发表的文章称Benchmarker一种可靠的对GWAS数据进行挖掘的算法。（图片来源：Www.pixabay.com） “我们有不同的优先级算法，但我们实际上并不知道如何确定哪一个是最好的，”该文章主要作者Rebecca Fine说 “我们不想依赖先前的'黄金标准'或引入除原始GWAS数据之外的任何其他内容。” 借助“交叉验证”的机器学习概念，Benchmarker使调查人员能够将GWAS数据本身作为自己的控制。我们的想法是采用GWAS数据......阅读全文
scan扫描算法要到端吗
scan扫描算法要到端。扫描算法（SCAN）也叫电梯算法。只有磁头移动到最外侧磁道时才能往内移动，移动到最内侧磁道的时候才能往外移动。
商用密码算法的“中国远征”
起码需要5、6年时间。”一位来自德国的“老标准”给中国密码标准的国际“起步”估了个“时间戳”。那是2015年初，国家密码管理局计划启动SM系列算法的ISO（国际标准化组织）国际标准推进工作。在没有太多经验情况下，希望找到多年从事密码标准工作的国际友人，想摸个底，可前景却不太乐观。 “在ISO这
超快网络流算法问世
的同时最大限度降低传输成本 科技日报北京7月2日电（记者张佳欣）瑞士苏黎世联邦理工学院的研究人员开发了一种超快算法，即网络流算法。该算法成功解决了在网络中实现最大流量的同时最大限度降低传输成本的问题。这种超快计算能力是研究高度复杂、数据丰富、动态且快速变化的网络（例如生物学中的分子网络或大脑网络）的
AFM海森斑点的算法
King和同事采用一种名为海森斑点的算法解决这个问题。海森斑点算法将尺度空间框架与局部图像曲率值相结合，能够在亚像素精度上正式定义粒子中心和边界。最终产生的粒子边界与用户定义参数相互独立，也不需要对图像进行预处理。他们对不同算法进行了直接比较，发现海森斑点算法能够比传统原子力粒子检测技术更精确地对生
深度学习算法“解密”脑活动
英国《自然·医学》杂志9月25日在线发表的一项研究，报告了一种可以分析四肢瘫痪患者大脑活动的深度学习算法。该算法已被用于向患者的前臂肌肉传递电刺激，从而恢复瘫痪肢体的功能性运动。 慢性瘫痪患者的生活质量可以通过脑机接口加以改善。脑机接口可以将控制运动的中枢神经系统回路和辅助设备（例如计算机光标
常见的哈希算法有哪些
1.linear hash 线性2.quadratic hash 每次以1,4,9,16这样的幅度向下找3.double hash 用两个函数一起决定HASH的index
上海交大文章：GWAS研究揭示玉米直链淀粉含量遗传结构
来自上海交通大学的研究人员发表了题为“The Genetic Architecture of Amylose Biosynthesis in Maize Kernel”的论文，通过全基因组关联分析系统研究了玉米籽粒中表型直链淀粉的含量与单核苷酸多态性的基因型的连锁研究，筛选出了与直链淀粉合成相关
Nature－Genetics：GWAS和HiC技术解密全新癌症相关基因
睾丸癌是最常见的年轻男性癌症。铂类化疗是较为成功的治疗手段，但仍有少部分男性对其缺乏反应。一般患者的初次确诊年龄在二三十岁，这意味着他们今后的人生不得不忍受长期化疗带来的副作用。 伦敦癌症研究所（ICR）的科学家们调查了3万名男性DNA，发现了19种与睾丸癌有关的新基因变异。结合先前鉴定的遗传
上海交大：GWAS研究揭示玉米直链淀粉含量的遗传结构
来自上海交通大学的研究人员发表了题为“The Genetic Architecture of Amylose Biosynthesis in Maize Kernel”的论文，通过全基因组关联分析系统研究了玉米籽粒中表型直链淀粉的含量与单核苷酸多态性的基因型的连锁研究，筛选出了与直链淀粉合成相关
南京医科大学Nature－Genetics发表GWAS研究新成果
来自南京医科大学的研究人员通过全基因组关联研究(GWAS)，鉴别出了中国汉族人群先天心脏畸形(congenital heart malformations，CHM)的两个全新易感位点。相关论文于5月16日在线发表在国际顶级专业期刊《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。
利用GWAS方法挖掘谷子资源中蕴含的抗谷瘟病基因
谷子是中国传统粮食作物，具有抗旱耐贫瘠、营养丰富平衡、粮草兼用、耐储存等特点，作为谷子三大病害之一的谷瘟病，严重影响谷子产量和商品品质，目前对谷瘟病的研究仅局限于抗病性鉴定和评价，有关抗谷瘟病基因的研究尚未见报道。 近期，中国农业科学院作物科学研究所刁现民研究组完成的题为“Identifica
哈佛大学等用GWAS方法鉴定高学历遗传标记
一个跨国团队进行了一项大型的GWAS研究，通过分析来自美国、澳大利亚和13个西欧国家的超过125,000名个体，鉴定了与受教育程度有关的遗传学指标。文章发表在本期的Science杂志上。 这项研究由SSGAC领导(Social Science Genetic Association C
张学军，贺林Nature撰文：中国GWAS研究取得重大进展
在全基因组关联分析(Genome Wide Association Study，GWAS)方法提出以前，人们主要利用连锁研究方法开展复杂疾病/性状遗传易感性研究，发现了一些疾病和性状的易感基因(位点)。但是复杂疾病/表型具有明显的遗传异质性、表型复杂性等特点，使得以家系为基础的“全基因组连锁
中国农大、中科院Nature－Genetics携手发布GWAS研究新成果
来自中国科学院植物研究所、中国农业大学等处的研究人员证实，ZmVPP1基因遗传变异有助于玉米幼苗抗旱性。这一研究发现发布在8月15日的《自然遗传学》（Nature Genetics）杂志上。 中国科学院植物研究所的秦峰(Feng Qin)研究员，和中国农业大学的杨小红(Xiaohong Yan
贺林、张学军：中国GWAS发展现状、意义、挑战及展望
大部分常见疾病和遗传性状受多基因和环境因素的相互作用所影响。近年来，人类疾病遗传性定量分析主要依赖于利用GWAS来识别常见的变异体，通过GWAS分析许多新的易感基因特定生物学通路得到确定。截止2016年5月，已开展的GWAS研究共有2437项，确定了16617种疾病相关的SNP（单核苷酸多态性）
压缩算法为大语言模型“瘦身”
据美国科学促进会旗下网站19日报道，美国普林斯顿大学和斯坦福大学团队开发出一种新压缩算法CALDERA，能精简大型语言模型（LLM）的海量数据，为LLM“瘦身”。这项算法不仅有助保护数据隐私、节约能源、降低成本，还能推动LLM在手机和笔记本电脑上高效使用。团队举例称，当人们使用ChatGPT时，请求
新算法提升基因融合检测效率
近日，华大基因公开一种基因融合检测算法SOAPfuse。模拟数据和真实验证数据的综合测评表明，该算法具有准确率高、敏感性强、精度高、资源消耗少等优点。该算法主要采用局部穷举算法和一系列精细的过滤策略，从而对基因融合进行快速、精确的检测。相关研究成果在《基因组生物学》（Genome
新品来袭－|－独有算法，全新赋能
奥谱天成一直致力于光谱解决方案的应用开发，基于高端光谱仪器国产化的目标，当前已完成拉曼光谱仪、光纤光谱仪、高光谱成像仪和地物光谱仪等产品线的全系列开发，并且已全方位应用于各行各业，“国产引领世界” 也是众多用户对于奥谱天成的肯定和赞誉！ 在光谱仪器国产化推进过程中，奥谱天成一直是迎难而上，哪里
计算机算法预测分子气味
这不是一件可被嗤之以鼻的事情。计算机破解了一道困扰化学家几个世纪的难题：从分子的结构预测它的味道。这一壮举或许使香水制造商和味道专家得以在试验和错误大大减少的情况下创造新产品。相关成果日前发表于生命科学预印本网站bioRxiv。和结果可通过分析光波长或声音被预测出来的视觉和听觉不同，人类的嗅觉一直很
合成孔径雷达的算法
这里给出的合成孔径雷达算法通常适用于相控阵。 定义了一个场景元素的三维数组(体积)，它将代表目标存在的空间体积。阵列的每个元素都是立方体素，表示反射表面在空间中该位置的概率(“密度”)。(注意二维SAR也是可能的，只显示了目标区域的自上而下的视图。) 最初，合成孔径雷达算法将零密度赋予每个体
用FFT计算信号频谱的算法
离散付里叶变换X(k）可看成是z变换在单位圆上的等距离采样值 同样，X（k）也可看作是序列付氏变换X（ejω）的采样，采样间隔为ωN=2π/N 由此看出，离散付里叶变换实质上是其频谱的离散频域采样，对频率具有选择性（ωk=2πk/N），在这些点上反映了信号的频谱。 根据采样定律，一个频带有
全自动血凝仪定标算法研究
引言 血凝仪是对血栓和止血进行实验室检查的仪器。止血与血栓分子标志物的检测指标与临床各种疾患有着密切联系，如心脑血管疾病、糖尿病、动静脉血栓形成等。目前，国内的全自动血凝仪主要依靠进口，只在大中型医院使用而且价格都很昂贵，小型医院还是使用半自动血凝仪。由此可知，研制出产品化的全自动血凝仪，可
低荧光强度ret比值算法
根据荧光的强度，将散点图划分为三个RET区，并计算各区中某细胞总数的比率。低荧光比率：LFR = 1000 - HFR - MFR。RET=此细胞/（成熟细胞+此细胞）。
遗传算法的概念和应用
遗传算法（Genetic Algorithm，GA）最早是由美国的 John holland于20世纪70年代提出,该算法是根据大自然中生物体进化规律而设计提出的。是模拟达尔文生物进化论的自然选择和遗传学机理的生物进化过程的计算模型，是一种通过模拟自然进化过程搜索最优解的方法。该算法通过数学的方式,
AI首次创建高效准确数学算法
英国《自然》杂志封面以“矩阵游戏”为题，发表了人工智能（AI）公司“深度思维”团队的最新发现：AI可解决矩阵乘法问题。这是第一个可为矩阵乘法等基本任务发现新颖、高效且正确算法的AI系统。换句话说，这个名为“AlphaTensor”的AI能自行发现新算法，从而解决了50年来数学领域一个悬而未决的问
深度学习算法准确追踪动物运动
根据英国《自然·神经科学》杂志8月21日在线发表的一项研究，美国哈佛大学团队运用一种新型深度学习算法，成功追踪动物运动及行为，其准确度可达到人工水平，而且无需采用追踪标记物或进行费时的手动分析。专家认为，这一成果打开了海量的数据来源之门。 准确追踪行为发生期间的身体运动部位是运动科学的一项重要
算法自动“划重点”－－－AI学会“抱佛脚”
预训练模型的兴起给自然语言处理（NLP）带来了“新面貌”。 近年来，Google、Facebook、OpenAI、微软、百度等人工智能“头部玩家”推出多个颇具影响的预训练模型，并反复迭代出十多个版本。无论学术界还是业界，人们对大规模预训练模型“热情高涨”。 日前，来自清华大学的一
舒法斯曼算法的概念
中文名称舒-法斯曼算法英文名称Chou-Fasman algorithm定 义由美国蛋白质化学家舒(P. Y. Chou)和法斯曼(G. Fasman)在20世纪70年代提出来的一种基于单个氨基酸残基统计的经验参数方法。通过统计分析，获得的每个残基出现于特定二级结构构象的倾向性因子，进而利用这些倾
hash算法是怎么样的
hash算法是一种散列算法，是把任意的长度的输入，转换成固定的额输出，福鼎的输出，输出的是散列值。在空间的比较中，输入的空间是远大于输出的散列值的空间，不同输入散列成同样的输出，一般很难从输出的散列值获取输入值的。常用的hash函数有直接取余法、乘法取整法，平方取中法。在直接取余法中，质数用到的比较
【算法研究】如何对电机进行控制？
电机作为各种电器和机械的动力源，无论在工业应用还是个人项目上，几乎每位工程师和电子爱好者都会接触，可谓小电机大作用，今天我们就一起聊聊电机运动控制算法。 一、dsp与ti为什么提到电机控制很多人首先会联想到dsp?而谈到dsp控制总绕不过ti，首先dsp芯片是一种具有特殊结构的微处理器。该芯片的内部