先进院发现GPCR药物全新结合模式
日前,中国科学院深圳先进技术研究院医药所计算机辅助药物设计中心袁曙光课题组带领团队与上海科技大学合作,通过计算药学与生物化学相结合的方法,发现G蛋白偶联受体蛋白(GPCR)全新药物分子结合模式与激活机制。相关工作近期发表在ACS Central Science上。 G蛋白偶联受体(G Protein-Coupled Receptors,GPCRs)是一大类膜蛋白受体的统称。这类受体的共同点是其立体结构中都有7个跨膜α螺旋,且其肽链的C端和连接第5和第6个跨膜螺旋的胞内环上都有G蛋白(鸟苷酸结合蛋白)的结合位点。研究显示G蛋白偶联受体只见于真核生物之中,而且参与了很多细胞信号转导过程。在这些过程中,G蛋白偶联受体能结合细胞周围环境中的化学物质并激活细胞内的一系列信号通路,最终引起细胞状态的改变。 GPCR参与着人类体内包括细胞分化、神经信号传递、代谢等多种生理功能,同时也与癌症、抑郁症、疼痛、艾滋病、糖尿病等重大疾病密切相......阅读全文
先进院发现GPCR药物全新结合模式
日前,中国科学院深圳先进技术研究院医药所计算机辅助药物设计中心袁曙光课题组带领团队与上海科技大学合作,通过计算药学与生物化学相结合的方法,发现G蛋白偶联受体蛋白(GPCR)全新药物分子结合模式与激活机制。相关工作近期发表在ACS Central Science上。 G蛋白偶联受体(G Prot
先进院发现GPCR药物全新结合模式
日前,中国科学院深圳先进技术研究院医药所计算机辅助药物设计中心袁曙光课题组带领团队与上海科技大学合作,通过计算药学与生物化学相结合的方法,发现G蛋白偶联受体蛋白(GPCR)全新药物分子结合模式与激活机制。相关工作近期发表在ACS Central Science上。 GPCR参与着人类体内包括细
上海药物所发现B类GPCR与Arrestin全新作用模式
G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)在细胞信号转导过程中发挥关键作用,是最大的药物靶标蛋白质家族。GPCR被细胞外的信号分子激活后,与细胞内的效应蛋白(G蛋白、阻遏蛋白等)结合,激活多种下游信号通路,从而介导并调控人体各种生命活动。G蛋白(G prot
Attenuation-of-GPCR-Signaling
The G-protein coupled receptor (GPCR) family transduces extracellular signals across the plasma membrane, activating cellular responses through a vari
arrestins-in-GPCR-Desensitization
Role of ?-arrestins in the desensitization, sequestration and intracellular trafficking of GPCRs. Homologous desensitization of GPCRs (1) results from
HPLC结合复合模式色谱柱检测极性有机酸
近年来,有机酸的使用在制药和食品领域越来越普遍, 在制药领域,常用的有机酸主要有乙酸、三氟乙酸 、甲酸等,常被作为有机合成的原料,而三氟乙酸(TFA)随着大量使用和排放,在水体中广泛存在,植物会随土壤和水浓度增加而富集TFA,且由于其持久性和缺乏挥发性,难以从植物组织中消除。三氟乙酸对水生生物有
上海药物所发现GPCR与GPCR激酶相互作用新机制
GPCR(G蛋白偶联受体)已经成为当前最成功的药物靶标之一,迄今已有40%左右的上市药物以GPCR为靶点,因此,在药物发现领域,对GPCR结构及其如何与下游信号通路相互作用的认识与理解越深入,则越有希望开发出更加高效低毒的药物。自GPCR与下游G蛋白和阻遏蛋白复合物晶体结构被成功解析以来,GPC
创新种养结合新模式,开启高质量肉牛发展密码
为促进肉牛业高质量发展,四川省雅安市政府揭榜挂帅项目肉牛产业组成员因地制宜,提出了雅安种养结合新模式饲喂肉牛,并在荥经县牛鸣谷养牛基地率先示范应用。近日,肉牛产业揭榜挂帅项目主持人、四川农业大学动物科技学院教授赖松家一行来到荥经县开展肉牛技术培训和技术服务。专家团队到牛鸣谷养牛示范基地进行指导种养结
《GigaScience》—实现文章与数据结合的创新学术发表模式
2012年7月12日,华大基因和生物医学中心(BioMed Central)宣布其共同创办的生物学期刊《GigaScience》首刊正式发行。该期刊采用标准全文文献、数据库信息以及信息分析工具相结合的崭新模式,来发表大规模的生物学研究成果,为广大科研工作者提供免费公开的有效数据以及生物学发现
最新合作研究阐述泛素链结合的协同效应模式
近日,美国PLoS ONE杂志发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所胡红雨课题组的研究论文。该论文阐述了III型脊髓小脑共济失调症相关蛋白ataxin-3(AT3)中的串联泛素结合模体(ubiquitin-interaction motif,UIM)的构象变化和UIM与泛素链结
Nature长文:GPCR药物大盘点
G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptors,GPCRs)家族是人类中最庞大的膜蛋白家族,也是很多药物的重要靶点。这个家族中有800多个成员,其中包括400个左右嗅觉受体。据统计,靶向GPCR的药物销量占全球市场的27%。GPCRs一直是药物研发的重要靶点之一,因为它们
PNAS:GPCR孤儿受体找到“亲人”
人类基因组中存在一些被称为“孤儿受体”(orphan receptors)的蛋白,从它们与其他蛋白的序列相似性来看,这些蛋白应该能结合并应答激素或化学物质,但人们至今还未发现其生理性配体。 Emory大学的研究人员为大脑中的一对GPCR孤儿受体找到了配体,这一发现有望帮助人们治疗相关的
陈可冀院士:提倡多元模式-推进中西医结合
本期话题:SCI首次收录中医学类期刊 中国中西医结合学会和中国中医科学院主办的《中国结合医学杂志》(Chinese Journal of Integrative Medicine)日前被列为美国《科学引文索引(扩展库)》(SCI-E)来源期刊,成为国内第一份被SCI收录的中医学类期刊。创刊于1995
Science重要成果:室温解码GPCR结构
科学家利用目前最强力的X射线激光器,在最接近天然的条件下,获得了一种重要G蛋白偶联受体(GPCR)的3D结构。这一突破发表在最近一期的Science杂志上。 GPCR是一个蛋白大家族,对人类健康有关键性作用,约40%的现代药物都靶标这类蛋白。与GPCR有关的疾病包括,高血压、哮喘、精神分裂
首次破解糖尿病关键GPCR结构
GPCRs是一类与G蛋白有信号连接的受体家族,调控着细胞对激素,神经递质的大部分应答,以及视觉,嗅觉,味觉等。目前药物市场上至少有一半的小分子药物是GPCR的激活剂或者拮抗剂,2012年诺贝尔化学奖就颁给了“G蛋白偶联受体”结构研究。 近期来自斯克里普斯研究所(TSRI),中国科学院等处的
科学家系统评估AlphaFold3在药物开发中的预测能力
中国科学院上海药物研究所研究员徐华强团队,在前期评估AlphaFold3蛋白相互作用预测精度的基础上,进一步聚焦其新近开源的小分子配体预测功能,系统评估了AlphaFold3在G蛋白偶联受体(GPCR)-小分子配体复合物结构预测中的表现,并深入揭示了其在药物设计应用中的局限性。相关研究7月9日发表于
新成果-GCGR促进糖尿病新药开发
中科院上海药物研究所吴蓓丽课题组和赵强课题组在B型G蛋白偶联受体(GPCR)结构与功能研究领域又获重要突破,首次测定了胰高血糖素受体(GCGR)全长蛋白与多肽配体复合物的三维结构,揭示了该受体对细胞信号分子的特异性识别及其活化调控机制。该成果1月4日发表于《自然》杂志。 GPCR是人体内最大的
绘制D7152441与PB2cap的结合模式图(三)
必要时,可先将cartoo隐藏起来,等调整好label后,再显示出来),让视图更清晰。经过上述一系列操作,得到下图:2.6. 生成图片上面的图已经可以发表文章了,但为了更好看,还需要进行一步:光线追踪(Ray tracing)。继续使用命令:至此,我们拿到3张图片:focus.png、label.p
绘制D7152441与PB2cap的结合模式图(一)
前言本期,我将带大家使用PyMOL软件(搭配Photoshop、MS Powerpoint)绘制D715-2441与PB2cap的结合模式图。我们先来看一张成品图: 研究背景根据上期的分析结果,我们获得以下相互作用:1、化合物D715-2441的芳环夹在氨基酸残基H357和F404之间并形成π-π堆
绘制D7152441与PB2cap的结合模式图(二)
设置关键残基对象:关键残基包括:A链的K339、H357、E361、K376和F404。由于该蛋白只有一条链,在使用命令选择残基时,可以不用指定链名。按照下图顺序,将关键残基设置为res对象。2.3. 显示所需,隐藏多余在PyMOL中输入以下命令:然后,进行鼠标操作:2.4. 绘制相互作用力前面说过
发现GPCR磷酸化编码机制,创新性的提出“笛子模型”理论
中国科学院生物物理研究所研究员王江云课题组、山东大学基础医学院教授于晓团队与孙金鹏团队,与北京大学教授金长文团队合作,在Nature Communications上在线发表了研究论文Structural studies of phosphorylation-dependent interacti
研究揭示G蛋白选择调控机制
中国科学院上海药物研究所吴蓓丽、赵强研究团队与中国科学院生物物理研究所孙飞、澳大利亚莫纳什大学Denise Wootten研究团队合作,在G蛋白偶联受体(GPCR)结构与功能研究领域取得突破性进展:解析了人源胰高血糖素受体(GCGR)分别与激活型G蛋白(Gs)和抑制型G蛋白(Gi)结合的复合物三
Roles-of-arrestindependent-Recruitment-of-Src-Kinases-in-GPCR-Signaling
The binding of ?-arrestins to agonist-occupied GPCRs coincides with the recruitment of Src family tyrosine kinases, including c-Src, Hck and c-Fgr (Sr
《自然》挑战传统观点-揭示GPCR新特征
2012年诺贝尔化学奖颁给了两位美国科学家:罗伯特·莱夫科维茨(Robert J. Lefkowitz)和布莱恩·科比尔卡(Brian K. Kobilka),他们因“G蛋白偶联受体”研究领域的杰出贡献而获奖。 这一久负盛名的受体家族是最著名的药物靶标分子,调控着细胞对激素,神经递质的
华裔青年Cell追随诺奖脚步-解析GPCR
来自Salk生物研究所,Scripps研究院等处的研究人员发表了题为“Genetically Encoded Chemical Probes in Cells Reveal the Binding Path of Urocortin-I to CRF Class B GPCR”的文章,破
生物物理所等在大麻素受体的结构生物学研究中获重成果
中国科学院生物物理研究所刘志杰课题组与合作者成功解析了人源大麻素受体CB1(human Cannabinoid Receptor 1, CB1)与激动剂——四氢大麻酚(THC)类似物复合物的三维精细结构,揭示了大麻素受体在激动剂调控下的结构特征和激活机制。北京时间7月6日凌晨,该项成果以Crys
生物物理所等在大麻素受体结构生物学研究中获重要成果
中国科学院生物物理研究所刘志杰课题组与合作者成功解析了人源大麻素受体CB1(human Cannabinoid Receptor 1, CB1)与激动剂——四氢大麻酚(THC)类似物复合物的三维精细结构,揭示了大麻素受体在激动剂调控下的结构特征和激活机制。北京时间7月6日凌晨,该项成果以Crys
研究揭示人胰高血糖素受体的G蛋白特异性识别机制
G蛋白偶联受体(GPCR)在细胞信号转导中起重要作用,并作为多种疾病的重要治疗靶标。与细胞外激动剂结合后,GPCR通过招募不同的G蛋白(Gs、Gi和Gq等)刺激各种信号通路以介导多种生理功能。GPCR和特定G蛋白之间的选择性偶联对于这类受体的生物学作用至关重要。 但是,确定单个GPCR如何识别
胰高血糖素受体晶体结构揭示B型GPCR信号转导机制
近日,中国科学院上海药物研究所在B型G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor, GPCR)结构与功能研究方面取得又一项重要进展:首次测定了胰高血糖素受体(Glucagon receptor, GCGR)全长蛋白与多肽配体复合物的三维结构,揭示了该受体对细胞信号分子的特
研究发现胰高血糖素受体结构揭示G蛋白选择调控机制
近日,中国科学院上海药物研究所吴蓓丽研究组、赵强研究组与中国科学院生物物理研究所孙飞研究组和澳大利亚莫纳什大学Denise Wootten研究组合作,在G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)结构与功能研究领域取得又一突破性进展:解析了人源胰高血糖素受体(