赵方庆团队开发环形RNA定量和差异表达分析新方法
2020年1月3日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-通讯》（Nature Communications）杂志上发表题为Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform switching events 的文章。该研究开发了环形RNA定量和差异表达分析的新方法——CIRIquant。与常用的环形RNA分析软件相比，CIRIquant可以更准确对环形RNA转录本进行识别和定量，并为环形RNA的差异表达分析提供了便捷的一站式分析工具。 环形RNA是一类在真核生物中广泛存在的具有特殊环状结构的非编码RNA分子。已有文献表明，在生物体内，环形RNA有着miRNA海绵、RBP海绵以及翻译短肽等多项功能，在许多生物学过程中发挥着重要作用。目前研究表明，大部分环形RNA来源于蛋白编码基因的外显子区域。在pre-mRN......阅读全文
环状RNA研究深度剖析（一）
1.环状RNA为什么火？它到底是何方神圣？2013年两篇Nature[1][2]文章的出世，彻底颠覆了我们对RNA的传统认知，同时也迅速引爆了整个生物医学界！经过严格统计汇总后，2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项，其中有两项杰出青年基金，一项优秀青年基金，两
不同RNA－m5C甲基化修饰存在巨大差异
导读近年来，RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰，也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期，来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEA
RNA分析技术发现细胞的微小差异产生的深远影响
在一个特定的组织或器官中，细胞可能看起来非常相似，甚至完全相同。但在分子水平上，这些细胞可能有微小的差异，导致它们的功能发生巨大的变化。麻省理工学院(MIT)化学副教授Alex K. Shalek很享受揭示这些细微差别的挑战。在他的实验室里，研究人员开发和部署了单细胞RNA测序等技术，这让他们能够分
环形变压器
使用环境 1、周围空气温度-30℃至+40℃，24小时的平均值不超过+35℃；超过+40℃时变压器的负载能力下降，低于0℃以下时，变压器的负载能力上升，负载功率可略超出额定功率。在-30℃的低温环境并不影响环形变压
显微镜环形灯
显微镜环形灯LED灯采用控流开关电源技术，体积小，重量轻，能效高，发热量小，环保，输出稳定，纹波小，寿命长等优点。输入功率：3W荧光灯源具有光效高、耗电省、显色性好，长时间照明不疲劳等优点。是新一代理想的绿色照明光源。我们一直秉诚信经营、质优价廉、真诚服务的作风、以及互惠互利的原则，为客户提供理想的
E花环形成试验
实验目的 1.掌握T淋巴细胞E花环试验的原理、正常值，了解其方法和用途。2.熟悉光镜下E花环的形态和计数方法。实验原理 T细胞表面具有能与绵羊红细胞（SRBC）表面糖肽结合的受体，称为E受体（CD2）。已证实E受体是人类T细胞所特有的表面标志。当T细胞与SRBC混合后，SRBC便粘附于T细胞表面，呈
液相法筛选cDNA表达文库中RNA结合蛋白实验
将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上，然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方法原理将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上，然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法
Nature：重大进展！揭示RNA中调节蛋白表达的隐藏信号
科学家们早就知道RNA会编码表达蛋白的指令。组成RNA的构成单元（building block）---碱基A、U、C和G---形成了细胞中蛋白制造复合物（protein-making machinery）的蓝图。为了表达蛋白，这种复合物结合到RNA的一端上，然后沿着RNA扫描，直到它到达AUG密
揭示宿主内的小RNA参与乙肝病毒表达调控
乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBV）感染可引起肝脏的急性和慢性炎症。急性感染一般表现为自限性肝炎，除爆发性肝炎外，对人体的危害较小；而慢性感染则与肝硬化（cirrhosis）和原发性肝癌（hepatocellular carcinoma，HCC）的发生密切相关。全球
液相法筛选cDNA表达文库中RNA结合蛋白实验
实验方法原理 将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上，然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。实验材料 TY试剂、试剂盒 储存液溶菌酶干粉细菌裂解缓冲液甘油水溶液实验步骤 一、材料与设备1. 2X TY：16 g 蛋白胨，10 g 酵母提
T7－RNA聚合酶/启动子表达实验1
在适宜的条件下，T7 RNA聚合酶/启动子系统表达的基因产物可占细胞总蛋白的25%以上，但多数情况下产量比这个比例要低得多。实验材料载体试剂、试剂盒氨苄青霉素卡那霉素pGP裂解缓冲液仪器、耗材培养箱分光光度计离心机实验步骤1. 将含有待表达基因的片段亚克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中，转化
T7－RNA聚合酶/启动子表达实验2
实验材料蛋白质试剂、试剂盒氨基酸混合物M9培养基甲硫氨酸甲醇仪器、耗材荧光显微镜离心机分光光度计实验步骤1. 将含有待表达基因的片段亚克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中，转化一种标准大肠杆菌菌株，此菌株不应带有可指导T7 RNA聚合酶合成的质粒。转化物涂布于氨苄青霉素平皿，于37℃温育培养过
T7－RNA聚合酶/启动子表达实验3
实验材料噬菌体试剂、试剂盒PEGIPTG仪器、耗材培养箱离心机实验步骤1. 制备从M13噬菌体mGP1-2原种，加PEG溶液沉淀浓缩噬菌体。重悬噬菌体于M9培养基，滴定其滴度。 2. 将由“基本方案”步骤1所得的含T7 启动子表达质粒转化M13许可性大肠杆菌细胞，转化物涂布于氨苄青霉素平皿上，3
液相法筛选cDNA表达文库中RNA结合蛋白实验
实验方法原理 将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上，然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。 实验材料
中国学者Cell子刊揭示基因组“暗物质”中环状RNA新分子
9月27日，国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)发表了中科院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲组与计算生物学所杨力组的最新合作研究论文，发现来源于基因内含子区域的环形RNA新分子，揭示其成环机制及在基因转录调控中的重要功能。 众所周知，人类基因组中存在大量被称为基因组
世界首篇非洲爪蟾环状RNA研究成果发表！
作为最新的明星分子，环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度？从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑：上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究，整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上，云序客户此前更是先后发表了全世
非洲爪蟾环状RNA研究成果
作为最新的明星分子，环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度？从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑：上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究，整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上，云序客户此前更是先后发表了全世界第
中国科大发现新型非编码RNA
最近，中国科学技术大学单革教授实验室在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)发表研究性论文，报导了其实验室发现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能和功能机理。 非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起
世界首篇非洲爪蟾环状RNA研究成果发表！
作为最新的明星分子，环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度？从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑：上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究，整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上，云序客户此前更是先后发表了全世
从表达谱至海绵机制完美进阶－环状RNA测序加机制研究！
禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属，慢病毒亚科的家族成员，可引起禽类多种肿瘤性疾病，如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症，以及禽类骨髓白血病，导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛，既能水平传播又能垂直传播，往往造成禽类养殖领域的巨大经济损失。目前我
Cell：神秘的非编码RNA在基因表达中起重要作用
在细胞中，DNA被转录成RNA，提供给细胞制造蛋白质的分子配方。大多数的基因组被转录成RNA，但实际上只有一小部分的RNA是来自于基因组中的蛋白质编码区域。 宾夕法尼亚大学Perelman医学院Penn表观遗传学研究所主任Shelley Berger博士说：“为什么非编码区能转录？它们的功能一
RNA通过激活肺泡上皮TLR3嗜中性粒细胞肺预转移微环形成
研究背景 1889年，Stephen Paget通过对大量肿瘤的解剖学研究发现，特定的肿瘤细胞总是倾向于转移到特定的组织器官。假说认为肿瘤细胞只能在适宜的组织器官环境中才能形成转移灶。尽管该发现意义重大，此种现象产生的原因却直到2015年才最终得到解答。Nature杂志在2015年在线刊登
陈玲玲，杨力受邀Cell子刊发表综述：核重复序列
2月10日，上海生化细胞所陈玲玲研究员与上海生科院（健康院）计算生物学所杨力研究员受邀在《Trends Cell Biol》发表了题为“ALUternative Regulation for Gene Expression.”的综述论文，系统总结了灵长类（包括人）基因组中特异的Alu短散在核重复
环形混凝土电杆的技术要求
环形混凝土电杆的技术要求，分别从以下几方面阐述：一、混凝土抗压强度1.钢筋混凝土电杆的混凝土强度不低于C40,脱模时混凝土抗压强度不宜低于设计的混凝土强度等级的60%2.预应力混凝土电杆，部分预应力混凝土电杆的混凝土强度等级不低于C50，脱模时混凝土抗压强度不宜低于设计的混凝土强度等级的70%3.保
环形激光自动测角仪
大家对自动侧角装置的研制非常重视，特别是测角仪。其中一个很有发展前途的仪器是基于环形激光器的测角仪。这种测角仪容易实现自校，因此可以在测量过程中确定环形激光器的比例因子，从而大大地减少了测量误差。在测量时，当装有环形激光器的回转装置的角速度比较高时，其输出信号（即测量值）的非线性实际上不影响测角
多物种转录图谱综合数据库已对用户免费开放
随着高通量测序技术的发展，转录组测序（RNA-seq）已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法，并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生，以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临挑战。为更充分展现转录组数据蕴含的丰富信息，服务生物医学基础研究领域需求，构
计算生物学所揭示汉族和日本人之间的基因表达谱差异
记者获悉，由全国人大常委会副委员长沈跃跃带领的全国人大检查执法组近日在江苏多个省辖市对《可再生能源法》贯彻实施情况进行执法检查。 作为可再生能源起步早、规模大、企业多、产业链齐全的省份，江苏当下在这一领域的企业正面临着严重的全面亏损状态。 《可再生能源法》于2006年实施，2009年
基于iTRAQ技术鉴定梭子蟹中与生长相关的差异表达蛋白
梭子蟹广泛分布在韩国，日本，中国和东南亚的沿海水域。这种物种栖息在河口和沿海水域。 在中国，它是一种主要的食用蟹种和重要的渔业资源，也是中国重要的养殖物种。目前关于梭子蟹的研究已经很广泛，但关于其遗传背景信息的研究亟待深入。目前为止，关于梭子蟹蛋白质组学的研究比较少。 在这项研究中，中国水产科
研究发现长非编码RNA种属特异性加工决定其功能差异
北京时间4月6日，国际学术期刊《细胞》（Cell）在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新研究成果“Distinct processing of lncRNAs contributes to non-conserved fun
研究人员发现长非编码RNA物种差异加工及其功能演变
从细菌到真核单细胞，从真核单细胞到复杂生命，在物种进化的时间长河里，生命体中每一个可能导致物种演变的功能“单位”都值得科学家探究，比如细胞中广泛地存在功能未知的“暗物质”——长非编码RNA。中科院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所，简称分子细胞卓越中心）陈玲玲研究组的最新研究