引物合成及各种问题总结
1.引物是如何合成的？目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。DNA合成仪有很多种, 主要都是由ABI/PE 公司生产，无论采用什么机器合成，合成的原理都相同，主要差别在于合成产率的高低，试剂消耗量的不同和单个循环用时的多少。亚磷酰胺三酯法合成DNA片段，具有高效、快速的偶联以及起始反应物比较稳定的特点。亚磷酰胺三酯法是将DNA固定在固相载体上完成DNA链的合成的，合成的方向是由待合成引物的3'端向5'端合成的，相邻的核苷酸通过3'→5'磷酸二酯键连接。第一步是将预先连接在固相载体CPG上的活性基团被保护的核苷酸与三氯乙酸反应，脱去其5'-羟基的保护基团DMT，获得游离的5'-羟基；第二步，合成DNA的原料，亚磷酰胺保护核苷酸单体，与活化剂四氮唑混合，得到核苷亚磷酸活化中间体，它的3'端被活化，5'-羟基仍然被DMT保护，与溶液中游离的5'-羟基发生缩合反应......阅读全文
PCR技术是如何合成引物的
目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。亚磷酰胺三酯法合成DNA片段，具有高效、快速的偶联以及起始反应物比较稳定的特点。亚磷酰胺三酯法是将DNA固定在固相载体上完成DNA链的合成的，合成的方向是由待合成引物的3′端向5′端合成的，相邻的核苷酸通过3′→5′磷酸二酯键连接。第一步是将预先连接在固相载体
分子杂交技术随机引物合成法
随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是：(1)Klenow片段没有5'→3'外切
基线的各种问题汇总
相信很多人都曾经因为基线波动或基线漂移问题而受到困扰，下文是一些经验总结，到底是哪些原因导致了基线走不好呢? 一、基线漂移(或上下波动)的原因 1、柱温波动。(即使是很小的温度变化都会引起基线的波动。通常影响示差检测器、电导检测器、较低灵敏度的紫外检测器或其它光电类检测器。) 可
25－个引物相关的问题
1. 引物是如何合成的？目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。DNA合成仪有很多种, 主要都是由ABI/PE 公司生产，而Bioneer自行研制的ZL384并行高通量DNA合成仪，可实现99%的高合成率。无论采用什么机器合成，合成的原理都相同，主要差别在于合成产率的高低，试剂消耗量的不同
已经溶解的引物的问题
已经溶解的引物，为什么原先使用正常，而过一段时间再使用就不好了？如果您溶解引物的水pH过低或污染了菌或核酸酶，会使引物降解。使用时没有充分解冻混合，液体不均匀也可能会造成引物加入量不准确。建议分装引物，避免反复冻溶。建议使用10mM Tris pH7.5缓冲液溶解引物，因为有些蒸馏水的pH值
25－个引物相关的问题
1. 引物是如何合成的？目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。DNA合成仪有很多种, 主要都是由ABI/PE 公司生产，而Bioneer自行研制的ZL384并行高通量DNA合成仪，可实现99%的高合成率。无论采用什么机器合成，合成的原理都相同，主要差别在于合成产率的高低，试剂消耗量的不同
引物延伸实验问题与解答
1)什么是引物延伸实验？引物延伸实验用于定量mRNA的量，测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端， 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域， 随后用RNA作为模板，用反转录酶延伸引物得到cDNA，用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析cDNA。cDNA的
PCR常见的问题总结
PCR产物的电泳检测时间一般为48h以内，有些zui好于当日电泳检测，大于48h后带型不规则甚致消失。假阴性，不出现扩增条带 PCR反应的关键环节有: ①模板核酸的制备; ②引物的质量与特异性; ③酶的质量及活性; ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。 模板： ①模板中
液压系统进水问题总结
液压系统中水的来源有： • 液压油生产工艺中带来的水分没能有效去除； • 油品储存和使用过程中冷却的水蒸汽、雨水或其他水污染源的侵入。 液压油中允许水含量： • 一般系统
DNA合成由RNA引物引发过程
DNA聚合酶不能发动新链的合成，只能催化已有链的延长；RNA聚合酶则不同，只要有模板存在，不需引物，就可以合成新RNA链。因此在体内先由RNA聚合酶合成RNA引物，DNA聚合酶再从RNA引物的3‘-OH端开始合成新的DNA链。催化RNA引物合成的酶称为引物合成酶。引物长度通常只有几个~10多个核苷酸
双链DNA探针随机引物合成法
随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是：(1)Klenow片段没有5'→3'外切
有机合成操作的经验总结
选择玻璃仪器和搅拌子：（1）均相反应：物料不超过容器体积的2/3；（2）非均相、回流或者产生气体的反应：物料不超过容器体积的小于1/2，无水无氧的反应时更应注意。搅拌装置的选择：（1）机械搅拌：物料体积>2 L的非均相体系；（2）强力搅拌：物料体积>3 L的均相反应和250 mL~2 L的非均相体系
有机合成后处理经验总结
在有机合成中，后处理的问题往往被大多数人所忽略，认为只要找对了合成方法，合成任务就可以事半功倍了，这话不错，正确地合成方法固然重要，但是机合成的任务是拿到相当纯的产品， 任何反应没有 100％产率的， 总要伴随或多或少的副反应，产生或多或少的杂质，反应完成后，面临的巨大问题就是从反应混合体系中分离出
引物TM值和PCR程序问题
tm值和引物中的GC含量有关 只要相差不是太大就行 设定时取平均值就可以；你可以根据引物的长度和GC的百分比来确定一下哪个更准确。不知道你用的那个公司的机器，一般是的在退火温度后面的空格里，输入你每个循环升或降的温度，后面还有加减号代表升或降。
SSCP检测SNP原理，步骤及常见问题总结整理
SSCP原理：sscp称为单链构象多态性，它是基于DNA构象来检测PCR产物单链碱基微小差异的方法，因其检测敏感，快速和所需装置简便而在分子生物学各个领域广泛应用。但该方法的试验结果受多种因素的影响，如：PCR产物，温度，电压，PAGE胶的浓度和交联度等，因而重复性比较差。因此在做SSCP时要注意各
SSCP检测SNP原理，步骤及常见问题总结整理
SSCP原理：sscp称为单链构象多态性，它是基于DNA构象来检测PCR产物单链碱基微小差异的方法，因其检测敏感，快速和所需装置简便而在分子生物学各个领域广泛应用。但该方法的试验结果受多种因素的影响，如：PCR产物，温度，电压，PAGE胶的浓度和交联度等，因而重复性比较差。因此在做SSCP时要注意各
移液器使用常见问题及解决方法总结
移液器，对于实验室人员而言，几乎是都要在实验室中用到的，并且在使用的过程中，也会遇到一些列问题。 一、移液器使用常见问题： A.活塞/吸头 泄漏 B.吸头不适合移液器 C.二次使用吸头 D.移液器吸头没有碰到容器壁 E.湿度差异 F.没有
环氧氯丙烷各种合成工艺研究
环氧氯丙烷(ECH)别名表氯醇，化学名称为1-氯-2，3-环氧丙烷，是一种易挥发、不稳定的无色油状液体，有与氯仿、醚相似的刺激性气味，有毒性和麻醉性，微溶于水，易溶于酒精、乙醚、苯等有机溶剂，可与多种有机液体形成共沸物。 环氧氯丙烷是一种重要的有机化工原料和精细化工产品，用途十分广泛。以它为原
蛋白纯化常见问题总结
蛋白纯化过程中常遇见一些问题，这里整理了以下几个蛋白纯化实验中遇见的问题及其解决方案。1)我现在手头有个融合蛋白，纯化的时候用助溶剂溶解后做了GST亲和层析，之后用蛋白酶切割后却发现目的蛋白没有活性。请问有哪些可能会出现这种原因?怎么解决?测过基因序列，没有问题。细胞破碎后，融合蛋白在沉淀里，我用助
气质常见12个问题总结
1、样品进样一段时间后，突然进样口中压力不上不去了，这是为什么呢？ 其实主要是因为我们进样次数过多，导致隔垫密封不好，压力上不去。 2、进样后，不出峰呢？这又是什么原因呢？ 主要原因有以下几个问题： 第一看柱子是否连接正常； 第二看是否进到样品了，因为如果液面低于0.5ml时
蛋白纯化常见问题总结
蛋白纯化过程中常遇见一些问题，这里整理了以下几个蛋白纯化实验中遇见的问题及其解决方案。1)我现在手头有个融合蛋白，纯化的时候用助溶剂溶解后做了GST亲和层析，之后用蛋白酶切割后却发现目的蛋白没有活性。请问有哪些可能会出现这种原因?怎么解决?测过基因序列，没有问题。细胞破碎后，融合蛋白在沉淀里，我用助
Western－Blot常见问题总结
Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳，经过PAGE分离的蛋白质样品，转移到固相载体上，固相载体以非共价键形式吸附蛋白质，且能保持电泳分离的类型及其生物学活性不变。以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原，与对应的抗体起免疫反应，再与或标记的第二抗体起反应，经过底物显色或放射自显影以检测电
PCR假阴性问题总结
PCR的假阳性问题深受重视，但PCR假阴性问题相对于临床检测更为严重。其实PCR假阳性的问题是比较单纯的，一般仅涉及污染和引物的非特异性问题。而污染可以通过严格的实验室管理，合理的环境设置，以及加入UNG酶抗污染基本可以解决，而引物的非特异性问题基本属于厂家试剂质量问题。而PCR的假阴性却不同，它
分子杂交技术随机引物合成法操作步骤
(1) 200ng双链DNA(1μl)和7.5ng随机引物(1μl)混合后置于eppendorf管内,水浴煮沸5分钟后，立即置于冰浴中1分钟。 (2) 与此同时,尽快在一置于冰浴中的0.5ml eppendorf管内混合下列化合物: 20mmol/L DTT 1μl 未标记的dNTP溶液
根据引物合成单如何设定PCR退火温度？
PCR退火温度应如何设置？ 问题：引物单上数据如下 上游TTACAAGATGGAGCCTCACC(GC含量50%) Tm(1M Na+)：68.2 Tm(50mM Na+)：46.6 下游CAAAGAATAACCCAGGACGA(GC含量45%) Tm(1M Na+)：
根据引物合成单如何设定PCR退火温度？
问题：引物单上数据如下上游TTACAAGATGGAGCCTCACC(GC含量50%)Tm(1M Na+)：68.2Tm(50mM Na+)：46.6下游CAAAGAATAACCCAGGACGA(GC含量45%)Tm(1M Na+)：66.2Tm(50mM Na+)：44.6顺便问下大家，Tm(1M
余氯各种常见问题与常识！
传统的余氯测试方法主要有分光光度法和比色法，这二种方法的缺点是：需要5种以上的试剂和溶液，测试精度受样品的颜色和浑浊度的影响。为何说电极法测试余氯是最简单的测试方法？传统的余氯测试方法主要有分光光度法和比色法，这二种方法的缺点是：需要5种以上的试剂和溶液，测试精度受样品的颜色和浑浊度的影响。而且，这
PCR扩增失败是引物的问题吗？
基本不是。当今发展出各色各样的PCR扩增技术，各色各样的高温聚合酶，就是来解决PCR扩增中遇到的扩不出，扩增效率低的问题。如槽式PCR就是扩增那些拷贝数很低的基因片段。有些重复片段的扩增, GC含量高的片段，非要采用特殊扩增手段才能扩增出了。
解决荧光定量PCR引物探针问题
荧光实时定量 PCR 技术 (real-time quantitative PCR，qPCR) 几乎是现代分子生物学技术中最重要、应用最广泛的核酸定量检测技术。成功的定量 PCR 实验离不开精准的实验设计和操作流程。 实时荧光定量 PCR 分析的部分实施需要经过优化以确保所有反应参数均设置精确
蛋白纯化常见问题总结（一）
蛋白纯化过程中常遇见一些问题，这里整理了以下几个蛋白纯化实验中遇见的问题及其解决方案。1)我现在手头有个融合蛋白，纯化的时候用助溶剂溶解后做了GST亲和层析，之后用蛋白酶切割后却发现目的蛋白没有活性。请问有哪些可能会出现这种原因?怎么解决?测过基因序列，没有问题。细胞破碎后，融合蛋白在沉淀里，我用助